Doublet Group distance statistics: 50384

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 2, 4, 2, 0, 1, 3, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.019, 0.035, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C2	A	0, -0.001, 0.014, 0.030, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.014 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.027, 0.047, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.027 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.008, 0.033, 0.057, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.005, 0.040, 0.075, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.040 std_dev=0.035
O4'	A	0, -0.006, 0.100, 0.207, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.100 std_dev=0.107
C2'	A	0, -0.024, 0.121, 0.266, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.121 std_dev=0.145
C4'	A	0, 0.042, 0.197, 0.353, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.197 std_dev=0.156
O2'	A	0, -0.001, 0.191, 0.384, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.191 std_dev=0.193
C3'	A	0, -0.013, 0.203, 0.419, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.203 std_dev=0.216
O4'	B	0, 0.154, 0.427, 0.699, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.427 std_dev=0.273
C5'	A	0, 0.049, 0.331, 0.612, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.331 std_dev=0.281
O3'	B	0, 0.224, 0.510, 0.796, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.510 std_dev=0.286
O2'	B	0, 0.140, 0.434, 0.729, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.434 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.175, 0.470, 0.765, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.470 std_dev=0.295
O5'	B	0, 0.196, 0.503, 0.811, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.503 std_dev=0.308
C1'	B	0, 0.164, 0.477, 0.790, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.477 std_dev=0.313
C3'	B	0, 0.200, 0.518, 0.836, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.518 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.163, 0.486, 0.808, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.486 std_dev=0.323
P	B	0, 0.328, 0.651, 0.974, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.651 std_dev=0.323
O3'	A	0, -0.010, 0.324, 0.658, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.324 std_dev=0.334
OP1	B	0, 0.434, 0.797, 1.160, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.797 std_dev=0.363
N1	B	0, 0.194, 0.655, 1.115, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.655 std_dev=0.460
OP2	B	0, 0.413, 0.886, 1.358, 2.021 max_d=2.021 avg_d=0.886 std_dev=0.473
C6	B	0, 0.242, 0.778, 1.315, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.778 std_dev=0.537
C5'	B	0, 0.143, 0.709, 1.274, 2.000 max_d=2.000 avg_d=0.709 std_dev=0.565
C2	B	0, 0.182, 0.757, 1.333, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.757 std_dev=0.576
O2	B	0, 0.131, 0.736, 1.342, 2.192 max_d=2.192 avg_d=0.736 std_dev=0.606
O5'	A	0, -0.185, 0.451, 1.087, 2.929 max_d=2.929 avg_d=0.451 std_dev=0.636
C5	B	0, 0.280, 0.954, 1.627, 2.292 max_d=2.292 avg_d=0.954 std_dev=0.674
P	A	0, -0.026, 0.652, 1.331, 3.247 max_d=3.247 avg_d=0.652 std_dev=0.679
N3	B	0, 0.222, 0.925, 1.628, 2.512 max_d=2.512 avg_d=0.925 std_dev=0.703
C4	B	0, 0.273, 1.011, 1.749, 2.588 max_d=2.588 avg_d=1.011 std_dev=0.738
OP1	A	0, 0.006, 0.813, 1.620, 3.868 max_d=3.868 avg_d=0.813 std_dev=0.807
