Doublet Group distance statistics: 50373

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.001, 0.011, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.007, 0.046, 0.084, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.046 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.029, 0.072, 0.114, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.072 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.015, 0.063, 0.111, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.063 std_dev=0.048
O2'	A	0, 0.060, 0.120, 0.180, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.120 std_dev=0.060
N3	B	0, 0.065, 0.126, 0.186, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.126 std_dev=0.060
C3'	A	0, 0.045, 0.129, 0.213, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.129 std_dev=0.084
C4'	A	0, 0.030, 0.121, 0.212, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.121 std_dev=0.091
O3'	A	0, 0.096, 0.209, 0.322, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.209 std_dev=0.113
O5'	A	0, 0.075, 0.225, 0.375, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.225 std_dev=0.150
C5'	A	0, 0.043, 0.200, 0.358, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.200 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.158, 0.350, 0.542, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.350 std_dev=0.192
C2	B	0, 0.018, 0.227, 0.437, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.227 std_dev=0.209
N1	B	0, 0.043, 0.263, 0.484, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.263 std_dev=0.221
P	A	0, 0.040, 0.268, 0.496, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.268 std_dev=0.228
C4	B	0, 0.060, 0.302, 0.543, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.302 std_dev=0.242
C5	B	0, 0.161, 0.428, 0.695, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.428 std_dev=0.267
OP2	A	0, 0.004, 0.328, 0.651, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.328 std_dev=0.324
OP1	A	0, 0.018, 0.365, 0.712, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.365 std_dev=0.347
O2	B	0, -0.006, 0.409, 0.824, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.409 std_dev=0.415
O4	B	0, 0.000, 0.416, 0.831, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.416 std_dev=0.416
O5'	B	0, 0.021, 0.486, 0.951, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.486 std_dev=0.465
C1'	B	0, -0.077, 0.391, 0.859, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.391 std_dev=0.468
P	B	0, 0.009, 0.487, 0.965, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.487 std_dev=0.478
C3'	B	0, -0.016, 0.482, 0.979, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.482 std_dev=0.498
C2'	B	0, -0.014, 0.485, 0.985, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.485 std_dev=0.500
O4'	B	0, -0.111, 0.428, 0.966, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.428 std_dev=0.539
C5'	B	0, 0.007, 0.567, 1.127, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.567 std_dev=0.560
C4'	B	0, -0.077, 0.500, 1.076, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.500 std_dev=0.577
OP1	B	0, -0.078, 0.536, 1.149, 2.212 max_d=2.212 avg_d=0.536 std_dev=0.613
O3'	B	0, -0.191, 0.559, 1.310, 2.607 max_d=2.607 avg_d=0.559 std_dev=0.751
O2'	B	0, -0.301, 0.768, 1.837, 3.720 max_d=3.720 avg_d=0.768 std_dev=1.069
OP2	B	0, -0.346, 0.813, 1.972, 4.038 max_d=4.038 avg_d=0.813 std_dev=1.159

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.08	0.05
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.02	0.08	0.09	0.17	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.09	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.13	0.19	0.26	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.02	0.13	0.19	0.26	0.18
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.12	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.02	0.02	0.11	0.13	0.19	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.07	0.08	0.15	0.10
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.11	0.14	0.22	0.15
O2	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.04	0.07	0.07	0.16	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04	0.08	0.05	0.05
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.09	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.10	0.02	0.06	0.10	0.09	0.07
O4	0.03	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.10	0.00	0.04	0.15	0.22	0.28	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.05	0.03
