Doublet Group distance statistics: 50458

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.017, 0.035, 0.054, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.022, 0.043, 0.065, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.026, 0.049, 0.071, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.049 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.027, 0.052, 0.077, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.052 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.048 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.031, 0.060, 0.088, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.060 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.032, 0.064, 0.095, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.064 std_dev=0.031
N3	A	0, 0.034, 0.066, 0.099, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.066 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.071, 0.131, 0.192, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.131 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.095, 0.170, 0.244, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.170 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.045, 0.127, 0.209, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.127 std_dev=0.082
C3'	A	0, 0.116, 0.224, 0.332, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.224 std_dev=0.108
C4'	A	0, 0.137, 0.258, 0.380, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.258 std_dev=0.121
O2'	A	0, 0.029, 0.152, 0.275, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.152 std_dev=0.123
O3'	A	0, 0.117, 0.257, 0.397, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.257 std_dev=0.140
C5'	A	0, 0.164, 0.353, 0.542, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.353 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.151, 0.438, 0.725, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.438 std_dev=0.287
N1	B	0, 0.141, 0.428, 0.715, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.428 std_dev=0.287
O5'	A	0, 0.121, 0.419, 0.717, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.419 std_dev=0.298
O2'	B	0, 0.243, 0.545, 0.847, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.545 std_dev=0.302
C1'	B	0, 0.203, 0.523, 0.842, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.523 std_dev=0.319
C2'	B	0, 0.231, 0.595, 0.959, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.595 std_dev=0.364
O4'	B	0, 0.169, 0.595, 1.021, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.595 std_dev=0.426
C3'	B	0, 0.266, 0.705, 1.143, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.705 std_dev=0.439
OP2	A	0, -0.024, 0.451, 0.926, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.451 std_dev=0.475
P	A	0, -0.068, 0.408, 0.884, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.408 std_dev=0.476
O3'	B	0, 0.277, 0.776, 1.275, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.776 std_dev=0.499
OP1	A	0, -0.102, 0.443, 0.989, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.443 std_dev=0.546
N9	B	0, 0.039, 0.601, 1.162, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.601 std_dev=0.561
C4'	B	0, 0.172, 0.738, 1.304, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.738 std_dev=0.566
N3	B	0, -0.017, 0.679, 1.375, 2.326 max_d=2.326 avg_d=0.679 std_dev=0.696
C6	B	0, -0.211, 0.496, 1.203, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.496 std_dev=0.707
OP2	B	0, 0.200, 0.974, 1.748, 2.668 max_d=2.668 avg_d=0.974 std_dev=0.774
C2	B	0, -0.082, 0.707, 1.496, 2.596 max_d=2.596 avg_d=0.707 std_dev=0.789
OP1	B	0, 0.190, 1.044, 1.899, 2.955 max_d=2.955 avg_d=1.044 std_dev=0.855
P	B	0, 0.110, 0.985, 1.860, 2.968 max_d=2.968 avg_d=0.985 std_dev=0.875
C5	B	0, -0.271, 0.608, 1.486, 2.741 max_d=2.741 avg_d=0.608 std_dev=0.879
