Doublet Group distance statistics: 50378

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 4, 8, 5, 7, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.009, 0.030, 0.052, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.008, 0.035, 0.062, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.035 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.013, 0.042, 0.071, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.042 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.012, 0.042, 0.072, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.009, 0.117, 0.226, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.117 std_dev=0.109
C2'	A	0, 0.033, 0.149, 0.265, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.149 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.069, 0.219, 0.370, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.219 std_dev=0.150
C2'	B	0, 0.259, 0.416, 0.573, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.416 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.029, 0.205, 0.381, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.205 std_dev=0.176
O4'	B	0, 0.174, 0.355, 0.537, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.355 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.002, 0.203, 0.403, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.203 std_dev=0.200
O2'	B	0, 0.252, 0.459, 0.666, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.459 std_dev=0.207
C4'	B	0, 0.167, 0.408, 0.649, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.408 std_dev=0.241
C1'	B	0, 0.172, 0.415, 0.658, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.415 std_dev=0.243
O3'	A	0, 0.032, 0.315, 0.599, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.315 std_dev=0.284
C5'	A	0, 0.012, 0.322, 0.632, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.322 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.167, 0.478, 0.789, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.478 std_dev=0.311
O5'	A	0, 0.010, 0.347, 0.684, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.347 std_dev=0.337
P	A	0, -0.003, 0.422, 0.848, 2.241 max_d=2.241 avg_d=0.422 std_dev=0.425
OP2	A	0, -0.005, 0.421, 0.847, 2.398 max_d=2.398 avg_d=0.421 std_dev=0.426
C5'	B	0, 0.062, 0.507, 0.952, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.507 std_dev=0.445
O3'	B	0, 0.065, 0.585, 1.104, 2.835 max_d=2.835 avg_d=0.585 std_dev=0.520
N1	B	0, 0.020, 0.540, 1.060, 2.723 max_d=2.723 avg_d=0.540 std_dev=0.520
OP1	A	0, -0.030, 0.496, 1.022, 2.772 max_d=2.772 avg_d=0.496 std_dev=0.526
O5'	B	0, 0.016, 0.542, 1.069, 2.752 max_d=2.752 avg_d=0.542 std_dev=0.527
O2	B	0, 0.036, 0.586, 1.136, 2.496 max_d=2.496 avg_d=0.586 std_dev=0.550
C2	B	0, -0.036, 0.611, 1.257, 3.135 max_d=3.135 avg_d=0.611 std_dev=0.646
P	B	0, -0.098, 0.609, 1.317, 3.745 max_d=3.745 avg_d=0.609 std_dev=0.708
C6	B	0, -0.084, 0.634, 1.352, 3.750 max_d=3.750 avg_d=0.634 std_dev=0.718
OP1	B	0, -0.137, 0.717, 1.571, 4.518 max_d=4.518 avg_d=0.717 std_dev=0.854
OP2	B	0, -0.164, 0.694, 1.551, 4.561 max_d=4.561 avg_d=0.694 std_dev=0.857
N3	B	0, -0.189, 0.741, 1.672, 4.419 max_d=4.419 avg_d=0.741 std_dev=0.931
C5	B	0, -0.249, 0.770, 1.790, 5.114 max_d=5.114 avg_d=0.770 std_dev=1.020
C4	B	0, -0.300, 0.811, 1.922, 5.389 max_d=5.389 avg_d=0.811 std_dev=1.111
N4	B	0, -0.459, 0.950, 2.360, 6.713 max_d=6.713 avg_d=0.950 std_dev=1.409

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.08	0.11	0.07
C2	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.10	0.04	0.14	0.20	0.26	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.09	0.05
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.07	0.08	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.13	0.16	0.21	0.15
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.05	0.04	0.07	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.16	0.20	0.25	0.19
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.10	0.07	0.13	0.13	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.02	0.17	0.23	0.28	0.21
C8	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.04	0.15	0.14	0.14	0.13
N1	0.03	0.00	0.06	0.07	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.09	0.03	0.16	0.23	0.29	0.21
N3	0.03	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.04	0.12	0.17	0.23	0.16
N6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.10	0.03	0.19	0.25	0.29	0.23
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.18	0.19	0.22	0.19
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.12	0.15	0.11
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.09	0.07	0.04
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.11	0.09	0.10	0.10	0.11	0.04	0.04	0.00	0.01	0.07	0.14	0.09	0.06
