Doublet Group distance statistics: 50350

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.018, 0.059, 0.099, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.059 std_dev=0.041
N4	A	0, 0.024, 0.079, 0.134, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.079 std_dev=0.055
O5'	A	0, 0.035, 0.132, 0.228, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.132 std_dev=0.097
C2'	A	0, 0.027, 0.126, 0.225, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.126 std_dev=0.099
O2'	A	0, 0.036, 0.140, 0.244, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.140 std_dev=0.104
O4'	A	0, -0.012, 0.135, 0.282, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.135 std_dev=0.147
P	A	0, 0.025, 0.188, 0.351, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.188 std_dev=0.163
C1'	B	0, 0.067, 0.284, 0.501, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.284 std_dev=0.217
C3'	A	0, -0.023, 0.218, 0.458, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.218 std_dev=0.240
C4'	A	0, -0.052, 0.198, 0.447, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.198 std_dev=0.250
C5'	A	0, -0.026, 0.270, 0.567, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.270 std_dev=0.296
O3'	A	0, -0.065, 0.312, 0.690, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.312 std_dev=0.378
O2'	B	0, -0.022, 0.359, 0.740, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.359 std_dev=0.381
C2'	B	0, -0.060, 0.373, 0.805, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.373 std_dev=0.433
N9	B	0, -0.064, 0.537, 1.138, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.537 std_dev=0.601
OP1	A	0, -0.143, 0.544, 1.232, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.544 std_dev=0.688
O4'	B	0, -0.178, 0.723, 1.624, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.723 std_dev=0.901
C4	B	0, -0.178, 0.736, 1.651, 2.302 max_d=2.302 avg_d=0.736 std_dev=0.915
C3'	B	0, -0.292, 0.720, 1.732, 2.461 max_d=2.461 avg_d=0.720 std_dev=1.012
O3'	B	0, -0.318, 0.780, 1.879, 2.673 max_d=2.673 avg_d=0.780 std_dev=1.098
OP2	A	0, -0.406, 0.748, 1.903, 2.745 max_d=2.745 avg_d=0.748 std_dev=1.154
C8	B	0, -0.275, 0.888, 2.051, 2.884 max_d=2.884 avg_d=0.888 std_dev=1.163
C4'	B	0, -0.344, 0.895, 2.133, 3.029 max_d=3.029 avg_d=0.895 std_dev=1.239
N3	B	0, -0.320, 0.935, 2.190, 3.095 max_d=3.095 avg_d=0.935 std_dev=1.255
C5	B	0, -0.297, 0.995, 2.286, 3.214 max_d=3.214 avg_d=0.995 std_dev=1.292
N7	B	0, -0.351, 1.096, 2.543, 3.584 max_d=3.584 avg_d=1.096 std_dev=1.447
C6	B	0, -0.447, 1.283, 3.014, 4.264 max_d=4.264 avg_d=1.283 std_dev=1.730
C2	B	0, -0.526, 1.272, 3.069, 4.374 max_d=4.374 avg_d=1.272 std_dev=1.798
N1	B	0, -0.562, 1.406, 3.374, 4.801 max_d=4.801 avg_d=1.406 std_dev=1.968
C5'	B	0, -0.661, 1.407, 3.475, 4.980 max_d=4.980 avg_d=1.407 std_dev=2.068
N6	B	0, -0.560, 1.547, 3.655, 5.180 max_d=5.180 avg_d=1.547 std_dev=2.108
O5'	B	0, -0.779, 1.476, 3.731, 5.373 max_d=5.373 avg_d=1.476 std_dev=2.255
P	B	0, -1.108, 1.974, 5.057, 7.304 max_d=7.304 avg_d=1.974 std_dev=3.082
OP2	B	0, -1.201, 2.109, 5.419, 7.833 max_d=7.833 avg_d=2.109 std_dev=3.310
OP1	B	0, -1.262, 2.230, 5.723, 8.269 max_d=8.269 avg_d=2.230 std_dev=3.492

