Doublet Group distance statistics: 50387

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 2, 2, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.018, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.021, 0.033, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.017, 0.031, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.019, 0.040, 0.062, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.040 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.017, 0.040, 0.062, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.040 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.024, 0.053, 0.082, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.077, 0.201, 0.325, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.201 std_dev=0.124
O4'	A	0, 0.092, 0.231, 0.369, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.231 std_dev=0.138
O2'	A	0, 0.113, 0.266, 0.420, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.266 std_dev=0.153
O2'	B	0, 0.253, 0.447, 0.642, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.447 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.112, 0.318, 0.524, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.318 std_dev=0.206
C3'	A	0, 0.102, 0.324, 0.545, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.324 std_dev=0.221
C2'	B	0, 0.286, 0.551, 0.816, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.551 std_dev=0.265
O3'	A	0, 0.170, 0.489, 0.808, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.489 std_dev=0.319
O3'	B	0, 0.293, 0.616, 0.938, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.616 std_dev=0.323
C5'	A	0, 0.185, 0.535, 0.884, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.535 std_dev=0.350
C1'	B	0, 0.316, 0.685, 1.053, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.685 std_dev=0.369
C3'	B	0, 0.319, 0.697, 1.075, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.697 std_dev=0.378
O2	B	0, 0.406, 0.809, 1.213, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.809 std_dev=0.404
C4'	B	0, 0.335, 0.807, 1.280, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.807 std_dev=0.473
N1	B	0, 0.388, 0.884, 1.380, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.884 std_dev=0.496
O4'	B	0, 0.345, 0.852, 1.359, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.852 std_dev=0.507
C2	B	0, 0.438, 0.948, 1.457, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.948 std_dev=0.510
OP1	B	0, 0.351, 0.904, 1.458, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.904 std_dev=0.554
P	A	0, 0.281, 0.842, 1.402, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.842 std_dev=0.560
O5'	B	0, 0.388, 0.969, 1.549, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.969 std_dev=0.581
P	B	0, 0.365, 0.960, 1.555, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.960 std_dev=0.595
OP2	A	0, 0.318, 0.930, 1.542, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.930 std_dev=0.612
C6	B	0, 0.449, 1.077, 1.705, 1.927 max_d=1.927 avg_d=1.077 std_dev=0.628
N3	B	0, 0.534, 1.188, 1.842, 2.132 max_d=2.132 avg_d=1.188 std_dev=0.654
C5'	B	0, 0.403, 1.122, 1.841, 1.982 max_d=1.982 avg_d=1.122 std_dev=0.719
O5'	A	0, 0.303, 1.052, 1.801, 1.816 max_d=1.816 avg_d=1.052 std_dev=0.749
C5	B	0, 0.549, 1.313, 2.078, 2.289 max_d=2.289 avg_d=1.313 std_dev=0.765
C4	B	0, 0.586, 1.366, 2.147, 2.390 max_d=2.390 avg_d=1.366 std_dev=0.780
OP1	A	0, 0.377, 1.186, 1.995, 2.114 max_d=2.114 avg_d=1.186 std_dev=0.809
OP2	B	0, 0.454, 1.274, 2.095, 2.422 max_d=2.422 avg_d=1.274 std_dev=0.821
N4	B	0, 0.693, 1.628, 2.563, 2.756 max_d=2.756 avg_d=1.628 std_dev=0.935

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.20	0.04	0.57	0.24
C2	0.04	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.04	0.50	0.10	0.29	0.07
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.08	0.10	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.33	0.28	0.46	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.11	0.06	0.08	0.04	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.39	0.47	0.37	0.11
C4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.02	0.50	0.08	0.34	0.08
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.15	0.56	0.16
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.59	0.09	0.20	0.08
C5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.13	0.04	0.02	0.07	0.11	0.07	0.03	0.04	0.01	0.01	0.24	0.47	0.02
C6	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.60	0.10	0.15	0.10
C8	0.02	0.01	0.03	0.11	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.10	0.03	0.56	0.06	0.33	0.07
N1	0.04	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.56	0.10	0.20	0.08
N3	0.04	0.00	0.10	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.11	0.04	0.44	0.09	0.36	0.09
N6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.62	0.11	0.11	0.14
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.62	0.08	0.15	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.44	0.05	0.43	0.11
