Doublet Group distance statistics: 50390

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 1, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.005, 0.027, 0.050, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.012, 0.041, 0.069, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.008, 0.038, 0.068, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.038 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.011, 0.047, 0.084, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.047 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.049, 0.167, 0.286, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.167 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.047, 0.201, 0.356, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.201 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.085, 0.271, 0.456, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.271 std_dev=0.186
C3'	A	0, 0.070, 0.290, 0.510, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.290 std_dev=0.220
O2'	A	0, 0.026, 0.262, 0.497, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.262 std_dev=0.236
O2'	B	0, 0.145, 0.411, 0.676, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.411 std_dev=0.266
C2'	B	0, 0.194, 0.464, 0.734, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.464 std_dev=0.270
O4'	B	0, 0.193, 0.490, 0.787, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.490 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.144, 0.443, 0.742, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.443 std_dev=0.299
C5'	A	0, 0.194, 0.501, 0.807, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.501 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.096, 0.427, 0.759, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.427 std_dev=0.331
C3'	B	0, 0.152, 0.484, 0.816, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.484 std_dev=0.332
O3'	B	0, 0.173, 0.522, 0.872, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.522 std_dev=0.350
C5'	B	0, 0.167, 0.549, 0.931, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.549 std_dev=0.382
C1'	B	0, 0.213, 0.600, 0.988, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.600 std_dev=0.388
O5'	B	0, 0.222, 0.673, 1.124, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.673 std_dev=0.451
P	B	0, 0.276, 0.793, 1.311, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.793 std_dev=0.517
OP1	B	0, 0.300, 0.871, 1.443, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.871 std_dev=0.572
N1	B	0, 0.243, 0.847, 1.452, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.847 std_dev=0.605
OP2	B	0, 0.360, 0.993, 1.626, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.993 std_dev=0.633
C6	B	0, 0.204, 0.849, 1.494, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.849 std_dev=0.645
O5'	A	0, 0.051, 0.731, 1.411, 2.149 max_d=2.149 avg_d=0.731 std_dev=0.680
C2	B	0, 0.259, 1.167, 2.075, 2.507 max_d=2.507 avg_d=1.167 std_dev=0.908
C5	B	0, 0.199, 1.142, 2.084, 2.771 max_d=2.771 avg_d=1.142 std_dev=0.943
O2	B	0, 0.264, 1.249, 2.234, 2.780 max_d=2.780 avg_d=1.249 std_dev=0.985
P	A	0, 0.029, 1.075, 2.121, 3.165 max_d=3.165 avg_d=1.075 std_dev=1.046
OP2	A	0, 0.097, 1.181, 2.266, 3.213 max_d=3.213 avg_d=1.181 std_dev=1.084
N3	B	0, 0.246, 1.426, 2.605, 3.140 max_d=3.140 avg_d=1.426 std_dev=1.179
C4	B	0, 0.222, 1.416, 2.610, 3.216 max_d=3.216 avg_d=1.416 std_dev=1.194
