Doublet Group distance statistics: 50449

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.020, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.006, 0.030, 0.054, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.030 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.010, 0.041, 0.072, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.041 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.010, 0.044, 0.078, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.044 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.007, 0.042, 0.078, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.042 std_dev=0.036
O4'	B	0, 0.207, 0.332, 0.457, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.332 std_dev=0.125
C4'	B	0, 0.276, 0.428, 0.580, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.428 std_dev=0.152
C3'	B	0, 0.263, 0.426, 0.589, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.426 std_dev=0.163
C2'	A	0, 0.118, 0.295, 0.473, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.295 std_dev=0.178
O4'	A	0, 0.105, 0.290, 0.475, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.290 std_dev=0.185
C1'	B	0, 0.258, 0.486, 0.713, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.486 std_dev=0.228
O2'	A	0, 0.136, 0.364, 0.593, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.364 std_dev=0.229
C2'	B	0, 0.269, 0.507, 0.745, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.507 std_dev=0.238
O3'	B	0, 0.291, 0.554, 0.817, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.554 std_dev=0.263
C4'	A	0, 0.155, 0.450, 0.745, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.450 std_dev=0.295
C3'	A	0, 0.192, 0.491, 0.790, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.491 std_dev=0.299
O2'	B	0, 0.372, 0.694, 1.017, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.694 std_dev=0.322
C5'	B	0, 0.373, 0.699, 1.025, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.699 std_dev=0.326
N9	B	0, 0.466, 0.840, 1.214, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.840 std_dev=0.374
O3'	A	0, 0.276, 0.718, 1.160, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.718 std_dev=0.442
C5'	A	0, 0.265, 0.709, 1.153, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.709 std_dev=0.444
O5'	B	0, 0.385, 0.833, 1.282, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.833 std_dev=0.448
C8	B	0, 0.540, 1.025, 1.509, 1.584 max_d=1.584 avg_d=1.025 std_dev=0.485
C4	B	0, 0.615, 1.163, 1.711, 1.771 max_d=1.771 avg_d=1.163 std_dev=0.548
N3	B	0, 0.635, 1.291, 1.947, 1.978 max_d=1.978 avg_d=1.291 std_dev=0.656
N7	B	0, 0.713, 1.370, 2.027, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.370 std_dev=0.657
C5	B	0, 0.752, 1.431, 2.111, 2.171 max_d=2.171 avg_d=1.431 std_dev=0.680
P	B	0, 0.484, 1.239, 1.994, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.239 std_dev=0.755
C2	B	0, 0.789, 1.653, 2.516, 2.542 max_d=2.542 avg_d=1.653 std_dev=0.863
C6	B	0, 0.904, 1.790, 2.676, 2.743 max_d=2.743 avg_d=1.790 std_dev=0.886
OP1	B	0, 0.627, 1.575, 2.523, 2.663 max_d=2.663 avg_d=1.575 std_dev=0.948
N1	B	0, 0.913, 1.874, 2.835, 2.887 max_d=2.887 avg_d=1.874 std_dev=0.961
OP2	B	0, 0.503, 1.532, 2.560, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.532 std_dev=1.028
N6	B	0, 1.052, 2.102, 3.152, 3.222 max_d=3.222 avg_d=2.102 std_dev=1.050
O5'	A	0, 0.623, 1.997, 3.371, 3.338 max_d=3.338 avg_d=1.997 std_dev=1.374
P	A	0, 0.753, 2.328, 3.902, 3.745 max_d=3.745 avg_d=2.328 std_dev=1.574
OP2	A	0, 1.176, 3.331, 5.487, 5.208 max_d=5.208 avg_d=3.331 std_dev=2.155
OP1	A	0, 1.136, 3.313, 5.491, 5.299 max_d=5.299 avg_d=3.313 std_dev=2.177

