Doublet Group distance statistics: 50412

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.003, 0.028, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.028 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.008, 0.033, 0.058, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.025
N1	A	0, 0.010, 0.036, 0.063, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.036 std_dev=0.026
C2	A	0, -0.002, 0.025, 0.052, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.025 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.005, 0.033, 0.060, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.033 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.004, 0.034, 0.065, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.034 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.011, 0.043, 0.074, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.043 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.035 std_dev=0.036
N6	A	0, 0.015, 0.051, 0.087, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.051 std_dev=0.036
O2'	A	0, 0.061, 0.264, 0.468, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.264 std_dev=0.203
C2'	A	0, 0.033, 0.240, 0.447, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.240 std_dev=0.207
O3'	A	0, -0.008, 0.231, 0.469, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.231 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.120, 0.411, 0.701, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.411 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.122, 0.434, 0.747, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.434 std_dev=0.312
O2'	B	0, 0.144, 0.492, 0.840, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.492 std_dev=0.348
C2'	B	0, 0.155, 0.528, 0.901, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.528 std_dev=0.373
O4'	A	0, -0.011, 0.379, 0.768, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.379 std_dev=0.390
C3'	A	0, -0.005, 0.385, 0.775, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.385 std_dev=0.390
O2	B	0, 0.177, 0.612, 1.047, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.612 std_dev=0.435
N1	B	0, 0.135, 0.611, 1.087, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.611 std_dev=0.476
C4'	B	0, 0.153, 0.643, 1.132, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.643 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.170, 0.684, 1.199, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.684 std_dev=0.515
C3'	B	0, 0.186, 0.742, 1.298, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.742 std_dev=0.556
C4'	A	0, 0.007, 0.633, 1.259, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.633 std_dev=0.626
C5'	B	0, 0.119, 0.785, 1.450, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.785 std_dev=0.666
C6	B	0, 0.055, 0.758, 1.462, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.758 std_dev=0.703
O3'	B	0, 0.204, 0.908, 1.613, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.908 std_dev=0.704
N3	B	0, 0.169, 0.896, 1.623, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.896 std_dev=0.727
O5'	B	0, 0.102, 0.962, 1.822, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.962 std_dev=0.860
O5'	A	0, -0.063, 0.842, 1.748, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.842 std_dev=0.906
C5'	A	0, 0.085, 0.999, 1.912, 2.208 max_d=2.208 avg_d=0.999 std_dev=0.913
C4	B	0, 0.087, 1.017, 1.947, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.017 std_dev=0.930
C5	B	0, 0.011, 0.952, 1.893, 2.234 max_d=2.234 avg_d=0.952 std_dev=0.941
