Doublet Group distance statistics: 50423

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N1	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N3	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C2	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C1'	A	0, 0.000, 0.056, 0.112, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.056
N6	A	0, 0.000, 0.072, 0.143, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.072 std_dev=0.072
C3'	B	0, 0.000, 0.264, 0.528, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.264 std_dev=0.264
O4'	A	0, 0.000, 0.332, 0.664, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.332 std_dev=0.332
C4'	B	0, 0.000, 0.405, 0.810, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.405 std_dev=0.405
C2'	B	0, 0.000, 0.432, 0.864, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.432 std_dev=0.432
C2'	A	0, 0.000, 0.455, 0.909, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.455 std_dev=0.455
O4'	B	0, 0.000, 0.465, 0.930, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.465 std_dev=0.465
C1'	B	0, 0.000, 0.488, 0.976, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.488 std_dev=0.488
O3'	B	0, 0.000, 0.514, 1.027, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.514 std_dev=0.514
O2'	A	0, 0.000, 0.522, 1.044, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.522 std_dev=0.522
O2'	B	0, 0.000, 0.528, 1.056, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.528 std_dev=0.528
C4'	A	0, 0.000, 0.596, 1.192, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.596 std_dev=0.596
C3'	A	0, 0.000, 0.655, 1.310, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.655 std_dev=0.655
N1	B	0, 0.000, 0.771, 1.541, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.771 std_dev=0.771
C5'	B	0, 0.000, 0.773, 1.547, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.773 std_dev=0.773
O2	B	0, 0.000, 0.875, 1.749, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.875 std_dev=0.875
C2	B	0, 0.000, 0.933, 1.867, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.933 std_dev=0.933
C5'	A	0, 0.000, 0.963, 1.926, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.963 std_dev=0.963
O3'	A	0, 0.000, 0.985, 1.970, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.985 std_dev=0.985
C6	B	0, 0.000, 1.011, 2.021, 2.021 max_d=2.021 avg_d=1.011 std_dev=1.011
N3	B	0, 0.000, 1.260, 2.521, 2.521 max_d=2.521 avg_d=1.260 std_dev=1.260
C5	B	0, 0.000, 1.320, 2.640, 2.640 max_d=2.640 avg_d=1.320 std_dev=1.320
C4	B	0, 0.000, 1.419, 2.839, 2.839 max_d=2.839 avg_d=1.419 std_dev=1.419
O5'	B	0, 0.000, 1.443, 2.886, 2.886 max_d=2.886 avg_d=1.443 std_dev=1.443
O5'	A	0, 0.000, 1.527, 3.054, 3.054 max_d=3.054 avg_d=1.527 std_dev=1.527
OP2	B	0, 0.000, 1.602, 3.204, 3.204 max_d=3.204 avg_d=1.602 std_dev=1.602
P	B	0, 0.000, 1.711, 3.422, 3.422 max_d=3.422 avg_d=1.711 std_dev=1.711
N4	B	0, 0.000, 1.789, 3.578, 3.578 max_d=3.578 avg_d=1.789 std_dev=1.789
OP1	B	0, 0.000, 1.804, 3.608, 3.608 max_d=3.608 avg_d=1.804 std_dev=1.804
OP1	A	0, 0.000, 2.145, 4.290, 4.290 max_d=4.290 avg_d=2.145 std_dev=2.145
P	A	0, 0.000, 2.468, 4.936, 4.936 max_d=4.936 avg_d=2.468 std_dev=2.468
OP2	A	0, 0.000, 3.235, 6.471, 6.471 max_d=6.471 avg_d=3.235 std_dev=3.235

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.17	0.35	0.10
C2	0.07	0.00	0.27	0.26	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.27	0.35	0.00	0.18	0.04	0.61	0.31