N4	B	0, 0.316, 1.200, 2.084, 3.133 max_d=3.133 avg_d=1.200 std_dev=0.884
OP2	A	0, -0.115, 0.798, 1.710, 4.317 max_d=4.317 avg_d=0.798 std_dev=0.912

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.18	0.05	0.18	0.08
C2	0.04	0.00	0.13	0.11	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.04	0.32	0.14	0.48	0.26
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.08	0.09	0.13	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.09	0.20	0.10
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.12	0.07	0.11	0.05	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.21	0.19	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.36	0.18	0.46	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.03	0.05	0.07	0.07	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.47	0.31	0.62	0.41
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.09	0.10	0.06	0.04	0.13	0.11	0.04	0.03	0.03	0.02	0.01	0.20	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.07	0.04	0.48	0.34	0.68	0.44
C8	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.50	0.32	0.55	0.39
N1	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.12	0.04	0.41	0.25	0.60	0.37
N3	0.04	0.00	0.13	0.11	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.04	0.27	0.09	0.39	0.20
N6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.02	0.13	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.06	0.06	0.55	0.45	0.80	0.54
N7	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.54	0.40	0.69	0.48
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.35	0.16	0.38	0.24
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.07	0.03	0.05	0.03	0.08	0.06	0.13	0.15	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.11	0.08	0.05
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.07	0.03	0.05	0.03	0.07	0.12	0.12	0.15	0.06	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.11	0.25	0.17	0.13
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.12	0.08	0.07	0.07
O5'	0.18	0.32	0.17	0.19	0.36	0.01	0.47	0.01	0.48	0.50	0.41	0.27	0.55	0.54	0.35	0.05	0.11	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.14	0.09	0.21	0.18	0.05	0.31	0.20	0.34	0.32	0.25	0.09	0.45	0.40	0.16	0.11	0.25	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.48	0.20	0.19	0.46	0.05	0.62	0.12	0.68	0.55	0.60	0.39	0.80	0.69	0.38	0.08	0.17	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.26	0.10	0.14	0.27	0.05	0.41	0.02	0.44	0.39	0.37	0.20	0.54	0.48	0.24	0.05	0.13	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.41	0.25	0.10	0.41	0.15	0.34	0.22	0.29	0.31	0.45	0.44	0.48	0.22	0.19	0.12	0.16	0.11	0.24	0.10
C2	0.15	0.16	0.16	0.18	0.15	0.23	0.17	0.31	0.17	0.15	0.16	0.16	0.21	0.23	0.24	0.14	0.16	0.13	0.19	0.07
C2'	0.32	0.51	0.35	0.17	0.50	0.14	0.41	0.17	0.36	0.40	0.55	0.54	0.58	0.28	0.17	0.20	0.20	0.11	0.32	0.14
C3'	0.34	0.54	0.39	0.21	0.52	0.15	0.42	0.19	0.37	0.42	0.58	0.57	0.61	0.34	0.20	0.21	0.23	0.12	0.31	0.14
C4	0.15	0.24	0.16	0.12	0.22	0.21	0.19	0.33	0.17	0.18	0.25	0.23	0.31	0.23	0.25	0.09	0.18	0.12	0.19	0.08
C4'	0.29	0.51	0.33	0.15	0.51	0.13	0.40	0.21	0.34	0.38	0.56	0.56	0.59	0.28	0.19	0.15	0.17	0.11	0.25	0.09
C5	0.13	0.20	0.14	0.15	0.17	0.24	0.16	0.41	0.15	0.14	0.20	0.18	0.28	0.27	0.27	0.12	0.24	0.13	0.19	0.12
C5'	0.28	0.50	0.33	0.16	0.49	0.15	0.38	0.25	0.32	0.36	0.56	0.55	0.58	0.31	0.22	0.13	0.16	0.14	0.20	0.06
C6	0.14	0.16	0.13	0.20	0.15	0.28	0.19	0.46	0.18	0.14	0.15	0.16	0.22	0.27	0.28	0.17	0.29	0.14	0.21	0.15
C8	0.16	0.30	0.18	0.10	0.26	0.21	0.20	0.37	0.18	0.20	0.31	0.29	0.39	0.26	0.26	0.08	0.21	0.13	0.19	0.10
