Doublet Group distance statistics: 50395

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.038 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.025, 0.046, 0.066, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.046 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.026, 0.050, 0.074, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.025, 0.049, 0.074, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.049 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.029, 0.056, 0.083, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.056 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.032, 0.060, 0.087, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.060 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.030, 0.058, 0.087, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.058 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.024, 0.052, 0.081, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.037, 0.068, 0.099, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.068 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.049, 0.105, 0.162, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.105 std_dev=0.057
O2'	A	0, 0.086, 0.166, 0.245, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.166 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.107, 0.249, 0.392, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.249 std_dev=0.142
O4'	A	0, 0.192, 0.385, 0.577, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.385 std_dev=0.193
OP2	A	0, 0.298, 0.568, 0.839, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.568 std_dev=0.270
C3'	A	0, 0.249, 0.537, 0.826, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.537 std_dev=0.289
C4'	A	0, 0.262, 0.560, 0.858, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.560 std_dev=0.298
O2'	B	0, 0.254, 0.564, 0.873, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.564 std_dev=0.310
O5'	A	0, 0.357, 0.740, 1.122, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.740 std_dev=0.382
O3'	A	0, 0.396, 0.836, 1.276, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.836 std_dev=0.440
C5'	A	0, 0.358, 0.801, 1.245, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.801 std_dev=0.444
C2'	B	0, 0.352, 0.800, 1.247, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.800 std_dev=0.448
P	A	0, 0.390, 0.860, 1.330, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.860 std_dev=0.470
C1'	B	0, 0.374, 0.894, 1.413, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.894 std_dev=0.520
O4'	B	0, 0.438, 1.058, 1.678, 1.665 max_d=1.665 avg_d=1.058 std_dev=0.620
OP1	A	0, 0.465, 1.196, 1.928, 1.897 max_d=1.897 avg_d=1.196 std_dev=0.731
C4'	B	0, 0.579, 1.325, 2.072, 2.020 max_d=2.020 avg_d=1.325 std_dev=0.746
N1	B	0, 0.600, 1.390, 2.181, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.390 std_dev=0.790
C3'	B	0, 0.627, 1.422, 2.217, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.422 std_dev=0.795
O2	B	0, 0.552, 1.454, 2.355, 2.449 max_d=2.449 avg_d=1.454 std_dev=0.901
C6	B	0, 0.809, 1.770, 2.730, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.770 std_dev=0.960
C2	B	0, 0.660, 1.620, 2.581, 2.599 max_d=2.599 avg_d=1.620 std_dev=0.960
O3'	B	0, 0.765, 1.742, 2.718, 2.646 max_d=2.646 avg_d=1.742 std_dev=0.977
C5'	B	0, 0.839, 1.971, 3.103, 2.951 max_d=2.951 avg_d=1.971 std_dev=1.132
C5	B	0, 1.016, 2.225, 3.434, 3.276 max_d=3.276 avg_d=2.225 std_dev=1.209
N3	B	0, 0.891, 2.142, 3.392, 3.315 max_d=3.315 avg_d=2.142 std_dev=1.250
O5'	B	0, 0.953, 2.238, 3.523, 3.324 max_d=3.324 avg_d=2.238 std_dev=1.285
C4	B	0, 1.049, 2.396, 3.744, 3.581 max_d=3.581 avg_d=2.396 std_dev=1.348
P	B	0, 1.094, 2.708, 4.323, 3.990 max_d=3.990 avg_d=2.708 std_dev=1.614
N4	B	0, 1.282, 2.940, 4.598, 4.338 max_d=4.338 avg_d=2.940 std_dev=1.658
OP1	B	0, 1.160, 2.910, 4.660, 4.259 max_d=4.259 avg_d=2.910 std_dev=1.750
OP2	B	0, 1.224, 3.022, 4.820, 4.431 max_d=4.431 avg_d=3.022 std_dev=1.798

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.08	0.08
C2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.05	0.05	0.04	0.09	0.09
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.11	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.09	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.12	0.11	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.07	0.03
C4	0.01	0.02	0.06	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04	0.03	0.09	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.05	0.03	0.09	0.09
C5'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.04	0.05	0.03	0.08	0.09
C8	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.09	0.08
N1	0.03	0.01	0.10	0.12	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.05	0.05	0.04	0.08	0.09
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.11	0.05	0.05	0.04	0.09	0.08
N6	0.03	0.01	0.04	0.08	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.11	0.05	0.07	0.04	0.06	0.10