P	B	0, 0.058, 1.146, 2.234, 2.608 max_d=2.608 avg_d=1.146 std_dev=1.088
N4	B	0, 0.080, 1.234, 2.389, 2.777 max_d=2.777 avg_d=1.234 std_dev=1.155
OP1	B	0, 0.055, 1.276, 2.497, 2.922 max_d=2.922 avg_d=1.276 std_dev=1.221
OP2	B	0, 0.038, 1.311, 2.583, 3.034 max_d=3.034 avg_d=1.311 std_dev=1.272
OP2	A	0, 0.413, 1.975, 3.537, 3.819 max_d=3.819 avg_d=1.975 std_dev=1.562
P	A	0, -0.230, 1.361, 2.953, 3.595 max_d=3.595 avg_d=1.361 std_dev=1.592
OP1	A	0, 0.180, 2.612, 5.045, 5.856 max_d=5.856 avg_d=2.612 std_dev=2.432

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.02	0.04	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.37	0.36	0.46	0.12
C2	0.05	0.00	0.07	0.13	0.01	0.31	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.04	0.33	0.58	0.63	0.46	0.28
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.08	0.05	0.12	0.14	0.12	0.11	0.11	0.05	0.16	0.13	0.06	0.00	0.06	0.02	0.30	0.43	0.54	0.23
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.04	0.19	0.06	0.14	0.10	0.17	0.05	0.01	0.00	0.01	0.08	0.39	0.57	0.30
C4	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.16	0.46	0.41	0.52	0.16
C4'	0.01	0.31	0.05	0.01	0.09	0.00	0.05	0.01	0.04	0.31	0.19	0.31	0.06	0.24	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.21	0.45	0.17
C5	0.01	0.01	0.12	0.07	0.00	0.05	0.00	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.06	0.34	0.25	0.61	0.11
C5'	0.11	0.16	0.14	0.02	0.12	0.01	0.31	0.00	0.23	0.60	0.07	0.17	0.36	0.56	0.28	0.12	0.06	0.06	0.02	0.39	0.23	0.02
C6	0.02	0.00	0.12	0.04	0.00	0.04	0.01	0.23	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.07	0.13	0.38	0.31	0.60	0.10
C8	0.04	0.02	0.11	0.19	0.01	0.31	0.01	0.60	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.19	0.18	0.16	0.24	0.68	0.24
N1	0.04	0.01	0.11	0.06	0.01	0.19	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.13	0.01	0.24	0.50	0.50	0.53	0.19
N3	0.06	0.00	0.05	0.14	0.01	0.31	0.00	0.17	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.03	0.34	0.59	0.62	0.43	0.28
N6	0.01	0.02	0.16	0.10	0.01	0.06	0.01	0.36	0.01	0.04	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.10	0.10	0.07	0.28	0.17	0.66	0.11
N7	0.01	0.02	0.13	0.17	0.00	0.24	0.01	0.56	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.16	0.09	0.18	0.20	0.70	0.22
N9	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.09	0.01	0.28	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.36	0.30	0.54	0.12
O2'	0.04	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.12	0.09	0.05	0.13	0.11	0.10	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.25	0.56	0.66	0.33
O3'	0.12	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.10	0.06	0.07	0.19	0.01	0.03	0.10	0.16	0.12	0.03	0.00	0.12	0.01	0.39	0.58	0.29
O4'	0.01	0.33	0.02	0.01	0.16	0.01	0.06	0.06	0.13	0.18	0.24	0.34	0.07	0.09	0.02	0.03	0.12	0.00	0.25	0.36	0.39	0.08
O5'	0.37	0.58	0.30	0.08	0.46	0.03	0.34	0.02	0.38	0.16	0.50	0.59	0.28	0.18	0.36	0.25	0.01	0.25	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.36	0.63	0.43	0.39	0.41	0.21	0.25	0.39	0.31	0.24	0.50	0.62	0.17	0.20	0.30	0.56	0.39	0.36	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.46	0.46	0.54	0.57	0.52	0.45	0.61	0.23	0.60	0.68	0.53	0.43	0.66	0.70	0.54	0.66	0.58	0.39	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.12	0.28	0.23	0.30	0.16	0.17	0.11	0.02	0.10	0.24	0.19	0.28	0.11	0.22	0.12	0.33	0.29	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.12	0.05	0.05	0.06	0.06	0.18	0.11	0.15	0.04	0.07	0.09	0.24	0.07	0.06	0.05	0.19	0.16	0.16	0.17
C2	0.03	0.05	0.04	0.02	0.22	0.02	0.31	0.02	0.26	0.11	0.11	0.25	0.10	0.08	0.03	0.02	0.16	0.07	0.15	0.11
