Doublet Group distance statistics: 50366

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.005, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C3'	B	0, 0.000, 0.303, 0.606, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.303 std_dev=0.303
O2'	B	0, 0.000, 0.402, 0.803, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.402 std_dev=0.402
O4'	A	0, 0.000, 0.428, 0.856, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.428 std_dev=0.428
C2'	A	0, 0.000, 0.447, 0.894, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C2'	B	0, 0.000, 0.505, 1.009, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.505 std_dev=0.505
O5'	A	0, 0.000, 0.610, 1.220, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.610 std_dev=0.610
C4'	A	0, 0.000, 0.753, 1.505, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.753 std_dev=0.753
O3'	B	0, 0.000, 0.779, 1.557, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.779 std_dev=0.779
P	A	0, 0.000, 0.823, 1.646, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.823 std_dev=0.823
C3'	A	0, 0.000, 0.836, 1.672, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.836 std_dev=0.836
O2'	A	0, 0.000, 0.843, 1.686, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.843 std_dev=0.843
C5'	A	0, 0.000, 0.870, 1.740, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.870 std_dev=0.870
C4'	B	0, 0.000, 1.220, 2.441, 2.441 max_d=2.441 avg_d=1.220 std_dev=1.220
O3'	A	0, 0.000, 1.387, 2.774, 2.774 max_d=2.774 avg_d=1.387 std_dev=1.387
C1'	B	0, 0.000, 1.454, 2.907, 2.907 max_d=2.907 avg_d=1.454 std_dev=1.454
OP1	A	0, 0.000, 1.507, 3.014, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.507 std_dev=1.507
C5'	B	0, 0.000, 1.674, 3.348, 3.348 max_d=3.348 avg_d=1.674 std_dev=1.674
O5'	B	0, 0.000, 1.840, 3.681, 3.681 max_d=3.681 avg_d=1.840 std_dev=1.840
O4'	B	0, 0.000, 1.879, 3.759, 3.759 max_d=3.759 avg_d=1.879 std_dev=1.879
OP2	A	0, 0.000, 2.119, 4.237, 4.237 max_d=4.237 avg_d=2.119 std_dev=2.119
N1	B	0, 0.000, 2.366, 4.732, 4.732 max_d=4.732 avg_d=2.366 std_dev=2.366
OP1	B	0, 0.000, 2.488, 4.976, 4.976 max_d=4.976 avg_d=2.488 std_dev=2.488
P	B	0, 0.000, 2.603, 5.205, 5.205 max_d=5.205 avg_d=2.603 std_dev=2.603
O2	B	0, 0.000, 2.650, 5.300, 5.300 max_d=5.300 avg_d=2.650 std_dev=2.650
C2	B	0, 0.000, 2.907, 5.814, 5.814 max_d=5.814 avg_d=2.907 std_dev=2.907
C6	B	0, 0.000, 2.913, 5.827, 5.827 max_d=5.827 avg_d=2.913 std_dev=2.913
OP2	B	0, 0.000, 2.999, 5.999, 5.999 max_d=5.999 avg_d=2.999 std_dev=2.999
C5	B	0, 0.000, 3.795, 7.590, 7.590 max_d=7.590 avg_d=3.795 std_dev=3.795
N3	B	0, 0.000, 3.905, 7.809, 7.809 max_d=7.809 avg_d=3.905 std_dev=3.905
C4	B	0, 0.000, 4.360, 8.721, 8.721 max_d=8.721 avg_d=4.360 std_dev=4.360
O4	B	0, 0.000, 5.264, 10.527, 10.527 max_d=10.527 avg_d=5.264 std_dev=5.264

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.24	0.01	0.10	0.35	0.03	0.14
C2	0.00	0.00	0.13	0.21	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.04	0.03	0.56	0.30	0.04
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.14	0.09	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.32	0.39	0.14	0.33
C3'	0.00	0.21	0.01	0.00	0.29	0.01	0.27	0.01	0.22	0.18	0.27	0.31	0.16	0.03	0.01	0.02	0.00	0.19	0.09	0.05
