Doublet Group distance statistics: 50394

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.018, 0.037, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.019, 0.042, 0.066, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.022, 0.050, 0.077, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.050 std_dev=0.028
O2'	A	0, 0.074, 0.167, 0.260, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.167 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.046, 0.186, 0.326, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.186 std_dev=0.140
O4'	A	0, 0.099, 0.260, 0.422, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.260 std_dev=0.161
O2'	B	0, 0.220, 0.432, 0.645, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.432 std_dev=0.212
C3'	A	0, 0.194, 0.435, 0.677, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.435 std_dev=0.241
C4'	A	0, 0.216, 0.464, 0.712, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.464 std_dev=0.248
O4'	B	0, 0.308, 0.557, 0.806, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.557 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.309, 0.564, 0.820, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.564 std_dev=0.256
C2'	B	0, 0.339, 0.606, 0.872, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.606 std_dev=0.267
C4'	B	0, 0.343, 0.667, 0.990, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.667 std_dev=0.324
O3'	A	0, 0.251, 0.575, 0.899, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.575 std_dev=0.324
C3'	B	0, 0.378, 0.739, 1.100, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.739 std_dev=0.361
C5'	A	0, 0.341, 0.737, 1.133, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.737 std_dev=0.396
O3'	B	0, 0.356, 0.768, 1.180, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.768 std_dev=0.412
N1	B	0, 0.429, 0.849, 1.270, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.849 std_dev=0.420
C5'	B	0, 0.394, 0.851, 1.307, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.851 std_dev=0.457
O5'	B	0, 0.531, 1.040, 1.550, 1.561 max_d=1.561 avg_d=1.040 std_dev=0.510
C6	B	0, 0.475, 1.005, 1.535, 1.713 max_d=1.713 avg_d=1.005 std_dev=0.530
O2	B	0, 0.480, 1.026, 1.572, 1.721 max_d=1.721 avg_d=1.026 std_dev=0.546
O5'	A	0, 0.351, 0.898, 1.445, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.898 std_dev=0.547
C2	B	0, 0.497, 1.044, 1.591, 1.806 max_d=1.806 avg_d=1.044 std_dev=0.547
P	B	0, 0.588, 1.241, 1.893, 1.966 max_d=1.966 avg_d=1.241 std_dev=0.653
C5	B	0, 0.571, 1.268, 1.964, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.268 std_dev=0.697
OP1	B	0, 0.561, 1.260, 1.959, 2.028 max_d=2.028 avg_d=1.260 std_dev=0.699
N3	B	0, 0.589, 1.313, 2.037, 2.380 max_d=2.380 avg_d=1.313 std_dev=0.724
OP2	B	0, 0.663, 1.402, 2.141, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.402 std_dev=0.739
C4	B	0, 0.626, 1.403, 2.180, 2.559 max_d=2.559 avg_d=1.403 std_dev=0.777
N4	B	0, 0.728, 1.680, 2.633, 3.119 max_d=3.119 avg_d=1.680 std_dev=0.952
OP2	A	0, 0.608, 1.576, 2.544, 2.656 max_d=2.656 avg_d=1.576 std_dev=0.968
P	A	0, 0.331, 1.850, 3.370, 3.613 max_d=3.613 avg_d=1.850 std_dev=1.520
OP1	A	0, 0.213, 2.658, 5.103, 5.513 max_d=5.513 avg_d=2.658 std_dev=2.445