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.26	0.54	0.34	0.31
C2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.16	0.17	0.10	0.42	0.71	0.90	0.56
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.12	0.15	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.30	0.49	0.18	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.09	0.10	0.11	0.12	0.08	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.35	0.51	0.04	0.25
C4	0.01	0.02	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.05	0.53	0.81	0.91	0.64
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.26	0.22	0.04
C5	0.01	0.02	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.09	0.04	0.70	1.03	1.22	0.86
C5'	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.35	0.33	0.03
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.06	0.68	1.02	1.30	0.86
C8	0.01	0.03	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.06	0.81	1.13	1.12	0.92
N1	0.02	0.01	0.12	0.11	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.15	0.08	0.55	0.86	1.14	0.72
N3	0.02	0.00	0.15	0.12	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.16	0.09	0.37	0.65	0.75	0.48
N6	0.03	0.02	0.06	0.08	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.11	0.05	0.78	1.15	1.50	1.00
N7	0.01	0.03	0.05	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.12	0.04	0.85	1.23	1.38	1.04
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.54	0.82	0.78	0.62
O2'	0.03	0.16	0.00	0.02	0.09	0.06	0.06	0.07	0.09	0.05	0.13	0.15	0.08	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.27	0.16	0.08
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.05	0.11	0.13	0.15	0.16	0.11	0.12	0.05	0.04	0.00	0.01	0.20	0.40	0.33	0.06
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.08	0.09	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.06	0.42	0.12	0.14
O5'	0.26	0.42	0.30	0.35	0.53	0.01	0.70	0.01	0.68	0.81	0.55	0.37	0.78	0.85	0.54	0.06	0.20	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.54	0.71	0.49	0.51	0.81	0.26	1.03	0.35	1.02	1.13	0.86	0.65	1.15	1.23	0.82	0.27	0.40	0.42	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.90	0.18	0.04	0.91	0.22	1.22	0.33	1.30	1.12	1.14	0.75	1.50	1.38	0.78	0.16	0.33	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.31	0.56	0.28	0.25	0.64	0.04	0.86	0.03	0.86	0.92	0.72	0.48	1.00	1.04	0.62	0.08	0.06	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.67	0.15	0.07	0.52	0.11	0.60	0.17	0.71	0.42	0.74	0.55	0.76	0.54	0.39	0.15	0.14	0.08	0.09	0.12	0.21	0.10
C2	0.10	0.30	0.06	0.11	0.25	0.16	0.29	0.20	0.32	0.22	0.32	0.26	0.34	0.27	0.19	0.10	0.14	0.11	0.11	0.11	0.14	0.10
C2'	0.48	1.00	0.40	0.25	0.83	0.15	0.89	0.08	1.00	0.67	1.05	0.88	1.03	0.80	0.67	0.31	0.16	0.28	0.24	0.08	0.37	0.23
C3'	0.50	1.02	0.47	0.31	0.82	0.19	0.87	0.08	0.99	0.64	1.06	0.90	1.02	0.76	0.66	0.42	0.25	0.29	0.23	0.06	0.33	0.20
C4	0.14	0.45	0.09	0.10	0.35	0.15	0.40	0.23	0.46	0.27	0.48	0.38	0.48	0.35	0.26	0.11	0.17	0.10	0.10	0.18	0.10	0.08
C4'	0.30	0.81	0.28	0.15	0.61	0.05	0.68	0.10	0.80	0.47	0.86	0.67	0.85	0.59	0.46	0.25	0.13	0.12	0.10	0.10	0.20	0.09
C5	0.11	0.38	0.07	0.15	0.28	0.20	0.31	0.30	0.37	0.20	0.40	0.32	0.39	0.26	0.19	0.11	0.21	0.13	0.18	0.29	0.08	0.17
C5'	0.27	0.75	0.28	0.14	0.54	0.04	0.59	0.12	0.72	0.39	0.79	0.62	0.76	0.50	0.40	0.27	0.14	0.09	0.06	0.15	0.14	0.06
C6	0.09	0.29	0.08	0.19	0.22	0.23	0.25	0.34	0.29	0.20	0.31	0.24	0.31	0.23	0.16	0.10	0.23	0.16	0.23	0.31	0.14	0.21
C8	0.16	0.54	0.11	0.11	0.39	0.17	0.43	0.27	0.52	0.27	0.57	0.45	0.55	0.36	0.27	0.13	0.20	0.10	0.14	0.28	0.06	0.14
N1	0.10	0.26	0.09	0.17	0.22	0.21	0.25	0.29	0.28	0.21	0.29	0.22	0.30	0.24	0.17	0.10	0.21	0.16	0.18	0.21	0.07	0.13
