Doublet Group distance statistics: 50393

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.009 std_dev=0.004
N6	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.016, 0.028, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.028 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.025, 0.042, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.042 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.026, 0.045, 0.065, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.045 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.026, 0.047, 0.067, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.047 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.062, 0.221, 0.380, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.221 std_dev=0.159
O4'	A	0, 0.009, 0.184, 0.358, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.184 std_dev=0.175
O2'	A	0, 0.240, 0.416, 0.593, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.416 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.103, 0.365, 0.627, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.365 std_dev=0.262
C2'	B	0, 0.387, 0.658, 0.928, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.658 std_dev=0.271
C3'	A	0, 0.042, 0.319, 0.596, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.319 std_dev=0.277
O2'	B	0, 0.299, 0.654, 1.010, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.654 std_dev=0.356
O3'	A	0, 0.121, 0.490, 0.858, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.490 std_dev=0.369
C5'	A	0, 0.184, 0.659, 1.135, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.659 std_dev=0.476
O5'	A	0, 0.195, 0.704, 1.212, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.704 std_dev=0.508
C3'	B	0, 0.419, 1.013, 1.607, 2.287 max_d=2.287 avg_d=1.013 std_dev=0.594
P	A	0, 0.465, 1.171, 1.878, 2.579 max_d=2.579 avg_d=1.171 std_dev=0.707
C1'	B	0, 0.049, 0.912, 1.776, 3.095 max_d=3.095 avg_d=0.912 std_dev=0.863
OP2	A	0, 0.501, 1.412, 2.323, 3.165 max_d=3.165 avg_d=1.412 std_dev=0.911
N1	B	0, 0.256, 1.342, 2.428, 4.020 max_d=4.020 avg_d=1.342 std_dev=1.086
C6	B	0, 0.415, 1.554, 2.693, 4.297 max_d=4.297 avg_d=1.554 std_dev=1.139
O3'	B	0, 0.348, 1.488, 2.628, 4.252 max_d=4.252 avg_d=1.488 std_dev=1.140
C4'	B	0, -0.173, 1.026, 2.225, 4.109 max_d=4.109 avg_d=1.026 std_dev=1.199
O4'	B	0, -0.019, 1.181, 2.380, 4.192 max_d=4.192 avg_d=1.181 std_dev=1.200
OP1	A	0, 1.883, 3.087, 4.291, 3.888 max_d=3.888 avg_d=3.087 std_dev=1.204
O5'	B	0, 0.908, 2.256, 3.604, 5.272 max_d=5.272 avg_d=2.256 std_dev=1.348
C5	B	0, 0.654, 2.044, 3.433, 5.318 max_d=5.318 avg_d=2.044 std_dev=1.389
C2	B	0, 0.253, 1.758, 3.264, 5.521 max_d=5.521 avg_d=1.758 std_dev=1.505
O2	B	0, 0.185, 1.760, 3.336, 5.731 max_d=5.731 avg_d=1.760 std_dev=1.575
OP2	B	0, 2.463, 4.150, 5.837, 6.190 max_d=6.190 avg_d=4.150 std_dev=1.687
C5'	B	0, -0.182, 1.579, 3.341, 6.099 max_d=6.099 avg_d=1.579 std_dev=1.761
C4	B	0, 0.600, 2.421, 4.242, 6.852 max_d=6.852 avg_d=2.421 std_dev=1.821
P	B	0, 1.911, 3.786, 5.662, 7.391 max_d=7.391 avg_d=3.786 std_dev=1.875
N3	B	0, 0.371, 2.307, 4.244, 7.132 max_d=7.132 avg_d=2.307 std_dev=1.936
N4	B	0, 0.771, 3.014, 5.258, 8.469 max_d=8.469 avg_d=3.014 std_dev=2.243
