Doublet Group distance statistics: 50454

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.014, 0.024, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.024 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.020, 0.034, 0.048, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.034 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.036, 0.059, 0.083, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.059 std_dev=0.024
O2'	A	0, 0.022, 0.111, 0.200, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.111 std_dev=0.089
C2'	A	0, 0.034, 0.145, 0.255, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.145 std_dev=0.111
O4'	A	0, 0.036, 0.150, 0.264, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.150 std_dev=0.114
C4'	A	0, 0.043, 0.248, 0.453, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.248 std_dev=0.205
O5'	A	0, 0.160, 0.365, 0.570, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.365 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.141, 0.366, 0.592, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.366 std_dev=0.225
N9	B	0, 0.129, 0.359, 0.588, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.359 std_dev=0.230
C3'	A	0, 0.021, 0.254, 0.487, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.254 std_dev=0.233
O4'	B	0, 0.226, 0.487, 0.748, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.487 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.109, 0.371, 0.632, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.371 std_dev=0.261
C2'	B	0, 0.135, 0.438, 0.741, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.438 std_dev=0.303
O5'	B	0, 0.310, 0.648, 0.987, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.648 std_dev=0.338
P	A	0, 0.179, 0.555, 0.931, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.555 std_dev=0.376
C4'	B	0, 0.165, 0.543, 0.920, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.543 std_dev=0.377
OP2	A	0, 0.161, 0.545, 0.928, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.545 std_dev=0.384
C8	B	0, 0.060, 0.444, 0.827, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.444 std_dev=0.384
O2'	B	0, 0.168, 0.560, 0.951, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.560 std_dev=0.391
C5'	B	0, 0.217, 0.615, 1.013, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.615 std_dev=0.398
O3'	A	0, 0.010, 0.409, 0.809, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.409 std_dev=0.400
C3'	B	0, 0.164, 0.608, 1.052, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.608 std_dev=0.444
C4	B	0, 0.053, 0.500, 0.946, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.500 std_dev=0.446
P	B	0, 0.259, 0.747, 1.234, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.747 std_dev=0.488
OP1	A	0, 0.207, 0.744, 1.280, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.744 std_dev=0.536
O3'	B	0, 0.198, 0.777, 1.355, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.777 std_dev=0.578
N3	B	0, 0.045, 0.633, 1.222, 1.747 max_d=1.747 avg_d=0.633 std_dev=0.589
N7	B	0, -0.031, 0.592, 1.216, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.592 std_dev=0.624
C5	B	0, -0.025, 0.607, 1.239, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.607 std_dev=0.632
C2	B	0, -0.021, 0.804, 1.629, 2.339 max_d=2.339 avg_d=0.804 std_dev=0.825
C6	B	0, -0.055, 0.819, 1.693, 2.424 max_d=2.424 avg_d=0.819 std_dev=0.874
N1	B	0, -0.046, 0.895, 1.835, 2.634 max_d=2.634 avg_d=0.895 std_dev=0.941
N6	B	0, -0.075, 1.020, 2.115, 3.043 max_d=3.043 avg_d=1.020 std_dev=1.095
OP1	B	0, 0.245, 1.341, 2.437, 2.998 max_d=2.998 avg_d=1.341 std_dev=1.096
OP2	B	0, 0.092, 1.654, 3.217, 4.386 max_d=4.386 avg_d=1.654 std_dev=1.563

