Doublet Group distance statistics: 50422

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C2	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N3	A	0, 0.000, 0.041, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
N6	A	0, 0.000, 0.093, 0.187, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.093 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.000, 0.477, 0.955, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.477 std_dev=0.477
O4'	A	0, 0.000, 0.485, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.485 std_dev=0.485
C1'	B	0, 0.000, 0.632, 1.264, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.632 std_dev=0.632
O4'	B	0, 0.000, 0.709, 1.419, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.709 std_dev=0.709
C2'	B	0, 0.000, 0.720, 1.439, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.720 std_dev=0.720
O2'	B	0, 0.000, 0.732, 1.465, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.732 std_dev=0.732
OP1	A	0, 0.000, 0.797, 1.595, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.797 std_dev=0.797
C4'	A	0, 0.000, 0.846, 1.693, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.846 std_dev=0.846
C3'	A	0, 0.000, 0.854, 1.708, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.854 std_dev=0.854
C4'	B	0, 0.000, 0.859, 1.718, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.859 std_dev=0.859
O2'	A	0, 0.000, 0.897, 1.793, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.897 std_dev=0.897
N1	B	0, 0.000, 0.900, 1.801, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.900 std_dev=0.900
C3'	B	0, 0.000, 0.908, 1.816, 1.816 max_d=1.816 avg_d=0.908 std_dev=0.908
O2	B	0, 0.000, 0.913, 1.826, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.913 std_dev=0.913
O3'	B	0, 0.000, 0.961, 1.921, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.961 std_dev=0.961
C2	B	0, 0.000, 1.038, 2.075, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.038 std_dev=1.038
C5'	B	0, 0.000, 1.090, 2.180, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.090 std_dev=1.090
C6	B	0, 0.000, 1.093, 2.187, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.093 std_dev=1.093
C5'	A	0, 0.000, 1.117, 2.233, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.117 std_dev=1.117
O5'	A	0, 0.000, 1.161, 2.321, 2.321 max_d=2.321 avg_d=1.161 std_dev=1.161
P	A	0, 0.000, 1.174, 2.349, 2.349 max_d=2.349 avg_d=1.174 std_dev=1.174
O5'	B	0, 0.000, 1.272, 2.545, 2.545 max_d=2.545 avg_d=1.272 std_dev=1.272
O3'	A	0, 0.000, 1.274, 2.547, 2.547 max_d=2.547 avg_d=1.274 std_dev=1.274
C5	B	0, 0.000, 1.340, 2.680, 2.680 max_d=2.680 avg_d=1.340 std_dev=1.340
N3	B	0, 0.000, 1.346, 2.693, 2.693 max_d=2.693 avg_d=1.346 std_dev=1.346
C4	B	0, 0.000, 1.474, 2.949, 2.949 max_d=2.949 avg_d=1.474 std_dev=1.474
P	B	0, 0.000, 1.529, 3.058, 3.058 max_d=3.058 avg_d=1.529 std_dev=1.529
OP1	B	0, 0.000, 1.644, 3.288, 3.288 max_d=3.288 avg_d=1.644 std_dev=1.644
OP2	B	0, 0.000, 1.670, 3.339, 3.339 max_d=3.339 avg_d=1.670 std_dev=1.670
OP2	A	0, 0.000, 1.743, 3.487, 3.487 max_d=3.487 avg_d=1.743 std_dev=1.743
N4	B	0, 0.000, 1.784, 3.569, 3.569 max_d=3.569 avg_d=1.784 std_dev=1.784

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.22	0.01	0.09	0.37	0.03	0.11
C2	0.04	0.00	0.21	0.20	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.12	0.11	0.09	0.25	0.38	0.12
