Doublet Group distance statistics: 50405

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.019, 0.044, 0.068, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.044 std_dev=0.025
C4'	B	0, 0.161, 0.327, 0.494, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.327 std_dev=0.166
O2'	B	0, 0.185, 0.404, 0.622, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.404 std_dev=0.219
O4'	A	0, 0.045, 0.264, 0.483, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.264 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.202, 0.422, 0.642, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.422 std_dev=0.220
C2'	A	0, 0.054, 0.278, 0.502, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.278 std_dev=0.224
O2'	A	0, 0.063, 0.288, 0.513, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.288 std_dev=0.225
C3'	B	0, 0.225, 0.469, 0.713, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.469 std_dev=0.244
C2'	B	0, 0.007, 0.260, 0.514, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.260 std_dev=0.253
O4'	B	0, 0.183, 0.471, 0.759, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.471 std_dev=0.288
O2	B	0, 0.212, 0.527, 0.843, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.527 std_dev=0.316
N1	B	0, 0.304, 0.627, 0.950, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.627 std_dev=0.323
C4'	A	0, 0.105, 0.431, 0.757, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.431 std_dev=0.326
C5'	B	0, 0.215, 0.546, 0.878, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.546 std_dev=0.332
C2	B	0, 0.324, 0.663, 1.002, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.663 std_dev=0.339
C3'	A	0, 0.096, 0.455, 0.814, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.455 std_dev=0.359
O3'	B	0, 0.298, 0.678, 1.058, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.678 std_dev=0.380
O5'	B	0, 0.362, 0.779, 1.196, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.779 std_dev=0.417
N3	B	0, 0.438, 0.884, 1.331, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.884 std_dev=0.447
C6	B	0, 0.368, 0.846, 1.324, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.846 std_dev=0.478
P	B	0, 0.302, 0.782, 1.262, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.782 std_dev=0.480
O5'	A	0, 0.225, 0.708, 1.192, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.708 std_dev=0.484
OP1	B	0, 0.324, 0.843, 1.361, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.843 std_dev=0.518
P	A	0, 0.189, 0.708, 1.227, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.708 std_dev=0.519
O3'	A	0, 0.149, 0.680, 1.211, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.680 std_dev=0.531
C5'	A	0, 0.186, 0.725, 1.263, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.725 std_dev=0.539
OP2	B	0, 0.369, 0.952, 1.534, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.952 std_dev=0.583
C4	B	0, 0.515, 1.100, 1.686, 1.599 max_d=1.599 avg_d=1.100 std_dev=0.586
C5	B	0, 0.469, 1.088, 1.708, 1.670 max_d=1.670 avg_d=1.088 std_dev=0.619
N4	B	0, 0.619, 1.336, 2.053, 1.948 max_d=1.948 avg_d=1.336 std_dev=0.717
OP2	A	0, 0.394, 1.381, 2.368, 2.682 max_d=2.682 avg_d=1.381 std_dev=0.987
OP1	A	0, -0.002, 1.037, 2.076, 3.021 max_d=3.021 avg_d=1.037 std_dev=1.039

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.28	0.14	0.13
C2	0.03	0.00	0.09	0.16	0.01	0.08	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.21	0.02	0.21	0.83	0.25	0.24
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.07	0.06	0.10	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.09	0.09
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.02	0.10	0.12	0.13	0.16	0.09	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.11	0.01	0.18	0.71	0.16	0.21
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.09	0.07	0.07	0.08	0.09	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.17	0.21	0.04
C5	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.18	0.89	0.25	0.21
C5'	0.02	0.14	0.02	0.02	0.10	0.00	0.11	0.00	0.13	0.10	0.14	0.12	0.15	0.11	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.31	0.25	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.02	0.20	1.00	0.33	0.23
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.13	0.61	0.10	0.12
N1	0.03	0.01	0.06	0.13	0.02	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.17	0.03	0.21	0.95	0.32	0.25
N3	0.03	0.01	0.10	0.16	0.01	0.07	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.08	0.19	0.02	0.19	0.70	0.18	0.23
N6	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.12	0.02	0.21	1.11	0.39	0.24
N7	0.03	0.02	0.06	0.10	0.02	0.09	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.13	0.04	0.16	0.87	0.25	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.53	0.06	0.16
O2'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.08	0.03	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.12	0.07
