Doublet Group distance statistics: 50348

back

Distances from reference structure (by RMSD)

6, 17, 16, 4, 4, 0, 1, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.002, 0.026, 0.049, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.004, 0.028, 0.053, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.028 std_dev=0.025
O2'	B	0, 0.051, 0.263, 0.475, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.263 std_dev=0.212
O4'	A	0, -0.054, 0.163, 0.379, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.163 std_dev=0.217
C2'	A	0, -0.056, 0.178, 0.412, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.178 std_dev=0.234
C2'	B	0, 0.029, 0.281, 0.533, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.281 std_dev=0.252
O2'	A	0, -0.057, 0.224, 0.504, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.224 std_dev=0.281
C4'	A	0, -0.068, 0.263, 0.593, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.263 std_dev=0.330
C1'	B	0, 0.000, 0.337, 0.674, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.337 std_dev=0.337
C3'	A	0, -0.069, 0.290, 0.649, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.290 std_dev=0.359
C3'	B	0, -0.013, 0.381, 0.774, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.381 std_dev=0.394
C4'	B	0, -0.003, 0.423, 0.849, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.423 std_dev=0.426
O4'	B	0, -0.015, 0.422, 0.860, 2.582 max_d=2.582 avg_d=0.422 std_dev=0.437
O3'	B	0, -0.037, 0.454, 0.945, 2.408 max_d=2.408 avg_d=0.454 std_dev=0.491
N9	B	0, -0.097, 0.407, 0.911, 2.676 max_d=2.676 avg_d=0.407 std_dev=0.504
O3'	A	0, -0.081, 0.439, 0.958, 2.484 max_d=2.484 avg_d=0.439 std_dev=0.520
C5'	A	0, -0.121, 0.438, 0.996, 2.654 max_d=2.654 avg_d=0.438 std_dev=0.558
C5'	B	0, -0.029, 0.542, 1.114, 2.889 max_d=2.889 avg_d=0.542 std_dev=0.571
C4	B	0, -0.167, 0.429, 1.024, 3.294 max_d=3.294 avg_d=0.429 std_dev=0.596
N3	B	0, -0.211, 0.420, 1.050, 4.021 max_d=4.021 avg_d=0.420 std_dev=0.630
C8	B	0, -0.183, 0.528, 1.239, 3.898 max_d=3.898 avg_d=0.528 std_dev=0.711
O5'	A	0, -0.191, 0.535, 1.262, 3.120 max_d=3.120 avg_d=0.535 std_dev=0.726
C5	B	0, -0.248, 0.538, 1.323, 4.148 max_d=4.148 avg_d=0.538 std_dev=0.786
O5'	B	0, -0.170, 0.627, 1.424, 4.971 max_d=4.971 avg_d=0.627 std_dev=0.797
OP1	B	0, -0.115, 0.714, 1.542, 3.800 max_d=3.800 avg_d=0.714 std_dev=0.829
C2	B	0, -0.311, 0.522, 1.355, 5.297 max_d=5.297 avg_d=0.522 std_dev=0.833
P	A	0, -0.203, 0.635, 1.473, 3.506 max_d=3.506 avg_d=0.635 std_dev=0.838
N7	B	0, -0.267, 0.593, 1.454, 4.571 max_d=4.571 avg_d=0.593 std_dev=0.860
OP2	A	0, -0.244, 0.656, 1.556, 4.476 max_d=4.476 avg_d=0.656 std_dev=0.900
C6	B	0, -0.323, 0.619, 1.561, 5.138 max_d=5.138 avg_d=0.619 std_dev=0.942
N1	B	0, -0.348, 0.610, 1.567, 5.688 max_d=5.688 avg_d=0.610 std_dev=0.958
P	B	0, -0.311, 0.673, 1.658, 5.893 max_d=5.893 avg_d=0.673 std_dev=0.985
N6	B	0, -0.396, 0.742, 1.880, 6.054 max_d=6.054 avg_d=0.742 std_dev=1.138
OP2	B	0, -0.541, 0.752, 2.046, 8.393 max_d=8.393 avg_d=0.752 std_dev=1.294
OP1	A	0, -0.465, 0.872, 2.209, 5.701 max_d=5.701 avg_d=0.872 std_dev=1.337

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.12	0.11	0.20	0.11
C2	0.01	0.00	0.10	0.07	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.09	0.06	0.21	0.20	0.37	0.24