N3	0.15	0.41	0.08	0.07	0.35	0.12	0.40	0.17	0.45	0.31	0.45	0.36	0.47	0.38	0.27	0.11	0.12	0.09	0.11	0.10	0.19	0.11
N6	0.10	0.26	0.10	0.23	0.20	0.26	0.25	0.40	0.28	0.24	0.29	0.21	0.31	0.26	0.17	0.11	0.28	0.19	0.32	0.44	0.28	0.34
N7	0.13	0.44	0.09	0.15	0.31	0.21	0.34	0.32	0.41	0.21	0.46	0.37	0.43	0.28	0.21	0.12	0.23	0.13	0.20	0.35	0.11	0.21
N9	0.17	0.56	0.12	0.09	0.43	0.15	0.48	0.22	0.57	0.33	0.60	0.47	0.60	0.42	0.31	0.13	0.17	0.09	0.10	0.19	0.11	0.08
O2'	0.51	1.12	0.41	0.29	0.93	0.20	1.02	0.16	1.15	0.79	1.20	0.97	1.21	0.94	0.75	0.26	0.15	0.33	0.33	0.17	0.48	0.33
O3'	0.64	1.23	0.63	0.46	0.99	0.31	1.04	0.19	1.18	0.79	1.27	1.08	1.21	0.92	0.81	0.57	0.39	0.41	0.34	0.15	0.44	0.30
O4'	0.14	0.61	0.13	0.08	0.43	0.15	0.51	0.22	0.63	0.33	0.67	0.48	0.68	0.45	0.30	0.15	0.15	0.08	0.10	0.19	0.14	0.10
O5'	0.57	0.66	0.63	0.57	0.61	0.51	0.61	0.44	0.63	0.58	0.65	0.64	0.63	0.59	0.59	0.67	0.60	0.47	0.48	0.46	0.53	0.49
OP1	0.71	0.72	0.76	0.74	0.70	0.70	0.68	0.66	0.68	0.68	0.70	0.72	0.67	0.67	0.69	0.81	0.79	0.66	0.67	0.70	0.71	0.70
OP2	0.89	0.77	0.90	0.92	0.84	0.94	0.86	0.96	0.83	0.93	0.79	0.79	0.84	0.91	0.89	0.89	0.92	0.88	1.00	1.05	1.07	1.06
P	0.65	0.69	0.71	0.66	0.67	0.62	0.66	0.56	0.67	0.64	0.69	0.68	0.67	0.65	0.65	0.74	0.70	0.57	0.60	0.59	0.64	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.07	0.11	0.08
C2	0.05	0.00	0.09	0.08	0.02	0.05	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.13	0.10	0.06	0.13	0.14	0.17	0.16
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.08	0.09	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.07	0.06
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.10	0.07	0.07	0.08	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.06	0.06
C4	0.03	0.02	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.06	0.03	0.14	0.15	0.16	0.15
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.05	0.05	0.07	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03
C5	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.18	0.19	0.20	0.20
C5'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.14	0.18	0.12	0.09	0.16	0.18	0.11	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02
C6	0.04	0.02	0.08	0.07	0.02	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.09	0.03	0.18	0.20	0.22	0.21
C8	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.20	0.21	0.19	0.20
N1	0.04	0.01	0.08	0.07	0.02	0.05	0.02	0.12	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.11	0.10	0.05	0.16	0.17	0.20	0.19
N3	0.05	0.00	0.09	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.12	0.09	0.06	0.12	0.13	0.14	0.13
N6	0.04	0.04	0.09	0.08	0.03	0.07	0.02	0.16	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.11	0.11	0.03	0.20	0.23	0.26	0.24
N7	0.02	0.02	0.05	0.09	0.02	0.09	0.01	0.18	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.10	0.03	0.21	0.23	0.24	0.24
N9	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.13	0.14	0.15	0.14
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.10	0.04	0.11	0.12	0.11	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.09	0.11	0.10	0.09	0.11	0.10	0.05	0.03	0.00	0.01	0.05	0.12	0.09	0.08
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.08	0.07	0.15	0.10
O5'	0.06	0.13	0.05	0.04	0.14	0.02	0.18	0.01	0.18	0.20	0.16	0.12	0.20	0.21	0.13	0.04	0.05	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.08	0.09	0.15	0.04	0.19	0.03	0.20	0.21	0.17	0.13	0.23	0.23	0.14	0.07	0.12	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.17	0.07	0.06	0.16	0.05	0.20	0.02	0.22	0.19	0.20	0.14	0.26	0.24	0.15	0.06	0.09	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.06	0.06	0.15	0.03	0.20	0.02	0.21	0.20	0.19	0.13	0.24	0.24	0.14	0.05	0.08	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00