Doublet Group distance statistics: 50435

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 3, 3, 9, 1, 4, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.017, 0.030, 0.044, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.019, 0.034, 0.049, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.034 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.018, 0.035, 0.052, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.014, 0.032, 0.051, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.014, 0.036, 0.059, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.036 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.014, 0.041, 0.068, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.041 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.016, 0.048, 0.081, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.048 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.043, 0.164, 0.285, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.164 std_dev=0.121
C2'	A	0, 0.099, 0.224, 0.349, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.224 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.220, 0.377, 0.534, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.377 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.136, 0.308, 0.481, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.308 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.143, 0.327, 0.510, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.327 std_dev=0.184
O2'	B	0, 0.362, 0.589, 0.816, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.589 std_dev=0.227
C4'	B	0, 0.307, 0.539, 0.771, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.539 std_dev=0.232
O4'	B	0, 0.328, 0.567, 0.806, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.567 std_dev=0.239
C1'	B	0, 0.365, 0.607, 0.849, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.607 std_dev=0.242
O3'	A	0, 0.206, 0.457, 0.708, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.457 std_dev=0.251
C2'	B	0, 0.412, 0.671, 0.929, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.671 std_dev=0.258
C3'	B	0, 0.449, 0.715, 0.982, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.715 std_dev=0.267
O3'	B	0, 0.498, 0.770, 1.042, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.770 std_dev=0.272
C5'	B	0, 0.328, 0.603, 0.878, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.603 std_dev=0.275
O5'	A	0, 0.321, 0.604, 0.887, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.604 std_dev=0.283
N3	B	0, 0.436, 0.734, 1.031, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.734 std_dev=0.298
N9	B	0, 0.483, 0.788, 1.093, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.788 std_dev=0.305
C4	B	0, 0.496, 0.821, 1.147, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.821 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.245, 0.583, 0.921, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.583 std_dev=0.338
C2	B	0, 0.487, 0.834, 1.181, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.834 std_dev=0.347
OP2	A	0, 0.422, 0.794, 1.166, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.794 std_dev=0.372
C8	B	0, 0.631, 1.006, 1.381, 1.745 max_d=1.745 avg_d=1.006 std_dev=0.375
O5'	B	0, 0.379, 0.758, 1.136, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.758 std_dev=0.379
C5	B	0, 0.630, 1.026, 1.422, 1.805 max_d=1.805 avg_d=1.026 std_dev=0.396
P	B	0, 0.329, 0.727, 1.125, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.727 std_dev=0.398
OP1	B	0, 0.342, 0.745, 1.149, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.745 std_dev=0.404
P	A	0, 0.312, 0.718, 1.123, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.718 std_dev=0.405
OP2	B	0, 0.366, 0.772, 1.179, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.772 std_dev=0.407
N1	B	0, 0.577, 0.986, 1.395, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.986 std_dev=0.409
N7	B	0, 0.730, 1.157, 1.584, 1.985 max_d=1.985 avg_d=1.157 std_dev=0.427
C6	B	0, 0.666, 1.100, 1.534, 1.976 max_d=1.976 avg_d=1.100 std_dev=0.434
N6	B	0, 0.814, 1.319, 1.824, 2.359 max_d=2.359 avg_d=1.319 std_dev=0.505
OP1	A	0, 0.473, 0.980, 1.488, 2.248 max_d=2.248 avg_d=0.980 std_dev=0.507

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.21	0.25	0.10
C2	0.05	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.11	0.06	0.20	0.20	0.34	0.20
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.27	0.20	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.09	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09	0.05	0.02	0.00	0.01	0.18	0.28	0.15	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.03	0.21	0.19	0.33	0.20
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.03	0.04	0.07	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.27	0.14	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.08	0.02	0.25	0.20	0.36	0.23
C5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.09	0.00	0.14	0.00	0.14	0.16	0.10	0.05	0.18	0.18	0.09	0.06	0.05	0.01	0.01	0.14	0.18	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.02	0.25	0.19	0.37	0.23
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.27	0.20	0.35	0.23
N1	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.10	0.04	0.23	0.19	0.36	0.23
N3	0.05	0.01	0.09	0.09	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.10	0.06	0.18	0.20	0.32	0.18
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.10	0.11	0.03	0.27	0.19	0.37	0.24
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.29	0.21	0.38	0.26
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.20	0.19	0.32	0.18
