Doublet Group distance statistics: 50362

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.020, 0.040, 0.061, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.040 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.028, 0.054, 0.080, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.054 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.028, 0.054, 0.080, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.054 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.029, 0.057, 0.085, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.057 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.029, 0.058, 0.087, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.058 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.081, 0.156, 0.232, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.156 std_dev=0.075
N4	A	0, 0.083, 0.163, 0.243, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.163 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.133, 0.315, 0.497, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.315 std_dev=0.182
O4'	A	0, 0.215, 0.412, 0.608, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.412 std_dev=0.196
O2'	A	0, 0.114, 0.313, 0.512, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.313 std_dev=0.199
C2	B	0, 0.266, 0.496, 0.726, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.496 std_dev=0.230
C4	B	0, 0.144, 0.380, 0.616, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.380 std_dev=0.236
C5	B	0, 0.239, 0.485, 0.732, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.485 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.206, 0.456, 0.706, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.456 std_dev=0.250
C4'	A	0, 0.302, 0.584, 0.866, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.584 std_dev=0.282
N1	B	0, 0.165, 0.448, 0.730, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.448 std_dev=0.282
O4	B	0, 0.110, 0.414, 0.718, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.414 std_dev=0.304
C3'	A	0, 0.289, 0.596, 0.902, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.596 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.203, 0.511, 0.819, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.511 std_dev=0.308
O2	B	0, 0.365, 0.691, 1.018, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.691 std_dev=0.327
C1'	B	0, 0.189, 0.541, 0.893, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.541 std_dev=0.352
O4'	B	0, 0.374, 0.781, 1.189, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.781 std_dev=0.407
O3'	A	0, 0.409, 0.876, 1.343, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.876 std_dev=0.467
C2'	B	0, 0.437, 0.915, 1.392, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.915 std_dev=0.478
C5'	A	0, 0.505, 0.985, 1.465, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.985 std_dev=0.480
O2'	B	0, 0.472, 0.980, 1.488, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.980 std_dev=0.508
C4'	B	0, 0.589, 1.149, 1.709, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.149 std_dev=0.560
C3'	B	0, 0.620, 1.217, 1.814, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.217 std_dev=0.597
P	A	0, 0.804, 1.479, 2.154, 2.350 max_d=2.350 avg_d=1.479 std_dev=0.675
O5'	A	0, 0.714, 1.396, 2.079, 2.169 max_d=2.169 avg_d=1.396 std_dev=0.682
C5'	B	0, 0.798, 1.494, 2.190, 2.176 max_d=2.176 avg_d=1.494 std_dev=0.696
P	B	0, 0.845, 1.547, 2.249, 2.258 max_d=2.258 avg_d=1.547 std_dev=0.702
OP1	A	0, 0.784, 1.514, 2.245, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.514 std_dev=0.731
O3'	B	0, 0.837, 1.598, 2.358, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.598 std_dev=0.761
O5'	B	0, 0.622, 1.385, 2.148, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.385 std_dev=0.763
OP2	A	0, 0.813, 1.636, 2.459, 2.855 max_d=2.855 avg_d=1.636 std_dev=0.823
OP1	B	0, 0.784, 1.633, 2.482, 2.797 max_d=2.797 avg_d=1.633 std_dev=0.849
OP2	B	0, 1.091, 2.051, 3.011, 3.072 max_d=3.072 avg_d=2.051 std_dev=0.960

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.31	0.27	0.03
C2	0.04	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.03	0.06	0.28	0.27	0.05
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.05	0.06	0.13	0.01	0.04	0.01	0.14	0.27	0.32	0.06
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.12	0.06	0.08	0.09	0.13	0.04	0.01	0.02	0.22	0.23	0.34	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.03	0.11	0.22	0.22	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.04	0.06	0.08	0.08	0.02	0.01	0.03	0.27	0.26	0.01
C5	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.14	0.05	0.11	0.21	0.21	0.08
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.06	0.02	0.05	0.09	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.23	0.21	0.01
C6	0.03	0.02	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.13	0.05	0.09	0.25	0.23	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.28	0.26	0.05
N3	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.10	0.02	0.10	0.25	0.26	0.07