OP1	A	0, 0.054, 1.416, 2.778, 4.233 max_d=4.233 avg_d=1.416 std_dev=1.362
N4	B	0, 0.206, 1.717, 3.228, 3.955 max_d=3.955 avg_d=1.717 std_dev=1.511

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.27	0.22	0.28	0.14
C2	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.18	0.07	0.42	0.26	0.32	0.25
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.07	0.09	0.09	0.13	0.08	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01	0.13	0.13	0.38	0.08
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.03	0.12	0.08	0.13	0.13	0.12	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.05	0.15	0.43	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.44	0.27	0.30	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.20	0.32	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.52	0.32	0.32	0.32
C5'	0.04	0.10	0.02	0.03	0.12	0.01	0.17	0.00	0.17	0.19	0.14	0.08	0.20	0.21	0.12	0.07	0.08	0.02	0.01	0.35	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.16	0.04	0.52	0.33	0.34	0.34
C8	0.01	0.02	0.09	0.08	0.01	0.08	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.11	0.05	0.53	0.33	0.26	0.31
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.17	0.06	0.48	0.30	0.33	0.31
N3	0.01	0.00	0.13	0.13	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.16	0.07	0.38	0.23	0.31	0.22
N6	0.03	0.01	0.08	0.12	0.02	0.08	0.02	0.20	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.17	0.05	0.56	0.37	0.37	0.39
N7	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.08	0.00	0.21	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.56	0.36	0.32	0.37
N9	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.42	0.26	0.27	0.23
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.07	0.07	0.02	0.00	0.05	0.05	0.06	0.13	0.38	0.09
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.12	0.03	0.14	0.08	0.16	0.11	0.17	0.16	0.17	0.13	0.07	0.05	0.00	0.02	0.21	0.25	0.48	0.28
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.28	0.34	0.22	0.21
O5'	0.27	0.42	0.13	0.05	0.44	0.02	0.52	0.01	0.52	0.53	0.48	0.38	0.56	0.56	0.42	0.06	0.21	0.28	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.22	0.26	0.13	0.15	0.27	0.20	0.32	0.35	0.33	0.33	0.30	0.23	0.37	0.36	0.26	0.13	0.25	0.34	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.32	0.38	0.43	0.30	0.32	0.32	0.29	0.34	0.26	0.33	0.31	0.37	0.32	0.27	0.38	0.48	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.25	0.08	0.16	0.25	0.04	0.32	0.02	0.34	0.31	0.31	0.22	0.39	0.37	0.23	0.09	0.28	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.86	0.18	0.16	0.97	0.17	0.77	0.21	0.59	0.61	1.03	1.09	0.91	0.10	0.12	0.27	0.25	0.16	0.26	0.16
C2	0.25	0.51	0.17	0.18	0.49	0.20	0.39	0.24	0.33	0.38	0.54	0.52	0.56	0.14	0.17	0.22	0.21	0.14	0.17	0.13
C2'	0.51	1.07	0.36	0.28	1.15	0.24	0.92	0.23	0.74	0.78	1.23	1.27	1.14	0.24	0.19	0.37	0.32	0.20	0.36	0.24
C3'	0.54	1.07	0.43	0.35	1.13	0.29	0.90	0.25	0.73	0.78	1.23	1.26	1.15	0.35	0.27	0.40	0.33	0.20	0.34	0.23
C4	0.30	0.69	0.18	0.16	0.70	0.16	0.54	0.20	0.43	0.49	0.77	0.76	0.77	0.11	0.13	0.24	0.19	0.15	0.16	0.11
C4'	0.38	0.90	0.27	0.22	1.02	0.19	0.79	0.20	0.61	0.63	1.08	1.16	0.96	0.20	0.16	0.30	0.25	0.15	0.26	0.16
C5	0.28	0.60	0.17	0.15	0.57	0.16	0.41	0.19	0.32	0.41	0.66	0.62	0.70	0.13	0.15	0.20	0.15	0.22	0.14	0.15
C5'	0.42	0.90	0.31	0.26	0.99	0.22	0.77	0.23	0.61	0.65	1.06	1.12	0.97	0.24	0.19	0.33	0.26	0.12	0.26	0.16
