Doublet Group distance statistics: 50416

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.022, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.009, 0.035, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.012, 0.043, 0.074, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.043 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.008, 0.039, 0.071, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.012, 0.050, 0.089, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.050 std_dev=0.039
O2'	A	0, 0.020, 0.102, 0.184, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.102 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.033, 0.134, 0.236, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.134 std_dev=0.102
O4'	A	0, 0.037, 0.175, 0.313, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.175 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.091, 0.327, 0.564, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.327 std_dev=0.237
C2'	B	0, 0.104, 0.362, 0.620, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.362 std_dev=0.258
C4'	A	0, 0.090, 0.353, 0.615, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.353 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.067, 0.360, 0.654, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.360 std_dev=0.294
O3'	A	0, 0.129, 0.443, 0.756, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.443 std_dev=0.314
O2'	B	0, 0.100, 0.499, 0.898, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.499 std_dev=0.399
N1	B	0, 0.158, 0.559, 0.960, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.559 std_dev=0.401
O5'	A	0, 0.108, 0.543, 0.978, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.543 std_dev=0.435
C3'	B	0, 0.151, 0.589, 1.026, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.589 std_dev=0.437
C5'	A	0, 0.121, 0.569, 1.017, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.569 std_dev=0.448
C2	B	0, 0.209, 0.726, 1.244, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.726 std_dev=0.518
O4'	B	0, 0.180, 0.702, 1.223, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.702 std_dev=0.522
O2	B	0, 0.192, 0.735, 1.278, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.735 std_dev=0.543
C4'	B	0, 0.204, 0.788, 1.372, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.788 std_dev=0.584
C6	B	0, 0.245, 0.837, 1.429, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.837 std_dev=0.592
O3'	B	0, 0.241, 0.834, 1.426, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.834 std_dev=0.593
P	A	0, 0.055, 0.785, 1.515, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.785 std_dev=0.730
N3	B	0, 0.293, 1.052, 1.811, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.052 std_dev=0.759
C5'	B	0, 0.218, 1.001, 1.784, 1.912 max_d=1.912 avg_d=1.001 std_dev=0.783
C5	B	0, 0.322, 1.112, 1.903, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.112 std_dev=0.790
C4	B	0, 0.343, 1.198, 2.054, 1.941 max_d=1.941 avg_d=1.198 std_dev=0.855
O5'	B	0, 0.319, 1.265, 2.211, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.265 std_dev=0.946
OP2	B	0, 0.385, 1.379, 2.373, 2.305 max_d=2.305 avg_d=1.379 std_dev=0.994
P	B	0, 0.418, 1.461, 2.503, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.461 std_dev=1.043
OP1	A	0, 0.255, 1.309, 2.363, 2.581 max_d=2.581 avg_d=1.309 std_dev=1.054
N4	B	0, 0.440, 1.556, 2.673, 2.563 max_d=2.563 avg_d=1.556 std_dev=1.116
OP1	B	0, 0.468, 1.598, 2.728, 2.415 max_d=2.415 avg_d=1.598 std_dev=1.130
OP2	A	0, 0.069, 1.314, 2.558, 2.985 max_d=2.985 avg_d=1.314 std_dev=1.245

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.08	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.16	0.12	0.26	0.23
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.36	0.35	0.18
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.05	0.08	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.45	0.51	0.32
C4	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.16	0.12	0.24	0.23
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.04	0.01	0.06	0.06	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.26	0.21	0.10
C5	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.20	0.26	0.39	0.33
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.08	0.04	0.13	0.13	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.12	0.07	0.03
C6	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.22	0.29	0.43	0.35
C8	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.19	0.22	0.32	0.30
N1	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.19	0.22	0.36	0.30
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.03	0.14	0.07	0.19	0.19
N6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.24	0.40	0.53	0.41
N7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.22	0.34	0.47	0.38
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.14	0.07	0.17	0.19
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.03	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.47	0.41	0.24
O3'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.09	0.05	0.08	0.06	0.10	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.70	0.77	0.52