O5'	B	0, 0.031, 0.918, 1.806, 2.951 max_d=2.951 avg_d=0.918 std_dev=0.888
C5'	B	0, 0.016, 0.926, 1.836, 3.046 max_d=3.046 avg_d=0.926 std_dev=0.910
N6	B	0, -0.698, 0.703, 2.105, 4.132 max_d=4.132 avg_d=0.703 std_dev=1.401
C8	B	0, -0.512, 0.937, 2.386, 4.463 max_d=4.463 avg_d=0.937 std_dev=1.449
N7	B	0, -0.757, 0.952, 2.661, 5.129 max_d=5.129 avg_d=0.952 std_dev=1.709

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.12	0.08	0.04
C2	0.04	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.14	0.08	0.04	0.12	0.27	0.08	0.12
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.08	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.07	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.13	0.24	0.05	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.06
C5	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.04	0.02	0.17	0.31	0.08	0.19
C5'	0.03	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.12	0.07	0.05	0.14	0.13	0.07	0.04	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02
C6	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.05	0.04	0.18	0.35	0.08	0.21
C8	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.15	0.24	0.09	0.17
N1	0.03	0.01	0.08	0.05	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.06	0.04	0.15	0.32	0.07	0.17
N3	0.04	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.12	0.07	0.04	0.10	0.22	0.09	0.09
N6	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.02	0.14	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.08	0.05	0.05	0.21	0.40	0.13	0.26
N7	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.18	0.30	0.11	0.21
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.20	0.05	0.11
O2'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.02	0.13	0.12	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.11	0.04
O3'	0.06	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05	0.03	0.05	0.04	0.00	0.07	0.06	0.11	0.22	0.17
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.11	0.06	0.06
O5'	0.06	0.12	0.07	0.02	0.13	0.02	0.17	0.01	0.18	0.15	0.15	0.10	0.21	0.18	0.11	0.05	0.06	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.27	0.07	0.05	0.24	0.03	0.31	0.04	0.35	0.24	0.32	0.22	0.40	0.30	0.20	0.05	0.11	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.08	0.07	0.12	0.05	0.08	0.08	0.04	0.08	0.09	0.07	0.09	0.13	0.11	0.05	0.11	0.22	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.12	0.03	0.08	0.12	0.06	0.19	0.02	0.21	0.17	0.17	0.09	0.26	0.21	0.11	0.04	0.17	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.72	0.11	0.14	0.10	0.13	0.65	0.20	0.61	0.86	0.13	0.71	1.22	1.20	0.22	0.23	0.38	0.13	0.24	0.29	0.22	0.24
C2	0.24	0.05	0.21	0.26	0.05	0.22	0.21	0.18	0.25	0.16	0.13	0.16	0.36	0.28	0.06	0.09	0.51	0.26	0.43	0.29	0.35	0.34
C2'	0.24	0.70	0.13	0.18	0.10	0.14	0.60	0.21	0.57	0.83	0.13	0.70	1.18	1.15	0.19	0.24	0.44	0.18	0.31	0.36	0.30	0.32
C3'	0.18	0.75	0.13	0.13	0.12	0.21	0.74	0.32	0.67	1.05	0.13	0.73	1.35	1.39	0.31	0.33	0.34	0.12	0.20	0.30	0.21	0.23
C4	0.25	0.42	0.17	0.21	0.10	0.14	0.35	0.13	0.39	0.38	0.04	0.48	0.72	0.61	0.06	0.12	0.45	0.22	0.39	0.33	0.33	0.34
C4'	0.16	0.78	0.14	0.12	0.13	0.22	0.78	0.30	0.73	1.07	0.15	0.74	1.46	1.43	0.32	0.33	0.29	0.10	0.16	0.28	0.17	0.19
C5	0.25	0.21	0.20	0.24	0.15	0.21	0.06	0.24	0.15	0.03	0.07	0.28	0.32	0.14	0.13	0.09	0.46	0.27	0.51	0.38	0.40	0.43
C5'	0.14	0.74	0.16	0.12	0.14	0.22	0.75	0.27	0.73	1.00	0.16	0.68	1.46	1.35	0.32	0.33	0.27	0.10	0.16	0.28	0.17	0.19
C6	0.25	0.16	0.25	0.29	0.16	0.30	0.21	0.37	0.10	0.32	0.14	0.06	0.11	0.30	0.24	0.11	0.48	0.32	0.60	0.39	0.45	0.48
C8	0.24	0.54	0.16	0.20	0.14	0.13	0.27	0.14	0.32	0.33	0.15	0.53	0.77	0.55	0.05	0.12	0.42	0.22	0.42	0.37	0.35	0.38
N1	0.25	0.21	0.26	0.30	0.10	0.32	0.13	0.36	0.06	0.31	0.17	0.10	0.06	0.26	0.21	0.11	0.50	0.33	0.58	0.34	0.44	0.46
