Doublet Group distance statistics: 50382

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 4, 8, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.020, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.020 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.014, 0.020, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.020 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.015, 0.022, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.018, 0.025, 0.033, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.028, 0.037, 0.047, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.037 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.014, 0.027, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.057, 0.076, 0.096, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.076 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.032 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.052, 0.091, 0.131, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.091 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.050, 0.098, 0.147, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.098 std_dev=0.048
O2'	A	0, 0.069, 0.151, 0.233, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.151 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.062, 0.144, 0.226, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.144 std_dev=0.082
C3'	A	0, 0.061, 0.149, 0.237, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.149 std_dev=0.088
C5'	A	0, 0.133, 0.259, 0.386, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.259 std_dev=0.127
O5'	A	0, 0.223, 0.354, 0.486, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.354 std_dev=0.132
O3'	A	0, 0.083, 0.237, 0.391, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.237 std_dev=0.154
OP2	A	0, 0.364, 0.539, 0.715, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.539 std_dev=0.176
C3'	B	0, 0.350, 0.537, 0.724, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.537 std_dev=0.187
P	A	0, 0.343, 0.532, 0.721, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.532 std_dev=0.189
C1'	B	0, 0.275, 0.477, 0.680, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.477 std_dev=0.203
C2'	B	0, 0.467, 0.672, 0.876, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.672 std_dev=0.205
C6	B	0, 0.257, 0.491, 0.725, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.491 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.164, 0.400, 0.637, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.400 std_dev=0.236
C2	B	0, 0.433, 0.671, 0.909, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.671 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.605, 0.847, 1.089, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.847 std_dev=0.242
O5'	B	0, 0.193, 0.441, 0.688, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.441 std_dev=0.247
O3'	B	0, 0.548, 0.798, 1.047, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.798 std_dev=0.249
O4'	B	0, 0.346, 0.613, 0.880, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.613 std_dev=0.267
O2	B	0, 0.553, 0.849, 1.145, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.849 std_dev=0.296
OP2	B	0, 0.345, 0.642, 0.939, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.642 std_dev=0.297
N3	B	0, 0.637, 0.935, 1.233, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.935 std_dev=0.298
C4	B	0, 0.739, 1.041, 1.343, 1.425 max_d=1.425 avg_d=1.041 std_dev=0.302
OP1	A	0, 0.524, 0.828, 1.131, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.828 std_dev=0.304
P	B	0, 0.102, 0.412, 0.721, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.412 std_dev=0.309
OP1	B	0, 0.190, 0.507, 0.825, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.507 std_dev=0.318
C4'	B	0, 0.193, 0.523, 0.854, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.523 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.682, 1.055, 1.428, 1.405 max_d=1.405 avg_d=1.055 std_dev=0.373
C5'	B	0, 0.622, 1.012, 1.402, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.012 std_dev=0.390
N4	B	0, 0.996, 1.443, 1.890, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.443 std_dev=0.447

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.06	0.05
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.12	0.12	0.17	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.09	0.09	0.07	0.10	0.09	0.07	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.12	0.12	0.14	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.15	0.16	0.19	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.10	0.08	0.05	0.11	0.12	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.16	0.18	0.22	0.19
C8	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.02	0.15	0.14	0.14	0.15
N1	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.14	0.15	0.20	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.10	0.10	0.14	0.11
N6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.17	0.21	0.25	0.22
