Doublet Group distance statistics: 50376

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 7, 11, 7, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.006, 0.028, 0.051, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.028 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.005, 0.033, 0.061, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.033 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.004, 0.033, 0.062, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.033 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.003, 0.049, 0.095, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.049 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.011, 0.086, 0.161, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.086 std_dev=0.075
C4'	A	0, 0.013, 0.103, 0.192, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.103 std_dev=0.090
C4'	B	0, 0.115, 0.222, 0.328, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.222 std_dev=0.107
C5'	B	0, 0.129, 0.236, 0.343, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.236 std_dev=0.107
O2'	A	0, 0.040, 0.152, 0.263, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.152 std_dev=0.111
O4'	B	0, 0.144, 0.266, 0.388, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.266 std_dev=0.122
C3'	A	0, 0.004, 0.130, 0.256, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.130 std_dev=0.126
O5'	B	0, 0.119, 0.246, 0.373, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.246 std_dev=0.127
O2'	B	0, 0.155, 0.286, 0.416, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.286 std_dev=0.130
C3'	B	0, 0.116, 0.250, 0.384, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.250 std_dev=0.134
C5'	A	0, 0.035, 0.170, 0.305, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.170 std_dev=0.135
C2'	B	0, 0.143, 0.277, 0.412, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.277 std_dev=0.135
O3'	B	0, 0.121, 0.260, 0.398, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.260 std_dev=0.139
C1'	B	0, 0.143, 0.290, 0.436, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.290 std_dev=0.146
P	B	0, 0.162, 0.310, 0.458, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.310 std_dev=0.148
OP1	B	0, 0.190, 0.343, 0.497, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.343 std_dev=0.153
N1	B	0, 0.122, 0.332, 0.542, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.332 std_dev=0.210
C6	B	0, 0.130, 0.341, 0.553, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.341 std_dev=0.212
P	A	0, 0.069, 0.290, 0.511, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.290 std_dev=0.221
O3'	A	0, -0.018, 0.207, 0.432, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.207 std_dev=0.225
OP2	B	0, 0.189, 0.416, 0.642, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.416 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.216, 0.491, 0.767, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.491 std_dev=0.275
C5	B	0, 0.118, 0.400, 0.682, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.400 std_dev=0.282
O2	B	0, 0.322, 0.613, 0.903, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.613 std_dev=0.290
N3	B	0, 0.200, 0.554, 0.909, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.554 std_dev=0.354
C4	B	0, 0.112, 0.473, 0.834, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.473 std_dev=0.361
O5'	A	0, -0.074, 0.294, 0.662, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.294 std_dev=0.368
N4	B	0, 0.120, 0.556, 0.992, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.556 std_dev=0.436
OP1	A	0, -0.027, 0.484, 0.995, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.484 std_dev=0.511
OP2	A	0, 0.026, 0.581, 1.135, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.581 std_dev=0.554

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.39	0.21	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.11	0.42	0.30	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.50	0.13	0.14
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.07	0.09	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.50	0.15	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.14	0.38	0.33	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.02	0.03	0.05	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.42	0.14	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.17	0.35	0.40	0.06
C5'	0.03	0.04	0.01	0.03	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.09	0.06	0.04	0.10	0.10	0.05	0.03	0.07	0.02	0.01	0.33	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.16	0.36	0.41	0.06
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.20	0.30	0.42	0.07
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.13	0.40	0.36	0.06
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.11	0.41	0.27	0.08
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.11	0.03	0.18	0.34	0.46	0.07
