Doublet Group distance statistics: 50455

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.021, 0.035, 0.048, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.035 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.026, 0.042, 0.059, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.042 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.028, 0.048, 0.069, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.048 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.034, 0.055, 0.077, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.055 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.034, 0.059, 0.084, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.059 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.036, 0.062, 0.088, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.062 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.039, 0.066, 0.092, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.066 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.042, 0.069, 0.096, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.069 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.047, 0.078, 0.108, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.078 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.048, 0.079, 0.110, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.079 std_dev=0.031
O2'	B	0, 0.498, 0.905, 1.312, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.905 std_dev=0.407
C2'	B	0, 0.626, 1.045, 1.463, 1.423 max_d=1.423 avg_d=1.045 std_dev=0.419
O4'	B	0, 0.824, 1.339, 1.853, 1.664 max_d=1.664 avg_d=1.339 std_dev=0.514
C1'	B	0, 0.787, 1.359, 1.931, 1.768 max_d=1.768 avg_d=1.359 std_dev=0.572
O4'	A	0, 1.028, 1.655, 2.281, 1.965 max_d=1.965 avg_d=1.655 std_dev=0.627
C2'	A	0, 1.045, 1.680, 2.315, 1.949 max_d=1.949 avg_d=1.680 std_dev=0.635
C4'	A	0, 1.203, 1.937, 2.671, 2.337 max_d=2.337 avg_d=1.937 std_dev=0.734
C3'	B	0, 1.327, 2.223, 3.118, 3.313 max_d=3.313 avg_d=2.223 std_dev=0.895
C3'	A	0, 1.541, 2.478, 3.414, 2.868 max_d=2.868 avg_d=2.478 std_dev=0.937
O2'	A	0, 1.662, 2.671, 3.681, 3.074 max_d=3.074 avg_d=2.671 std_dev=1.010
O3'	B	0, 1.710, 2.821, 3.931, 3.963 max_d=3.963 avg_d=2.821 std_dev=1.110
C4'	B	0, 1.819, 2.954, 4.090, 3.858 max_d=3.858 avg_d=2.954 std_dev=1.135
N9	B	0, 1.891, 3.065, 4.239, 3.787 max_d=3.787 avg_d=3.065 std_dev=1.174
O3'	A	0, 2.015, 3.242, 4.469, 3.802 max_d=3.802 avg_d=3.242 std_dev=1.227
C5'	A	0, 2.581, 4.152, 5.722, 4.897 max_d=4.897 avg_d=4.152 std_dev=1.571
C4	B	0, 2.773, 4.474, 6.175, 5.331 max_d=5.331 avg_d=4.474 std_dev=1.701
C8	B	0, 2.843, 4.581, 6.320, 5.532 max_d=5.532 avg_d=4.581 std_dev=1.739
C5'	B	0, 2.842, 4.586, 6.330, 5.688 max_d=5.688 avg_d=4.586 std_dev=1.744
O5'	B	0, 3.065, 4.938, 6.812, 6.037 max_d=6.037 avg_d=4.938 std_dev=1.874
N3	B	0, 3.125, 5.040, 6.956, 6.018 max_d=6.018 avg_d=5.040 std_dev=1.915
O5'	A	0, 3.355, 5.396, 7.437, 6.345 max_d=6.345 avg_d=5.396 std_dev=2.041
C5	B	0, 3.786, 6.093, 8.400, 7.194 max_d=7.194 avg_d=6.093 std_dev=2.307
N7	B	0, 3.976, 6.398, 8.820, 7.585 max_d=7.585 avg_d=6.398 std_dev=2.422
OP2	A	0, 4.081, 6.566, 9.050, 7.704 max_d=7.704 avg_d=6.566 std_dev=2.484
C2	B	0, 4.086, 6.579, 9.072, 7.834 max_d=7.834 avg_d=6.579 std_dev=2.493
P	B	0, 4.423, 7.120, 9.816, 8.557 max_d=8.557 avg_d=7.120 std_dev=2.697
P	A	0, 4.567, 7.346, 10.124, 8.596 max_d=8.596 avg_d=7.346 std_dev=2.778
C6	B	0, 4.746, 7.634, 10.522, 8.904 max_d=8.904 avg_d=7.634 std_dev=2.888
N1	B	0, 4.771, 7.675, 10.579, 9.035 max_d=9.035 avg_d=7.675 std_dev=2.904
OP2	B	0, 5.206, 8.382, 11.558, 10.102 max_d=10.102 avg_d=8.382 std_dev=3.176
OP1	B	0, 5.441, 8.754, 12.067, 10.416 max_d=10.416 avg_d=8.754 std_dev=3.313
