Doublet Group distance statistics: 50439

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 4, 3, 2, 1, 0, 2, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.040, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.004, 0.025, 0.046, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.025 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.007, 0.028, 0.050, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.028 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.011, 0.033, 0.055, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.033 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.007, 0.030, 0.054, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.010, 0.039, 0.067, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.043, 0.174, 0.305, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.174 std_dev=0.131
O4'	A	0, 0.017, 0.162, 0.307, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.162 std_dev=0.145
O2'	A	0, 0.076, 0.274, 0.471, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.274 std_dev=0.197
C3'	A	0, 0.070, 0.292, 0.513, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.292 std_dev=0.221
O5'	A	0, 0.063, 0.318, 0.572, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.318 std_dev=0.254
O3'	A	0, 0.099, 0.362, 0.626, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.362 std_dev=0.264
O4'	B	0, 0.204, 0.508, 0.813, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.508 std_dev=0.304
OP1	B	0, 0.307, 0.621, 0.934, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.621 std_dev=0.313
P	B	0, 0.241, 0.562, 0.882, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.562 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.175, 0.497, 0.818, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.497 std_dev=0.321
C4'	A	0, 0.036, 0.361, 0.685, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.361 std_dev=0.324
C5'	B	0, 0.198, 0.524, 0.849, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.524 std_dev=0.325
C1'	B	0, 0.204, 0.532, 0.860, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.532 std_dev=0.328
O2'	B	0, 0.236, 0.578, 0.920, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.578 std_dev=0.342
OP2	B	0, 0.265, 0.609, 0.953, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.609 std_dev=0.344
C2'	B	0, 0.189, 0.547, 0.905, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.547 std_dev=0.358
P	A	0, 0.096, 0.455, 0.815, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.455 std_dev=0.359
C3'	B	0, 0.157, 0.529, 0.901, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.529 std_dev=0.372
N9	B	0, 0.201, 0.575, 0.949, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.575 std_dev=0.374
C8	B	0, 0.229, 0.612, 0.994, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.612 std_dev=0.383
O5'	B	0, 0.188, 0.580, 0.971, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.580 std_dev=0.391
O3'	B	0, 0.149, 0.541, 0.934, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.541 std_dev=0.392
C4	B	0, 0.191, 0.609, 1.027, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.609 std_dev=0.418
N7	B	0, 0.237, 0.664, 1.090, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.664 std_dev=0.426
N3	B	0, 0.192, 0.620, 1.048, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.620 std_dev=0.428
C5	B	0, 0.211, 0.661, 1.111, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.661 std_dev=0.450
C2	B	0, 0.203, 0.680, 1.158, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.680 std_dev=0.478
C6	B	0, 0.219, 0.718, 1.217, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.718 std_dev=0.499
N1	B	0, 0.213, 0.726, 1.240, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.726 std_dev=0.513
N6	B	0, 0.257, 0.785, 1.312, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.785 std_dev=0.528
