Doublet Group distance statistics: 50400

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, -0.002, 0.010, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.003, 0.016, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.048, 0.225, 0.402, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.225 std_dev=0.177
C2'	A	0, 0.043, 0.223, 0.403, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.223 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.064, 0.295, 0.526, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.295 std_dev=0.231
C1'	B	0, 0.112, 0.352, 0.592, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.352 std_dev=0.240
N1	B	0, 0.124, 0.385, 0.646, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.385 std_dev=0.261
O4'	B	0, 0.131, 0.403, 0.676, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.403 std_dev=0.272
O2'	A	0, 0.105, 0.392, 0.678, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.392 std_dev=0.286
C3'	A	0, 0.072, 0.364, 0.655, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.364 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.138, 0.431, 0.725, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.431 std_dev=0.294
O5'	A	0, 0.126, 0.457, 0.788, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.457 std_dev=0.331
C4'	B	0, 0.146, 0.482, 0.819, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.482 std_dev=0.337
C2'	B	0, 0.146, 0.499, 0.853, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.499 std_dev=0.354
C2	B	0, 0.128, 0.508, 0.888, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.508 std_dev=0.380
C5	B	0, 0.157, 0.541, 0.925, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.541 std_dev=0.384
C5'	B	0, 0.186, 0.571, 0.957, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.571 std_dev=0.385
O2'	B	0, 0.128, 0.528, 0.927, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.528 std_dev=0.399
C3'	B	0, 0.185, 0.598, 1.010, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.598 std_dev=0.413
C5'	A	0, 0.115, 0.538, 0.960, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.538 std_dev=0.423
O5'	B	0, 0.204, 0.633, 1.061, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.633 std_dev=0.429
O3'	A	0, 0.117, 0.565, 1.013, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.565 std_dev=0.448
O2	B	0, 0.124, 0.580, 1.035, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.580 std_dev=0.456
C4	B	0, 0.167, 0.626, 1.086, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.626 std_dev=0.459
N3	B	0, 0.157, 0.624, 1.091, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.624 std_dev=0.467
P	A	0, 0.138, 0.661, 1.184, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.661 std_dev=0.523
P	B	0, 0.124, 0.677, 1.231, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.677 std_dev=0.553
O3'	B	0, 0.209, 0.785, 1.360, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.785 std_dev=0.576
N4	B	0, 0.204, 0.787, 1.370, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.787 std_dev=0.583
OP2	A	0, 0.184, 0.788, 1.393, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.788 std_dev=0.604
OP1	B	0, 0.214, 0.820, 1.427, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.820 std_dev=0.607
OP2	B	0, 0.139, 0.780, 1.420, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.780 std_dev=0.641
OP1	A	0, 0.083, 0.774, 1.466, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.774 std_dev=0.691

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.13	0.10	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.03	0.18	0.21	0.19	0.15
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.07	0.05	0.08	0.05	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.12	0.08
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.02	0.04	0.14	0.02	0.06	0.07	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.09	0.19	0.12	0.10
C4	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.02	0.02	0.18	0.20	0.19	0.15
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.02	0.02	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.02	0.20	0.23	0.26	0.21
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.15	0.08	0.04	0.13	0.15	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.13	0.04	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.05	0.03	0.21	0.24	0.27	0.22
C8	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.01	0.21	0.22	0.26	0.21
N1	0.03	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.03	0.19	0.23	0.24	0.19
N3	0.02	0.00	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.03	0.16	0.19	0.16	0.12
N6	0.03	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.09	0.03	0.22	0.27	0.31	0.25
N7	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.15	0.01	0.22	0.25	0.30	0.24
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.17	0.17	0.18	0.14
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.08	0.04	0.07	0.05	0.08	0.05	0.11	0.12	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.04	0.07	0.17	0.13	0.09