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.35	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.03	0.50	0.44	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.07	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.21	0.15
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.12	0.00	0.09	0.03	0.06	0.07	0.13	0.14	0.10	0.02	0.00	0.01	0.13	0.04	0.14	0.15
C4	0.00	0.00	0.05	0.12	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.01	0.07	0.60	0.67	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.21	0.03
C5	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.01	0.08	0.61	0.65	0.14
C5'	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.20	0.40	0.01
C6	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.06	0.55	0.47	0.13
N1	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.48	0.36	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.02	0.05	0.56	0.59	0.14
N4	0.00	0.00	0.06	0.14	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.18	0.01	0.09	0.62	0.76	0.14
O2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.01	0.46	0.37	0.12
O2'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.00	0.03	0.04	0.06	0.17	0.04	0.07
O3'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.15	0.01	0.11	0.02	0.07	0.07	0.15	0.18	0.12	0.03	0.00	0.01	0.15	0.21	0.08	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.06	0.33	0.13	0.04
O5'	0.02	0.03	0.11	0.13	0.07	0.02	0.08	0.00	0.06	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.15	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.35	0.50	0.14	0.04	0.60	0.04	0.61	0.20	0.55	0.48	0.56	0.62	0.46	0.17	0.21	0.33	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.44	0.21	0.14	0.67	0.21	0.65	0.40	0.47	0.36	0.59	0.76	0.37	0.04	0.08	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.12	0.15	0.15	0.14	0.03	0.14	0.01	0.13	0.11	0.14	0.14	0.12	0.07	0.14	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	1.49	0.23	0.19	0.68	0.85	0.71	1.15	1.11	0.02	1.48	1.09	1.13	0.31	0.18	0.16	0.19	0.74	0.81	1.19	0.66	0.99
C2	0.15	1.30	0.18	0.28	0.57	0.91	0.53	1.21	0.87	0.10	1.22	0.99	0.84	0.15	0.10	0.21	0.29	0.76	0.91	1.26	0.80	1.08
C2'	0.21	1.51	0.13	0.36	0.62	1.04	0.60	1.43	1.04	0.16	1.47	1.09	1.03	0.15	0.07	0.15	0.37	0.88	1.10	1.58	1.01	1.35
C3'	0.28	1.56	0.11	0.37	0.60	1.08	0.61	1.46	1.08	0.20	1.54	1.08	1.10	0.13	0.03	0.10	0.35	0.97	1.12	1.58	1.01	1.36
C4	0.13	1.32	0.24	0.16	0.62	0.76	0.59	0.94	0.90	0.01	1.22	1.05	0.86	0.24	0.16	0.20	0.14	0.71	0.64	0.86	0.49	0.74
C4'	0.16	1.63	0.25	0.15	0.73	0.87	0.79	1.17	1.26	0.03	1.67	1.15	1.31	0.36	0.18	0.14	0.13	0.80	0.81	1.19	0.63	1.00
C5	0.11	1.55	0.29	0.08	0.74	0.66	0.77	0.82	1.14	0.13	1.49	1.16	1.14	0.41	0.24	0.15	0.09	0.65	0.49	0.70	0.29	0.58
C5'	0.12	1.72	0.31	0.06	0.81	0.77	0.91	1.04	1.40	0.13	1.81	1.20	1.48	0.48	0.26	0.15	0.07	0.74	0.65	0.99	0.43	0.82
C6	0.11	1.57	0.28	0.10	0.74	0.73	0.79	0.93	1.18	0.11	1.55	1.15	1.20	0.41	0.23	0.14	0.10	0.69	0.58	0.84	0.38	0.69
N1	0.13	1.46	0.23	0.18	0.67	0.83	0.68	1.10	1.06	0.02	1.42	1.08	1.06	0.29	0.17	0.17	0.18	0.73	0.77	1.10	0.61	0.92
N3	0.15	1.20	0.17	0.29	0.53	0.90	0.47	1.15	0.77	0.12	1.09	0.95	0.73	0.11	0.08	0.24	0.29	0.76	0.87	1.16	0.76	1.01