OP1	A	0, 5.472, 8.801, 12.131, 10.365 max_d=10.365 avg_d=8.801 std_dev=3.330
N6	B	0, 5.873, 9.443, 13.013, 10.975 max_d=10.975 avg_d=9.443 std_dev=3.570

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.06	0.08	0.20	0.12
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.11	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.10	0.18	0.40	0.18	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.15	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.07	0.10	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.06	0.06	0.19	0.21	0.11
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.10	0.07	0.11	0.03	0.08	0.03	0.08	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.03	0.08	0.16	0.28	0.17
C5'	0.02	0.24	0.05	0.01	0.10	0.01	0.05	0.00	0.08	0.15	0.17	0.23	0.06	0.12	0.03	0.04	0.07	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.05	0.06	0.20	0.23	0.14
C8	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.06	0.24	0.27	0.45	0.35
N1	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.08	0.12	0.33	0.18	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.10	0.17	0.35	0.17	0.19
N6	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.04	0.08	0.19	0.27	0.17
N7	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.03	0.21	0.25	0.43	0.32
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.10	0.12	0.28	0.17
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.08	0.08	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04	0.08	0.09	0.06	0.00	0.02	0.06	0.08	0.05	0.18	0.09
O3'	0.08	0.10	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.07	0.08	0.03	0.10	0.08	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.07	0.10	0.05
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.04	0.03	0.01	0.06	0.05	0.00	0.08	0.08	0.16	0.11
O5'	0.06	0.18	0.02	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.06	0.24	0.12	0.17	0.08	0.21	0.10	0.08	0.04	0.08	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.08	0.40	0.10	0.06	0.19	0.06	0.16	0.06	0.20	0.27	0.33	0.35	0.19	0.25	0.12	0.05	0.07	0.08	0.03	0.00	0.01	0.02
OP2	0.20	0.18	0.15	0.14	0.21	0.09	0.28	0.05	0.23	0.45	0.18	0.17	0.27	0.43	0.28	0.18	0.10	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.22	0.06	0.04	0.11	0.03	0.17	0.01	0.14	0.35	0.16	0.19	0.17	0.32	0.17	0.09	0.05	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.40	0.21	0.20	0.19	0.16	0.17	0.32	0.22	0.20	0.34	0.32	0.21	0.19	0.16	0.20	0.18	0.10	0.46	0.53	0.73	0.57
C2	0.11	0.18	0.16	0.14	0.09	0.15	0.12	0.22	0.15	0.16	0.19	0.12	0.16	0.15	0.12	0.10	0.15	0.10	0.23	0.20	0.22	0.17
C2'	0.15	0.31	0.27	0.26	0.13	0.19	0.17	0.34	0.17	0.28	0.25	0.23	0.20	0.27	0.17	0.19	0.23	0.11	0.53	0.59	0.87	0.65
C3'	0.18	0.24	0.33	0.30	0.15	0.20	0.24	0.33	0.20	0.38	0.20	0.17	0.27	0.38	0.23	0.25	0.26	0.13	0.53	0.56	0.88	0.63
C4	0.13	0.33	0.18	0.19	0.18	0.19	0.19	0.32	0.25	0.17	0.33	0.24	0.26	0.17	0.15	0.14	0.18	0.10	0.38	0.37	0.46	0.39
C4'	0.22	0.18	0.36	0.33	0.20	0.26	0.31	0.38	0.26	0.43	0.18	0.14	0.35	0.45	0.28	0.28	0.30	0.19	0.56	0.57	0.85	0.63
C5	0.13	0.34	0.17	0.18	0.21	0.21	0.27	0.33	0.36	0.19	0.40	0.22	0.40	0.24	0.16	0.13	0.20	0.12	0.32	0.31	0.32	0.30
C5'	0.40	0.18	0.55	0.50	0.40	0.42	0.53	0.51	0.47	0.66	0.30	0.21	0.57	0.69	0.49	0.47	0.47	0.36	0.68	0.62	0.91	0.69
C6	0.11	0.27	0.14	0.16	0.19	0.21	0.30	0.29	0.38	0.22	0.37	0.16	0.45	0.30	0.15	0.11	0.20	0.13	0.22	0.19	0.16	0.15
C8	0.15	0.41	0.20	0.21	0.23	0.22	0.25	0.37	0.35	0.18	0.44	0.30	0.37	0.20	0.17	0.17	0.21	0.11	0.42	0.47	0.54	0.47
N1	0.10	0.19	0.14	0.14	0.14	0.18	0.23	0.23	0.28	0.20	0.26	0.11	0.33	0.25	0.13	0.09	0.18	0.13	0.16	0.15	0.13	0.09
N3	0.13	0.25	0.18	0.17	0.12	0.15	0.12	0.27	0.15	0.17	0.23	0.18	0.14	0.15	0.13	0.13	0.16	0.09	0.35	0.32	0.44	0.34