OP1	B	0, 1.922, 4.403, 6.885, 9.666 max_d=9.666 avg_d=4.403 std_dev=2.482

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.54	0.16	0.22
C2	0.02	0.00	0.18	0.19	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.25	0.04	0.17	0.70	0.39	0.34
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.08	0.14	0.18	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.28	0.11	0.12
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.10	0.16	0.18	0.09	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.09	0.06
C4	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.02	0.15	0.67	0.35	0.33
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.23	0.05	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.18	0.70	0.43	0.38
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.07	0.12	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.14	0.02	0.19	0.73	0.47	0.40
C8	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.03	0.14	0.64	0.34	0.34
N1	0.02	0.00	0.14	0.16	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.21	0.03	0.19	0.73	0.45	0.38
N3	0.02	0.00	0.18	0.18	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.22	0.04	0.15	0.67	0.34	0.31
N6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.12	0.02	0.21	0.74	0.51	0.43
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.17	0.68	0.44	0.39
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.12	0.62	0.28	0.30
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.08	0.03	0.06	0.03	0.09	0.05	0.14	0.16	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.29	0.06	0.12
O3'	0.01	0.25	0.02	0.00	0.12	0.00	0.09	0.01	0.14	0.11	0.21	0.22	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.22	0.13	0.08
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.57	0.11	0.21
O5'	0.07	0.17	0.03	0.02	0.15	0.01	0.18	0.01	0.19	0.14	0.19	0.15	0.21	0.17	0.12	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.54	0.70	0.28	0.10	0.67	0.23	0.70	0.07	0.73	0.64	0.73	0.67	0.74	0.68	0.62	0.29	0.22	0.57	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.39	0.11	0.09	0.35	0.05	0.43	0.13	0.47	0.34	0.45	0.34	0.51	0.44	0.28	0.06	0.13	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.34	0.12	0.06	0.33	0.07	0.38	0.01	0.40	0.34	0.38	0.31	0.43	0.39	0.30	0.12	0.08	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.28	0.12	0.21	0.27	0.38	0.19	0.52	0.17	0.18	0.33	0.31	0.36	0.13	0.24	0.32	0.41	0.68	0.42	0.49
C2	0.30	0.35	0.10	0.15	0.35	0.23	0.34	0.26	0.32	0.32	0.36	0.36	0.36	0.12	0.29	0.32	0.25	0.26	0.29	0.24
C2'	0.40	0.23	0.28	0.34	0.25	0.57	0.35	0.70	0.40	0.34	0.21	0.23	0.21	0.29	0.27	0.59	0.62	0.91	0.65	0.74
C3'	0.49	0.38	0.37	0.37	0.40	0.58	0.47	0.69	0.50	0.45	0.36	0.39	0.34	0.36	0.27	0.63	0.64	0.93	0.68	0.77
C4	0.23	0.26	0.11	0.14	0.27	0.25	0.26	0.32	0.25	0.23	0.28	0.29	0.26	0.12	0.22	0.29	0.26	0.32	0.29	0.26
C4'	0.26	0.14	0.19	0.28	0.11	0.49	0.17	0.65	0.23	0.17	0.16	0.13	0.20	0.21	0.26	0.46	0.55	0.88	0.57	0.67
C5	0.29	0.19	0.12	0.12	0.23	0.33	0.29	0.39	0.31	0.25	0.20	0.23	0.16	0.14	0.19	0.42	0.34	0.31	0.38	0.36
C5'	0.23	0.18	0.23	0.26	0.17	0.42	0.17	0.56	0.20	0.18	0.21	0.20	0.23	0.24	0.24	0.39	0.47	0.79	0.49	0.59
C6	0.37	0.18	0.12	0.12	0.24	0.43	0.35	0.50	0.39	0.30	0.18	0.23	0.15	0.18	0.20	0.57	0.45	0.44	0.50	0.51