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.10	0.05
C2	0.01	0.00	0.11	0.15	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.06	0.08	0.09	0.18	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.03	0.05	0.01	0.08	0.03	0.10	0.11	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.08	0.13	0.07
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.12	0.01	0.13	0.01	0.15	0.08	0.16	0.14	0.15	0.10	0.08	0.02	0.01	0.02	0.07	0.11	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.14	0.04	0.08	0.09	0.16	0.09
C4'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.08	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.04	0.11	0.13	0.19	0.13
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.05	0.04	0.09	0.10	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.19	0.05	0.11	0.14	0.21	0.14
C8	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.12	0.11	0.16	0.11
N1	0.01	0.00	0.10	0.16	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.20	0.06	0.09	0.12	0.20	0.13
N3	0.01	0.00	0.11	0.14	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.05	0.06	0.07	0.15	0.08
N6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.21	0.05	0.13	0.17	0.23	0.16
N7	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.13	0.15	0.20	0.14
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.07	0.07	0.13	0.07
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.08	0.04	0.07	0.06	0.03	0.08	0.08	0.05	0.03	0.02	0.00	0.06	0.05	0.04	0.10	0.08	0.04
O3'	0.02	0.19	0.01	0.01	0.14	0.02	0.16	0.03	0.19	0.09	0.20	0.16	0.21	0.13	0.07	0.06	0.00	0.02	0.09	0.17	0.16	0.11
O4'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.05	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.06	0.10	0.09
O5'	0.03	0.08	0.07	0.07	0.08	0.02	0.11	0.01	0.11	0.12	0.09	0.06	0.13	0.13	0.07	0.04	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.02	0.09	0.08	0.11	0.09	0.06	0.13	0.07	0.14	0.11	0.12	0.07	0.17	0.15	0.07	0.10	0.17	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.18	0.13	0.11	0.16	0.04	0.19	0.02	0.21	0.16	0.20	0.15	0.23	0.20	0.13	0.08	0.16	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.07	0.07	0.09	0.02	0.13	0.01	0.14	0.11	0.13	0.08	0.16	0.14	0.07	0.04	0.11	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.19	0.11	0.10	0.17	0.11	0.36	0.21	0.44	0.33	0.26	0.17	0.65	0.46	0.17	0.12	0.21	0.11	0.28	0.70	1.02	0.41
C2	0.14	0.11	0.17	0.18	0.13	0.19	0.20	0.26	0.17	0.23	0.11	0.12	0.21	0.26	0.15	0.20	0.18	0.18	0.32	0.72	0.81	0.35
C2'	0.13	0.20	0.14	0.08	0.28	0.13	0.53	0.22	0.66	0.45	0.47	0.14	0.91	0.61	0.26	0.07	0.15	0.15	0.29	0.67	1.04	0.44
C3'	0.20	0.20	0.22	0.16	0.35	0.22	0.62	0.30	0.72	0.58	0.46	0.16	1.04	0.75	0.36	0.11	0.09	0.25	0.37	0.74	1.24	0.56
C4	0.09	0.27	0.13	0.13	0.10	0.14	0.21	0.24	0.19	0.27	0.16	0.22	0.32	0.35	0.12	0.16	0.16	0.12	0.29	0.71	1.07	0.43
C4'	0.12	0.17	0.13	0.09	0.24	0.14	0.47	0.24	0.55	0.44	0.34	0.14	0.82	0.59	0.24	0.08	0.16	0.16	0.30	0.71	1.14	0.47
C5	0.10	0.47	0.15	0.16	0.17	0.17	0.11	0.27	0.23	0.21	0.44	0.35	0.17	0.23	0.09	0.19	0.15	0.15	0.31	0.73	1.25	0.49
C5'	0.10	0.20	0.12	0.09	0.18	0.14	0.38	0.25	0.42	0.41	0.21	0.16	0.69	0.54	0.20	0.10	0.16	0.16	0.31	0.71	1.23	0.50
C6	0.12	0.44	0.19	0.22	0.21	0.23	0.19	0.30	0.35	0.14	0.45	0.34	0.32	0.10	0.10	0.24	0.18	0.20	0.33	0.75	1.26	0.50
C8	0.09	0.50	0.12	0.12	0.15	0.13	0.15	0.25	0.18	0.26	0.42	0.37	0.25	0.33	0.10	0.16	0.16	0.11	0.29	0.72	1.28	0.50
N1	0.13	0.24	0.20	0.23	0.10	0.23	0.06	0.29	0.14	0.13	0.21	0.20	0.14	0.11	0.08	0.26	0.20	0.21	0.33	0.74	1.01	0.42
N3	0.13	0.13	0.14	0.14	0.18	0.16	0.31	0.24	0.33	0.28	0.21	0.13	0.41	0.36	0.17	0.15	0.18	0.15	0.31	0.71	0.86	0.36