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.09	0.06	0.08	0.06	0.11	0.03	0.15	0.14	0.10	0.05	0.04	0.00	0.03	0.05	0.07	0.39	0.13	0.10
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.02	0.08	0.05	0.10	0.08	0.10	0.10	0.11	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.19	0.38	0.15	0.19
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.20	0.25	0.08
O5'	0.11	0.20	0.13	0.18	0.21	0.01	0.25	0.01	0.25	0.27	0.23	0.18	0.27	0.29	0.20	0.07	0.19	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.20	0.27	0.28	0.19	0.27	0.20	0.14	0.19	0.20	0.19	0.20	0.19	0.21	0.19	0.39	0.38	0.20	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.34	0.20	0.15	0.33	0.14	0.36	0.18	0.37	0.35	0.36	0.32	0.37	0.38	0.32	0.13	0.15	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.11	0.14	0.20	0.06	0.23	0.01	0.23	0.23	0.23	0.18	0.24	0.26	0.18	0.10	0.19	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.19	0.12	0.13	0.15	0.15	0.15	0.16	0.16	0.14	0.19	0.17	0.16	0.15	0.13	0.13	0.13	0.15	0.18	0.20	0.17	0.17
C2	0.14	0.15	0.15	0.15	0.14	0.16	0.15	0.16	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.14	0.17	0.16	0.15	0.16	0.19	0.14	0.14
C2'	0.16	0.21	0.14	0.15	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.17	0.21	0.20	0.19	0.17	0.17	0.14	0.15	0.18	0.20	0.21	0.18	0.18
C3'	0.17	0.20	0.17	0.18	0.17	0.20	0.17	0.21	0.18	0.17	0.19	0.19	0.17	0.17	0.17	0.18	0.19	0.20	0.22	0.25	0.19	0.21
C4	0.14	0.17	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.15	0.14	0.16	0.15	0.16	0.18	0.20	0.16	0.16
C4'	0.12	0.17	0.12	0.13	0.13	0.15	0.13	0.17	0.14	0.13	0.16	0.15	0.14	0.13	0.12	0.13	0.14	0.15	0.18	0.21	0.17	0.17
C5	0.14	0.16	0.14	0.15	0.14	0.16	0.15	0.17	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.17	0.17	0.15	0.17	0.20	0.15	0.15
C5'	0.13	0.17	0.14	0.16	0.14	0.18	0.14	0.20	0.15	0.14	0.17	0.15	0.15	0.15	0.13	0.16	0.18	0.17	0.21	0.24	0.19	0.20
C6	0.14	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.15	0.15	0.17	0.15	0.14	0.15	0.17	0.14	0.17	0.18	0.15	0.15	0.19	0.13	0.14
C8	0.13	0.18	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.18	0.16	0.15	0.17	0.16	0.16	0.16	0.14	0.16	0.16	0.16	0.19	0.22	0.17	0.18
N1	0.14	0.14	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.14	0.15	0.17	0.15	0.14	0.15	0.17	0.15	0.18	0.18	0.15	0.14	0.18	0.12	0.12
N3	0.14	0.17	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.17	0.17	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.16	0.18	0.20	0.16	0.16
N6	0.14	0.14	0.15	0.16	0.15	0.15	0.16	0.15	0.16	0.18	0.15	0.14	0.17	0.19	0.15	0.18	0.19	0.15	0.14	0.18	0.14	0.14
N7	0.14	0.16	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.15	0.16	0.16	0.16	0.15	0.16	0.14	0.17	0.17	0.15	0.18	0.22	0.16	0.17
N9	0.13	0.18	0.14	0.14	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.18	0.17	0.16	0.15	0.14	0.15	0.15	0.16	0.19	0.21	0.17	0.17
O2'	0.15	0.19	0.15	0.16	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.18	0.17	0.16	0.15	0.15	0.17	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.15
O3'	0.18	0.21	0.19	0.19	0.18	0.20	0.18	0.21	0.18	0.17	0.20	0.20	0.18	0.17	0.18	0.20	0.20	0.20	0.21	0.24	0.18	0.19
O4'	0.12	0.19	0.12	0.13	0.15	0.15	0.15	0.16	0.17	0.14	0.19	0.17	0.17	0.15	0.13	0.13	0.14	0.15	0.18	0.20	0.17	0.17
O5'	0.14	0.17	0.14	0.17	0.14	0.18	0.14	0.19	0.15	0.14	0.17	0.15	0.15	0.13	0.13	0.15	0.20	0.17	0.19	0.20	0.19	0.19
OP1	0.25	0.39	0.25	0.24	0.31	0.23	0.31	0.22	0.35	0.24	0.39	0.35	0.35	0.27	0.26	0.25	0.25	0.24	0.23	0.18	0.22	0.19
OP2	0.30	0.24	0.31	0.33	0.26	0.34	0.26	0.36	0.24	0.31	0.24	0.25	0.23	0.29	0.29	0.31	0.36	0.32	0.33	0.33	0.33	0.33
P	0.14	0.17	0.15	0.18	0.13	0.18	0.12	0.19	0.14	0.14	0.17	0.15	0.13	0.13	0.13	0.17	0.22	0.16	0.15	0.12	0.15	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.08	0.05
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.03	0.06	0.07	0.12	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06	0.06	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.07	0.07	0.11	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.03	0.03	0.06	0.08	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.09	0.11	0.15	0.11
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.05	0.03	0.10	0.11	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.03	0.10	0.12	0.17	0.13
C8	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.10	0.10	0.11	0.10
N1	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.03	0.08	0.10	0.15	0.11
N3	0.03	0.00	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.03	0.06	0.06	0.10	0.06
N6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.08	0.04	0.12	0.16	0.20	0.16
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.12	0.13	0.16	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.09	0.06
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.04	0.11	0.11	0.07	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.08	0.07	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.09	0.08	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.09	0.08	0.07
O5'	0.05	0.06	0.03	0.05	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.10	0.08	0.06	0.12	0.12	0.07	0.04	0.09	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.07	0.05	0.06	0.07	0.07	0.11	0.08	0.12	0.10	0.10	0.06	0.16	0.13	0.07	0.08	0.09	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.12	0.07	0.06	0.11	0.04	0.15	0.03	0.17	0.11	0.15	0.10	0.20	0.16	0.09	0.07	0.08	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.04	0.05	0.07	0.02	0.11	0.01	0.13	0.10	0.11	0.06	0.16	0.13	0.06	0.05	0.08	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00