C2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.13	0.02	0.07	0.01	0.13	0.09	0.22	0.27	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.24	0.54	0.16
C3'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.12	0.20	0.25	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.20	0.17	0.61	0.24
C4	0.03	0.02	0.13	0.13	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.17	0.02	0.21	0.08	0.57	0.34
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.10	0.06	0.11	0.04	0.09	0.02	0.07	0.00	0.00	0.02	0.32	0.19	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.04	0.24	0.22	0.60	0.45
C5'	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.12	0.17	0.05	0.03	0.18	0.19	0.07	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01
C6	0.03	0.01	0.13	0.11	0.01	0.00	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.18	0.04	0.23	0.22	0.63	0.45
C8	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.11	0.02	0.30	0.27	0.54	0.49
N1	0.05	0.00	0.22	0.20	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.30	0.02	0.20	0.14	0.64	0.39
N3	0.07	0.01	0.27	0.25	0.01	0.11	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.32	0.00	0.17	0.02	0.57	0.26
N6	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01	0.04	0.01	0.18	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.10	0.14	0.06	0.22	0.30	0.63	0.50
N7	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.29	0.34	0.59	0.54
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.22	0.07	0.51	0.32
O2'	0.01	0.27	0.00	0.02	0.11	0.07	0.07	0.06	0.13	0.07	0.21	0.24	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.45	0.40	0.03
O3'	0.01	0.35	0.01	0.01	0.17	0.00	0.10	0.02	0.18	0.11	0.30	0.32	0.14	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.16	0.31	0.67	0.18
O4'	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.19	0.14	0.03
O5'	0.10	0.18	0.14	0.20	0.21	0.02	0.24	0.00	0.23	0.30	0.20	0.17	0.22	0.29	0.22	0.05	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.17	0.04	0.24	0.17	0.08	0.32	0.22	0.04	0.22	0.27	0.14	0.02	0.30	0.34	0.07	0.45	0.31	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.61	0.54	0.61	0.57	0.19	0.60	0.07	0.63	0.54	0.64	0.57	0.63	0.59	0.51	0.40	0.67	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.31	0.16	0.24	0.34	0.07	0.45	0.01	0.45	0.49	0.39	0.26	0.50	0.54	0.32	0.03	0.18	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.19	0.25	0.22	0.24	0.15	0.13	0.11	0.04	0.06	0.29	0.31	0.21	0.35	0.27	0.05	0.04	0.24	0.05	0.08
C2	0.15	0.03	0.19	0.15	0.09	0.14	0.15	0.14	0.17	0.11	0.02	0.08	0.02	0.25	0.10	0.13	0.19	0.20	0.19	0.05
C2'	0.28	0.04	0.46	0.45	0.12	0.37	0.01	0.32	0.11	0.11	0.16	0.21	0.05	0.55	0.52	0.25	0.21	0.03	0.25	0.11
C3'	0.34	0.05	0.56	0.56	0.05	0.45	0.07	0.40	0.18	0.18	0.08	0.16	0.05	0.64	0.65	0.31	0.28	0.04	0.31	0.17
C4	0.06	0.16	0.17	0.17	0.12	0.15	0.02	0.16	0.03	0.03	0.19	0.16	0.21	0.26	0.18	0.08	0.20	0.11	0.18	0.08
C4'	0.23	0.02	0.45	0.41	0.12	0.29	0.02	0.23	0.08	0.09	0.13	0.22	0.00	0.53	0.49	0.16	0.10	0.19	0.11	0.04
C5	0.05	0.15	0.12	0.16	0.08	0.21	0.04	0.26	0.08	0.02	0.18	0.11	0.24	0.17	0.15	0.13	0.38	0.09	0.35	0.28
C5'	0.19	0.02	0.41	0.38	0.12	0.24	0.03	0.19	0.06	0.07	0.13	0.21	0.00	0.49	0.46	0.12	0.08	0.24	0.06	0.08
C6	0.10	0.06	0.11	0.16	0.05	0.25	0.16	0.34	0.18	0.06	0.06	0.03	0.16	0.12	0.11	0.20	0.53	0.22	0.47	0.42
C8	0.01	0.26	0.12	0.16	0.24	0.17	0.10	0.20	0.03	0.11	0.32	0.30	0.33	0.20	0.19	0.06	0.26	0.00	0.24	0.16
