Doublet Group distance statistics: 50364

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.001, 0.020, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.004, 0.024, 0.051, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.024 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.001, 0.045, 0.090, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.045 std_dev=0.045
O2	A	0, -0.001, 0.059, 0.119, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.059 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.009, 0.126, 0.243, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.126 std_dev=0.117
O2'	A	0, 0.031, 0.164, 0.297, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.164 std_dev=0.133
C2'	A	0, 0.006, 0.154, 0.301, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.154 std_dev=0.148
O2'	B	0, 0.065, 0.256, 0.447, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.256 std_dev=0.191
C4'	A	0, 0.015, 0.209, 0.403, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.209 std_dev=0.194
C3'	A	0, 0.004, 0.227, 0.450, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.227 std_dev=0.223
OP1	A	0, 0.047, 0.276, 0.504, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.276 std_dev=0.229
C2'	B	0, 0.090, 0.322, 0.553, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.322 std_dev=0.232
O3'	B	0, 0.038, 0.287, 0.536, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.287 std_dev=0.249
C3'	B	0, 0.072, 0.321, 0.570, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.321 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.064, 0.322, 0.581, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.322 std_dev=0.258
O5'	A	0, -0.036, 0.227, 0.490, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.227 std_dev=0.263
O5'	B	0, 0.059, 0.323, 0.587, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.323 std_dev=0.264
O3'	A	0, 0.021, 0.324, 0.626, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.324 std_dev=0.303
C5'	B	0, 0.073, 0.379, 0.685, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.379 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.118, 0.436, 0.753, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.436 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.079, 0.404, 0.729, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.404 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.015, 0.341, 0.666, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.341 std_dev=0.325
P	A	0, -0.007, 0.322, 0.651, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.322 std_dev=0.329
P	B	0, 0.106, 0.443, 0.780, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.443 std_dev=0.337
O4'	B	0, 0.063, 0.408, 0.754, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.408 std_dev=0.345
OP1	B	0, 0.104, 0.508, 0.913, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.508 std_dev=0.405
N1	B	0, 0.076, 0.492, 0.908, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.492 std_dev=0.416
C5	B	0, 0.101, 0.534, 0.967, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.534 std_dev=0.433
OP2	A	0, -0.003, 0.434, 0.871, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.434 std_dev=0.437
OP2	B	0, 0.090, 0.659, 1.227, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.659 std_dev=0.569
C2	B	0, -0.004, 0.640, 1.283, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.640 std_dev=0.643
C4	B	0, 0.026, 0.681, 1.336, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.681 std_dev=0.655
N3	B	0, -0.024, 0.718, 1.459, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.718 std_dev=0.741
O2	B	0, -0.031, 0.712, 1.455, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.712 std_dev=0.743
O4	B	0, -0.002, 0.797, 1.595, 2.127 max_d=2.127 avg_d=0.797 std_dev=0.799

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.08	0.09	0.07	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.03	0.10	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.16	0.17	0.17	0.18
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.07	0.01	0.03	0.04	0.12	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.14	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03
C4	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.11	0.14	0.11	0.15
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.09	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.08	0.12	0.06	0.12
C5'	0.04	0.10	0.03	0.02	0.05	0.02	0.04	0.00	0.04	0.07	0.10	0.04	0.13	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01
C6	0.02	0.03	0.07	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.02	0.09	0.12	0.06	0.12
N1	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.13	0.14	0.11	0.13
N3	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.04	0.03	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.16	0.17	0.17	0.18
N4	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.08	0.12	0.09	0.13