N4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.11	0.03	0.14	0.21	0.23	0.13
O2	0.08	0.01	0.13	0.13	0.02	0.08	0.03	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.16	0.07	0.07	0.31	0.28	0.07
O2'	0.03	0.07	0.01	0.04	0.07	0.08	0.06	0.07	0.06	0.03	0.08	0.09	0.13	0.00	0.11	0.07	0.08	0.28	0.31	0.04
O3'	0.02	0.09	0.04	0.01	0.10	0.02	0.14	0.04	0.13	0.05	0.10	0.11	0.16	0.11	0.00	0.01	0.27	0.20	0.37	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.07	0.07	0.01	0.00	0.11	0.33	0.22	0.03
O5'	0.04	0.06	0.14	0.22	0.11	0.03	0.11	0.01	0.09	0.04	0.10	0.14	0.07	0.08	0.27	0.11	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.31	0.28	0.27	0.23	0.22	0.27	0.21	0.23	0.25	0.28	0.25	0.21	0.31	0.28	0.20	0.33	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.27	0.32	0.34	0.22	0.26	0.21	0.21	0.23	0.26	0.26	0.23	0.28	0.31	0.37	0.22	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.05	0.06	0.08	0.09	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.07	0.13	0.07	0.04	0.14	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.17	0.16	0.16	0.11	0.16	0.09	0.18	0.09	0.12	0.15	0.23	0.24	0.18	0.11	0.12	0.15	0.18	0.68	0.16
C2	0.12	0.15	0.16	0.16	0.09	0.15	0.08	0.18	0.07	0.11	0.13	0.21	0.25	0.19	0.09	0.10	0.13	0.20	0.66	0.19
C2'	0.16	0.19	0.18	0.18	0.14	0.17	0.12	0.17	0.12	0.15	0.17	0.24	0.27	0.20	0.14	0.15	0.18	0.28	0.73	0.14
C3'	0.13	0.17	0.15	0.17	0.12	0.18	0.09	0.20	0.09	0.11	0.16	0.23	0.23	0.20	0.12	0.12	0.17	0.19	0.82	0.21
C4	0.13	0.17	0.17	0.16	0.10	0.18	0.09	0.22	0.08	0.12	0.14	0.24	0.28	0.17	0.10	0.13	0.17	0.23	0.55	0.21
C4'	0.10	0.14	0.14	0.15	0.10	0.16	0.09	0.20	0.08	0.09	0.13	0.21	0.22	0.18	0.10	0.11	0.17	0.18	0.75	0.20
C5	0.12	0.18	0.14	0.14	0.12	0.17	0.10	0.22	0.09	0.12	0.16	0.25	0.24	0.13	0.12	0.13	0.19	0.24	0.56	0.20
C5'	0.10	0.15	0.12	0.14	0.12	0.16	0.13	0.20	0.11	0.10	0.15	0.21	0.20	0.16	0.12	0.12	0.19	0.21	0.73	0.22
C6	0.11	0.17	0.13	0.13	0.11	0.16	0.09	0.21	0.08	0.11	0.16	0.24	0.22	0.13	0.12	0.12	0.18	0.15	0.62	0.19
N1	0.12	0.16	0.15	0.15	0.11	0.16	0.08	0.19	0.08	0.11	0.15	0.23	0.23	0.16	0.11	0.11	0.15	0.14	0.66	0.18
N3	0.14	0.15	0.18	0.18	0.09	0.17	0.08	0.20	0.08	0.11	0.13	0.22	0.28	0.20	0.09	0.11	0.13	0.19	0.60	0.20
N4	0.17	0.18	0.22	0.19	0.09	0.20	0.10	0.22	0.09	0.13	0.14	0.26	0.32	0.19	0.09	0.16	0.17	0.34	0.46	0.21
O2	0.11	0.12	0.15	0.16	0.08	0.13	0.07	0.17	0.07	0.09	0.11	0.18	0.23	0.20	0.08	0.09	0.12	0.31	0.71	0.21
O2'	0.19	0.21	0.21	0.20	0.17	0.18	0.17	0.17	0.17	0.19	0.20	0.25	0.29	0.21	0.17	0.19	0.20	0.41	0.69	0.11
O3'	0.13	0.17	0.16	0.18	0.12	0.18	0.09	0.21	0.09	0.12	0.16	0.23	0.24	0.21	0.13	0.13	0.18	0.21	0.88	0.23
O4'	0.11	0.15	0.13	0.15	0.11	0.16	0.09	0.19	0.08	0.10	0.15	0.22	0.21	0.17	0.11	0.11	0.15	0.15	0.68	0.18
O5'	0.10	0.15	0.11	0.13	0.18	0.17	0.21	0.24	0.18	0.12	0.16	0.20	0.19	0.16	0.18	0.14	0.20	0.36	0.77	0.29
OP1	0.21	0.25	0.21	0.21	0.24	0.22	0.23	0.24	0.23	0.22	0.25	0.29	0.23	0.26	0.22	0.20	0.21	0.33	0.62	0.20
OP2	0.23	0.13	0.26	0.30	0.12	0.33	0.20	0.37	0.22	0.18	0.09	0.18	0.34	0.30	0.09	0.29	0.45	0.37	0.56	0.33
P	0.11	0.14	0.13	0.14	0.16	0.17	0.18	0.20	0.16	0.12	0.15	0.18	0.20	0.15	0.15	0.14	0.24	0.29	0.59	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.00	0.06	0.34	0.21	0.03
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.02	0.13	0.50	0.43	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.03	0.09	0.01	0.04	0.03	0.01	0.08	0.23	0.32	0.08
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.15	0.16	0.33	0.10
C4	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.18	0.70	0.52	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.03	0.01	0.03	0.09	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.04	0.20	0.72	0.46	0.09
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.18	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.02	0.03	0.19	0.61	0.37	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.14	0.48	0.35	0.05
N3	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02	0.02	0.15	0.61	0.50	0.07
O2	0.05	0.01	0.09	0.09	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.04	0.05	0.11	0.43	0.42	0.07
O2'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.08	0.00	0.07	0.06	0.05	0.08	0.12	0.24	0.05
O3'	0.03	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.04	0.10	0.07	0.00	0.03	0.02	0.22	0.21	0.37	0.12
O4	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.03	0.00	0.04	0.18	0.75	0.56	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.09	0.30	0.06	0.06
O5'	0.06	0.13	0.08	0.15	0.18	0.03	0.20	0.01	0.19	0.14	0.15	0.11	0.08	0.22	0.18	0.09	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.34	0.50	0.23	0.16	0.70	0.09	0.72	0.18	0.61	0.48	0.61	0.43	0.12	0.21	0.75	0.30	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.43	0.32	0.33	0.52	0.11	0.46	0.16	0.37	0.35	0.50	0.42	0.24	0.37	0.56	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.06	0.08	0.10	0.08	0.02	0.09	0.02	0.08	0.05	0.07	0.07	0.05	0.12	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00