C2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.13	0.00	0.08	0.13	0.13	0.09	0.18	0.21	0.12	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.20	0.67	0.13	0.35
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.21	0.00	0.27	0.00	0.30	0.20	0.26	0.15	0.35	0.26	0.15	0.02	0.00	0.01	0.11	0.23	0.20	0.03
C4	0.01	0.02	0.13	0.21	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.06	0.05	0.08	0.26	0.30	0.10
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.13	0.06	0.01	0.16	0.14	0.06	0.19	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.27	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.23	0.04	0.00	0.16	0.18	0.42	0.21
C5'	0.04	0.03	0.13	0.00	0.06	0.01	0.14	0.00	0.15	0.13	0.10	0.00	0.22	0.17	0.05	0.05	0.14	0.00	0.01	0.11	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.30	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.05	0.02	0.20	0.13	0.51	0.27
C8	0.02	0.03	0.09	0.20	0.02	0.13	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.00	0.25	0.04	0.07	0.07	0.24	0.22	0.11
N1	0.02	0.00	0.18	0.26	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.17	0.03	0.07	0.16	0.18	0.48	0.21
N3	0.04	0.00	0.21	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.16	0.11	0.04	0.30	0.28	0.05
N6	0.03	0.01	0.12	0.35	0.02	0.16	0.02	0.22	0.00	0.04	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.24	0.12	0.02	0.27	0.03	0.63	0.38
N7	0.02	0.02	0.03	0.26	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.27	0.09	0.05	0.16	0.16	0.38	0.23
N9	0.00	0.03	0.01	0.15	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.16	0.07	0.00	0.01	0.31	0.17	0.02
O2'	0.00	0.10	0.00	0.02	0.15	0.19	0.23	0.05	0.22	0.25	0.17	0.06	0.24	0.27	0.16	0.00	0.05	0.12	0.13	0.68	0.15	0.32
O3'	0.22	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.14	0.05	0.04	0.03	0.16	0.12	0.09	0.07	0.05	0.00	0.13	0.24	0.10	0.36	0.16
O4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.07	0.11	0.02	0.05	0.00	0.12	0.13	0.00	0.08	0.14	0.00	0.02
O5'	0.09	0.09	0.20	0.11	0.08	0.00	0.16	0.01	0.20	0.07	0.16	0.04	0.27	0.16	0.01	0.13	0.24	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.37	0.25	0.67	0.23	0.26	0.06	0.18	0.11	0.13	0.24	0.18	0.30	0.03	0.16	0.31	0.68	0.10	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.38	0.13	0.20	0.30	0.03	0.42	0.03	0.51	0.22	0.48	0.28	0.63	0.38	0.17	0.15	0.36	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.35	0.03	0.10	0.03	0.21	0.01	0.27	0.11	0.21	0.05	0.38	0.23	0.02	0.32	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.20	0.25	0.20	0.25	0.19	0.32	0.16	0.33	0.27	0.19	0.25	0.16	0.33	0.13	0.24	0.20	0.10	0.28	0.20
C2	0.15	0.08	0.16	0.08	0.09	0.04	0.13	0.03	0.15	0.13	0.06	0.08	0.06	0.26	0.02	0.09	0.01	0.11	0.03	0.03
C2'	0.11	0.17	0.12	0.20	0.15	0.21	0.10	0.27	0.09	0.12	0.19	0.16	0.18	0.00	0.24	0.15	0.27	0.37	0.21	0.29
C3'	0.05	0.07	0.07	0.08	0.02	0.07	0.09	0.09	0.12	0.03	0.09	0.03	0.12	0.16	0.06	0.06	0.12	0.14	0.23	0.16
C4	0.20	0.09	0.22	0.17	0.11	0.15	0.18	0.11	0.21	0.17	0.07	0.10	0.07	0.33	0.11	0.18	0.12	0.03	0.15	0.10
C4'	0.31	0.18	0.35	0.36	0.22	0.36	0.33	0.39	0.37	0.28	0.14	0.19	0.12	0.44	0.35	0.33	0.41	0.44	0.49	0.45
C5	0.19	0.03	0.25	0.21	0.03	0.19	0.11	0.16	0.16	0.12	0.01	0.00	0.01	0.38	0.17	0.17	0.14	0.08	0.15	0.12
