Doublet Group distance statistics: 50367

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C6	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
N4	A	0, 0.000, 0.048, 0.095, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.000, 0.098, 0.196, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.098 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.000, 0.127, 0.253, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.127 std_dev=0.127
C3'	A	0, 0.000, 0.205, 0.410, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.205 std_dev=0.205
C4'	A	0, 0.000, 0.244, 0.487, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.244 std_dev=0.244
O2'	A	0, 0.000, 0.262, 0.524, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.262 std_dev=0.262
O5'	A	0, 0.000, 0.330, 0.661, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.330 std_dev=0.330
O3'	A	0, 0.000, 0.356, 0.713, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.356 std_dev=0.356
C2'	B	0, 0.000, 0.386, 0.772, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.386 std_dev=0.386
C5'	A	0, 0.000, 0.408, 0.816, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.408 std_dev=0.408
P	A	0, 0.000, 0.512, 1.024, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.512 std_dev=0.512
OP2	A	0, 0.000, 0.556, 1.112, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.556 std_dev=0.556
OP1	A	0, 0.000, 0.588, 1.176, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.588 std_dev=0.588
O2'	B	0, 0.000, 0.637, 1.273, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.637 std_dev=0.636
C1'	B	0, 0.000, 1.182, 2.365, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.182 std_dev=1.182
N1	B	0, 0.000, 1.371, 2.742, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.371 std_dev=1.371
C2	B	0, 0.000, 1.603, 3.206, 3.206 max_d=3.206 avg_d=1.603 std_dev=1.603
N3	B	0, 0.000, 1.768, 3.535, 3.535 max_d=3.535 avg_d=1.768 std_dev=1.768
C3'	B	0, 0.000, 1.795, 3.589, 3.589 max_d=3.589 avg_d=1.795 std_dev=1.795
C4	B	0, 0.000, 1.795, 3.591, 3.591 max_d=3.591 avg_d=1.795 std_dev=1.795
O4	B	0, 0.000, 2.016, 4.031, 4.031 max_d=4.031 avg_d=2.016 std_dev=2.016
C6	B	0, 0.000, 2.119, 4.237, 4.237 max_d=4.237 avg_d=2.119 std_dev=2.119
O4'	B	0, 0.000, 2.231, 4.462, 4.462 max_d=4.462 avg_d=2.231 std_dev=2.231
O2	B	0, 0.000, 2.235, 4.470, 4.470 max_d=4.470 avg_d=2.235 std_dev=2.235
C4'	B	0, 0.000, 2.240, 4.480, 4.480 max_d=4.480 avg_d=2.240 std_dev=2.240
C5	B	0, 0.000, 2.299, 4.597, 4.597 max_d=4.597 avg_d=2.299 std_dev=2.299
O3'	B	0, 0.000, 2.548, 5.095, 5.095 max_d=5.095 avg_d=2.548 std_dev=2.548
C5'	B	0, 0.000, 3.720, 7.440, 7.440 max_d=7.440 avg_d=3.720 std_dev=3.720
O5'	B	0, 0.000, 4.145, 8.290, 8.290 max_d=8.290 avg_d=4.145 std_dev=4.145
P	B	0, 0.000, 5.675, 11.349, 11.349 max_d=11.349 avg_d=5.675 std_dev=5.675
OP2	B	0, 0.000, 5.779, 11.559, 11.559 max_d=11.559 avg_d=5.779 std_dev=5.779
OP1	B	0, 0.000, 6.571, 13.142, 13.142 max_d=13.142 avg_d=6.571 std_dev=6.571

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01
C2	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.01	0.08	0.10	0.14	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.08	0.07
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.02	0.08	0.05	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.09	0.10
C4	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.07	0.05	0.17	0.21	0.24	0.22
C4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.04	0.04	0.11	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02
C5	0.03	0.01	0.03	0.10	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.06	0.18	0.21	0.21	0.21
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.19	0.01	0.22	0.00	0.18	0.09	0.13	0.22	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.10	0.01	0.12	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.11	0.05	0.12	0.13	0.11	0.13
N1	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.08	0.08
N3	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.02	0.13	0.15	0.20	0.17
N4	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.05	0.21	0.27	0.31	0.28
O2	0.03	0.01	0.09	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.09	0.01	0.05	0.05	0.12	0.08
O2'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.05	0.16	0.00	0.01	0.03	0.06	0.07	0.07	0.07