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.01	0.08	0.03	0.17	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.31	0.17
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.02	0.12	0.03	0.07	0.07	0.13	0.01	0.01	0.01	0.19	0.23	0.35	0.20
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.27	0.32	0.56	0.37
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.05	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.23	0.05
C5	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.05	0.28	0.33	0.57	0.38
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.16	0.00	0.17	0.00	0.14	0.09	0.14	0.18	0.09	0.03	0.03	0.01	0.01	0.17	0.24	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.06	0.25	0.25	0.44	0.30
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.20	0.18	0.33	0.22
N3	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.05	0.24	0.27	0.47	0.31
N4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.28	0.38	0.63	0.41
O2	0.03	0.00	0.17	0.13	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.17	0.09	0.19	0.18	0.30	0.20
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.07	0.02	0.09	0.04	0.19	0.00	0.03	0.03	0.04	0.11	0.32	0.11
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.12	0.03	0.13	0.03	0.08	0.07	0.17	0.03	0.00	0.01	0.20	0.27	0.47	0.22
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.09	0.03	0.01	0.00	0.12	0.14	0.08	0.08
O5'	0.12	0.21	0.14	0.19	0.27	0.01	0.28	0.01	0.25	0.20	0.24	0.28	0.19	0.04	0.20	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.20	0.16	0.23	0.32	0.11	0.33	0.17	0.25	0.18	0.27	0.38	0.18	0.11	0.27	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.37	0.31	0.35	0.56	0.23	0.57	0.24	0.44	0.33	0.47	0.63	0.30	0.32	0.47	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.24	0.17	0.20	0.37	0.05	0.38	0.01	0.30	0.22	0.31	0.41	0.20	0.11	0.22	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.61	0.16	0.22	0.29	0.16	0.28	0.17	0.42	0.12	0.58	0.46	0.42	0.15	0.14	0.18	0.33	0.14	0.15	0.20	0.14	0.15
C2	0.12	0.51	0.16	0.21	0.23	0.16	0.20	0.17	0.32	0.13	0.46	0.40	0.30	0.12	0.12	0.18	0.31	0.14	0.16	0.20	0.15	0.16
C2'	0.13	0.59	0.13	0.18	0.27	0.13	0.25	0.14	0.39	0.15	0.56	0.46	0.38	0.15	0.14	0.16	0.28	0.16	0.13	0.17	0.13	0.12
C3'	0.10	0.62	0.14	0.19	0.28	0.12	0.26	0.12	0.41	0.14	0.59	0.47	0.40	0.15	0.12	0.18	0.30	0.13	0.11	0.15	0.13	0.10
C4	0.13	0.53	0.12	0.15	0.28	0.11	0.25	0.12	0.34	0.12	0.47	0.44	0.32	0.15	0.15	0.14	0.22	0.14	0.13	0.15	0.17	0.12
C4'	0.11	0.63	0.19	0.25	0.29	0.16	0.28	0.17	0.44	0.10	0.62	0.47	0.45	0.14	0.12	0.22	0.37	0.12	0.15	0.20	0.16	0.15
C5	0.15	0.64	0.11	0.14	0.35	0.11	0.34	0.12	0.46	0.16	0.60	0.51	0.45	0.22	0.20	0.13	0.22	0.16	0.15	0.15	0.23	0.15
C5'	0.16	0.61	0.29	0.35	0.28	0.25	0.27	0.25	0.44	0.13	0.61	0.45	0.45	0.15	0.15	0.31	0.47	0.16	0.22	0.27	0.24	0.22
C6	0.14	0.65	0.12	0.16	0.34	0.12	0.33	0.13	0.47	0.15	0.62	0.51	0.47	0.21	0.19	0.15	0.26	0.14	0.13	0.16	0.19	0.13
N1	0.12	0.59	0.15	0.20	0.29	0.14	0.27	0.15	0.40	0.12	0.56	0.46	0.39	0.15	0.14	0.17	0.30	0.14	0.13	0.18	0.14	0.13
N3	0.12	0.46	0.15	0.20	0.21	0.15	0.18	0.16	0.28	0.13	0.41	0.37	0.26	0.11	0.12	0.18	0.28	0.14	0.14	0.18	0.14	0.15
N4	0.14	0.45	0.10	0.12	0.26	0.11	0.23	0.11	0.29	0.12	0.39	0.41	0.27	0.15	0.16	0.11	0.17	0.15	0.15	0.14	0.21	0.14