O5'	0.03	0.08	0.03	0.04	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.07	0.11	0.07	0.04	0.06	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.09	0.04	0.05	0.19	0.05	0.19	0.06	0.13	0.08	0.14	0.07	0.08	0.10	0.22	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.17	0.05	0.05	0.26	0.02	0.26	0.02	0.19	0.15	0.22	0.16	0.05	0.09	0.28	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.04	0.04	0.18	0.01	0.18	0.01	0.14	0.10	0.15	0.10	0.05	0.07	0.20	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.07	0.27	0.07	0.07	0.16	0.08	0.19	0.06	0.05	0.06	0.13	0.37	0.34	0.09	0.20	0.11	0.55	0.58	0.37
C2	0.03	0.03	0.15	0.04	0.06	0.08	0.05	0.09	0.03	0.03	0.04	0.07	0.08	0.34	0.08	0.11	0.04	0.60	0.35	0.26
C2'	0.16	0.12	0.35	0.13	0.12	0.09	0.11	0.14	0.06	0.09	0.08	0.24	0.52	0.22	0.16	0.11	0.09	0.57	0.69	0.39
C3'	0.13	0.10	0.34	0.09	0.11	0.13	0.11	0.19	0.07	0.07	0.08	0.20	0.58	0.27	0.15	0.15	0.13	0.56	0.78	0.43
C4	0.08	0.05	0.10	0.07	0.09	0.13	0.07	0.12	0.04	0.05	0.05	0.12	0.10	0.44	0.14	0.15	0.04	0.60	0.29	0.24
C4'	0.06	0.07	0.30	0.08	0.11	0.24	0.13	0.30	0.11	0.06	0.07	0.13	0.57	0.37	0.12	0.28	0.22	0.54	0.80	0.48
C5	0.11	0.08	0.13	0.11	0.07	0.20	0.06	0.19	0.06	0.08	0.06	0.14	0.10	0.49	0.10	0.21	0.09	0.60	0.40	0.30
C5'	0.07	0.07	0.27	0.12	0.09	0.30	0.12	0.36	0.11	0.08	0.06	0.11	0.55	0.44	0.09	0.33	0.26	0.53	0.81	0.50
C6	0.10	0.08	0.17	0.10	0.06	0.20	0.06	0.21	0.07	0.08	0.06	0.12	0.19	0.46	0.08	0.23	0.11	0.58	0.47	0.34
N1	0.06	0.06	0.19	0.06	0.05	0.15	0.05	0.16	0.05	0.05	0.05	0.09	0.20	0.39	0.07	0.18	0.08	0.58	0.46	0.32
N3	0.05	0.04	0.09	0.03	0.08	0.09	0.07	0.08	0.04	0.03	0.05	0.10	0.10	0.38	0.13	0.11	0.05	0.62	0.28	0.23
O2	0.05	0.03	0.16	0.08	0.04	0.05	0.04	0.07	0.03	0.04	0.03	0.05	0.08	0.26	0.07	0.07	0.07	0.61	0.34	0.24
O2'	0.21	0.15	0.40	0.18	0.21	0.09	0.19	0.14	0.12	0.11	0.14	0.31	0.65	0.15	0.26	0.10	0.12	0.56	0.81	0.44
O3'	0.18	0.12	0.38	0.12	0.18	0.10	0.18	0.18	0.11	0.10	0.11	0.25	0.68	0.21	0.23	0.12	0.16	0.57	0.91	0.48
O4	0.07	0.04	0.08	0.07	0.12	0.11	0.10	0.08	0.05	0.04	0.06	0.12	0.16	0.44	0.18	0.12	0.07	0.59	0.22	0.19
O4'	0.09	0.08	0.27	0.10	0.08	0.25	0.10	0.28	0.09	0.08	0.07	0.11	0.45	0.41	0.09	0.29	0.18	0.52	0.64	0.41
O5'	0.08	0.07	0.26	0.12	0.06	0.27	0.08	0.31	0.08	0.07	0.06	0.11	0.46	0.46	0.07	0.29	0.20	0.53	0.70	0.44
OP1	0.13	0.08	0.19	0.22	0.08	0.40	0.12	0.45	0.13	0.11	0.06	0.09	0.44	0.58	0.07	0.40	0.32	0.58	0.85	0.55
OP2	0.07	0.10	0.30	0.09	0.13	0.23	0.10	0.25	0.07	0.07	0.13	0.12	0.42	0.45	0.17	0.23	0.12	0.47	0.54	0.34
P	0.08	0.06	0.25	0.14	0.06	0.30	0.05	0.34	0.06	0.05	0.07	0.09	0.44	0.50	0.08	0.31	0.21	0.50	0.67	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.22	0.03	0.01	0.08	0.36	0.34	0.23
C2	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.03	0.05	0.06	0.55	0.31	0.24
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.13	0.09	0.02	0.07	0.19	0.01	0.03	0.03	0.02	0.25	0.40	0.28	0.30
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.14	0.01	0.16	0.02	0.14	0.08	0.10	0.06	0.01	0.01	0.15	0.01	0.05	0.23	0.09	0.11
C4	0.03	0.01	0.03	0.14	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.08	0.00	0.05	0.11	0.73	0.21	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.04	0.02	0.13	0.01	0.08	0.01	0.02	0.17	0.27	0.05
C5	0.03	0.01	0.07	0.16	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.26	0.03	0.02	0.07	0.13	0.74	0.20	0.22
C5'	0.04	0.04	0.13	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.04	0.04	0.03	0.02	0.14	0.08	0.02	0.01	0.26	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.14	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.03	0.24	0.04	0.01	0.08	0.10	0.65	0.23	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.14	0.02	0.02	0.06	0.53	0.30	0.24
N3	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.17	0.02	0.04	0.08	0.65	0.27	0.24
O2	0.04	0.01	0.19	0.06	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.16	0.29	0.05	0.06	0.07	0.45	0.33	0.22
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.21	0.13	0.26	0.02	0.24	0.12	0.12	0.16	0.00	0.02	0.22	0.08	0.23	0.42	0.28	0.30
O3'	0.22	0.21	0.03	0.01	0.08	0.01	0.03	0.14	0.04	0.14	0.17	0.29	0.02	0.00	0.08	0.14	0.13	0.52	0.15	0.26
O4	0.03	0.03	0.03	0.15	0.00	0.08	0.02	0.08	0.01	0.02	0.02	0.05	0.22	0.08	0.00	0.05	0.13	0.76	0.18	0.20
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.04	0.06	0.08	0.14	0.05	0.00	0.04	0.17	0.41	0.15
O5'	0.08	0.06	0.25	0.05	0.11	0.02	0.13	0.01	0.10	0.06	0.08	0.07	0.23	0.13	0.13	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.36	0.55	0.40	0.23	0.73	0.17	0.74	0.26	0.65	0.53	0.65	0.45	0.42	0.52	0.76	0.17	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.31	0.28	0.09	0.21	0.27	0.20	0.27	0.23	0.30	0.27	0.33	0.28	0.15	0.18	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.24	0.30	0.11	0.22	0.05	0.22	0.01	0.23	0.24	0.24	0.22	0.30	0.26	0.20	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00