N7	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.09	0.08
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.09	0.08
O2'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.07	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.04
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.14	0.11	0.11	0.05	0.03	0.03	0.00	0.02	0.06	0.13	0.04	0.03
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.06	0.09	0.09
O5'	0.03	0.05	0.06	0.06	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.03	0.04	0.05	0.07	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.13	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.04	0.09	0.02	0.08	0.09	0.08	0.09	0.06	0.09	0.09	0.07	0.04	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.06	0.03	0.09	0.04	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.08	0.04	0.03	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.57	0.24	0.27	0.55	0.31	0.39	0.35	0.31	0.39	0.64	0.62	0.66	0.30	0.30	0.37	0.35	0.32	0.33	0.32
C2	0.13	0.15	0.21	0.28	0.13	0.30	0.11	0.30	0.12	0.09	0.16	0.15	0.21	0.27	0.32	0.20	0.28	0.30	0.23	0.26
C2'	0.41	0.73	0.26	0.25	0.73	0.28	0.57	0.32	0.48	0.54	0.81	0.80	0.82	0.21	0.20	0.43	0.37	0.30	0.40	0.34
C3'	0.41	0.74	0.26	0.23	0.74	0.27	0.56	0.30	0.47	0.54	0.83	0.82	0.83	0.17	0.17	0.41	0.34	0.28	0.37	0.31
C4	0.18	0.33	0.21	0.28	0.27	0.30	0.14	0.31	0.10	0.19	0.36	0.31	0.43	0.29	0.34	0.25	0.28	0.32	0.22	0.26
C4'	0.33	0.66	0.23	0.25	0.67	0.29	0.47	0.33	0.37	0.45	0.77	0.76	0.77	0.23	0.24	0.37	0.35	0.31	0.34	0.32
C5	0.14	0.26	0.20	0.30	0.19	0.31	0.08	0.35	0.08	0.12	0.28	0.22	0.37	0.27	0.39	0.19	0.33	0.41	0.30	0.34
C5'	0.30	0.62	0.21	0.24	0.61	0.29	0.40	0.33	0.30	0.40	0.72	0.71	0.74	0.23	0.27	0.33	0.33	0.33	0.29	0.30
C6	0.13	0.15	0.21	0.33	0.12	0.34	0.15	0.40	0.17	0.10	0.17	0.13	0.25	0.23	0.40	0.18	0.39	0.48	0.40	0.43
C8	0.20	0.41	0.20	0.28	0.36	0.30	0.19	0.32	0.13	0.23	0.46	0.42	0.53	0.28	0.38	0.25	0.29	0.36	0.23	0.28
N1	0.14	0.12	0.21	0.32	0.14	0.33	0.20	0.37	0.21	0.13	0.14	0.15	0.17	0.23	0.36	0.18	0.38	0.42	0.37	0.39
N3	0.19	0.29	0.23	0.28	0.24	0.30	0.14	0.31	0.10	0.18	0.31	0.27	0.37	0.31	0.31	0.28	0.28	0.29	0.22	0.24
N6	0.14	0.13	0.21	0.36	0.13	0.37	0.22	0.47	0.23	0.13	0.14	0.14	0.22	0.19	0.43	0.19	0.48	0.61	0.52	0.55
N7	0.15	0.31	0.20	0.31	0.24	0.32	0.09	0.36	0.07	0.15	0.35	0.29	0.43	0.27	0.42	0.20	0.33	0.44	0.30	0.35
N9	0.23	0.44	0.22	0.27	0.40	0.30	0.24	0.32	0.18	0.27	0.49	0.46	0.55	0.30	0.34	0.29	0.29	0.31	0.24	0.26
O2'	0.43	0.78	0.27	0.27	0.82	0.31	0.66	0.37	0.55	0.59	0.88	0.90	0.84	0.23	0.20	0.45	0.43	0.37	0.50	0.43
O3'	0.45	0.80	0.30	0.25	0.83	0.27	0.65	0.31	0.55	0.60	0.91	0.92	0.88	0.16	0.13	0.44	0.37	0.29	0.43	0.35
O4'	0.29	0.56	0.25	0.29	0.54	0.33	0.35	0.37	0.27	0.36	0.64	0.62	0.66	0.31	0.32	0.36	0.37	0.35	0.33	0.33
O5'	0.24	0.54	0.18	0.24	0.51	0.30	0.30	0.34	0.22	0.33	0.63	0.60	0.67	0.23	0.32	0.29	0.32	0.38	0.27	0.31
OP1	0.27	0.59	0.22	0.25	0.54	0.29	0.31	0.32	0.22	0.35	0.67	0.63	0.73	0.24	0.31	0.28	0.30	0.38	0.24	0.30
OP2	0.13	0.45	0.12	0.23	0.40	0.25	0.19	0.31	0.09	0.22	0.53	0.48	0.58	0.20	0.37	0.15	0.27	0.42	0.24	0.32
P	0.16	0.48	0.15	0.24	0.44	0.27	0.21	0.32	0.11	0.24	0.57	0.53	0.62	0.22	0.35	0.19	0.28	0.40	0.23	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02
C2	0.01	0.00	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.10	0.05	0.05	0.04	0.04	0.04
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.09	0.03	0.20	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.15	0.04	0.04	0.04	0.15	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.09	0.08	0.09	0.10
C4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01
C5	0.03	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.16	0.07	0.10	0.11	0.12	0.11
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.09	0.10	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04
N3	0.01	0.00	0.09	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.08
N4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.09	0.09	0.10	0.10
O2	0.03	0.00	0.20	0.15	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.23	0.20	0.09	0.04	0.04	0.02	0.03
O2'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.12	0.06	0.23	0.00	0.02	0.04	0.04	0.10	0.07	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.02	0.16	0.03	0.17	0.04	0.07	0.06	0.20	0.02	0.00	0.01	0.08	0.15	0.16	0.13
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.04	0.03	0.09	0.04	0.01	0.00	0.08	0.05	0.10	0.08
O5'	0.01	0.05	0.04	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.05	0.07	0.09	0.04	0.04	0.08	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.04	0.07	0.09	0.08	0.04	0.11	0.03	0.09	0.05	0.06	0.09	0.04	0.10	0.15	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.04	0.06	0.10	0.09	0.01	0.12	0.01	0.08	0.04	0.07	0.10	0.02	0.07	0.16	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.04	0.05	0.08	0.10	0.01	0.11	0.01	0.08	0.04	0.08	0.10	0.03	0.06	0.13	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00