O2	0.13	0.47	0.18	0.24	0.19	0.19	0.17	0.20	0.27	0.16	0.42	0.36	0.26	0.12	0.11	0.19	0.35	0.16	0.21	0.23	0.21	0.21
O2'	0.14	0.59	0.13	0.18	0.27	0.15	0.25	0.16	0.38	0.17	0.55	0.45	0.37	0.16	0.15	0.16	0.29	0.17	0.16	0.19	0.15	0.15
O3'	0.11	0.62	0.14	0.17	0.27	0.12	0.25	0.13	0.40	0.17	0.58	0.47	0.39	0.17	0.13	0.17	0.28	0.15	0.12	0.14	0.13	0.11
O4'	0.13	0.66	0.19	0.25	0.32	0.18	0.32	0.19	0.48	0.12	0.65	0.49	0.49	0.18	0.16	0.21	0.37	0.14	0.17	0.22	0.17	0.17
O5'	0.36	0.91	0.23	0.21	0.60	0.24	0.63	0.23	0.79	0.41	0.93	0.72	0.82	0.51	0.44	0.21	0.27	0.36	0.29	0.22	0.39	0.29
OP1	0.51	1.10	0.42	0.42	0.78	0.40	0.84	0.41	1.03	0.59	1.17	0.90	1.09	0.71	0.61	0.35	0.46	0.49	0.49	0.42	0.61	0.50
OP2	0.80	1.32	0.61	0.57	1.06	0.67	1.15	0.70	1.31	0.94	1.41	1.13	1.37	1.06	0.92	0.52	0.43	0.81	0.80	0.71	0.94	0.82
P	0.52	1.09	0.38	0.35	0.78	0.39	0.83	0.40	1.01	0.60	1.14	0.89	1.06	0.71	0.61	0.32	0.32	0.51	0.48	0.38	0.60	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.05	0.17	0.11
C2	0.04	0.00	0.12	0.25	0.00	0.19	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.29	0.07	0.13	0.43	0.13	0.21
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.09	0.12	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.14	0.06
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.12	0.00	0.07	0.01	0.11	0.15	0.19	0.25	0.08	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.11	0.13	0.07
C4	0.02	0.00	0.06	0.12	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.11	0.20	0.25	0.09
C4'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.11	0.15	0.19	0.08	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.22	0.15	0.42	0.20
C5'	0.02	0.30	0.01	0.01	0.16	0.01	0.11	0.00	0.17	0.14	0.25	0.27	0.15	0.11	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.04	0.16	0.25	0.37	0.15
C8	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.16	0.04	0.42	0.20	0.57	0.42
N1	0.03	0.00	0.09	0.19	0.01	0.15	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.22	0.06	0.09	0.38	0.22	0.14
N3	0.04	0.00	0.12	0.25	0.00	0.19	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.27	0.07	0.11	0.36	0.10	0.17
N6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.10	0.04	0.22	0.22	0.48	0.22
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.39	0.18	0.62	0.40
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.21	0.07	0.32	0.19
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.09	0.10	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.09	0.06	0.04
O3'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.12	0.02	0.08	0.03	0.12	0.16	0.22	0.27	0.10	0.13	0.04	0.03	0.00	0.02	0.10	0.17	0.16	0.14
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.12	0.07	0.13	0.12
O5'	0.13	0.13	0.07	0.07	0.11	0.01	0.22	0.01	0.16	0.42	0.09	0.11	0.22	0.39	0.21	0.03	0.10	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.05	0.43	0.09	0.11	0.20	0.06	0.15	0.05	0.25	0.20	0.38	0.36	0.22	0.18	0.07	0.09	0.17	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.13	0.14	0.13	0.25	0.03	0.42	0.04	0.37	0.57	0.22	0.10	0.48	0.62	0.32	0.06	0.16	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.21	0.06	0.07	0.09	0.02	0.20	0.02	0.15	0.42	0.14	0.17	0.22	0.40	0.19	0.04	0.14	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00