C4	0.00	0.01	0.02	0.29	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.10	0.00	0.12	0.76	0.53	0.02
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.11	0.07	0.08	0.11	0.02	0.25	0.01	0.01	0.00	0.17	0.19	0.00
C5	0.01	0.02	0.06	0.27	0.00	0.13	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.26	0.14	0.05	0.12	0.80	0.48	0.00
C5'	0.04	0.02	0.14	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.06	0.02	0.05	0.10	0.00	0.09	0.17	0.00	0.00	0.32	0.33	0.00
C6	0.01	0.02	0.09	0.22	0.00	0.11	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.21	0.08	0.07	0.05	0.69	0.27	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.18	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.05	0.00	0.00	0.54	0.19	0.08
N3	0.00	0.00	0.10	0.27	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.02	0.03	0.08	0.66	0.44	0.00
N4	0.01	0.01	0.01	0.31	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.14	0.00	0.16	0.80	0.65	0.07
O2	0.00	0.01	0.23	0.16	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.07	0.00	0.46	0.23	0.05
O2'	0.02	0.15	0.00	0.03	0.27	0.25	0.26	0.09	0.21	0.15	0.22	0.30	0.04	0.00	0.02	0.17	0.21	0.27	0.09	0.24
O3'	0.24	0.07	0.01	0.01	0.10	0.01	0.14	0.17	0.08	0.05	0.02	0.14	0.18	0.02	0.00	0.16	0.16	0.56	0.26	0.28
O4'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.17	0.16	0.00	0.01	0.15	0.14	0.04
O5'	0.10	0.03	0.32	0.00	0.12	0.00	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.16	0.00	0.21	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.35	0.56	0.39	0.19	0.76	0.17	0.80	0.32	0.69	0.54	0.66	0.80	0.46	0.27	0.56	0.15	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.03	0.30	0.14	0.09	0.53	0.19	0.48	0.33	0.27	0.19	0.44	0.65	0.23	0.09	0.26	0.14	0.01	0.02	0.00	0.02
P	0.14	0.04	0.33	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.00	0.07	0.05	0.24	0.28	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.51	0.12	0.03	0.62	0.41	0.36	0.48	0.17	0.20	0.69	0.60	0.10	0.08	0.77	0.44	0.28	0.48	0.09	0.27
C2	0.10	0.42	0.09	0.01	0.48	0.35	0.28	0.40	0.13	0.17	0.55	0.50	0.09	0.06	0.58	0.38	0.23	0.37	0.06	0.19
C2'	0.10	0.62	0.06	0.02	0.79	0.44	0.50	0.48	0.26	0.27	0.85	0.68	0.24	0.03	0.98	0.41	0.25	0.49	0.01	0.23
C3'	0.36	0.43	0.22	0.35	0.61	0.79	0.27	0.86	0.01	0.04	0.69	0.52	0.51	0.39	0.82	0.71	0.62	0.92	0.38	0.63
C4	0.26	0.28	0.08	0.00	0.25	0.50	0.02	0.56	0.11	0.01	0.37	0.43	0.09	0.15	0.33	0.59	0.40	0.57	0.29	0.42
C4'	0.25	0.44	0.03	0.15	0.56	0.63	0.24	0.73	0.03	0.08	0.65	0.55	0.25	0.10	0.73	0.62	0.51	0.80	0.33	0.54
C5	0.28	0.34	0.10	0.01	0.31	0.57	0.04	0.66	0.12	0.01	0.46	0.50	0.10	0.19	0.42	0.67	0.47	0.71	0.36	0.53
C5'	0.29	0.45	0.02	0.15	0.54	0.69	0.19	0.82	0.04	0.05	0.66	0.59	0.25	0.08	0.73	0.70	0.59	0.94	0.44	0.67
C6	0.23	0.41	0.11	0.02	0.44	0.53	0.15	0.62	0.02	0.07	0.56	0.56	0.11	0.15	0.57	0.61	0.42	0.66	0.28	0.47
N1	0.15	0.46	0.11	0.02	0.52	0.43	0.27	0.50	0.10	0.15	0.61	0.57	0.10	0.10	0.65	0.48	0.31	0.51	0.14	0.31
N3	0.15	0.33	0.09	0.01	0.34	0.36	0.16	0.40	0.04	0.09	0.43	0.44	0.08	0.08	0.42	0.41	0.26	0.38	0.12	0.22
N4	0.34	0.17	0.07	0.01	0.08	0.55	0.13	0.60	0.24	0.12	0.22	0.33	0.06	0.20	0.15	0.67	0.47	0.62	0.39	0.49
