Doublet Group distance statistics: 50370

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 6, 11, 13, 10, 5, 3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.013, 0.032, 0.052, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.012, 0.034, 0.056, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.034 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.014, 0.036, 0.059, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.036 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.092, 0.144, 0.197, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.144 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.122, 0.182, 0.242, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.182 std_dev=0.060
C4'	A	0, 0.146, 0.218, 0.290, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.218 std_dev=0.072
O2'	A	0, 0.179, 0.252, 0.326, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.252 std_dev=0.074
C3'	A	0, 0.196, 0.283, 0.369, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.283 std_dev=0.087
O3'	A	0, 0.342, 0.468, 0.593, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.468 std_dev=0.126
C5'	A	0, 0.265, 0.396, 0.528, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.396 std_dev=0.131
O5'	A	0, 0.272, 0.421, 0.571, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.421 std_dev=0.149
C4	B	0, 0.323, 0.507, 0.690, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.507 std_dev=0.184
C5	B	0, 0.213, 0.398, 0.582, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.398 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.197, 0.384, 0.571, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.384 std_dev=0.187
C6	B	0, 0.136, 0.329, 0.523, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.329 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.280, 0.477, 0.674, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.477 std_dev=0.197
N3	B	0, 0.331, 0.544, 0.758, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.544 std_dev=0.214
N9	B	0, 0.388, 0.605, 0.822, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.605 std_dev=0.217
P	A	0, 0.349, 0.567, 0.784, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.567 std_dev=0.217
N7	B	0, 0.193, 0.426, 0.659, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.426 std_dev=0.233
C8	B	0, 0.306, 0.548, 0.791, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.548 std_dev=0.243
N2	B	0, 0.270, 0.532, 0.794, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.532 std_dev=0.262
OP1	A	0, 0.374, 0.640, 0.906, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.640 std_dev=0.266
C1'	B	0, 0.491, 0.758, 1.025, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.758 std_dev=0.267
OP2	A	0, 0.374, 0.642, 0.910, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.642 std_dev=0.268
O6	B	0, 0.025, 0.296, 0.568, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.296 std_dev=0.272
C2'	B	0, 0.359, 0.899, 1.439, 3.639 max_d=3.639 avg_d=0.899 std_dev=0.540
O3'	B	0, 0.451, 1.052, 1.653, 4.087 max_d=4.087 avg_d=1.052 std_dev=0.601
O4'	B	0, 0.279, 0.894, 1.509, 4.031 max_d=4.031 avg_d=0.894 std_dev=0.615
O2'	B	0, 0.357, 1.034, 1.710, 4.794 max_d=4.794 avg_d=1.034 std_dev=0.677
C3'	B	0, 0.304, 1.010, 1.717, 4.419 max_d=4.419 avg_d=1.010 std_dev=0.706
C4'	B	0, 0.219, 1.001, 1.783, 4.950 max_d=4.950 avg_d=1.001 std_dev=0.782
C5'	B	0, -0.188, 1.123, 2.434, 7.931 max_d=7.931 avg_d=1.123 std_dev=1.311
O5'	B	0, -0.382, 1.103, 2.588, 8.929 max_d=8.929 avg_d=1.103 std_dev=1.485
P	B	0, -0.815, 1.240, 3.294, 11.982 max_d=11.982 avg_d=1.240 std_dev=2.054