C5'	0.27	0.09	0.34	0.38	0.13	0.38	0.26	0.43	0.31	0.23	0.05	0.08	0.04	0.44	0.39	0.31	0.43	0.51	0.51	0.49
C6	0.16	0.02	0.24	0.20	0.02	0.17	0.05	0.13	0.10	0.07	0.06	0.05	0.03	0.38	0.17	0.13	0.10	0.05	0.09	0.07
C8	0.22	0.08	0.27	0.24	0.10	0.23	0.19	0.22	0.23	0.17	0.04	0.07	0.04	0.39	0.20	0.22	0.21	0.16	0.24	0.20
N1	0.14	0.00	0.20	0.14	0.00	0.10	0.05	0.04	0.09	0.07	0.03	0.02	0.01	0.32	0.09	0.09	0.03	0.04	0.04	0.00
N3	0.18	0.12	0.17	0.10	0.15	0.07	0.20	0.00	0.22	0.18	0.11	0.15	0.10	0.26	0.03	0.14	0.04	0.08	0.09	0.01
N6	0.16	0.05	0.29	0.25	0.07	0.22	0.01	0.18	0.07	0.05	0.11	0.11	0.06	0.44	0.24	0.14	0.13	0.10	0.10	0.10
N7	0.20	0.02	0.27	0.24	0.03	0.23	0.12	0.21	0.17	0.12	0.03	0.01	0.01	0.40	0.21	0.19	0.19	0.15	0.20	0.18
N9	0.23	0.12	0.24	0.20	0.16	0.19	0.23	0.16	0.26	0.20	0.10	0.14	0.09	0.35	0.14	0.21	0.17	0.10	0.22	0.17
O2'	0.07	0.12	0.02	0.20	0.12	0.23	0.10	0.41	0.08	0.10	0.13	0.13	0.14	0.11	0.30	0.05	0.40	0.72	0.40	0.53
O3'	0.42	0.29	0.44	0.46	0.33	0.45	0.45	0.47	0.49	0.40	0.26	0.30	0.24	0.52	0.45	0.43	0.50	0.50	0.59	0.53
O4'	0.42	0.31	0.45	0.44	0.35	0.44	0.44	0.46	0.48	0.40	0.28	0.33	0.26	0.53	0.40	0.43	0.47	0.45	0.54	0.50
O5'	0.16	0.08	0.25	0.29	0.07	0.30	0.08	0.35	0.16	0.08	0.14	0.13	0.13	0.37	0.31	0.21	0.32	0.42	0.36	0.37
OP1	0.41	0.20	0.47	0.47	0.21	0.48	0.34	0.49	0.41	0.34	0.14	0.15	0.15	0.59	0.46	0.44	0.47	0.48	0.51	0.48
OP2	0.19	0.52	0.06	0.03	0.51	0.06	0.32	0.15	0.22	0.31	0.61	0.60	0.58	0.08	0.09	0.10	0.09	0.28	0.13	0.17
P	0.10	0.14	0.18	0.23	0.11	0.25	0.05	0.31	0.12	0.02	0.21	0.17	0.21	0.29	0.25	0.15	0.29	0.41	0.37	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
C2	0.01	0.00	0.08	0.13	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.14	0.00	0.07	0.06	0.08	0.06
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.04	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.13	0.10	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C4	0.02	0.02	0.02	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.01	0.05	0.06	0.07	0.05
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00
C5	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02
C5'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.08	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00
C6	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02
N1	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04
N3	0.01	0.00	0.06	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.16	0.01	0.06	0.07	0.08	0.06
N4	0.03	0.03	0.04	0.10	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.15	0.02	0.06	0.08	0.09	0.05
O2	0.03	0.00	0.15	0.17	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.19	0.00	0.08	0.08	0.09	0.07
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.03	0.08	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.04
O3'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.13	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.16	0.15	0.19	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02
O5'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.06	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.02	0.06	0.04	0.04	0.06	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.07	0.08	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.08	0.03	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.08	0.09	0.09	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00