Doublet Group distance statistics: 50417

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.028, 0.048, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.002, 0.027, 0.051, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.032 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.003, 0.029, 0.055, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.029 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.004, 0.032, 0.060, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.032 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.008, 0.037, 0.067, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.014, 0.049, 0.083, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.049 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.035, 0.133, 0.231, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.133 std_dev=0.098
O2'	A	0, 0.025, 0.130, 0.235, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.130 std_dev=0.105
O4'	A	0, 0.030, 0.150, 0.271, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.150 std_dev=0.121
C3'	A	0, 0.099, 0.347, 0.595, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.347 std_dev=0.248
C4'	A	0, 0.063, 0.366, 0.670, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.366 std_dev=0.304
O3'	A	0, 0.152, 0.519, 0.886, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.519 std_dev=0.367
C1'	B	0, 0.159, 0.545, 0.930, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.545 std_dev=0.385
O2'	B	0, 0.169, 0.578, 0.987, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.578 std_dev=0.409
C2'	B	0, 0.171, 0.613, 1.054, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.613 std_dev=0.442
O4'	B	0, 0.192, 0.662, 1.133, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.662 std_dev=0.470
O2	B	0, 0.191, 0.666, 1.142, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.666 std_dev=0.475
C5'	A	0, 0.024, 0.519, 1.014, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.519 std_dev=0.495
O5'	A	0, 0.137, 0.683, 1.230, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.683 std_dev=0.546
C2	B	0, 0.135, 0.683, 1.232, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.683 std_dev=0.549
C4'	B	0, 0.167, 0.769, 1.371, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.769 std_dev=0.602
N1	B	0, 0.111, 0.717, 1.323, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.717 std_dev=0.606
P	A	0, 0.213, 0.907, 1.600, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.907 std_dev=0.694
C3'	B	0, 0.142, 0.839, 1.536, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.839 std_dev=0.697
C5'	B	0, 0.141, 0.923, 1.704, 1.911 max_d=1.911 avg_d=0.923 std_dev=0.781
O5'	B	0, 0.103, 0.929, 1.755, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.929 std_dev=0.826
OP2	A	0, 0.156, 1.014, 1.872, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.014 std_dev=0.858
N3	B	0, 0.020, 0.881, 1.741, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.881 std_dev=0.860
O3'	B	0, 0.081, 0.998, 1.914, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.998 std_dev=0.916
OP1	A	0, 0.270, 1.204, 2.137, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.204 std_dev=0.933
P	B	0, 0.069, 1.109, 2.148, 2.499 max_d=2.499 avg_d=1.109 std_dev=1.039
OP2	B	0, 0.046, 1.090, 2.135, 2.498 max_d=2.498 avg_d=1.090 std_dev=1.044
C6	B	0, -0.004, 1.050, 2.104, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.050 std_dev=1.054
OP1	B	0, 0.042, 1.191, 2.340, 2.744 max_d=2.744 avg_d=1.191 std_dev=1.149
C4	B	0, -0.115, 1.125, 2.365, 2.852 max_d=2.852 avg_d=1.125 std_dev=1.240
C5	B	0, -0.108, 1.253, 2.614, 3.145 max_d=3.145 avg_d=1.253 std_dev=1.361
N4	B	0, -0.221, 1.350, 2.922, 3.554 max_d=3.554 avg_d=1.350 std_dev=1.571

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.16	0.04
C2	0.07	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.03	0.21	0.36	0.56	0.29
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.14	0.13	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.10	0.05	0.10	0.09	0.10	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.06	0.08
C4	0.03	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.21	0.26	0.44	0.22
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.10	0.10	0.07	0.05	0.13	0.12	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.05	0.31	0.34	0.56	0.31
C5'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.12	0.00	0.19	0.00	0.21	0.16	0.18	0.09	0.26	0.21	0.10	0.03	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.11	0.04	0.33	0.42	0.66	0.38
C8	0.05	0.01	0.03	0.05	0.00	0.10	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.05	0.09	0.29	0.20	0.31	0.19
N1	0.04	0.00	0.07	0.10	0.00	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.28	0.43	0.65	0.36
N3	0.07	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.10	0.05	0.16	0.27	0.45	0.21
N6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.13	0.01	0.26	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.06	0.12	0.08	0.38	0.49	0.73	0.45
N7	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00	0.12	0.00	0.21	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.35	0.29	0.50	0.30