OP1	A	0, 0.125, 0.719, 1.312, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.719 std_dev=0.593
OP2	A	0, 0.132, 0.738, 1.344, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.738 std_dev=0.606
C5'	A	0, -0.012, 0.789, 1.590, 2.147 max_d=2.147 avg_d=0.789 std_dev=0.801

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.37	0.17	0.15
C2	0.05	0.00	0.08	0.18	0.01	0.06	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.17	0.03	0.12	0.35	0.31	0.11
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.09	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.40	0.16	0.13
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.13	0.01	0.12	0.03	0.14	0.11	0.16	0.17	0.13	0.11	0.08	0.02	0.01	0.04	0.29	0.29	0.26	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.13	0.00	0.07	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.13	0.30	0.33	0.10
C4'	0.03	0.06	0.04	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.12	0.16	0.08	0.05	0.15	0.17	0.08	0.09	0.02	0.01	0.01	0.45	0.08	0.22
C5	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.12	0.00	0.41	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.14	0.25	0.41	0.11
C5'	0.05	0.24	0.01	0.03	0.29	0.01	0.41	0.00	0.42	0.43	0.34	0.19	0.49	0.49	0.27	0.14	0.07	0.03	0.01	0.19	0.06	0.04
C6	0.02	0.01	0.04	0.14	0.01	0.12	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.12	0.03	0.14	0.26	0.42	0.10
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.16	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.06	0.16	0.20	0.42	0.12
N1	0.04	0.00	0.06	0.16	0.01	0.08	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	0.02	0.12	0.31	0.37	0.10
N3	0.05	0.00	0.09	0.17	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.04	0.12	0.36	0.28	0.12
N6	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.15	0.01	0.49	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.12	0.04	0.15	0.22	0.46	0.12
N7	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.17	0.00	0.49	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.06	0.16	0.19	0.47	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.13	0.28	0.32	0.10
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.11	0.09	0.10	0.14	0.14	0.04	0.17	0.15	0.14	0.07	0.04	0.00	0.05	0.06	0.08	0.60	0.14	0.33
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.07	0.12	0.12	0.15	0.15	0.12	0.12	0.06	0.05	0.00	0.02	0.34	0.41	0.22	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.18	0.35	0.14	0.17
O5'	0.13	0.12	0.15	0.29	0.13	0.01	0.14	0.01	0.14	0.16	0.12	0.12	0.15	0.16	0.13	0.08	0.34	0.18	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.37	0.35	0.40	0.29	0.30	0.45	0.25	0.19	0.26	0.20	0.31	0.36	0.22	0.19	0.28	0.60	0.41	0.35	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.31	0.16	0.26	0.33	0.08	0.41	0.06	0.42	0.42	0.37	0.28	0.46	0.47	0.32	0.14	0.22	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.11	0.13	0.11	0.10	0.22	0.11	0.04	0.10	0.12	0.10	0.12	0.12	0.13	0.10	0.33	0.20	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.16	0.19	0.18	0.19	0.19	0.23	0.22	0.22	0.28	0.18	0.16	0.25	0.28	0.22	0.22	0.16	0.23	0.24	0.24	0.17	0.19
C2	0.10	0.11	0.13	0.13	0.08	0.15	0.11	0.20	0.10	0.18	0.09	0.11	0.13	0.17	0.11	0.19	0.14	0.15	0.21	0.25	0.14	0.16
C2'	0.16	0.16	0.18	0.16	0.14	0.16	0.16	0.17	0.15	0.20	0.15	0.14	0.17	0.19	0.16	0.21	0.18	0.18	0.20	0.19	0.15	0.13
C3'	0.13	0.20	0.15	0.11	0.14	0.11	0.13	0.13	0.15	0.15	0.18	0.18	0.15	0.15	0.13	0.19	0.13	0.14	0.15	0.16	0.15	0.11
C4	0.11	0.08	0.12	0.11	0.09	0.13	0.13	0.18	0.11	0.19	0.08	0.08	0.15	0.19	0.12	0.18	0.11	0.15	0.18	0.21	0.13	0.14
C4'	0.19	0.25	0.16	0.12	0.24	0.13	0.29	0.17	0.30	0.29	0.28	0.22	0.34	0.32	0.23	0.18	0.11	0.20	0.21	0.21	0.18	0.17
C5	0.10	0.10	0.12	0.11	0.09	0.12	0.12	0.17	0.11	0.17	0.09	0.10	0.14	0.17	0.11	0.19	0.11	0.13	0.14	0.19	0.14	0.13