N1	0.16	0.16	0.15	0.22	0.17	0.28	0.21	0.43	0.21	0.16	0.16	0.18	0.20	0.25	0.26	0.19	0.26	0.12	0.19	0.11
N3	0.15	0.22	0.17	0.13	0.21	0.20	0.20	0.27	0.19	0.18	0.22	0.22	0.27	0.21	0.23	0.09	0.14	0.13	0.20	0.08
N6	0.15	0.16	0.14	0.23	0.17	0.29	0.22	0.52	0.22	0.16	0.15	0.18	0.21	0.30	0.28	0.21	0.36	0.19	0.25	0.22
N7	0.13	0.23	0.15	0.14	0.19	0.24	0.16	0.43	0.15	0.15	0.24	0.21	0.33	0.28	0.28	0.11	0.25	0.15	0.20	0.14
N9	0.17	0.32	0.19	0.09	0.29	0.19	0.24	0.30	0.21	0.23	0.33	0.32	0.39	0.23	0.24	0.08	0.17	0.12	0.20	0.08
O2'	0.36	0.58	0.37	0.23	0.59	0.18	0.49	0.18	0.43	0.46	0.63	0.63	0.64	0.23	0.19	0.25	0.21	0.13	0.38	0.19
O3'	0.40	0.61	0.46	0.30	0.61	0.20	0.50	0.20	0.44	0.49	0.66	0.66	0.68	0.37	0.24	0.28	0.27	0.15	0.39	0.21
O4'	0.23	0.43	0.26	0.09	0.43	0.16	0.35	0.25	0.29	0.31	0.48	0.48	0.50	0.23	0.19	0.11	0.15	0.12	0.22	0.09
O5'	0.28	0.45	0.29	0.20	0.43	0.32	0.36	0.45	0.32	0.34	0.49	0.48	0.53	0.30	0.30	0.26	0.37	0.42	0.38	0.38
OP1	0.24	0.49	0.30	0.11	0.46	0.23	0.33	0.39	0.26	0.32	0.55	0.52	0.60	0.32	0.24	0.11	0.22	0.31	0.21	0.22
OP2	0.33	0.38	0.32	0.38	0.35	0.53	0.35	0.71	0.36	0.33	0.39	0.37	0.47	0.37	0.48	0.40	0.54	0.67	0.56	0.62
P	0.19	0.38	0.22	0.18	0.35	0.33	0.27	0.50	0.23	0.25	0.42	0.39	0.49	0.26	0.31	0.19	0.31	0.42	0.31	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.17	0.17	0.17	0.11
C2	0.02	0.00	0.07	0.15	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.02	0.29	0.22	0.25	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.06	0.02	0.05	0.04	0.12	0.00	0.01	0.01	0.19	0.20	0.16	0.13
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.16	0.01	0.15	0.03	0.14	0.11	0.17	0.17	0.17	0.01	0.01	0.01	0.22	0.23	0.19	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.16	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.18	0.03	0.37	0.28	0.33	0.28
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.06	0.09	0.11	0.06	0.08	0.02	0.00	0.02	0.13	0.26	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.03	0.38	0.28	0.32	0.28
C5'	0.03	0.15	0.03	0.03	0.22	0.01	0.23	0.00	0.19	0.13	0.20	0.25	0.12	0.08	0.06	0.01	0.01	0.16	0.36	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.03	0.35	0.24	0.26	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.28	0.21	0.22	0.18
N3	0.02	0.00	0.05	0.17	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.02	0.33	0.25	0.30	0.24
N4	0.02	0.01	0.04	0.17	0.00	0.11	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.20	0.03	0.39	0.31	0.36	0.31
O2	0.04	0.01	0.12	0.17	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.17	0.04	0.24	0.22	0.22	0.17
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.09	0.08	0.06	0.08	0.04	0.05	0.11	0.09	0.15	0.00	0.05	0.08	0.08	0.12	0.23	0.08
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.18	0.02	0.18	0.06	0.15	0.09	0.17	0.20	0.17	0.05	0.00	0.01	0.13	0.16	0.27	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.08	0.01	0.00	0.11	0.14	0.18	0.05
O5'	0.17	0.29	0.19	0.22	0.37	0.02	0.38	0.01	0.35	0.28	0.33	0.39	0.24	0.08	0.13	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.17	0.22	0.20	0.23	0.28	0.13	0.28	0.16	0.24	0.21	0.25	0.31	0.22	0.12	0.16	0.14	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.25	0.16	0.19	0.33	0.26	0.32	0.36	0.26	0.22	0.30	0.36	0.22	0.23	0.27	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.20	0.13	0.14	0.28	0.03	0.28	0.02	0.23	0.18	0.24	0.31	0.17	0.08	0.09	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00