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.09	0.12
O5'	0.07	0.16	0.02	0.05	0.16	0.02	0.20	0.02	0.22	0.19	0.19	0.14	0.24	0.22	0.14	0.04	0.11	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.12	0.12	0.36	0.45	0.12	0.26	0.26	0.12	0.29	0.22	0.22	0.07	0.40	0.34	0.07	0.47	0.70	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.26	0.35	0.51	0.24	0.21	0.39	0.07	0.43	0.32	0.36	0.19	0.53	0.47	0.17	0.41	0.77	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.23	0.18	0.32	0.23	0.10	0.33	0.03	0.35	0.30	0.30	0.19	0.41	0.38	0.19	0.24	0.52	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.11	0.11	0.10	0.15	0.19	0.15	0.28	0.11	0.08	0.12	0.19	0.16	0.14	0.12	0.19	0.11	0.07	0.31	0.08
C2	0.04	0.06	0.14	0.20	0.14	0.27	0.15	0.39	0.11	0.06	0.11	0.17	0.05	0.24	0.25	0.16	0.21	0.09	0.30	0.10
C2'	0.09	0.11	0.03	0.05	0.13	0.18	0.09	0.24	0.04	0.06	0.14	0.18	0.16	0.04	0.04	0.22	0.10	0.14	0.28	0.08
C3'	0.10	0.12	0.02	0.06	0.15	0.18	0.09	0.25	0.02	0.05	0.16	0.20	0.17	0.03	0.05	0.23	0.17	0.19	0.30	0.14
C4	0.04	0.01	0.14	0.15	0.10	0.22	0.11	0.33	0.08	0.03	0.04	0.13	0.08	0.23	0.20	0.17	0.21	0.05	0.31	0.11
C4'	0.07	0.17	0.06	0.04	0.23	0.16	0.20	0.24	0.13	0.11	0.22	0.30	0.21	0.06	0.03	0.19	0.11	0.08	0.31	0.08
C5	0.03	0.02	0.15	0.16	0.12	0.20	0.14	0.34	0.11	0.04	0.06	0.15	0.05	0.26	0.23	0.14	0.30	0.03	0.31	0.15
C5'	0.06	0.15	0.03	0.05	0.23	0.18	0.19	0.27	0.12	0.08	0.21	0.30	0.20	0.04	0.05	0.20	0.16	0.14	0.31	0.11
C6	0.05	0.06	0.16	0.18	0.16	0.21	0.18	0.36	0.14	0.07	0.11	0.19	0.02	0.28	0.26	0.11	0.35	0.02	0.31	0.17
C8	0.04	0.04	0.14	0.13	0.10	0.18	0.11	0.31	0.08	0.03	0.05	0.13	0.10	0.22	0.18	0.16	0.25	0.05	0.31	0.13
N1	0.05	0.08	0.15	0.20	0.18	0.24	0.19	0.39	0.15	0.09	0.13	0.21	0.03	0.27	0.27	0.10	0.33	0.04	0.30	0.15
N3	0.06	0.01	0.13	0.17	0.09	0.25	0.11	0.34	0.08	0.02	0.04	0.12	0.08	0.21	0.21	0.20	0.16	0.10	0.30	0.09
N6	0.06	0.07	0.16	0.18	0.18	0.18	0.20	0.35	0.16	0.09	0.13	0.22	0.00	0.29	0.28	0.08	0.42	0.06	0.31	0.21
N7	0.03	0.01	0.15	0.14	0.11	0.18	0.13	0.32	0.10	0.04	0.05	0.14	0.07	0.25	0.21	0.14	0.31	0.05	0.31	0.16
N9	0.05	0.05	0.13	0.13	0.10	0.20	0.11	0.30	0.08	0.04	0.06	0.14	0.12	0.20	0.16	0.18	0.19	0.05	0.31	0.10
O2'	0.16	0.20	0.05	0.09	0.22	0.21	0.17	0.25	0.13	0.15	0.23	0.26	0.23	0.05	0.07	0.26	0.07	0.17	0.23	0.04
O3'	0.13	0.17	0.04	0.10	0.19	0.21	0.10	0.24	0.05	0.09	0.22	0.25	0.21	0.08	0.10	0.25	0.18	0.24	0.28	0.16
O4'	0.09	0.14	0.10	0.10	0.20	0.19	0.20	0.28	0.15	0.11	0.16	0.25	0.20	0.12	0.10	0.19	0.14	0.07	0.32	0.11
O5'	0.12	0.09	0.02	0.12	0.10	0.26	0.06	0.37	0.03	0.05	0.10	0.16	0.16	0.02	0.10	0.29	0.22	0.27	0.27	0.20
OP1	0.17	0.36	0.35	0.22	0.43	0.03	0.35	0.15	0.27	0.27	0.45	0.51	0.38	0.38	0.27	0.08	0.34	0.28	0.41	0.27
OP2	0.11	0.21	0.32	0.18	0.24	0.07	0.22	0.26	0.18	0.15	0.25	0.29	0.25	0.41	0.29	0.19	0.35	0.35	0.37	0.33
P	0.05	0.09	0.14	0.03	0.13	0.19	0.09	0.34	0.06	0.02	0.14	0.19	0.14	0.21	0.10	0.26	0.25	0.32	0.27	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.38	0.07
C2	0.01	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.25	0.07	0.26	0.04
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.12	0.04	0.13	0.02	0.05	0.05	0.23	0.00	0.01	0.00	0.18	0.15	0.26	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.16	0.05	0.17	0.04	0.09	0.08	0.24	0.01	0.01	0.01	0.26	0.22	0.21	0.13
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.03	0.43	0.16	0.13	0.16
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.05	0.08	0.09	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.37	0.07
C5	0.01	0.00	0.12	0.16	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.18	0.05	0.47	0.19	0.13	0.18
C5'	0.03	0.11	0.04	0.05	0.17	0.01	0.19	0.00	0.17	0.10	0.14	0.19	0.10	0.03	0.07	0.01	0.01	0.07	0.37	0.03
C6	0.01	0.01	0.13	0.17	0.01	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.18	0.06	0.41	0.15	0.21	0.11
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.26	0.08	0.28	0.03
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.34	0.11	0.19	0.10
N4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.46	0.19	0.11	0.20
O2	0.01	0.00	0.23	0.24	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.28	0.04	0.16	0.04	0.30	0.01
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.09	0.03	0.09	0.02	0.04	0.05	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.33	0.06
O3'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.18	0.07	0.18	0.03	0.09	0.09	0.28	0.01	0.00	0.02	0.19	0.24	0.17	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	0.00	0.06	0.06	0.47	0.16
O5'	0.08	0.25	0.18	0.26	0.43	0.03	0.47	0.01	0.41	0.26	0.34	0.46	0.16	0.01	0.19	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.04	0.07	0.15	0.22	0.16	0.05	0.19	0.07	0.15	0.08	0.11	0.19	0.04	0.07	0.24	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.26	0.26	0.21	0.13	0.37	0.13	0.37	0.21	0.28	0.19	0.11	0.30	0.33	0.17	0.47	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.04	0.05	0.13	0.16	0.07	0.18	0.03	0.11	0.03	0.10	0.20	0.01	0.06	0.12	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00