OP2	B	0, -0.952, 1.327, 3.606, 13.410 max_d=13.410 avg_d=1.327 std_dev=2.279
OP1	B	0, -1.057, 1.251, 3.558, 13.238 max_d=13.238 avg_d=1.251 std_dev=2.307

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.06	0.09	0.15	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.06	0.08	0.14	0.09
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.07	0.10	0.16	0.11
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.05	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.07	0.11	0.16	0.11
C8	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.06	0.09	0.14	0.10
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.10	0.16	0.10
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.06	0.08	0.13	0.08
N6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.03	0.07	0.13	0.17	0.12
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.07	0.12	0.16	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.07	0.12	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.06	0.04
O3'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.06	0.13	0.08	0.07
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.07	0.04
O5'	0.04	0.06	0.03	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.05	0.04	0.06	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.09	0.07	0.09	0.08	0.06	0.10	0.05	0.11	0.09	0.10	0.08	0.13	0.12	0.07	0.08	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.15	0.07	0.06	0.14	0.03	0.16	0.02	0.16	0.14	0.16	0.13	0.17	0.16	0.12	0.06	0.08	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.04	0.04	0.09	0.01	0.11	0.01	0.11	0.10	0.10	0.08	0.12	0.11	0.08	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.11	0.31	0.40	0.13	0.58	0.11	0.86	0.11	0.27	0.15	0.14	0.10	0.19	0.23	0.17	0.33	0.50	1.05	0.17	1.74	1.21	1.30
C2	0.27	0.11	0.30	0.36	0.14	0.50	0.11	0.70	0.14	0.28	0.15	0.12	0.11	0.20	0.23	0.18	0.32	0.45	0.87	0.22	1.41	0.89	1.02
C2'	0.26	0.12	0.35	0.45	0.11	0.58	0.09	0.88	0.14	0.23	0.17	0.15	0.08	0.15	0.20	0.21	0.37	0.47	1.09	0.21	1.85	1.29	1.39
C3'	0.25	0.12	0.35	0.43	0.11	0.55	0.09	0.83	0.13	0.24	0.17	0.16	0.09	0.16	0.20	0.22	0.36	0.44	1.04	0.19	1.80	1.22	1.32
C4	0.26	0.10	0.28	0.34	0.13	0.48	0.11	0.69	0.11	0.28	0.14	0.14	0.09	0.21	0.23	0.19	0.30	0.43	0.86	0.17	1.46	0.90	1.04
C4'	0.27	0.11	0.31	0.41	0.13	0.58	0.10	0.86	0.11	0.26	0.15	0.16	0.09	0.18	0.22	0.18	0.33	0.49	1.06	0.16	1.79	1.25	1.33
C5	0.24	0.10	0.25	0.27	0.13	0.38	0.12	0.52	0.09	0.28	0.14	0.15	0.08	0.23	0.22	0.21	0.26	0.35	0.67	0.13	1.22	0.62	0.79
C5'	0.25	0.12	0.29	0.37	0.11	0.53	0.10	0.79	0.10	0.26	0.15	0.17	0.08	0.18	0.21	0.18	0.30	0.46	0.97	0.14	1.68	1.13	1.22
C6	0.23	0.10	0.23	0.23	0.13	0.32	0.13	0.42	0.09	0.28	0.14	0.14	0.08	0.25	0.21	0.23	0.25	0.31	0.55	0.14	1.04	0.45	0.63
C8	0.25	0.10	0.26	0.30	0.12	0.43	0.12	0.60	0.08	0.28	0.13	0.15	0.08	0.23	0.22	0.20	0.27	0.39	0.77	0.12	1.38	0.77	0.93
N1	0.24	0.10	0.26	0.28	0.13	0.38	0.12	0.50	0.12	0.28	0.15	0.13	0.09	0.23	0.22	0.21	0.28	0.35	0.65	0.21	1.12	0.57	0.73
N3	0.28	0.11	0.31	0.39	0.14	0.55	0.11	0.79	0.13	0.27	0.15	0.13	0.11	0.19	0.24	0.17	0.33	0.49	0.98	0.20	1.59	1.07	1.18
N6	0.20	0.10	0.20	0.16	0.12	0.21	0.15	0.24	0.08	0.26	0.12	0.15	0.07	0.26	0.20	0.25	0.21	0.22	0.36	0.09	0.78	0.24	0.39
N7	0.23	0.10	0.24	0.25	0.12	0.35	0.13	0.48	0.08	0.28	0.13	0.16	0.07	0.24	0.21	0.22	0.24	0.33	0.63	0.10	1.19	0.57	0.75
N9	0.26	0.10	0.28	0.35	0.13	0.50	0.11	0.72	0.10	0.28	0.14	0.14	0.09	0.21	0.22	0.18	0.30	0.45	0.90	0.15	1.54	0.98	1.10
O2'	0.27	0.11	0.37	0.50	0.12	0.65	0.09	1.00	0.15	0.23	0.17	0.14	0.09	0.14	0.21	0.18	0.39	0.52	1.22	0.23	2.02	1.51	1.57