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.19	0.17	0.30	0.14
O2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.11	0.11	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.08	0.10	0.03
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.05	0.11	0.05	0.12	0.10	0.12	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.21	0.23	0.09	0.12
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.09	0.01	0.05	0.08	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.08	0.11	0.07	0.06
O5'	0.07	0.21	0.05	0.15	0.21	0.02	0.31	0.01	0.33	0.29	0.28	0.16	0.38	0.35	0.19	0.06	0.21	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00
OP1	0.07	0.36	0.14	0.18	0.26	0.04	0.34	0.03	0.42	0.20	0.43	0.27	0.49	0.29	0.17	0.08	0.23	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.56	0.13	0.06	0.44	0.03	0.56	0.03	0.66	0.31	0.65	0.45	0.73	0.50	0.30	0.10	0.09	0.07	0.04	0.00	0.00	0.01
P	0.04	0.29	0.05	0.08	0.22	0.02	0.31	0.01	0.38	0.19	0.36	0.21	0.45	0.30	0.14	0.03	0.12	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.37	0.51	0.20	0.23	0.82	0.26	0.87	0.36	0.75	0.55	0.66	0.91	0.32	0.12	0.14	0.41	0.21	0.24	0.23	0.26
C2	0.22	0.18	0.18	0.28	0.38	0.32	0.52	0.44	0.51	0.30	0.22	0.39	0.15	0.08	0.21	0.36	0.21	0.30	0.20	0.25
C2'	0.41	0.58	0.24	0.24	0.81	0.27	0.81	0.32	0.70	0.57	0.70	0.88	0.45	0.18	0.22	0.43	0.21	0.19	0.23	0.23
C3'	0.44	0.60	0.29	0.29	0.81	0.32	0.80	0.36	0.69	0.58	0.72	0.89	0.48	0.24	0.29	0.47	0.25	0.24	0.25	0.26
C4	0.35	0.38	0.24	0.30	0.65	0.33	0.77	0.43	0.69	0.48	0.48	0.69	0.23	0.11	0.18	0.43	0.23	0.30	0.24	0.28
C4'	0.38	0.52	0.21	0.23	0.83	0.28	0.85	0.36	0.71	0.54	0.68	0.93	0.35	0.18	0.21	0.43	0.21	0.23	0.22	0.25
C5	0.28	0.29	0.21	0.27	0.56	0.30	0.69	0.41	0.62	0.40	0.38	0.60	0.18	0.10	0.18	0.36	0.19	0.30	0.20	0.25
C5'	0.44	0.54	0.28	0.31	0.84	0.37	0.88	0.46	0.76	0.58	0.68	0.94	0.37	0.21	0.26	0.51	0.29	0.34	0.30	0.34
C6	0.18	0.16	0.15	0.23	0.37	0.26	0.52	0.37	0.48	0.26	0.21	0.40	0.16	0.08	0.17	0.26	0.14	0.27	0.15	0.20
C8	0.37	0.45	0.25	0.29	0.77	0.32	0.86	0.43	0.75	0.53	0.57	0.84	0.28	0.12	0.17	0.43	0.24	0.32	0.26	0.29
N1	0.13	0.11	0.13	0.23	0.27	0.26	0.42	0.39	0.40	0.20	0.14	0.28	0.18	0.07	0.19	0.24	0.15	0.28	0.16	0.20
N3	0.35	0.35	0.24	0.31	0.59	0.35	0.71	0.44	0.66	0.47	0.43	0.61	0.20	0.10	0.19	0.45	0.25	0.30	0.24	0.29
N6	0.10	0.11	0.10	0.18	0.27	0.19	0.42	0.30	0.38	0.17	0.13	0.30	0.19	0.06	0.14	0.17	0.08	0.23	0.11	0.13
N7	0.31	0.35	0.22	0.27	0.65	0.30	0.77	0.41	0.67	0.44	0.46	0.71	0.21	0.11	0.17	0.38	0.20	0.31	0.22	0.26
N9	0.39	0.47	0.26	0.30	0.77	0.33	0.86	0.43	0.76	0.55	0.60	0.84	0.30	0.12	0.17	0.46	0.25	0.31	0.26	0.30
O2'	0.32	0.58	0.12	0.12	0.82	0.14	0.79	0.21	0.66	0.53	0.73	0.91	0.43	0.18	0.18	0.32	0.11	0.09	0.14	0.15
O3'	0.44	0.63	0.29	0.29	0.81	0.32	0.77	0.34	0.65	0.57	0.75	0.90	0.54	0.28	0.37	0.45	0.25	0.23	0.24	0.25
O4'	0.36	0.50	0.20	0.24	0.84	0.28	0.90	0.38	0.76	0.55	0.66	0.94	0.31	0.14	0.15	0.42	0.22	0.27	0.25	0.28
O5'	0.47	0.57	0.31	0.35	0.86	0.42	0.92	0.52	0.80	0.62	0.70	0.95	0.40	0.20	0.27	0.56	0.37	0.42	0.41	0.43
OP1	0.68	0.64	0.59	0.63	0.85	0.69	0.93	0.77	0.88	0.73	0.70	0.89	0.51	0.51	0.54	0.77	0.57	0.67	0.53	0.60
OP2	0.80	0.80	0.68	0.72	1.04	0.80	1.14	0.90	1.07	0.89	0.88	1.09	0.64	0.55	0.59	0.91	0.74	0.84	0.76	0.80
P	0.57	0.58	0.45	0.50	0.82	0.56	0.91	0.66	0.83	0.65	0.67	0.89	0.43	0.35	0.40	0.66	0.48	0.56	0.48	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.14	0.17	0.22	0.14
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.14	0.21	0.28	0.17
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.05	0.07	0.08	0.12	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.09	0.10
C4	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.09	0.02	0.15	0.29	0.35	0.21
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.00
C5	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.10	0.03	0.16	0.32	0.38	0.21
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.12	0.07	0.09	0.12	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.10	0.04	0.17	0.28	0.33	0.19
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.15	0.22	0.28	0.17
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.15	0.25	0.32	0.19
N4	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.10	0.02	0.15	0.31	0.36	0.21
O2	0.04	0.01	0.11	0.12	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.10	0.13	0.05	0.12	0.16	0.24	0.14
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.10	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.10	0.06	0.09	0.10	0.13	0.02	0.00	0.01	0.29	0.18	0.28	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.01	0.00	0.22	0.20	0.26	0.19
O5'	0.14	0.14	0.02	0.14	0.15	0.01	0.16	0.00	0.17	0.15	0.15	0.15	0.12	0.05	0.29	0.22	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.17	0.21	0.06	0.01	0.29	0.06	0.32	0.11	0.28	0.22	0.25	0.31	0.16	0.03	0.18	0.20	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.28	0.05	0.09	0.35	0.04	0.38	0.01	0.33	0.28	0.32	0.36	0.24	0.02	0.28	0.26	0.03	0.00	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.01	0.10	0.21	0.00	0.21	0.01	0.19	0.17	0.19	0.21	0.14	0.05	0.27	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00