C8	0.22	0.20	0.12	0.13	0.22	0.28	0.23	0.35	0.23	0.21	0.21	0.23	0.19	0.12	0.17	0.32	0.27	0.30	0.31	0.29
N1	0.40	0.25	0.11	0.11	0.30	0.37	0.38	0.40	0.41	0.35	0.24	0.29	0.18	0.18	0.26	0.54	0.39	0.34	0.43	0.42
N3	0.21	0.35	0.11	0.17	0.34	0.27	0.27	0.35	0.24	0.26	0.38	0.37	0.40	0.12	0.28	0.24	0.28	0.43	0.30	0.30
N6	0.44	0.15	0.14	0.14	0.21	0.58	0.38	0.71	0.46	0.32	0.18	0.20	0.25	0.23	0.19	0.74	0.63	0.71	0.69	0.75
N7	0.27	0.17	0.13	0.12	0.21	0.35	0.27	0.42	0.29	0.23	0.19	0.21	0.18	0.15	0.16	0.43	0.35	0.34	0.40	0.39
N9	0.19	0.24	0.12	0.15	0.25	0.27	0.22	0.36	0.20	0.20	0.27	0.28	0.27	0.12	0.21	0.27	0.28	0.41	0.30	0.30
O2'	0.47	0.22	0.27	0.41	0.24	0.75	0.40	0.94	0.47	0.37	0.20	0.21	0.23	0.26	0.32	0.76	0.83	1.21	0.87	1.00
O3'	0.73	0.61	0.51	0.49	0.67	0.77	0.77	0.90	0.79	0.71	0.60	0.66	0.53	0.48	0.31	0.90	0.87	1.19	0.94	1.05
O4'	0.16	0.33	0.11	0.20	0.33	0.37	0.21	0.52	0.17	0.20	0.40	0.39	0.41	0.12	0.24	0.30	0.40	0.69	0.41	0.48
O5'	0.22	0.28	0.30	0.25	0.28	0.29	0.23	0.38	0.22	0.23	0.31	0.31	0.32	0.30	0.26	0.27	0.31	0.56	0.34	0.40
OP1	0.47	0.66	0.49	0.43	0.70	0.40	0.61	0.45	0.54	0.56	0.73	0.76	0.69	0.48	0.46	0.40	0.35	0.33	0.40	0.29
OP2	0.40	0.53	0.54	0.46	0.52	0.33	0.43	0.34	0.40	0.44	0.56	0.55	0.58	0.52	0.48	0.33	0.34	0.51	0.33	0.39
P	0.17	0.33	0.26	0.19	0.36	0.19	0.29	0.29	0.23	0.24	0.39	0.41	0.36	0.24	0.24	0.16	0.14	0.28	0.19	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.08	0.11
C2	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.12	0.15	0.17	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.14	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.20	0.12
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.11	0.04	0.08	0.06	0.16	0.02	0.01	0.00	0.18	0.11	0.23	0.18
C4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.03	0.17	0.18	0.23	0.18
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.05	0.06	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.14	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.19	0.21	0.25	0.21
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.12	0.00	0.12	0.00	0.09	0.07	0.12	0.14	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.18	0.20	0.20	0.19
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.13	0.17	0.15	0.14
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.14	0.15	0.20	0.15
N4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.17	0.19	0.26	0.20
O2	0.03	0.00	0.14	0.16	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.19	0.03	0.10	0.15	0.16	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.06	0.10	0.00	0.03	0.05	0.02	0.18	0.11	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.12	0.03	0.09	0.07	0.19	0.03	0.00	0.01	0.24	0.21	0.26	0.22
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.15	0.27	0.06	0.15
O5'	0.09	0.12	0.07	0.18	0.17	0.01	0.19	0.01	0.18	0.13	0.14	0.17	0.10	0.02	0.24	0.15	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.19	0.15	0.07	0.11	0.18	0.14	0.21	0.05	0.20	0.17	0.15	0.19	0.15	0.18	0.21	0.27	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.17	0.20	0.23	0.23	0.03	0.25	0.10	0.20	0.15	0.20	0.26	0.16	0.11	0.26	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.12	0.18	0.18	0.05	0.21	0.01	0.19	0.14	0.15	0.20	0.11	0.05	0.22	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00