Doublet Group distance statistics: 50363

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C1'	A	0, -0.002, 0.020, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.035, 0.084, 0.134, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.084 std_dev=0.050
O2	A	0, 0.026, 0.076, 0.127, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.076 std_dev=0.050
O2	B	0, 0.113, 0.281, 0.450, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.281 std_dev=0.169
O4'	A	0, 0.003, 0.180, 0.357, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.180 std_dev=0.177
O2'	B	0, 0.110, 0.300, 0.489, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.300 std_dev=0.190
C2'	A	0, 0.046, 0.244, 0.441, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.244 std_dev=0.197
C2	B	0, 0.142, 0.357, 0.572, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.357 std_dev=0.215
N3	B	0, 0.155, 0.379, 0.604, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.379 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.110, 0.356, 0.602, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.356 std_dev=0.246
N1	B	0, 0.178, 0.451, 0.725, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.451 std_dev=0.273
C4	B	0, 0.191, 0.474, 0.756, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.474 std_dev=0.283
O4	B	0, 0.181, 0.468, 0.756, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.468 std_dev=0.287
C4'	A	0, 0.012, 0.300, 0.588, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.300 std_dev=0.288
C1'	B	0, 0.167, 0.458, 0.749, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.458 std_dev=0.291
O2'	A	0, 0.082, 0.383, 0.684, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.383 std_dev=0.301
C3'	A	0, 0.040, 0.348, 0.656, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.348 std_dev=0.308
O5'	A	0, 0.150, 0.480, 0.810, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.480 std_dev=0.330
C6	B	0, 0.232, 0.574, 0.916, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.574 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.241, 0.589, 0.937, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.589 std_dev=0.348
O3'	A	0, 0.045, 0.504, 0.962, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.504 std_dev=0.458
C5'	A	0, 0.078, 0.547, 1.016, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.547 std_dev=0.469
C3'	B	0, 0.191, 0.665, 1.138, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.665 std_dev=0.474
O4'	B	0, 0.270, 0.754, 1.238, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.754 std_dev=0.484
P	A	0, 0.121, 0.609, 1.097, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.609 std_dev=0.488
OP2	A	0, 0.181, 0.731, 1.281, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.731 std_dev=0.550
C4'	B	0, 0.269, 0.828, 1.387, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.828 std_dev=0.559
O5'	B	0, 0.335, 0.903, 1.471, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.903 std_dev=0.568
OP1	A	0, 0.122, 0.726, 1.331, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.726 std_dev=0.605
O3'	B	0, 0.179, 0.788, 1.398, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.788 std_dev=0.609
C5'	B	0, 0.371, 1.146, 1.922, 2.064 max_d=2.064 avg_d=1.146 std_dev=0.776
P	B	0, 0.363, 1.160, 1.957, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.160 std_dev=0.797
OP2	B	0, 0.363, 1.192, 2.021, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.192 std_dev=0.829
OP1	B	0, 0.405, 1.327, 2.249, 2.433 max_d=2.433 avg_d=1.327 std_dev=0.922

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.10	0.02	0.02	0.00	0.07	0.04	0.05	0.03
C2	0.04	0.00	0.08	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.04	0.05	0.17	0.17	0.21	0.14
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.15	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.07	0.04
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.11	0.00	0.12	0.04	0.02	0.05	0.11	0.03	0.01	0.01	0.05	0.14	0.08	0.07
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.05	0.02	0.29	0.33	0.38	0.30
C4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.03	0.06	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.11	0.00	0.11	0.00	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.12	0.02	0.33	0.35	0.37	0.32
C5'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.19	0.00	0.24	0.00	0.21	0.10	0.13	0.20	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.05	0.12	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.13	0.01	0.28	0.25	0.23	0.21
N1	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.10	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.17	0.15	0.15	0.11
N3	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.13	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.11	0.03	0.04	0.24	0.27	0.31	0.24