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.06	0.08	0.05
O5'	0.06	0.14	0.03	0.03	0.13	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.16	0.12	0.19	0.18	0.11	0.03	0.07	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.20	0.11	0.12	0.16	0.08	0.20	0.07	0.23	0.14	0.23	0.17	0.25	0.19	0.12	0.09	0.14	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.26	0.09	0.07	0.21	0.03	0.25	0.01	0.28	0.14	0.29	0.23	0.29	0.22	0.15	0.07	0.09	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.18	0.05	0.04	0.15	0.02	0.19	0.01	0.21	0.13	0.21	0.16	0.23	0.19	0.11	0.04	0.06	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.60	0.13	0.12	0.75	0.18	0.67	0.27	0.55	0.50	0.72	0.83	0.56	0.22	0.35	0.21	0.09	0.17	0.16	0.10
C2	0.21	0.32	0.15	0.14	0.40	0.19	0.39	0.27	0.35	0.30	0.37	0.42	0.30	0.26	0.26	0.16	0.11	0.13	0.11	0.09
C2'	0.41	0.69	0.20	0.06	0.78	0.13	0.69	0.22	0.59	0.58	0.79	0.84	0.68	0.18	0.31	0.29	0.09	0.17	0.16	0.09
C3'	0.43	0.70	0.23	0.04	0.77	0.13	0.68	0.23	0.58	0.58	0.79	0.84	0.71	0.20	0.28	0.30	0.09	0.19	0.14	0.10
C4	0.25	0.46	0.13	0.15	0.56	0.20	0.53	0.30	0.45	0.40	0.54	0.62	0.42	0.24	0.33	0.18	0.11	0.17	0.13	0.10
C4'	0.36	0.66	0.18	0.08	0.78	0.14	0.69	0.25	0.57	0.54	0.78	0.87	0.64	0.18	0.31	0.24	0.08	0.17	0.15	0.10
C5	0.22	0.39	0.14	0.18	0.49	0.22	0.46	0.33	0.38	0.34	0.46	0.54	0.37	0.24	0.35	0.16	0.15	0.21	0.13	0.14
C5'	0.37	0.65	0.19	0.06	0.77	0.15	0.69	0.27	0.57	0.54	0.76	0.86	0.63	0.18	0.27	0.27	0.10	0.18	0.17	0.13
C6	0.20	0.30	0.16	0.20	0.37	0.22	0.36	0.34	0.30	0.27	0.35	0.41	0.29	0.25	0.33	0.15	0.18	0.21	0.14	0.16
C8	0.26	0.50	0.12	0.17	0.63	0.21	0.57	0.33	0.47	0.42	0.60	0.70	0.47	0.22	0.37	0.18	0.13	0.22	0.13	0.13
N1	0.19	0.27	0.17	0.19	0.32	0.21	0.31	0.31	0.27	0.25	0.30	0.35	0.26	0.26	0.29	0.14	0.16	0.16	0.12	0.12
N3	0.25	0.44	0.13	0.12	0.54	0.18	0.51	0.27	0.45	0.40	0.51	0.57	0.40	0.25	0.29	0.19	0.10	0.14	0.14	0.11
N6	0.19	0.27	0.18	0.23	0.32	0.23	0.31	0.36	0.26	0.24	0.31	0.35	0.26	0.25	0.34	0.16	0.24	0.27	0.20	0.22
N7	0.23	0.43	0.13	0.19	0.54	0.22	0.49	0.35	0.40	0.36	0.51	0.60	0.40	0.23	0.38	0.16	0.16	0.25	0.14	0.16
N9	0.28	0.53	0.12	0.14	0.66	0.20	0.60	0.30	0.50	0.45	0.63	0.73	0.49	0.22	0.35	0.20	0.10	0.18	0.14	0.11
O2'	0.42	0.75	0.21	0.11	0.85	0.14	0.75	0.19	0.63	0.62	0.86	0.92	0.74	0.18	0.33	0.28	0.13	0.19	0.20	0.12
O3'	0.48	0.75	0.28	0.05	0.80	0.12	0.69	0.21	0.59	0.62	0.84	0.86	0.78	0.24	0.26	0.33	0.09	0.20	0.14	0.10
O4'	0.29	0.61	0.14	0.12	0.77	0.18	0.68	0.27	0.55	0.50	0.74	0.86	0.56	0.22	0.34	0.20	0.09	0.17	0.16	0.10
O5'	0.39	0.64	0.20	0.08	0.75	0.19	0.68	0.32	0.57	0.54	0.74	0.82	0.61	0.18	0.24	0.31	0.14	0.20	0.22	0.17
OP1	0.45	0.66	0.26	0.17	0.76	0.26	0.69	0.37	0.60	0.58	0.75	0.83	0.65	0.21	0.24	0.38	0.21	0.25	0.26	0.23
OP2	0.48	0.67	0.31	0.20	0.75	0.27	0.69	0.38	0.61	0.59	0.74	0.81	0.65	0.28	0.23	0.41	0.24	0.26	0.28	0.25
P	0.43	0.65	0.24	0.13	0.75	0.21	0.68	0.33	0.59	0.56	0.74	0.83	0.63	0.21	0.21	0.35	0.18	0.22	0.24	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.08	0.10	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.06	0.02	0.13	0.16	0.19	0.15
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.04	0.09	0.01	0.02	0.01	0.10	0.11	0.11	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.05	0.05	0.09	0.03	0.01	0.01	0.15	0.14	0.10	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.17	0.24	0.25	0.20
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03	0.18	0.25	0.25	0.20
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.10	0.12	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.17	0.20	0.21	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.13	0.15	0.17	0.14
N3	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.16	0.21	0.22	0.18
N4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03	0.18	0.26	0.26	0.21
O2	0.04	0.01	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.11	0.04	0.12	0.14	0.17	0.13
O2'	0.02	0.07	0.01	0.03	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.07	0.09	0.00	0.04	0.06	0.06	0.09	0.07	0.06
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.07	0.03	0.06	0.05	0.11	0.04	0.00	0.01	0.16	0.17	0.13	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.09	0.10	0.12	0.09
O5'	0.08	0.13	0.10	0.15	0.17	0.02	0.18	0.01	0.17	0.13	0.16	0.18	0.12	0.06	0.16	0.09	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.16	0.11	0.14	0.24	0.08	0.25	0.08	0.20	0.15	0.21	0.26	0.14	0.09	0.17	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.13	0.19	0.11	0.10	0.25	0.07	0.25	0.12	0.21	0.17	0.22	0.26	0.17	0.07	0.13	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.10	0.12	0.20	0.03	0.20	0.02	0.17	0.14	0.18	0.21	0.13	0.06	0.14	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00