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.02	0.17	0.18	0.20	0.19
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.10	0.11	0.10
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.02	0.09	0.07	0.07	0.03	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.03
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.08	0.02	0.11	0.03	0.11	0.10	0.11	0.08	0.12	0.12	0.07	0.03	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.04
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.04
O5'	0.04	0.12	0.03	0.04	0.12	0.01	0.15	0.01	0.16	0.15	0.14	0.10	0.17	0.17	0.10	0.03	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.12	0.06	0.07	0.12	0.04	0.16	0.04	0.18	0.14	0.15	0.10	0.21	0.18	0.10	0.04	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.17	0.06	0.04	0.14	0.02	0.19	0.01	0.22	0.14	0.20	0.14	0.25	0.20	0.11	0.05	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.14	0.04	0.03	0.13	0.02	0.17	0.01	0.19	0.15	0.17	0.11	0.22	0.19	0.10	0.03	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.10	0.20	0.24	0.23	0.24	0.22	0.23	0.15	0.09	0.17	0.29	0.15	0.28	0.35	0.14	0.13	0.15	0.09	0.11
C2	0.09	0.16	0.19	0.24	0.33	0.26	0.34	0.24	0.26	0.16	0.25	0.38	0.13	0.27	0.36	0.11	0.13	0.15	0.14	0.12
C2'	0.09	0.14	0.18	0.20	0.19	0.19	0.17	0.17	0.13	0.09	0.18	0.24	0.20	0.25	0.31	0.11	0.10	0.12	0.09	0.09
C3'	0.07	0.16	0.14	0.17	0.19	0.15	0.18	0.14	0.13	0.10	0.19	0.23	0.22	0.21	0.28	0.11	0.10	0.11	0.10	0.10
C4	0.08	0.11	0.19	0.24	0.28	0.24	0.29	0.23	0.21	0.11	0.19	0.34	0.12	0.29	0.38	0.12	0.13	0.16	0.13	0.12
C4'	0.11	0.13	0.18	0.21	0.19	0.20	0.18	0.19	0.13	0.09	0.16	0.24	0.20	0.24	0.31	0.12	0.11	0.13	0.09	0.10
C5	0.08	0.12	0.20	0.26	0.29	0.23	0.32	0.23	0.24	0.13	0.20	0.35	0.13	0.31	0.42	0.12	0.14	0.17	0.16	0.15
C5'	0.10	0.12	0.17	0.20	0.19	0.19	0.19	0.19	0.14	0.09	0.16	0.25	0.20	0.24	0.32	0.12	0.11	0.14	0.10	0.11
C6	0.09	0.14	0.21	0.27	0.32	0.23	0.36	0.23	0.28	0.16	0.22	0.39	0.13	0.31	0.44	0.12	0.16	0.18	0.19	0.17
C8	0.08	0.10	0.20	0.25	0.25	0.22	0.27	0.22	0.20	0.10	0.17	0.32	0.15	0.30	0.40	0.12	0.14	0.17	0.14	0.14
N1	0.10	0.17	0.21	0.26	0.34	0.25	0.37	0.24	0.29	0.18	0.25	0.40	0.14	0.30	0.42	0.12	0.15	0.17	0.18	0.15
N3	0.08	0.13	0.18	0.23	0.29	0.25	0.29	0.24	0.21	0.12	0.21	0.34	0.11	0.27	0.34	0.13	0.13	0.15	0.12	0.11
N6	0.11	0.15	0.23	0.28	0.34	0.21	0.38	0.22	0.30	0.17	0.23	0.40	0.14	0.33	0.47	0.14	0.17	0.20	0.22	0.20
N7	0.08	0.10	0.21	0.26	0.27	0.22	0.30	0.22	0.23	0.12	0.18	0.34	0.14	0.31	0.42	0.12	0.15	0.18	0.17	0.15
N9	0.09	0.10	0.20	0.24	0.25	0.24	0.26	0.23	0.19	0.09	0.17	0.31	0.14	0.29	0.38	0.13	0.13	0.16	0.12	0.12
O2'	0.18	0.20	0.25	0.27	0.21	0.26	0.17	0.24	0.14	0.16	0.22	0.24	0.27	0.31	0.35	0.18	0.16	0.17	0.13	0.14
O3'	0.08	0.21	0.13	0.14	0.21	0.12	0.16	0.12	0.12	0.12	0.25	0.25	0.28	0.17	0.23	0.10	0.10	0.11	0.10	0.10
O4'	0.13	0.10	0.20	0.24	0.23	0.25	0.22	0.24	0.15	0.09	0.16	0.30	0.16	0.28	0.35	0.15	0.14	0.16	0.10	0.12
O5'	0.09	0.11	0.17	0.20	0.22	0.18	0.25	0.19	0.19	0.10	0.16	0.28	0.18	0.24	0.33	0.14	0.13	0.15	0.15	0.14
OP1	0.10	0.13	0.19	0.22	0.21	0.19	0.23	0.20	0.18	0.10	0.16	0.26	0.22	0.27	0.36	0.14	0.15	0.18	0.18	0.17
OP2	0.12	0.10	0.18	0.23	0.28	0.22	0.33	0.25	0.27	0.15	0.17	0.34	0.14	0.26	0.37	0.22	0.23	0.24	0.28	0.26
P	0.10	0.09	0.18	0.21	0.25	0.20	0.29	0.21	0.23	0.12	0.16	0.31	0.16	0.25	0.35	0.17	0.18	0.20	0.21	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.12	0.14	0.20	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.09	0.00	0.02	0.00	0.04	0.05	0.07	0.05
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.05	0.08	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02	0.19	0.23	0.30	0.26
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.20	0.25	0.30	0.27
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.13	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.17	0.19	0.21	0.20
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.12	0.13	0.17	0.14
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.16	0.19	0.26	0.21
N4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.06	0.03	0.20	0.27	0.35	0.29
O2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.10	0.04	0.10	0.10	0.17	0.12
O2'	0.02	0.07	0.00	0.03	0.07	0.04	0.05	0.03	0.04	0.04	0.08	0.09	0.10	0.00	0.06	0.04	0.04	0.07	0.06	0.04
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.03	0.07	0.06	0.10	0.06	0.00	0.01	0.05	0.08	0.06	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.04	0.06	0.08	0.05
O5'	0.05	0.12	0.04	0.05	0.19	0.02	0.20	0.01	0.17	0.12	0.16	0.20	0.10	0.04	0.05	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.14	0.05	0.06	0.23	0.05	0.25	0.06	0.19	0.13	0.19	0.27	0.10	0.07	0.08	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.20	0.07	0.05	0.30	0.04	0.30	0.03	0.21	0.17	0.26	0.35	0.17	0.06	0.06	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.05	0.04	0.26	0.02	0.27	0.01	0.20	0.14	0.21	0.29	0.12	0.04	0.05	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00