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.11	0.02	0.09	0.04	0.12	0.14	0.17	0.19	0.12	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.11	0.27	0.12	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.21	0.30	0.13
O5'	0.08	0.21	0.06	0.07	0.18	0.02	0.18	0.00	0.20	0.13	0.21	0.19	0.21	0.16	0.12	0.04	0.11	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.28	0.83	0.12	0.06	0.71	0.17	0.89	0.31	1.00	0.61	0.95	0.70	1.11	0.87	0.53	0.05	0.27	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.25	0.09	0.10	0.16	0.21	0.25	0.25	0.33	0.10	0.32	0.18	0.39	0.25	0.06	0.12	0.12	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.24	0.09	0.07	0.21	0.04	0.21	0.02	0.23	0.12	0.25	0.23	0.24	0.16	0.16	0.07	0.12	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.15	0.12	0.10	0.37	0.09	0.44	0.17	0.37	0.21	0.24	0.42	0.10	0.31	0.22	0.21	0.16	0.11	0.20	0.15
C2	0.07	0.07	0.11	0.10	0.22	0.11	0.30	0.22	0.26	0.10	0.11	0.25	0.15	0.23	0.13	0.15	0.16	0.14	0.15	0.15
C2'	0.30	0.37	0.11	0.14	0.54	0.21	0.59	0.27	0.53	0.41	0.44	0.57	0.24	0.20	0.18	0.40	0.29	0.21	0.34	0.28
C3'	0.44	0.46	0.27	0.29	0.58	0.36	0.63	0.40	0.59	0.50	0.50	0.60	0.36	0.21	0.25	0.52	0.39	0.31	0.41	0.36
C4	0.07	0.10	0.12	0.11	0.29	0.12	0.37	0.20	0.31	0.15	0.17	0.33	0.13	0.26	0.18	0.19	0.16	0.12	0.16	0.14
C4'	0.29	0.31	0.15	0.20	0.47	0.26	0.53	0.32	0.48	0.37	0.37	0.51	0.20	0.17	0.20	0.40	0.29	0.23	0.30	0.27
C5	0.06	0.09	0.10	0.11	0.26	0.12	0.34	0.21	0.28	0.13	0.15	0.31	0.13	0.22	0.17	0.17	0.14	0.11	0.13	0.12
C5'	0.34	0.33	0.23	0.28	0.46	0.35	0.52	0.40	0.49	0.39	0.37	0.49	0.23	0.20	0.27	0.46	0.35	0.30	0.34	0.32
C6	0.05	0.07	0.09	0.10	0.22	0.12	0.29	0.21	0.23	0.09	0.12	0.26	0.14	0.18	0.14	0.13	0.12	0.10	0.09	0.10
C8	0.08	0.12	0.10	0.11	0.32	0.12	0.40	0.20	0.33	0.17	0.20	0.37	0.12	0.25	0.20	0.21	0.16	0.11	0.16	0.14
N1	0.07	0.07	0.09	0.09	0.19	0.11	0.26	0.22	0.21	0.07	0.09	0.23	0.15	0.18	0.12	0.11	0.13	0.12	0.10	0.12
N3	0.07	0.09	0.13	0.11	0.28	0.12	0.36	0.21	0.31	0.15	0.16	0.31	0.14	0.28	0.17	0.19	0.17	0.14	0.18	0.16
N6	0.05	0.07	0.07	0.10	0.19	0.11	0.26	0.19	0.19	0.07	0.10	0.24	0.14	0.15	0.12	0.10	0.09	0.09	0.06	0.07
N7	0.06	0.09	0.10	0.11	0.28	0.12	0.36	0.20	0.29	0.14	0.16	0.33	0.13	0.23	0.19	0.18	0.14	0.10	0.13	0.12
N9	0.08	0.12	0.12	0.11	0.33	0.12	0.41	0.19	0.34	0.18	0.20	0.37	0.12	0.28	0.21	0.21	0.16	0.11	0.18	0.15
O2'	0.27	0.39	0.05	0.05	0.58	0.13	0.62	0.21	0.55	0.42	0.47	0.62	0.23	0.25	0.18	0.34	0.26	0.19	0.34	0.26
O3'	0.59	0.63	0.43	0.41	0.72	0.47	0.74	0.47	0.71	0.65	0.66	0.73	0.55	0.34	0.33	0.64	0.49	0.39	0.51	0.45
O4'	0.12	0.15	0.09	0.11	0.35	0.13	0.42	0.20	0.35	0.21	0.23	0.40	0.09	0.24	0.19	0.24	0.17	0.13	0.19	0.16
O5'	0.38	0.36	0.25	0.30	0.50	0.38	0.57	0.44	0.53	0.43	0.41	0.52	0.26	0.16	0.25	0.50	0.39	0.33	0.37	0.35
OP1	0.71	0.59	0.60	0.76	0.76	0.90	0.89	1.03	0.88	0.73	0.62	0.78	0.46	0.50	0.74	0.94	0.96	1.02	0.99	1.01
OP2	0.30	0.28	0.27	0.25	0.40	0.29	0.46	0.34	0.43	0.34	0.32	0.42	0.19	0.26	0.25	0.33	0.32	0.35	0.23	0.28
P	0.38	0.37	0.27	0.32	0.52	0.41	0.59	0.48	0.56	0.44	0.41	0.55	0.26	0.17	0.27	0.51	0.41	0.36	0.37	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.02	0.11	0.12	0.24	0.17
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.12	0.14	0.09
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.05	0.07	0.07	0.06	0.01	0.00	0.02	0.12	0.16	0.18	0.14
C4	0.02	0.03	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.07	0.03	0.18	0.25	0.37	0.29
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.07	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.08	0.04	0.19	0.27	0.37	0.31
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.14	0.00	0.17	0.00	0.15	0.08	0.11	0.17	0.05	0.08	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.07	0.01	0.15	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.08	0.04	0.16	0.20	0.27	0.23
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.11	0.11	0.20	0.16
N3	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.08	0.03	0.16	0.19	0.32	0.24
N4	0.03	0.04	0.04	0.07	0.01	0.07	0.03	0.17	0.03	0.02	0.03	0.00	0.07	0.07	0.07	0.04	0.21	0.32	0.45	0.35
O2	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.09	0.08	0.04	0.09	0.10	0.21	0.14
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.07	0.07	0.09	0.00	0.03	0.04	0.08	0.18	0.11	0.09
O3'	0.02	0.07	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.08	0.05	0.08	0.07	0.08	0.03	0.00	0.02	0.16	0.25	0.26	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.09	0.08	0.10	0.10
O5'	0.04	0.11	0.08	0.12	0.18	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.16	0.21	0.09	0.08	0.16	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.12	0.12	0.16	0.25	0.06	0.27	0.06	0.20	0.11	0.19	0.32	0.10	0.18	0.25	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.24	0.14	0.18	0.37	0.02	0.37	0.02	0.27	0.20	0.32	0.45	0.21	0.11	0.26	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.09	0.14	0.29	0.01	0.31	0.01	0.23	0.16	0.24	0.35	0.14	0.09	0.20	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00