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.21	0.30	0.46	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.15	0.36	0.32	0.07
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.08	0.52	0.10	0.19
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.03	0.09	0.07	0.09	0.10	0.08	0.07	0.11	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.22	0.60	0.14	0.19
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.18	0.33	0.22	0.09
O5'	0.12	0.11	0.03	0.11	0.14	0.01	0.17	0.01	0.16	0.20	0.13	0.11	0.18	0.21	0.15	0.08	0.22	0.18	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.39	0.42	0.50	0.50	0.38	0.42	0.35	0.33	0.36	0.30	0.40	0.41	0.34	0.30	0.36	0.52	0.60	0.33	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.30	0.13	0.15	0.33	0.14	0.40	0.26	0.41	0.42	0.36	0.27	0.46	0.46	0.32	0.10	0.14	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.08	0.14	0.12	0.07	0.11	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.19	0.19	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.24	0.08	0.06	0.30	0.07	0.29	0.07	0.25	0.21	0.29	0.33	0.25	0.10	0.07	0.13	0.08	0.08	0.08	0.05
C2	0.12	0.16	0.07	0.07	0.20	0.08	0.22	0.07	0.20	0.16	0.18	0.22	0.16	0.09	0.08	0.13	0.07	0.08	0.06	0.05
C2'	0.12	0.27	0.07	0.05	0.32	0.06	0.28	0.06	0.23	0.20	0.32	0.36	0.29	0.11	0.09	0.10	0.06	0.10	0.06	0.05
C3'	0.12	0.28	0.08	0.05	0.32	0.05	0.27	0.06	0.22	0.20	0.33	0.36	0.31	0.12	0.09	0.10	0.06	0.11	0.05	0.05
C4	0.14	0.20	0.08	0.06	0.24	0.07	0.24	0.07	0.22	0.18	0.22	0.26	0.21	0.10	0.07	0.13	0.07	0.09	0.06	0.05
C4'	0.13	0.26	0.07	0.04	0.31	0.05	0.28	0.06	0.23	0.20	0.31	0.36	0.29	0.11	0.07	0.12	0.06	0.08	0.07	0.05
C5	0.13	0.18	0.08	0.06	0.20	0.07	0.20	0.06	0.19	0.16	0.19	0.21	0.19	0.11	0.08	0.13	0.07	0.11	0.05	0.05
C5'	0.15	0.27	0.09	0.06	0.32	0.08	0.29	0.09	0.25	0.22	0.32	0.36	0.30	0.12	0.07	0.14	0.08	0.09	0.10	0.07
C6	0.12	0.15	0.08	0.07	0.17	0.08	0.17	0.06	0.17	0.14	0.16	0.18	0.16	0.10	0.09	0.13	0.06	0.11	0.06	0.06
C8	0.15	0.22	0.09	0.06	0.24	0.07	0.24	0.07	0.22	0.19	0.24	0.26	0.24	0.12	0.07	0.14	0.07	0.10	0.06	0.05
N1	0.12	0.14	0.08	0.07	0.16	0.08	0.18	0.06	0.17	0.14	0.15	0.17	0.14	0.09	0.09	0.13	0.06	0.09	0.05	0.05
N3	0.13	0.20	0.07	0.07	0.24	0.07	0.25	0.07	0.23	0.18	0.23	0.26	0.20	0.09	0.07	0.13	0.08	0.08	0.07	0.05
N6	0.12	0.13	0.09	0.08	0.14	0.08	0.14	0.08	0.14	0.12	0.13	0.15	0.14	0.11	0.10	0.12	0.08	0.14	0.09	0.10
N7	0.14	0.19	0.09	0.07	0.21	0.08	0.21	0.07	0.19	0.17	0.20	0.22	0.21	0.12	0.08	0.14	0.07	0.11	0.06	0.06
N9	0.14	0.23	0.09	0.06	0.26	0.07	0.26	0.07	0.23	0.19	0.25	0.29	0.24	0.11	0.07	0.14	0.07	0.09	0.06	0.05
O2'	0.11	0.26	0.10	0.10	0.33	0.10	0.29	0.10	0.23	0.19	0.32	0.38	0.26	0.14	0.13	0.11	0.10	0.12	0.08	0.08
O3'	0.13	0.33	0.10	0.07	0.37	0.07	0.30	0.07	0.23	0.23	0.39	0.42	0.36	0.14	0.12	0.08	0.07	0.12	0.06	0.06
O4'	0.14	0.25	0.08	0.06	0.31	0.07	0.30	0.08	0.26	0.21	0.30	0.35	0.26	0.11	0.06	0.14	0.08	0.08	0.09	0.06
O5'	0.12	0.27	0.08	0.07	0.28	0.10	0.22	0.15	0.18	0.18	0.31	0.32	0.33	0.14	0.10	0.10	0.15	0.22	0.14	0.17
OP1	0.41	0.31	0.47	0.48	0.26	0.46	0.31	0.42	0.36	0.36	0.27	0.24	0.35	0.52	0.53	0.43	0.43	0.42	0.38	0.39
OP2	0.31	0.36	0.29	0.29	0.38	0.30	0.38	0.33	0.36	0.33	0.38	0.41	0.37	0.30	0.29	0.31	0.30	0.34	0.32	0.33
P	0.08	0.14	0.09	0.09	0.19	0.10	0.20	0.09	0.17	0.11	0.18	0.23	0.18	0.13	0.12	0.11	0.11	0.12	0.08	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.12	0.15	0.19	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.09	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.09	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.15	0.20	0.25	0.20
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.15	0.19	0.23	0.19
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.11	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.12	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.12	0.15	0.17	0.15
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.11	0.13	0.15	0.12
N3	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.14	0.19	0.24	0.18
N4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.03	0.16	0.23	0.28	0.22
O2	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.10	0.03	0.10	0.14	0.17	0.12
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.03	0.08	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.07	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.07	0.03	0.07	0.07	0.10	0.03	0.00	0.01	0.06	0.09	0.06	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.08	0.09	0.09	0.08
O5'	0.07	0.12	0.04	0.04	0.15	0.01	0.15	0.01	0.12	0.11	0.14	0.16	0.10	0.02	0.06	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.15	0.09	0.09	0.20	0.06	0.19	0.07	0.15	0.13	0.19	0.23	0.14	0.07	0.09	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.19	0.09	0.07	0.25	0.03	0.23	0.02	0.17	0.15	0.24	0.28	0.17	0.07	0.06	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.05	0.04	0.20	0.01	0.19	0.01	0.15	0.12	0.18	0.22	0.12	0.03	0.05	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00