C5'	0.13	0.20	0.20	0.23	0.14	0.23	0.20	0.26	0.24	0.20	0.23	0.15	0.29	0.24	0.13	0.28	0.33	0.17	0.20	0.26	0.17	0.19
C6	0.13	0.15	0.14	0.13	0.13	0.13	0.14	0.17	0.13	0.17	0.13	0.15	0.15	0.17	0.13	0.21	0.14	0.14	0.14	0.19	0.16	0.14
C8	0.10	0.08	0.11	0.10	0.09	0.12	0.13	0.17	0.12	0.18	0.08	0.07	0.16	0.19	0.12	0.18	0.10	0.14	0.15	0.18	0.14	0.14
N1	0.13	0.16	0.14	0.12	0.13	0.12	0.13	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.17	0.13	0.22	0.14	0.14	0.15	0.22	0.15	0.14
N3	0.13	0.08	0.14	0.14	0.09	0.17	0.14	0.21	0.12	0.21	0.08	0.08	0.15	0.20	0.14	0.19	0.14	0.18	0.22	0.24	0.14	0.17
N6	0.17	0.18	0.18	0.18	0.17	0.18	0.17	0.21	0.17	0.19	0.17	0.19	0.18	0.19	0.17	0.24	0.19	0.17	0.20	0.19	0.20	0.18
N7	0.10	0.09	0.12	0.11	0.09	0.13	0.12	0.17	0.11	0.17	0.09	0.09	0.14	0.17	0.11	0.19	0.12	0.13	0.15	0.18	0.15	0.14
N9	0.12	0.09	0.12	0.12	0.11	0.14	0.15	0.18	0.14	0.21	0.10	0.08	0.17	0.21	0.14	0.18	0.11	0.16	0.18	0.20	0.14	0.14
O2'	0.40	0.36	0.42	0.39	0.38	0.37	0.38	0.35	0.37	0.40	0.36	0.37	0.37	0.39	0.39	0.44	0.40	0.38	0.38	0.33	0.28	0.29
O3'	0.15	0.26	0.17	0.12	0.18	0.10	0.18	0.12	0.21	0.17	0.24	0.23	0.21	0.17	0.16	0.19	0.13	0.15	0.16	0.16	0.16	0.11
O4'	0.19	0.19	0.16	0.14	0.20	0.17	0.26	0.21	0.25	0.29	0.21	0.17	0.29	0.31	0.22	0.19	0.12	0.22	0.23	0.24	0.19	0.20
O5'	0.18	0.25	0.16	0.12	0.22	0.12	0.26	0.15	0.27	0.25	0.27	0.23	0.30	0.28	0.21	0.19	0.15	0.17	0.16	0.15	0.16	0.13
OP1	0.35	0.40	0.37	0.32	0.35	0.30	0.34	0.28	0.35	0.33	0.37	0.39	0.35	0.33	0.34	0.40	0.33	0.32	0.27	0.23	0.28	0.24
OP2	0.32	0.25	0.32	0.35	0.29	0.36	0.32	0.41	0.30	0.38	0.27	0.26	0.33	0.38	0.32	0.33	0.38	0.35	0.41	0.46	0.38	0.41
P	0.12	0.15	0.13	0.09	0.12	0.08	0.15	0.12	0.16	0.18	0.15	0.14	0.19	0.19	0.13	0.18	0.13	0.12	0.13	0.15	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.08	0.21	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.07	0.02	0.22	0.18	0.20	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.20	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.12	0.17	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.22	0.16	0.20	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.04	0.03	0.07	0.08	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.10	0.15	0.05
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.02	0.27	0.21	0.22	0.19
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.16	0.13	0.07	0.18	0.18	0.10	0.06	0.02	0.02	0.01	0.13	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.28	0.23	0.23	0.21
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.27	0.18	0.20	0.16
N1	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.07	0.02	0.26	0.21	0.22	0.19
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.02	0.19	0.15	0.20	0.12
N6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.09	0.04	0.31	0.26	0.26	0.25
N7	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.30	0.22	0.23	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.20	0.14	0.20	0.11
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.08	0.06	0.08	0.06	0.10	0.02	0.13	0.12	0.10	0.05	0.03	0.00	0.03	0.06	0.06	0.13	0.18	0.06
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.08	0.07	0.06	0.09	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.09	0.17	0.16	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.07	0.21	0.08
O5'	0.11	0.22	0.05	0.05	0.22	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.26	0.19	0.31	0.30	0.20	0.06	0.09	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.08	0.18	0.10	0.12	0.16	0.10	0.21	0.13	0.23	0.18	0.21	0.15	0.26	0.22	0.14	0.13	0.17	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.20	0.20	0.17	0.20	0.15	0.22	0.06	0.23	0.20	0.22	0.20	0.26	0.23	0.20	0.18	0.16	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.07	0.07	0.14	0.05	0.19	0.01	0.21	0.16	0.19	0.12	0.25	0.21	0.11	0.06	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00