O3'	0.24	0.13	0.37	0.46	0.10	0.56	0.09	0.86	0.15	0.21	0.19	0.17	0.09	0.13	0.18	0.24	0.38	0.44	1.08	0.22	1.89	1.31	1.40
O4'	0.28	0.11	0.29	0.38	0.14	0.57	0.12	0.85	0.10	0.28	0.14	0.15	0.10	0.20	0.24	0.16	0.31	0.51	1.03	0.15	1.71	1.19	1.28
O5'	0.24	0.11	0.28	0.34	0.11	0.46	0.10	0.68	0.08	0.26	0.14	0.16	0.07	0.20	0.21	0.21	0.29	0.40	0.85	0.11	1.53	0.94	1.06
OP1	0.22	0.16	0.27	0.30	0.10	0.42	0.10	0.61	0.11	0.25	0.18	0.23	0.10	0.19	0.19	0.23	0.26	0.36	0.78	0.13	1.46	0.85	0.98
OP2	0.18	0.21	0.21	0.21	0.12	0.30	0.12	0.43	0.15	0.22	0.22	0.27	0.15	0.18	0.16	0.23	0.21	0.27	0.59	0.16	1.19	0.58	0.73
P	0.20	0.15	0.23	0.25	0.09	0.38	0.09	0.56	0.10	0.23	0.18	0.22	0.09	0.18	0.17	0.20	0.23	0.34	0.73	0.12	1.37	0.77	0.91

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.09	0.02	0.15	0.08	0.09
C2	0.02	0.00	0.15	0.24	0.01	0.25	0.00	0.46	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.20	0.55	0.01	0.48	0.95	0.70
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.05	0.07	0.08	0.11	0.18	0.15	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.19	0.06	0.24	0.14	0.21
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.12	0.00	0.08	0.02	0.13	0.09	0.19	0.29	0.22	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.11	0.11	0.13	0.06	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.09	0.22	0.01	0.18	0.41	0.26
C4'	0.01	0.25	0.01	0.00	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.13	0.19	0.32	0.24	0.09	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.07	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.08	0.03	0.16	0.01	0.33	0.27	0.18
C5'	0.02	0.46	0.05	0.02	0.18	0.01	0.08	0.00	0.17	0.25	0.34	0.61	0.42	0.18	0.05	0.03	0.08	0.02	0.01	0.12	0.13	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.07	0.21	0.00	0.25	0.45	0.26
C8	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.13	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.11	0.41	0.02	0.68	0.33	0.45
N1	0.02	0.01	0.11	0.19	0.01	0.19	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.08	0.14	0.40	0.01	0.30	0.77	0.52
N2	0.02	0.00	0.18	0.29	0.01	0.32	0.01	0.61	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.10	0.24	0.74	0.02	0.76	1.27	0.97
N3	0.02	0.00	0.15	0.22	0.00	0.24	0.00	0.42	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.20	0.49	0.01	0.41	0.79	0.59
N7	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.08	0.34	0.02	0.66	0.26	0.38
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.16	0.01	0.30	0.13	0.16
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.13	0.06	0.11	0.03	0.14	0.04	0.18	0.22	0.18	0.05	0.06	0.00	0.06	0.02	0.12	0.13	0.18	0.13	0.16
O3'	0.12	0.09	0.03	0.01	0.08	0.02	0.08	0.08	0.08	0.10	0.08	0.10	0.08	0.09	0.09	0.06	0.00	0.09	0.05	0.08	0.19	0.12	0.06
O4'	0.00	0.20	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.02	0.07	0.11	0.14	0.24	0.20	0.08	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.05	0.07	0.06	0.05
O5'	0.09	0.55	0.19	0.11	0.22	0.01	0.16	0.01	0.21	0.41	0.40	0.74	0.49	0.34	0.16	0.12	0.05	0.06	0.00	0.19	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.08	0.05	0.19	0.00	0.34	0.37	0.22
OP1	0.15	0.48	0.24	0.13	0.18	0.10	0.33	0.13	0.25	0.68	0.30	0.76	0.41	0.66	0.30	0.18	0.19	0.07	0.01	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.95	0.14	0.06	0.41	0.07	0.27	0.13	0.45	0.33	0.77	1.27	0.79	0.26	0.13	0.13	0.12	0.06	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.70	0.21	0.10	0.26	0.02	0.18	0.01	0.26	0.45	0.52	0.97	0.59	0.38	0.16	0.16	0.06	0.05	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00