N6	0.17	0.55	0.23	0.27	0.33	0.28	0.40	0.35	0.59	0.11	0.62	0.41	0.64	0.19	0.17	0.27	0.22	0.26	0.36	0.78	1.45	0.58
N7	0.10	0.59	0.14	0.15	0.22	0.17	0.15	0.27	0.34	0.22	0.59	0.43	0.27	0.24	0.11	0.19	0.14	0.15	0.31	0.74	1.37	0.54
N9	0.09	0.32	0.11	0.11	0.11	0.12	0.24	0.23	0.25	0.28	0.19	0.25	0.43	0.39	0.12	0.14	0.18	0.10	0.28	0.71	1.12	0.44
O2'	0.14	0.32	0.08	0.09	0.30	0.11	0.54	0.18	0.71	0.39	0.62	0.19	0.93	0.57	0.24	0.06	0.26	0.15	0.24	0.61	0.83	0.33
O3'	0.28	0.31	0.27	0.20	0.48	0.28	0.77	0.35	0.91	0.70	0.66	0.25	1.25	0.89	0.47	0.16	0.10	0.32	0.41	0.75	1.27	0.60
O4'	0.10	0.18	0.11	0.11	0.15	0.11	0.33	0.21	0.39	0.31	0.22	0.17	0.63	0.44	0.15	0.16	0.22	0.10	0.27	0.70	1.05	0.41
O5'	0.10	0.33	0.12	0.11	0.11	0.15	0.28	0.28	0.25	0.37	0.18	0.24	0.51	0.48	0.16	0.11	0.16	0.15	0.33	0.72	1.34	0.55
OP1	0.15	0.38	0.13	0.13	0.16	0.20	0.26	0.32	0.22	0.37	0.27	0.29	0.40	0.45	0.19	0.12	0.18	0.21	0.35	0.70	1.39	0.57
OP2	0.17	0.56	0.17	0.18	0.21	0.21	0.16	0.34	0.22	0.29	0.49	0.42	0.18	0.32	0.16	0.22	0.24	0.19	0.36	0.74	1.44	0.59
P	0.11	0.42	0.11	0.11	0.12	0.15	0.17	0.28	0.13	0.30	0.31	0.32	0.29	0.38	0.12	0.17	0.20	0.14	0.32	0.72	1.37	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.30	0.41	0.11
C2	0.04	0.00	0.13	0.10	0.02	0.04	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.25	0.12	0.10	0.19	0.27	0.63	0.17
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.09	0.06	0.07	0.11	0.13	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.58	0.11	0.13
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.08	0.10	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.76	0.29	0.20
C4	0.02	0.02	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.07	0.05	0.20	0.27	0.64	0.21
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.04	0.06	0.08	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.39	0.34	0.08
C5	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.04	0.25	0.45	0.76	0.31
C5'	0.06	0.12	0.09	0.01	0.15	0.00	0.20	0.00	0.20	0.24	0.16	0.10	0.23	0.25	0.15	0.08	0.04	0.01	0.01	0.25	0.34	0.01
C6	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.14	0.08	0.06	0.25	0.46	0.79	0.31
C8	0.01	0.02	0.07	0.07	0.00	0.08	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.29	0.50	0.73	0.34
N1	0.04	0.01	0.11	0.08	0.02	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.11	0.08	0.22	0.33	0.74	0.24
N3	0.04	0.01	0.13	0.10	0.01	0.04	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.24	0.11	0.09	0.16	0.27	0.57	0.14
N6	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.05	0.28	0.61	0.86	0.37
N7	0.01	0.02	0.04	0.05	0.00	0.08	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.30	0.63	0.82	0.39
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.03	0.20	0.24	0.59	0.20
O2'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.14	0.01	0.09	0.08	0.14	0.06	0.20	0.24	0.12	0.05	0.04	0.00	0.03	0.02	0.20	0.71	0.15	0.19
O3'	0.07	0.12	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.04	0.08	0.08	0.11	0.11	0.07	0.07	0.07	0.03	0.00	0.09	0.08	0.84	0.33	0.21
O4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.08	0.09	0.05	0.02	0.03	0.02	0.09	0.00	0.10	0.25	0.57	0.23
O5'	0.10	0.19	0.17	0.09	0.20	0.03	0.25	0.01	0.25	0.29	0.22	0.16	0.28	0.30	0.20	0.20	0.08	0.10	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.30	0.27	0.58	0.76	0.27	0.39	0.45	0.25	0.46	0.50	0.33	0.27	0.61	0.63	0.24	0.71	0.84	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	0.63	0.11	0.29	0.64	0.34	0.76	0.34	0.79	0.73	0.74	0.57	0.86	0.82	0.59	0.15	0.33	0.57	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.17	0.13	0.20	0.21	0.08	0.31	0.01	0.31	0.34	0.24	0.14	0.37	0.39	0.20	0.19	0.21	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00