O2'	0.00	0.12	0.00	0.02	0.07	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.10	0.11	0.07	0.02	0.03	0.00	0.04	0.04	0.17	0.24	0.49	0.12
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.10	0.10	0.11	0.05	0.08	0.03	0.04	0.00	0.01	0.30	0.63	0.30	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.18	0.71	0.39
O5'	0.20	0.50	0.33	0.39	0.50	0.01	0.59	0.01	0.60	0.56	0.56	0.44	0.62	0.62	0.44	0.17	0.30	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.04	0.10	0.28	0.47	0.08	0.15	0.09	0.24	0.10	0.06	0.10	0.09	0.11	0.08	0.05	0.24	0.63	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.57	0.29	0.46	0.37	0.34	0.56	0.20	0.47	0.15	0.33	0.20	0.36	0.11	0.15	0.43	0.49	0.30	0.71	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.07	0.06	0.11	0.08	0.16	0.08	0.02	0.10	0.07	0.08	0.09	0.14	0.10	0.11	0.12	0.18	0.39	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.14	0.21	0.10	0.08	0.11	0.13	0.29	0.12	0.09	0.12	0.08	0.24	0.33	0.18	0.11	0.42	0.19	0.32	0.23
C2	0.10	0.15	0.19	0.08	0.09	0.09	0.08	0.23	0.08	0.10	0.14	0.09	0.22	0.29	0.11	0.09	0.28	0.05	0.30	0.12
C2'	0.08	0.08	0.09	0.13	0.20	0.22	0.29	0.46	0.26	0.13	0.11	0.23	0.12	0.23	0.07	0.20	0.32	0.10	0.17	0.12
C3'	0.12	0.11	0.08	0.16	0.28	0.29	0.38	0.57	0.34	0.18	0.15	0.31	0.11	0.25	0.08	0.27	0.22	0.11	0.07	0.09
C4	0.07	0.13	0.19	0.07	0.05	0.14	0.10	0.32	0.10	0.06	0.11	0.05	0.22	0.31	0.13	0.12	0.31	0.08	0.26	0.13
C4'	0.07	0.06	0.14	0.07	0.17	0.21	0.27	0.45	0.25	0.11	0.07	0.19	0.16	0.30	0.12	0.21	0.29	0.09	0.13	0.09
C5	0.05	0.14	0.19	0.07	0.05	0.18	0.08	0.34	0.09	0.05	0.13	0.05	0.23	0.31	0.13	0.16	0.23	0.07	0.20	0.07
C5'	0.09	0.07	0.15	0.08	0.21	0.26	0.33	0.52	0.30	0.14	0.09	0.23	0.16	0.32	0.13	0.27	0.22	0.10	0.07	0.09
C6	0.05	0.15	0.20	0.09	0.07	0.18	0.05	0.31	0.07	0.06	0.15	0.08	0.25	0.31	0.13	0.15	0.16	0.09	0.19	0.04
C8	0.05	0.12	0.18	0.07	0.05	0.18	0.13	0.37	0.13	0.05	0.10	0.05	0.22	0.30	0.13	0.17	0.28	0.08	0.20	0.10
N1	0.07	0.16	0.20	0.08	0.08	0.14	0.04	0.26	0.05	0.07	0.15	0.09	0.23	0.31	0.12	0.10	0.17	0.09	0.23	0.05
N3	0.10	0.14	0.19	0.08	0.08	0.10	0.10	0.26	0.10	0.09	0.12	0.08	0.21	0.30	0.12	0.10	0.35	0.10	0.31	0.17
N6	0.08	0.19	0.21	0.11	0.12	0.20	0.07	0.31	0.08	0.09	0.19	0.14	0.28	0.29	0.14	0.19	0.10	0.13	0.14	0.07
N7	0.06	0.13	0.19	0.07	0.06	0.20	0.11	0.38	0.12	0.05	0.12	0.06	0.23	0.30	0.13	0.19	0.22	0.07	0.17	0.06
N9	0.06	0.12	0.19	0.07	0.05	0.14	0.12	0.34	0.12	0.06	0.10	0.05	0.22	0.31	0.14	0.13	0.34	0.11	0.26	0.15
O2'	0.10	0.10	0.09	0.14	0.20	0.19	0.28	0.40	0.24	0.14	0.12	0.23	0.13	0.20	0.10	0.17	0.37	0.16	0.24	0.19
O3'	0.17	0.18	0.08	0.23	0.38	0.34	0.49	0.64	0.43	0.26	0.24	0.43	0.10	0.21	0.14	0.31	0.17	0.15	0.12	0.13
O4'	0.07	0.12	0.22	0.11	0.07	0.12	0.15	0.32	0.14	0.06	0.10	0.07	0.23	0.34	0.21	0.14	0.38	0.17	0.27	0.18
O5'	0.61	0.69	0.75	0.55	0.53	0.38	0.41	0.12	0.43	0.58	0.65	0.52	0.82	0.90	0.60	0.43	0.84	0.50	0.65	0.58
OP1	0.18	0.24	0.30	0.16	0.13	0.09	0.08	0.23	0.09	0.16	0.22	0.12	0.34	0.40	0.19	0.08	0.56	0.37	0.43	0.38
OP2	0.16	0.14	0.16	0.23	0.17	0.42	0.30	0.69	0.30	0.16	0.13	0.17	0.25	0.28	0.19	0.36	0.12	0.32	0.18	0.25
P	0.13	0.22	0.26	0.12	0.10	0.17	0.10	0.39	0.10	0.11	0.20	0.10	0.35	0.39	0.14	0.13	0.36	0.11	0.22	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.22	0.22	0.09	0.15
C2	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.46	0.40	0.24	0.38
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.00	0.25	0.27	0.05	0.18
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03	0.07	0.05	0.09	0.01	0.01	0.01	0.29	0.33	0.09	0.21
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.67	0.60	0.49	0.59
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.12	0.30	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.71	0.61	0.49	0.62
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.10	0.00	0.10	0.00	0.08	0.06	0.09	0.11	0.06	0.03	0.05	0.01	0.01	0.20	0.43	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.62	0.50	0.29	0.49
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.45	0.38	0.17	0.34
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.57	0.51	0.38	0.49
N4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.72	0.67	0.61	0.67
O2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.09	0.03	0.36	0.32	0.17	0.29
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.00	0.03	0.03	0.02	0.09	0.17	0.02
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.06	0.09	0.03	0.00	0.02	0.15	0.24	0.17	0.12
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.08	0.13	0.22	0.05
O5'	0.22	0.46	0.25	0.29	0.67	0.02	0.71	0.01	0.62	0.45	0.57	0.72	0.36	0.02	0.15	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.40	0.27	0.33	0.60	0.12	0.61	0.20	0.50	0.38	0.51	0.67	0.32	0.09	0.24	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.24	0.05	0.09	0.49	0.30	0.49	0.43	0.29	0.17	0.38	0.61	0.17	0.17	0.17	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.38	0.18	0.21	0.59	0.02	0.62	0.01	0.49	0.34	0.49	0.67	0.29	0.02	0.12	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00