O3'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.02	0.05	0.16	0.04	0.08	0.09	0.15	0.06	0.02	0.00	0.02	0.17	0.21	0.15	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.11	0.10	0.08	0.03
O5'	0.11	0.18	0.06	0.09	0.18	0.01	0.20	0.01	0.21	0.21	0.19	0.16	0.22	0.22	0.17	0.07	0.17	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.13	0.21	0.17	0.19	0.20	0.13	0.23	0.13	0.24	0.22	0.23	0.19	0.27	0.25	0.17	0.17	0.21	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.19	0.12	0.12	0.19	0.07	0.26	0.04	0.27	0.26	0.24	0.16	0.31	0.30	0.18	0.13	0.15	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.15	0.08	0.10	0.15	0.03	0.21	0.01	0.22	0.21	0.19	0.12	0.25	0.24	0.14	0.09	0.13	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.12	0.18	0.09	0.21	0.12	0.30	0.11	0.19	0.05	0.11	0.29	0.26	0.26	0.10	0.14	0.14	0.11	0.08	0.07
C2	0.15	0.15	0.18	0.05	0.10	0.04	0.21	0.24	0.17	0.03	0.08	0.13	0.30	0.27	0.11	0.03	0.23	0.29	0.12	0.17
C2'	0.24	0.12	0.24	0.14	0.19	0.22	0.26	0.10	0.16	0.08	0.09	0.27	0.25	0.31	0.15	0.25	0.04	0.13	0.26	0.18
C3'	0.27	0.16	0.25	0.15	0.16	0.22	0.23	0.10	0.16	0.12	0.10	0.24	0.30	0.32	0.15	0.26	0.06	0.16	0.33	0.22
C4	0.16	0.15	0.18	0.06	0.13	0.05	0.24	0.16	0.18	0.04	0.10	0.18	0.31	0.28	0.12	0.07	0.18	0.22	0.06	0.10
C4'	0.21	0.13	0.19	0.10	0.19	0.15	0.27	0.08	0.17	0.06	0.09	0.27	0.27	0.27	0.10	0.19	0.07	0.05	0.18	0.10
C5	0.15	0.18	0.19	0.07	0.09	0.04	0.20	0.20	0.16	0.05	0.13	0.13	0.36	0.30	0.15	0.03	0.20	0.27	0.07	0.13
C5'	0.23	0.18	0.22	0.12	0.13	0.16	0.22	0.10	0.13	0.09	0.11	0.21	0.34	0.30	0.12	0.20	0.08	0.06	0.19	0.10
C6	0.13	0.20	0.19	0.08	0.07	0.08	0.17	0.25	0.15	0.06	0.15	0.09	0.37	0.30	0.18	0.07	0.23	0.31	0.11	0.16
C8	0.17	0.17	0.20	0.07	0.13	0.06	0.23	0.14	0.16	0.05	0.12	0.18	0.34	0.30	0.14	0.07	0.16	0.19	0.06	0.08
N1	0.13	0.19	0.19	0.07	0.06	0.08	0.17	0.27	0.16	0.05	0.13	0.07	0.35	0.29	0.15	0.08	0.24	0.33	0.13	0.19
N3	0.17	0.13	0.19	0.07	0.14	0.07	0.25	0.16	0.18	0.04	0.08	0.19	0.28	0.27	0.10	0.10	0.19	0.22	0.07	0.11
N6	0.12	0.23	0.20	0.10	0.08	0.11	0.14	0.26	0.14	0.08	0.20	0.08	0.41	0.31	0.22	0.11	0.23	0.33	0.12	0.17
N7	0.15	0.19	0.20	0.07	0.10	0.04	0.20	0.18	0.16	0.05	0.14	0.14	0.37	0.30	0.16	0.03	0.19	0.25	0.06	0.11
N9	0.17	0.15	0.19	0.07	0.16	0.08	0.25	0.12	0.18	0.04	0.10	0.22	0.30	0.28	0.11	0.10	0.16	0.16	0.06	0.07
O2'	0.25	0.10	0.24	0.16	0.29	0.27	0.34	0.16	0.22	0.11	0.16	0.39	0.18	0.31	0.15	0.29	0.07	0.22	0.26	0.22
O3'	0.30	0.17	0.28	0.19	0.21	0.29	0.27	0.19	0.20	0.17	0.14	0.29	0.27	0.34	0.18	0.32	0.16	0.33	0.48	0.36
O4'	0.16	0.12	0.16	0.09	0.21	0.11	0.30	0.14	0.20	0.05	0.10	0.29	0.26	0.24	0.10	0.12	0.17	0.16	0.08	0.10
O5'	0.34	0.30	0.34	0.22	0.07	0.25	0.12	0.15	0.06	0.20	0.21	0.11	0.47	0.43	0.24	0.28	0.12	0.10	0.27	0.17
OP1	0.41	0.45	0.39	0.28	0.22	0.30	0.11	0.21	0.16	0.33	0.39	0.18	0.61	0.44	0.27	0.35	0.20	0.19	0.43	0.30
OP2	0.26	0.35	0.26	0.19	0.17	0.19	0.16	0.25	0.14	0.21	0.30	0.16	0.51	0.31	0.18	0.20	0.23	0.22	0.19	0.15
P	0.28	0.32	0.27	0.17	0.12	0.18	0.13	0.18	0.09	0.19	0.26	0.13	0.49	0.34	0.17	0.21	0.17	0.14	0.22	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.14	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.16	0.20	0.19	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.03	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.09	0.26	0.29	0.19
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.13	0.01	0.15	0.04	0.14	0.09	0.11	0.13	0.11	0.01	0.00	0.01	0.14	0.31	0.38	0.28
C4	0.02	0.00	0.03	0.13	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.20	0.19	0.20	0.21
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.05	0.06	0.07	0.04	0.07	0.01	0.00	0.03	0.18	0.12	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.22	0.05	0.20	0.17	0.16	0.20
C5'	0.04	0.12	0.04	0.04	0.17	0.01	0.18	0.00	0.16	0.12	0.14	0.18	0.09	0.08	0.07	0.02	0.01	0.07	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.18	0.05	0.17	0.15	0.10	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.00	0.13	0.16	0.12	0.12
N3	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.19	0.20	0.21	0.20
N4	0.02	0.01	0.03	0.13	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.03	0.21	0.20	0.23	0.23
O2	0.04	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.12	0.10	0.05	0.14	0.21	0.20	0.15
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.07	0.05	0.08	0.04	0.03	0.07	0.06	0.12	0.00	0.08	0.07	0.13	0.36	0.33	0.24
O3'	0.02	0.09	0.04	0.00	0.18	0.01	0.22	0.07	0.18	0.08	0.13	0.20	0.10	0.08	0.00	0.01	0.25	0.55	0.66	0.50
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.05	0.07	0.01	0.00	0.05	0.06	0.08	0.08
O5'	0.05	0.16	0.09	0.14	0.20	0.03	0.20	0.01	0.17	0.13	0.19	0.21	0.14	0.13	0.25	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.14	0.20	0.26	0.31	0.19	0.18	0.17	0.07	0.15	0.16	0.20	0.20	0.21	0.36	0.55	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.19	0.29	0.38	0.20	0.12	0.16	0.04	0.10	0.12	0.21	0.23	0.20	0.33	0.66	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.19	0.28	0.21	0.08	0.20	0.02	0.15	0.12	0.20	0.23	0.15	0.24	0.50	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00