O2	0.03	0.44	0.08	0.01	0.54	0.26	0.38	0.30	0.24	0.23	0.58	0.47	0.09	0.00	0.64	0.25	0.14	0.24	0.06	0.05
O2'	0.38	1.12	0.50	0.42	1.36	0.03	1.07	0.01	0.81	0.79	1.39	1.15	0.17	0.37	1.57	0.08	0.27	0.05	0.55	0.31
O3'	0.10	0.69	0.05	0.22	0.90	0.59	0.55	0.67	0.28	0.31	0.96	0.76	0.33	0.33	1.12	0.45	0.43	0.75	0.16	0.41
O4'	0.17	0.44	0.11	0.00	0.51	0.48	0.24	0.59	0.06	0.12	0.61	0.55	0.08	0.09	0.65	0.53	0.39	0.63	0.23	0.41
O5'	0.35	0.45	0.05	0.19	0.53	0.78	0.15	0.92	0.09	0.01	0.67	0.61	0.31	0.11	0.72	0.79	0.67	1.06	0.52	0.78
OP1	0.52	1.28	0.86	0.76	1.32	0.13	0.95	0.02	0.73	0.86	1.46	1.44	0.59	0.87	1.49	0.09	0.21	0.25	0.31	0.05
OP2	1.01	0.21	0.71	0.90	0.21	1.51	0.62	1.69	0.85	0.68	0.02	0.01	0.91	0.80	0.02	1.48	1.48	1.96	1.40	1.65
P	0.34	0.48	0.00	0.15	0.52	0.79	0.12	0.95	0.12	0.02	0.69	0.66	0.26	0.04	0.72	0.80	0.71	1.16	0.59	0.86

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.08	0.11	0.15
C2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.06	0.01	0.04	0.08	0.10
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.02	0.11	0.02	0.12	0.02	0.02	0.14	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.11	0.06	0.02
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.22	0.07	0.00	0.14	0.02	0.01	0.11	0.01	0.13	0.21	0.17	0.13
C4	0.04	0.03	0.05	0.11	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.12	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.04
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.13	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05
C5	0.02	0.03	0.11	0.21	0.01	0.12	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.25	0.01	0.00	0.12	0.03	0.00	0.01
C5'	0.03	0.03	0.02	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.17	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.12	0.22	0.01	0.13	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.25	0.01	0.01	0.13	0.02	0.03	0.03
N1	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03	0.05	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.03	0.02	0.03	0.03	0.07	0.09
N3	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.07	0.08
O2	0.08	0.01	0.14	0.14	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.01	0.00	0.10	0.19	0.03	0.11	0.03	0.04	0.08	0.10
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.05	0.08	0.05	0.08	0.01	0.02	0.10	0.00	0.02	0.04	0.05	0.09	0.12	0.06	0.02
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.12	0.01	0.25	0.00	0.25	0.07	0.01	0.19	0.02	0.00	0.13	0.01	0.19	0.38	0.30	0.26
O4	0.05	0.03	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.13	0.00	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.05	0.01	0.03	0.00	0.10	0.20	0.21	0.24
O5'	0.02	0.01	0.07	0.13	0.06	0.01	0.12	0.01	0.13	0.03	0.00	0.03	0.09	0.19	0.06	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.04	0.11	0.21	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.12	0.38	0.02	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.08	0.06	0.17	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.07	0.07	0.08	0.06	0.30	0.02	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.10	0.02	0.13	0.04	0.05	0.01	0.01	0.03	0.09	0.08	0.10	0.02	0.26	0.02	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00