N6	0.10	0.26	0.13	0.15	0.22	0.22	0.37	0.28	0.47	0.28	0.42	0.15	0.60	0.39	0.17	0.10	0.21	0.14	0.17	0.15	0.15	0.10
N7	0.14	0.39	0.18	0.20	0.24	0.23	0.30	0.36	0.41	0.20	0.46	0.26	0.46	0.25	0.17	0.15	0.22	0.12	0.36	0.38	0.39	0.37
N9	0.15	0.39	0.20	0.20	0.20	0.19	0.19	0.34	0.27	0.17	0.37	0.29	0.27	0.17	0.15	0.17	0.19	0.10	0.43	0.47	0.60	0.50
O2'	0.16	0.36	0.24	0.27	0.15	0.20	0.13	0.38	0.16	0.23	0.29	0.30	0.16	0.22	0.15	0.20	0.23	0.13	0.59	0.74	1.01	0.78
O3'	0.15	0.27	0.27	0.25	0.14	0.15	0.21	0.28	0.19	0.33	0.21	0.21	0.26	0.34	0.19	0.19	0.20	0.11	0.50	0.56	0.90	0.63
O4'	0.18	0.25	0.29	0.28	0.15	0.24	0.21	0.38	0.19	0.31	0.21	0.19	0.24	0.32	0.21	0.23	0.26	0.16	0.52	0.55	0.77	0.59
O5'	0.34	0.17	0.49	0.44	0.35	0.36	0.49	0.46	0.44	0.61	0.27	0.18	0.57	0.66	0.44	0.43	0.42	0.31	0.61	0.56	0.83	0.62
OP1	0.65	0.47	0.77	0.70	0.70	0.63	0.86	0.67	0.82	0.94	0.61	0.50	0.95	1.01	0.77	0.73	0.71	0.60	0.79	0.65	0.90	0.73
OP2	0.21	0.14	0.32	0.29	0.25	0.27	0.37	0.36	0.36	0.43	0.23	0.12	0.46	0.48	0.30	0.26	0.30	0.23	0.43	0.33	0.54	0.38
P	0.37	0.20	0.50	0.45	0.40	0.39	0.55	0.47	0.52	0.64	0.33	0.22	0.64	0.70	0.48	0.45	0.45	0.35	0.58	0.49	0.74	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.08	0.07	0.07
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.10	0.09	0.17	0.20	0.16
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.13	0.12	0.10
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.05	0.01	0.08	0.13	0.07	0.02	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.03
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.05	0.11	0.17	0.21	0.19
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.11	0.08	0.09	0.07	0.10	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.11	0.05	0.03	0.18	0.26	0.32	0.29
C5'	0.01	0.12	0.04	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.12	0.18	0.12	0.10	0.14	0.18	0.07	0.03	0.05	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00
C6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.06	0.05	0.17	0.28	0.34	0.29
C8	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.11	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.17	0.07	0.06	0.24	0.26	0.30	0.30
N1	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.08	0.13	0.23	0.28	0.24
N3	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.10	0.07	0.13	0.16	0.12
N6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.02	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.15	0.06	0.05	0.20	0.33	0.40	0.35
N7	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.10	0.00	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.17	0.08	0.04	0.26	0.32	0.39	0.36
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01	0.12	0.15	0.18	0.18
O2'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.05	0.07	0.11	0.03	0.10	0.17	0.05	0.06	0.15	0.17	0.07	0.00	0.05	0.07	0.06	0.13	0.15	0.10
O3'	0.09	0.10	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.06	0.07	0.07	0.11	0.06	0.08	0.04	0.05	0.00	0.05	0.06	0.08	0.09	0.05
O4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.10	0.05	0.04	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.13	0.05	0.08
O5'	0.04	0.09	0.08	0.02	0.11	0.01	0.18	0.00	0.17	0.24	0.13	0.07	0.20	0.26	0.12	0.06	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.17	0.13	0.09	0.17	0.06	0.26	0.06	0.28	0.26	0.23	0.13	0.33	0.32	0.15	0.13	0.08	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.20	0.12	0.03	0.21	0.01	0.32	0.03	0.34	0.30	0.28	0.16	0.40	0.39	0.18	0.15	0.09	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.10	0.03	0.19	0.02	0.29	0.00	0.29	0.30	0.24	0.12	0.35	0.36	0.18	0.10	0.05	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00