O3'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.00	0.01	0.14	0.17	0.15	0.16
O4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.06	0.06	0.06
O5'	0.01	0.08	0.06	0.09	0.17	0.01	0.18	0.01	0.12	0.07	0.13	0.21	0.05	0.06	0.14	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.01	0.10	0.07	0.09	0.21	0.00	0.21	0.04	0.13	0.07	0.15	0.27	0.05	0.07	0.17	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.02	0.14	0.08	0.09	0.24	0.01	0.21	0.01	0.11	0.08	0.20	0.31	0.12	0.07	0.15	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.11	0.07	0.10	0.22	0.02	0.21	0.01	0.13	0.08	0.17	0.28	0.08	0.07	0.16	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.33	0.10	0.76	0.06	0.98	0.46	1.62	0.49	0.09	0.30	0.73	0.27	0.94	0.02	0.56	1.62	2.52	1.88	2.06
C2	0.08	0.34	0.08	0.78	0.05	1.04	0.43	1.66	0.48	0.08	0.29	0.73	0.31	0.97	0.00	0.58	1.59	2.34	1.73	1.94
C2'	0.24	0.18	0.10	0.74	0.25	1.10	0.65	1.79	0.67	0.26	0.13	0.59	0.28	0.77	0.21	0.78	1.80	2.71	2.12	2.30
C3'	0.15	0.18	0.01	0.54	0.18	0.87	0.52	1.47	0.53	0.18	0.14	0.53	0.30	0.55	0.15	0.62	1.47	2.25	1.78	1.92
C4	0.04	0.26	0.08	0.50	0.06	0.55	0.15	0.85	0.17	0.04	0.23	0.46	0.15	0.74	0.08	0.19	0.79	1.16	0.82	0.93
C4'	0.02	0.32	0.01	0.56	0.03	0.76	0.37	1.33	0.39	0.04	0.28	0.66	0.30	0.69	0.00	0.43	1.36	2.18	1.65	1.79
C5	0.07	0.25	0.07	0.43	0.08	0.43	0.10	0.71	0.12	0.06	0.23	0.42	0.10	0.66	0.10	0.11	0.68	1.06	0.73	0.82
C5'	0.14	0.41	0.11	0.34	0.13	0.48	0.15	0.94	0.16	0.12	0.38	0.68	0.36	0.48	0.15	0.18	0.97	1.67	1.22	1.32
C6	0.03	0.29	0.07	0.54	0.04	0.62	0.21	1.02	0.23	0.02	0.27	0.54	0.17	0.76	0.08	0.26	0.99	1.55	1.11	1.24
N1	0.04	0.33	0.08	0.69	0.02	0.88	0.36	1.43	0.39	0.04	0.29	0.67	0.25	0.89	0.03	0.46	1.40	2.13	1.56	1.74
N3	0.04	0.31	0.08	0.72	0.01	0.92	0.33	1.40	0.37	0.04	0.27	0.64	0.28	0.93	0.03	0.47	1.30	1.83	1.35	1.53
N4	0.10	0.19	0.08	0.33	0.09	0.25	0.01	0.38	0.02	0.09	0.18	0.29	0.03	0.57	0.10	0.03	0.35	0.55	0.35	0.40
O2	0.14	0.37	0.07	0.89	0.10	1.23	0.58	2.01	0.63	0.14	0.32	0.86	0.38	1.02	0.05	0.76	1.97	2.92	2.19	2.44
O2'	0.32	0.14	0.18	0.90	0.35	1.27	0.82	2.06	0.84	0.35	0.09	0.62	0.24	0.94	0.31	0.93	2.11	3.20	2.53	2.72
O3'	0.24	0.09	0.02	0.53	0.30	0.93	0.64	1.56	0.64	0.27	0.04	0.45	0.30	0.47	0.28	0.74	1.58	2.39	1.95	2.09
O4'	0.03	0.39	0.06	0.66	0.04	0.79	0.31	1.35	0.34	0.02	0.36	0.74	0.26	0.88	0.09	0.37	1.37	2.21	1.61	1.77
O5'	0.15	0.35	0.14	0.20	0.14	0.33	0.07	0.70	0.08	0.14	0.33	0.55	0.33	0.30	0.15	0.10	0.71	1.24	0.90	0.99
OP1	0.23	0.36	0.24	0.00	0.21	0.10	0.06	0.38	0.07	0.22	0.35	0.51	0.36	0.06	0.22	0.06	0.40	0.81	0.57	0.63
OP2	0.32	0.38	0.32	0.21	0.31	0.15	0.24	0.01	0.25	0.32	0.37	0.44	0.37	0.17	0.31	0.25	0.01	0.24	0.11	0.14
P	0.27	0.40	0.24	0.01	0.26	0.05	0.13	0.31	0.13	0.27	0.39	0.53	0.35	0.09	0.27	0.13	0.32	0.71	0.46	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.09	0.12	0.16	0.15
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.10	0.16	0.20	0.18
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01
C5	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.09	0.16	0.20	0.19
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.07	0.06	0.07	0.05	0.04	0.02	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00
C6	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.16	0.17
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.13	0.14
N3	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.01	0.10	0.15	0.19	0.17
O2	0.03	0.01	0.07	0.07	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.03	0.02	0.09	0.11	0.15	0.14
O2'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01
O3'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.00	0.06	0.00	0.04	0.04	0.01	0.00
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.03	0.09	0.15	0.19	0.17
O4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02
O5'	0.02	0.09	0.03	0.03	0.10	0.00	0.09	0.00	0.09	0.08	0.10	0.09	0.01	0.04	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.04	0.12	0.00	0.02	0.16	0.01	0.16	0.02	0.13	0.11	0.15	0.11	0.04	0.04	0.15	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.16	0.04	0.01	0.20	0.01	0.20	0.02	0.16	0.13	0.19	0.15	0.00	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.15	0.04	0.01	0.18	0.01	0.19	0.00	0.17	0.14	0.17	0.14	0.01	0.00	0.17	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00