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.42	0.24	0.23
C2	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.55	1.04	0.63	0.81
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.09	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.10	0.31	0.18
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.08	0.09	0.10	0.10	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.42	0.18	0.40	0.21
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.54	1.13	0.62	0.83
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.05	0.06	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.32	0.12	0.15
C5	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.67	1.55	0.82	1.14
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.13	0.09	0.05	0.13	0.13	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.18	0.26	0.02
C6	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.70	1.61	0.88	1.21
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.60	1.56	0.73	1.07
N1	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.65	1.36	0.78	1.04
N3	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.01	0.47	0.86	0.52	0.65
N6	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.02	0.77	1.86	1.02	1.40
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.70	1.83	0.90	1.31
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.46	1.03	0.53	0.71
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.08	0.09	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.09	0.46	0.08	0.20
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.10	0.09	0.13	0.12	0.10	0.08	0.03	0.04	0.00	0.02	0.32	0.70	0.32	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.30	0.08	0.07
O5'	0.19	0.55	0.33	0.42	0.54	0.01	0.67	0.01	0.70	0.60	0.65	0.47	0.77	0.70	0.46	0.09	0.32	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.42	1.04	0.10	0.18	1.13	0.32	1.55	0.18	1.61	1.56	1.36	0.86	1.86	1.83	1.03	0.46	0.70	0.30	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.24	0.63	0.31	0.40	0.62	0.12	0.82	0.26	0.88	0.73	0.78	0.52	1.02	0.90	0.53	0.08	0.32	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.23	0.81	0.18	0.21	0.83	0.15	1.14	0.02	1.21	1.07	1.04	0.65	1.40	1.31	0.71	0.20	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.14	0.18	0.29	0.09	0.31	0.12	0.42	0.14	0.08	0.14	0.09	0.24	0.20	0.37	0.16	0.39	0.50	0.43	0.46
C2	0.11	0.21	0.14	0.15	0.14	0.16	0.09	0.19	0.09	0.12	0.20	0.14	0.29	0.18	0.18	0.09	0.15	0.17	0.17	0.18
C2'	0.10	0.20	0.10	0.20	0.12	0.21	0.10	0.33	0.10	0.11	0.19	0.12	0.30	0.11	0.26	0.10	0.31	0.43	0.38	0.40
C3'	0.12	0.26	0.08	0.17	0.18	0.16	0.09	0.27	0.08	0.15	0.26	0.19	0.36	0.12	0.25	0.08	0.25	0.37	0.31	0.32
C4	0.09	0.24	0.11	0.18	0.17	0.22	0.10	0.30	0.08	0.12	0.25	0.19	0.34	0.16	0.24	0.10	0.24	0.31	0.26	0.29
C4'	0.07	0.19	0.16	0.27	0.12	0.25	0.09	0.36	0.10	0.09	0.20	0.14	0.28	0.19	0.37	0.11	0.34	0.46	0.39	0.40
C5	0.14	0.36	0.11	0.14	0.30	0.16	0.19	0.22	0.15	0.21	0.38	0.33	0.46	0.14	0.19	0.08	0.16	0.23	0.17	0.20
C5'	0.05	0.20	0.17	0.27	0.15	0.25	0.07	0.34	0.06	0.08	0.22	0.17	0.30	0.23	0.37	0.09	0.31	0.42	0.35	0.36
C6	0.20	0.43	0.15	0.13	0.38	0.12	0.27	0.14	0.22	0.29	0.46	0.40	0.53	0.16	0.16	0.10	0.10	0.14	0.12	0.13
C8	0.09	0.30	0.11	0.19	0.24	0.22	0.13	0.32	0.10	0.15	0.33	0.27	0.41	0.16	0.26	0.09	0.26	0.36	0.28	0.31
N1	0.20	0.37	0.18	0.15	0.30	0.12	0.21	0.12	0.18	0.25	0.37	0.31	0.45	0.19	0.17	0.11	0.10	0.12	0.11	0.12
N3	0.08	0.15	0.13	0.20	0.09	0.23	0.09	0.30	0.10	0.08	0.15	0.09	0.24	0.17	0.24	0.12	0.26	0.30	0.28	0.30
N6	0.26	0.56	0.20	0.16	0.52	0.12	0.39	0.11	0.32	0.38	0.60	0.56	0.65	0.17	0.16	0.15	0.12	0.14	0.15	0.14
N7	0.13	0.38	0.10	0.14	0.33	0.18	0.21	0.25	0.15	0.22	0.42	0.37	0.49	0.14	0.21	0.08	0.18	0.27	0.20	0.23
N9	0.07	0.22	0.13	0.23	0.15	0.25	0.09	0.35	0.09	0.10	0.23	0.17	0.32	0.18	0.29	0.12	0.30	0.40	0.33	0.36
O2'	0.15	0.17	0.18	0.29	0.17	0.28	0.22	0.41	0.22	0.16	0.17	0.18	0.24	0.13	0.33	0.19	0.42	0.56	0.50	0.51
O3'	0.16	0.28	0.09	0.17	0.20	0.15	0.12	0.23	0.11	0.18	0.28	0.21	0.38	0.09	0.23	0.12	0.22	0.34	0.30	0.30
O4'	0.09	0.14	0.22	0.33	0.09	0.32	0.12	0.43	0.14	0.08	0.15	0.10	0.23	0.25	0.43	0.16	0.40	0.53	0.44	0.47
O5'	0.47	0.32	0.51	0.57	0.44	0.63	0.55	0.74	0.57	0.45	0.33	0.43	0.20	0.51	0.56	0.57	0.73	0.79	0.79	0.81
OP1	1.01	1.04	1.07	0.91	1.00	0.84	0.96	0.70	0.95	1.00	1.03	1.00	1.06	1.18	0.87	0.90	0.70	0.41	0.61	0.58
OP2	0.56	0.43	0.58	0.61	0.53	0.66	0.63	0.73	0.64	0.54	0.44	0.53	0.32	0.59	0.58	0.63	0.73	0.74	0.78	0.78
P	0.72	0.66	0.71	0.67	0.73	0.70	0.78	0.72	0.78	0.72	0.67	0.74	0.59	0.73	0.60	0.74	0.72	0.62	0.74	0.73

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.08	0.08	0.15	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.03	0.07	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.11	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.10	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.10	0.14	0.21	0.16
C4'	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02
C5	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.12	0.16	0.21	0.17
C5'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.06	0.02	0.09	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.03	0.11	0.13	0.17	0.14
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.08	0.09	0.14	0.11
N3	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.09	0.11	0.18	0.13
N4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.10	0.01	0.11	0.16	0.23	0.17
O2	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.11	0.04	0.06	0.05	0.13	0.08
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.09	0.06	0.09	0.04	0.03	0.06	0.08	0.06	0.00	0.03	0.06	0.07	0.11	0.09	0.07
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.07	0.04	0.08	0.10	0.11	0.03	0.00	0.01	0.09	0.15	0.15	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04
O5'	0.04	0.08	0.04	0.06	0.10	0.02	0.12	0.01	0.11	0.08	0.09	0.11	0.06	0.07	0.09	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.08	0.05	0.07	0.14	0.02	0.16	0.03	0.13	0.09	0.11	0.16	0.05	0.11	0.15	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.15	0.11	0.11	0.21	0.04	0.21	0.03	0.17	0.14	0.18	0.23	0.13	0.09	0.15	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.05	0.07	0.16	0.02	0.17	0.01	0.14	0.11	0.13	0.17	0.08	0.07	0.12	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00