O2	0.06	0.01	0.12	0.14	0.01	0.09	0.04	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.15	0.05	0.19	0.19	0.21	0.20
O2'	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.08	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.15	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.07	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.06	0.11	0.05	0.06
O5'	0.08	0.16	0.04	0.02	0.11	0.02	0.08	0.00	0.09	0.13	0.16	0.08	0.19	0.06	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01
OP1	0.09	0.17	0.02	0.04	0.14	0.05	0.12	0.07	0.12	0.14	0.17	0.12	0.19	0.04	0.11	0.11	0.04	0.00	0.03	0.04
OP2	0.07	0.17	0.06	0.06	0.11	0.04	0.06	0.04	0.06	0.11	0.17	0.09	0.21	0.08	0.07	0.05	0.01	0.03	0.00	0.00
P	0.08	0.18	0.04	0.03	0.15	0.02	0.12	0.01	0.12	0.13	0.18	0.13	0.20	0.05	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.03	0.09	0.05	0.09	0.04	0.10	0.11	0.06	0.03	0.04	0.04	0.16	0.08	0.13	0.04	0.14	0.42	0.16	0.15
C2	0.08	0.04	0.11	0.07	0.05	0.05	0.05	0.09	0.04	0.05	0.03	0.04	0.16	0.12	0.07	0.05	0.18	0.34	0.03	0.07
C2'	0.05	0.02	0.07	0.04	0.11	0.03	0.14	0.11	0.09	0.02	0.03	0.04	0.14	0.08	0.15	0.03	0.09	0.45	0.21	0.19
C3'	0.04	0.02	0.06	0.03	0.10	0.03	0.15	0.13	0.10	0.02	0.02	0.05	0.13	0.05	0.15	0.02	0.06	0.47	0.21	0.21
C4	0.13	0.10	0.13	0.04	0.06	0.04	0.05	0.07	0.07	0.10	0.09	0.08	0.18	0.03	0.04	0.10	0.15	0.32	0.08	0.04
C4'	0.06	0.03	0.09	0.04	0.09	0.03	0.11	0.12	0.07	0.02	0.02	0.05	0.16	0.07	0.13	0.03	0.11	0.43	0.19	0.18
C5	0.15	0.12	0.13	0.04	0.06	0.04	0.04	0.07	0.07	0.11	0.10	0.11	0.19	0.03	0.04	0.12	0.14	0.36	0.04	0.06
C5'	0.04	0.02	0.06	0.05	0.10	0.06	0.13	0.16	0.09	0.03	0.03	0.04	0.13	0.05	0.14	0.02	0.07	0.47	0.20	0.21
C6	0.13	0.09	0.12	0.05	0.03	0.05	0.02	0.07	0.04	0.09	0.07	0.09	0.19	0.05	0.02	0.10	0.16	0.38	0.02	0.08
N1	0.10	0.06	0.11	0.06	0.04	0.05	0.05	0.09	0.03	0.05	0.03	0.06	0.18	0.08	0.07	0.06	0.16	0.38	0.07	0.10
N3	0.11	0.07	0.13	0.08	0.04	0.05	0.03	0.07	0.05	0.07	0.06	0.05	0.17	0.10	0.03	0.07	0.18	0.31	0.07	0.03
N4	0.14	0.11	0.11	0.01	0.08	0.03	0.07	0.08	0.09	0.11	0.11	0.09	0.17	0.06	0.08	0.10	0.10	0.31	0.12	0.04
O2	0.06	0.05	0.10	0.09	0.09	0.05	0.09	0.10	0.07	0.05	0.05	0.06	0.14	0.16	0.12	0.04	0.20	0.33	0.07	0.09
O2'	0.06	0.02	0.08	0.05	0.12	0.05	0.14	0.07	0.08	0.03	0.04	0.04	0.15	0.10	0.17	0.04	0.13	0.39	0.22	0.16
O3'	0.03	0.01	0.05	0.03	0.13	0.04	0.18	0.13	0.14	0.04	0.04	0.05	0.11	0.05	0.17	0.03	0.04	0.47	0.25	0.23
O4'	0.09	0.05	0.12	0.06	0.07	0.04	0.08	0.11	0.04	0.04	0.03	0.05	0.19	0.09	0.11	0.06	0.15	0.41	0.15	0.14
O5'	0.02	0.02	0.03	0.08	0.11	0.09	0.14	0.20	0.11	0.04	0.04	0.02	0.09	0.08	0.13	0.04	0.02	0.51	0.20	0.23
OP1	0.05	0.04	0.04	0.10	0.07	0.09	0.12	0.18	0.09	0.03	0.03	0.06	0.08	0.11	0.10	0.04	0.03	0.50	0.18	0.22
OP2	0.08	0.08	0.09	0.09	0.06	0.11	0.12	0.21	0.10	0.06	0.07	0.10	0.13	0.09	0.07	0.07	0.05	0.51	0.15	0.23
P	0.04	0.03	0.05	0.11	0.10	0.12	0.14	0.22	0.12	0.05	0.04	0.03	0.08	0.12	0.12	0.06	0.02	0.52	0.18	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.16	0.15	0.20	0.02
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.03	0.26	0.13	0.16	0.06
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.19	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.10	0.23	0.04
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.16	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.09	0.24	0.08
C4	0.03	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.31	0.09	0.10	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.16	0.20	0.03
C5	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.30	0.06	0.14	0.08
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.20	0.17	0.01
C6	0.02	0.03	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.08	0.02	0.08	0.26	0.07	0.20	0.05
N1	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.23	0.12	0.19	0.04
N3	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.09	0.03	0.02	0.29	0.11	0.13	0.07
O2	0.04	0.01	0.19	0.16	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.18	0.20	0.06	0.03	0.26	0.18	0.15	0.07
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.18	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00	0.13	0.22	0.04
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.09	0.20	0.03	0.00	0.05	0.01	0.20	0.05	0.25	0.14
O4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.05	0.00	0.04	0.35	0.11	0.03	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.19	0.20	0.15	0.06
O5'	0.16	0.26	0.04	0.05	0.31	0.01	0.30	0.00	0.26	0.23	0.29	0.26	0.00	0.20	0.35	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.15	0.13	0.10	0.09	0.09	0.16	0.06	0.20	0.07	0.12	0.11	0.18	0.13	0.05	0.11	0.20	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.16	0.23	0.24	0.10	0.20	0.14	0.17	0.20	0.19	0.13	0.15	0.22	0.25	0.03	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.06	0.04	0.08	0.09	0.03	0.08	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.14	0.14	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00