C6	0.25	0.48	0.18	0.17	0.40	0.18	0.27	0.20	0.22	0.32	0.50	0.43	0.58	0.15	0.18	0.19	0.15	0.25	0.17	0.18
C8	0.32	0.74	0.18	0.14	0.76	0.15	0.56	0.18	0.44	0.51	0.85	0.85	0.84	0.11	0.12	0.23	0.16	0.21	0.15	0.13
N1	0.24	0.42	0.18	0.19	0.35	0.19	0.24	0.22	0.21	0.30	0.43	0.37	0.51	0.16	0.19	0.19	0.15	0.17	0.13	0.13
N3	0.29	0.67	0.17	0.18	0.69	0.19	0.57	0.24	0.46	0.50	0.75	0.75	0.72	0.11	0.14	0.26	0.24	0.15	0.22	0.16
N6	0.24	0.42	0.18	0.20	0.31	0.20	0.19	0.23	0.17	0.27	0.42	0.32	0.53	0.16	0.21	0.19	0.21	0.37	0.28	0.30
N7	0.29	0.65	0.18	0.15	0.62	0.15	0.44	0.19	0.34	0.43	0.72	0.69	0.76	0.13	0.15	0.21	0.15	0.27	0.16	0.17
N9	0.33	0.78	0.18	0.15	0.82	0.16	0.64	0.19	0.50	0.54	0.90	0.91	0.85	0.10	0.12	0.25	0.20	0.16	0.18	0.12
O2'	0.45	1.08	0.30	0.24	1.24	0.22	0.99	0.22	0.78	0.77	1.30	1.39	1.10	0.22	0.20	0.34	0.33	0.22	0.41	0.27
O3'	0.62	1.16	0.53	0.44	1.24	0.37	0.99	0.31	0.81	0.86	1.34	1.38	1.24	0.46	0.38	0.47	0.40	0.28	0.42	0.31
O4'	0.31	0.81	0.17	0.16	0.94	0.17	0.73	0.22	0.55	0.56	0.99	1.08	0.86	0.11	0.12	0.26	0.23	0.17	0.23	0.16
O5'	0.41	0.80	0.34	0.35	0.85	0.41	0.65	0.47	0.53	0.56	0.94	0.97	0.91	0.32	0.36	0.43	0.46	0.54	0.43	0.47
OP1	0.51	0.90	0.49	0.41	0.88	0.35	0.67	0.32	0.55	0.64	1.00	0.98	1.05	0.48	0.40	0.39	0.33	0.25	0.30	0.27
OP2	0.75	1.16	0.72	0.60	1.06	0.51	0.81	0.40	0.71	0.87	1.23	1.13	1.34	0.71	0.56	0.55	0.39	0.15	0.31	0.24
P	0.45	0.86	0.42	0.34	0.83	0.30	0.62	0.30	0.51	0.59	0.96	0.93	1.01	0.40	0.32	0.35	0.30	0.30	0.28	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.07	0.07	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.18	0.19	0.25	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.08	0.08	0.12	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.09	0.05
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.01	0.07	0.08	0.16	0.16	0.16	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.26	0.30	0.37	0.32
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.09	0.06	0.09	0.11	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.04	0.26	0.29	0.34	0.32
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.18	0.01	0.19	0.00	0.16	0.10	0.14	0.20	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.04	0.20	0.21	0.23	0.24
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.15	0.15	0.19	0.17
N3	0.02	0.00	0.08	0.16	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.18	0.02	0.23	0.25	0.32	0.27
N4	0.02	0.01	0.08	0.16	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.19	0.03	0.29	0.35	0.43	0.36
O2	0.03	0.01	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.18	0.04	0.15	0.15	0.21	0.16
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.07	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05	0.00	0.02	0.06	0.03	0.10	0.06	0.04
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.16	0.01	0.12	0.02	0.08	0.09	0.18	0.19	0.18	0.02	0.00	0.01	0.09	0.20	0.14	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.08	0.07	0.10	0.09
O5'	0.07	0.18	0.04	0.06	0.26	0.01	0.26	0.01	0.20	0.15	0.23	0.29	0.15	0.03	0.09	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.19	0.11	0.14	0.30	0.07	0.29	0.05	0.21	0.15	0.25	0.35	0.15	0.10	0.20	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.25	0.09	0.10	0.37	0.02	0.34	0.01	0.23	0.19	0.32	0.43	0.21	0.06	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.20	0.05	0.08	0.32	0.02	0.32	0.01	0.24	0.17	0.27	0.36	0.16	0.04	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00