C2'	0.07	0.04	0.08	0.11	0.23	0.11	0.35	0.15	0.29	0.12	0.10	0.27	0.11	0.07	0.12	0.08	0.26	0.20	0.26	0.24
C3'	0.25	0.30	0.23	0.21	0.15	0.20	0.06	0.18	0.11	0.23	0.25	0.13	0.39	0.22	0.18	0.24	0.12	0.16	0.17	0.16
C4	0.04	0.03	0.03	0.05	0.25	0.05	0.35	0.09	0.29	0.11	0.11	0.29	0.12	0.06	0.03	0.05	0.22	0.13	0.22	0.18
C4'	0.54	0.57	0.55	0.57	0.47	0.56	0.42	0.58	0.46	0.53	0.53	0.45	0.62	0.50	0.54	0.56	0.56	0.65	0.66	0.65
C5	0.03	0.08	0.04	0.02	0.33	0.03	0.42	0.04	0.34	0.15	0.18	0.39	0.09	0.11	0.05	0.04	0.20	0.09	0.22	0.16
C5'	0.46	0.40	0.53	0.63	0.29	0.63	0.30	0.73	0.37	0.42	0.34	0.25	0.44	0.49	0.66	0.53	0.68	0.95	0.81	0.83
C6	0.01	0.11	0.07	0.06	0.36	0.07	0.43	0.02	0.33	0.16	0.22	0.42	0.07	0.16	0.11	0.00	0.16	0.05	0.19	0.12
C8	0.04	0.05	0.04	0.06	0.30	0.06	0.40	0.10	0.32	0.13	0.14	0.35	0.12	0.08	0.05	0.06	0.23	0.14	0.25	0.21
N1	0.01	0.10	0.07	0.06	0.32	0.07	0.38	0.03	0.31	0.15	0.20	0.36	0.06	0.15	0.11	0.00	0.14	0.05	0.16	0.10
N3	0.04	0.02	0.04	0.05	0.18	0.06	0.28	0.10	0.25	0.09	0.06	0.20	0.13	0.04	0.05	0.05	0.21	0.13	0.18	0.16
N6	0.04	0.14	0.13	0.12	0.40	0.13	0.45	0.08	0.34	0.16	0.26	0.48	0.09	0.24	0.20	0.04	0.14	0.06	0.19	0.10
N7	0.03	0.09	0.03	0.02	0.36	0.03	0.45	0.05	0.35	0.16	0.20	0.43	0.09	0.10	0.04	0.04	0.21	0.10	0.25	0.18
N9	0.04	0.01	0.04	0.07	0.21	0.08	0.32	0.12	0.27	0.09	0.06	0.25	0.15	0.06	0.07	0.06	0.23	0.16	0.23	0.20
O2'	0.21	0.15	0.24	0.32	0.40	0.31	0.57	0.41	0.50	0.28	0.22	0.44	0.02	0.19	0.34	0.24	0.55	0.55	0.62	0.58
O3'	0.17	0.31	0.11	0.04	0.24	0.01	0.12	0.06	0.10	0.21	0.32	0.27	0.39	0.07	0.04	0.11	0.09	0.14	0.03	0.05
O4'	0.45	0.49	0.43	0.42	0.36	0.41	0.28	0.39	0.33	0.43	0.45	0.34	0.57	0.40	0.37	0.44	0.35	0.37	0.39	0.38
O5'	0.70	0.64	0.74	0.77	0.43	0.78	0.39	0.78	0.49	0.62	0.54	0.36	0.74	0.76	0.78	0.73	0.67	0.80	0.67	0.72
OP1	0.89	0.70	1.03	1.16	0.55	1.18	0.55	1.25	0.65	0.74	0.59	0.54	0.79	1.08	1.28	0.98	1.11	1.43	1.06	1.19
OP2	0.34	0.50	0.29	0.23	0.74	0.23	0.73	0.17	0.58	0.46	0.62	0.85	0.44	0.29	0.23	0.28	0.27	0.15	0.22	0.13
P	0.41	0.24	0.52	0.60	0.16	0.63	0.13	0.67	0.13	0.25	0.15	0.27	0.36	0.58	0.69	0.49	0.50	0.77	0.44	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.00	0.06	0.09	0.10	0.06
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.06	0.02
C4	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.11	0.12	0.10
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.05	0.07	0.09	0.09	0.08
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00
C6	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.04	0.05	0.07	0.06	0.05
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
N3	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.08	0.12	0.13	0.10
N4	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.09	0.13	0.14	0.12
O2	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.07	0.06	0.04	0.03	0.07	0.09	0.04
O2'	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.06	0.03
O3'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.09	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.07	0.06	0.02
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.02
O5'	0.04	0.06	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.05	0.04	0.08	0.09	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.09	0.06	0.06	0.11	0.04	0.09	0.03	0.07	0.06	0.12	0.13	0.07	0.05	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.10	0.07	0.06	0.12	0.04	0.09	0.02	0.06	0.07	0.13	0.14	0.09	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.06	0.03	0.02	0.10	0.01	0.08	0.00	0.05	0.04	0.10	0.12	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00