N4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.06	0.02	0.20	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.08	0.05	0.03	0.31	0.38	0.43	0.35
O2	0.10	0.01	0.15	0.11	0.02	0.11	0.02	0.07	0.04	0.05	0.03	0.05	0.00	0.22	0.14	0.10	0.10	0.10	0.15	0.07
O2'	0.02	0.12	0.01	0.03	0.07	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.11	0.08	0.22	0.00	0.04	0.07	0.06	0.11	0.07	0.04
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.12	0.03	0.13	0.04	0.03	0.05	0.14	0.04	0.00	0.01	0.06	0.17	0.09	0.09
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.10	0.07	0.01	0.00	0.05	0.07	0.12	0.11
O5'	0.07	0.17	0.06	0.05	0.29	0.00	0.33	0.00	0.28	0.17	0.24	0.31	0.10	0.06	0.06	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.04	0.17	0.11	0.14	0.33	0.04	0.35	0.03	0.25	0.15	0.27	0.38	0.10	0.11	0.17	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.21	0.07	0.08	0.38	0.03	0.37	0.02	0.23	0.15	0.31	0.43	0.15	0.07	0.09	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02
P	0.03	0.14	0.04	0.07	0.30	0.03	0.32	0.01	0.21	0.11	0.24	0.35	0.07	0.04	0.09	0.11	0.00	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.06	0.08	0.11	0.09	0.13	0.07	0.13	0.06	0.06	0.07	0.07	0.05	0.20	0.11	0.23	0.10	0.08	0.17	0.14
C2	0.14	0.03	0.06	0.07	0.05	0.15	0.03	0.15	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.15	0.07	0.24	0.13	0.09	0.19	0.15
C2'	0.16	0.09	0.09	0.08	0.09	0.17	0.10	0.20	0.10	0.10	0.09	0.10	0.02	0.18	0.08	0.28	0.16	0.14	0.25	0.21
C3'	0.26	0.19	0.04	0.04	0.18	0.27	0.20	0.31	0.21	0.21	0.18	0.18	0.10	0.07	0.16	0.39	0.27	0.26	0.38	0.33
C4	0.15	0.04	0.04	0.04	0.04	0.14	0.04	0.14	0.05	0.06	0.04	0.06	0.08	0.10	0.05	0.22	0.12	0.09	0.19	0.15
C4'	0.25	0.18	0.05	0.02	0.15	0.23	0.16	0.25	0.18	0.19	0.16	0.18	0.13	0.09	0.13	0.35	0.23	0.21	0.33	0.28
C5	0.15	0.05	0.04	0.07	0.06	0.12	0.05	0.12	0.05	0.06	0.05	0.07	0.08	0.14	0.08	0.22	0.10	0.08	0.18	0.14
C5'	0.41	0.35	0.21	0.18	0.32	0.38	0.33	0.41	0.34	0.36	0.33	0.34	0.28	0.08	0.29	0.50	0.38	0.38	0.51	0.45
C6	0.15	0.05	0.05	0.08	0.08	0.13	0.06	0.13	0.05	0.07	0.06	0.07	0.08	0.16	0.10	0.23	0.10	0.08	0.18	0.14
N1	0.14	0.05	0.07	0.09	0.08	0.13	0.06	0.13	0.05	0.06	0.07	0.06	0.06	0.17	0.10	0.23	0.10	0.08	0.18	0.14
N3	0.14	0.03	0.05	0.05	0.04	0.15	0.03	0.15	0.05	0.06	0.03	0.06	0.06	0.12	0.05	0.23	0.13	0.09	0.19	0.15
N4	0.15	0.04	0.03	0.02	0.05	0.14	0.05	0.15	0.06	0.06	0.04	0.06	0.09	0.05	0.05	0.21	0.13	0.10	0.20	0.15
O2	0.16	0.03	0.06	0.08	0.03	0.18	0.02	0.19	0.05	0.07	0.02	0.05	0.10	0.16	0.06	0.26	0.17	0.13	0.21	0.18
O2'	0.12	0.07	0.15	0.16	0.08	0.11	0.08	0.13	0.07	0.07	0.08	0.08	0.07	0.28	0.08	0.22	0.10	0.08	0.19	0.15
O3'	0.28	0.22	0.04	0.06	0.23	0.30	0.25	0.36	0.25	0.24	0.22	0.20	0.08	0.06	0.22	0.42	0.32	0.31	0.44	0.39
O4'	0.15	0.07	0.05	0.09	0.09	0.13	0.08	0.13	0.07	0.08	0.07	0.08	0.09	0.17	0.11	0.23	0.10	0.08	0.18	0.14
O5'	0.51	0.44	0.33	0.31	0.39	0.50	0.42	0.53	0.43	0.45	0.41	0.43	0.40	0.23	0.35	0.60	0.49	0.49	0.61	0.55
OP1	0.65	0.60	0.45	0.43	0.59	0.64	0.60	0.68	0.61	0.61	0.59	0.56	0.50	0.33	0.56	0.76	0.66	0.68	0.81	0.75
OP2	0.69	0.62	0.52	0.50	0.58	0.68	0.60	0.71	0.62	0.64	0.60	0.60	0.57	0.42	0.52	0.77	0.67	0.69	0.80	0.75
P	0.60	0.54	0.41	0.38	0.51	0.57	0.52	0.60	0.53	0.55	0.52	0.52	0.47	0.29	0.47	0.68	0.58	0.59	0.71	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01
C2	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.04	0.03	0.14	0.07
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.17	0.10
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.15	0.10	0.18	0.14
C4	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.05	0.05	0.16	0.09
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.07	0.17	0.10
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.16	0.10
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.13	0.07
N3	0.02	0.00	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.01	0.02	0.05	0.04	0.15	0.07
O2	0.07	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.03	0.09	0.04	0.03	0.14	0.08
O2'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.10	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.00	0.06	0.01	0.19	0.14	0.20	0.18
O4	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.00	0.03	0.06	0.06	0.16	0.09
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.09	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.11	0.04	0.07
O5'	0.02	0.04	0.09	0.15	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.19	0.06	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.03	0.05	0.10	0.05	0.06	0.07	0.07	0.06	0.03	0.04	0.03	0.04	0.14	0.06	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02
OP2	0.07	0.14	0.17	0.18	0.16	0.03	0.17	0.02	0.16	0.13	0.15	0.14	0.10	0.20	0.16	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.01	0.07	0.10	0.14	0.09	0.01	0.10	0.01	0.10	0.07	0.07	0.08	0.04	0.18	0.09	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00