N4	0.12	1.16	0.25	0.13	0.58	0.67	0.52	0.80	0.76	0.02	1.03	1.00	0.71	0.20	0.15	0.23	0.11	0.67	0.54	0.69	0.40	0.60
O2	0.16	1.22	0.13	0.37	0.51	0.97	0.45	1.33	0.78	0.17	1.13	0.93	0.75	0.07	0.05	0.22	0.40	0.77	1.06	1.48	0.99	1.26
O2'	0.16	1.49	0.17	0.32	0.63	0.98	0.61	1.40	1.03	0.13	1.45	1.08	1.03	0.16	0.11	0.20	0.34	0.81	1.10	1.61	1.03	1.36
O3'	0.33	1.54	0.07	0.46	0.54	1.19	0.54	1.62	1.03	0.30	1.52	1.05	1.04	0.03	0.05	0.09	0.44	1.05	1.29	1.82	1.23	1.58
O4'	0.10	1.58	0.30	0.08	0.76	0.74	0.83	0.99	1.26	0.13	1.62	1.13	1.31	0.45	0.25	0.16	0.09	0.69	0.63	0.97	0.43	0.79
O5'	0.19	1.64	0.21	0.12	0.72	0.81	0.82	1.05	1.31	0.06	1.73	1.11	1.39	0.41	0.18	0.07	0.09	0.78	0.66	0.97	0.44	0.80
OP1	0.72	1.05	0.36	0.52	0.23	1.17	0.46	1.28	0.97	0.27	1.29	0.47	1.17	0.15	0.29	0.65	0.49	1.19	0.85	1.04	0.49	0.89
OP2	0.77	2.58	1.06	0.82	1.73	0.19	1.91	0.06	2.41	1.17	2.76	2.02	2.55	1.55	1.20	0.78	0.77	0.25	0.47	0.21	0.79	0.39
P	0.09	1.85	0.45	0.23	0.98	0.47	1.14	0.63	1.63	0.41	2.01	1.30	1.76	0.77	0.46	0.21	0.26	0.48	0.22	0.46	0.08	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.03	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.14	0.12	0.16	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.07	0.06	0.07	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.07	0.07	0.05
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.13	0.07	0.13	0.09	0.14	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.09	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.15	0.13	0.14	0.15
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.04	0.09	0.08	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.01	0.19	0.18	0.20	0.20
C5'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.08	0.00	0.11	0.00	0.13	0.11	0.11	0.07	0.14	0.13	0.07	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00
C6	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.20	0.20	0.23	0.22
C8	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.19	0.18	0.16	0.19
N1	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.01	0.18	0.17	0.20	0.20
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.12	0.10	0.12	0.13
N6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.17	0.02	0.23	0.24	0.27	0.26
N7	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.21	0.22	0.23	0.23
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.13	0.11	0.10	0.13
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.05	0.15	0.08	0.15	0.09	0.17	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.14	0.19	0.12	0.15
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.08	0.02	0.06
O5'	0.05	0.14	0.04	0.10	0.15	0.01	0.19	0.00	0.20	0.19	0.18	0.12	0.23	0.21	0.13	0.03	0.14	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.12	0.07	0.11	0.13	0.03	0.18	0.05	0.20	0.18	0.17	0.10	0.24	0.22	0.11	0.06	0.19	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.16	0.07	0.09	0.14	0.02	0.20	0.01	0.23	0.16	0.20	0.12	0.27	0.23	0.10	0.06	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.16	0.05	0.10	0.15	0.01	0.20	0.00	0.22	0.19	0.20	0.13	0.26	0.23	0.13	0.03	0.15	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00