N1	0.15	0.03	0.15	0.16	0.14	0.23	0.22	0.29	0.24	0.13	0.04	0.13	0.05	0.15	0.08	0.22	0.46	0.07	0.40	0.32
N3	0.10	0.07	0.21	0.16	0.06	0.10	0.01	0.08	0.05	0.01	0.10	0.08	0.10	0.30	0.15	0.05	0.06	0.28	0.07	0.07
N6	0.11	0.04	0.09	0.18	0.10	0.31	0.23	0.45	0.24	0.10	0.02	0.10	0.15	0.06	0.10	0.26	0.72	0.47	0.65	0.65
N7	0.02	0.22	0.10	0.16	0.16	0.21	0.02	0.27	0.03	0.07	0.26	0.20	0.31	0.15	0.17	0.11	0.39	0.15	0.36	0.30
N9	0.03	0.23	0.17	0.17	0.23	0.14	0.11	0.14	0.04	0.09	0.29	0.28	0.28	0.26	0.21	0.05	0.14	0.14	0.14	0.03
O2'	0.26	0.05	0.44	0.40	0.17	0.30	0.06	0.23	0.06	0.08	0.19	0.28	0.03	0.51	0.47	0.20	0.07	0.15	0.13	0.02
O3'	0.47	0.18	0.73	0.74	0.04	0.59	0.16	0.54	0.28	0.31	0.03	0.08	0.21	0.80	0.86	0.43	0.37	0.16	0.41	0.26
O4'	0.08	0.16	0.27	0.23	0.24	0.12	0.14	0.07	0.05	0.06	0.26	0.32	0.15	0.38	0.29	0.02	0.02	0.33	0.03	0.17
O5'	0.34	0.04	0.63	0.60	0.10	0.44	0.01	0.37	0.14	0.16	0.10	0.22	0.08	0.76	0.74	0.26	0.24	0.08	0.16	0.04
OP1	0.05	0.36	0.40	0.42	0.59	0.24	0.44	0.16	0.25	0.20	0.57	0.77	0.30	0.59	0.64	0.00	0.01	0.23	0.11	0.19
OP2	0.94	0.66	1.34	1.34	0.49	1.09	0.59	1.00	0.72	0.77	0.50	0.35	0.72	1.47	1.54	0.84	0.80	0.47	0.71	0.58
P	0.46	0.10	0.82	0.83	0.09	0.63	0.04	0.54	0.20	0.24	0.08	0.25	0.16	0.99	1.03	0.38	0.37	0.08	0.26	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.12	0.22	0.08	0.09
C2	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.19	0.00	0.21	0.22	0.08	0.14
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.08	0.16	0.00	0.02	0.02	0.05	0.15	0.09	0.04
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.17	0.01	0.11	0.01	0.07	0.10	0.19	0.18	0.19	0.02	0.01	0.02	0.04	0.12	0.09	0.02
C4	0.04	0.01	0.07	0.17	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.21	0.05	0.23	0.14	0.12	0.11
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.09	0.12	0.08	0.08	0.01	0.01	0.00	0.17	0.09	0.02
C5	0.03	0.00	0.02	0.11	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.14	0.06	0.22	0.11	0.12	0.09
C5'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.05	0.03	0.08	0.12	0.06	0.08	0.02	0.00	0.00	0.11	0.09	0.00
C6	0.02	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.06	0.21	0.14	0.11	0.09
N1	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.11	0.01	0.20	0.21	0.09	0.12
N3	0.03	0.00	0.10	0.19	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.02	0.23	0.19	0.10	0.14
N4	0.04	0.00	0.08	0.18	0.00	0.12	0.03	0.12	0.03	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.24	0.06	0.22	0.10	0.15	0.09
O2	0.03	0.00	0.16	0.19	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.22	0.01	0.17	0.24	0.08	0.14
O2'	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.00	0.07	0.10	0.06	0.17	0.07
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.21	0.01	0.14	0.02	0.09	0.11	0.23	0.24	0.22	0.00	0.00	0.02	0.05	0.06	0.11	0.04
O4'	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.10	0.24	0.09	0.09
O5'	0.12	0.21	0.05	0.04	0.23	0.00	0.22	0.00	0.21	0.20	0.23	0.22	0.17	0.10	0.05	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.22	0.22	0.15	0.12	0.14	0.17	0.11	0.11	0.14	0.21	0.19	0.10	0.24	0.06	0.06	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.08	0.09	0.09	0.12	0.09	0.12	0.09	0.11	0.09	0.10	0.15	0.08	0.17	0.11	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.04	0.02	0.11	0.02	0.09	0.00	0.09	0.12	0.14	0.09	0.14	0.07	0.04	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00