N3	0.24	0.33	0.16	0.21	0.09	0.13	0.46	0.11	0.44	0.53	0.06	0.44	0.71	0.75	0.14	0.14	0.47	0.19	0.32	0.30	0.29	0.29
N6	0.26	0.37	0.29	0.32	0.20	0.37	0.44	0.50	0.31	0.61	0.18	0.23	0.50	0.70	0.34	0.16	0.48	0.36	0.70	0.45	0.52	0.57
N7	0.25	0.32	0.19	0.23	0.17	0.19	0.05	0.23	0.13	0.05	0.12	0.34	0.36	0.17	0.12	0.09	0.44	0.26	0.51	0.40	0.40	0.44
N9	0.24	0.62	0.14	0.18	0.11	0.11	0.45	0.12	0.47	0.55	0.12	0.62	0.97	0.83	0.10	0.16	0.42	0.19	0.35	0.33	0.30	0.32
O2'	0.31	0.65	0.20	0.28	0.13	0.20	0.54	0.24	0.51	0.78	0.11	0.69	1.05	1.07	0.18	0.23	0.54	0.25	0.38	0.42	0.37	0.39
O3'	0.14	0.67	0.21	0.19	0.20	0.34	0.88	0.50	0.78	1.27	0.09	0.66	1.44	1.59	0.45	0.43	0.29	0.16	0.16	0.28	0.17	0.19
O4'	0.13	0.76	0.14	0.10	0.13	0.20	0.76	0.25	0.72	0.98	0.14	0.70	1.43	1.35	0.30	0.32	0.25	0.08	0.15	0.27	0.15	0.17
O5'	0.14	0.65	0.20	0.16	0.20	0.27	0.82	0.29	0.81	1.02	0.13	0.60	1.55	1.37	0.37	0.35	0.24	0.13	0.13	0.28	0.15	0.17
OP1	0.24	0.47	0.32	0.27	0.37	0.39	0.91	0.38	0.91	1.08	0.30	0.44	1.55	1.39	0.51	0.43	0.24	0.26	0.21	0.37	0.17	0.23
OP2	0.21	0.75	0.14	0.15	0.18	0.19	0.80	0.22	0.78	1.06	0.17	0.74	1.52	1.43	0.32	0.23	0.34	0.14	0.16	0.27	0.22	0.20
P	0.14	0.61	0.19	0.15	0.23	0.26	0.85	0.28	0.84	1.06	0.17	0.58	1.56	1.40	0.39	0.32	0.25	0.13	0.12	0.27	0.15	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.19	0.02	0.08	0.28	0.08	0.08
C2	0.05	0.00	0.04	0.04	0.02	0.08	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.07	0.32	0.09	0.11	0.33	0.07	0.11
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.14	0.05	0.07	0.02	0.05	0.09	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.12	0.23	0.11	0.06
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.11	0.02	0.05	0.10	0.11	0.05	0.03	0.01	0.02	0.24	0.25	0.08	0.12
C4	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.11	0.18	0.10	0.06
C4'	0.03	0.08	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.14	0.07	0.09	0.12	0.14	0.09	0.19	0.02	0.01	0.03	0.11	0.18	0.09
C5	0.02	0.03	0.06	0.06	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.29	0.13	0.04	0.29	0.24	0.17	0.25
C5'	0.05	0.09	0.14	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.14	0.26	0.09	0.10	0.18	0.26	0.12	0.12	0.14	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.24	0.10	0.04	0.28	0.22	0.16	0.22
C8	0.02	0.04	0.07	0.11	0.01	0.14	0.02	0.26	0.04	0.00	0.03	0.02	0.08	0.00	0.00	0.49	0.34	0.07	0.41	0.40	0.21	0.38
N1	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.01	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.07	0.19	0.06	0.15	0.16	0.11	0.07
N3	0.06	0.01	0.05	0.05	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.11	0.34	0.10	0.15	0.38	0.07	0.16
N6	0.04	0.03	0.09	0.10	0.01	0.12	0.03	0.18	0.01	0.08	0.04	0.03	0.00	0.09	0.04	0.35	0.19	0.06	0.39	0.35	0.20	0.34
N7	0.01	0.04	0.07	0.11	0.01	0.14	0.01	0.26	0.04	0.00	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.48	0.33	0.07	0.46	0.47	0.24	0.44
N9	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.00	0.20	0.11	0.01	0.14	0.19	0.12	0.12
O2'	0.02	0.07	0.01	0.03	0.11	0.19	0.29	0.12	0.24	0.49	0.07	0.11	0.35	0.48	0.20	0.00	0.05	0.12	0.19	0.28	0.08	0.13
O3'	0.19	0.32	0.02	0.01	0.14	0.02	0.13	0.14	0.10	0.34	0.19	0.34	0.19	0.33	0.11	0.05	0.00	0.14	0.24	0.17	0.09	0.10
O4'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06	0.10	0.06	0.07	0.01	0.12	0.14	0.00	0.04	0.23	0.10	0.06
O5'	0.08	0.11	0.12	0.24	0.11	0.03	0.29	0.01	0.28	0.41	0.15	0.15	0.39	0.46	0.14	0.19	0.24	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.28	0.33	0.23	0.25	0.18	0.11	0.24	0.11	0.22	0.40	0.16	0.38	0.35	0.47	0.19	0.28	0.17	0.23	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.08	0.07	0.11	0.08	0.10	0.18	0.17	0.12	0.16	0.21	0.11	0.07	0.20	0.24	0.12	0.08	0.09	0.10	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.06	0.12	0.06	0.09	0.25	0.02	0.22	0.38	0.07	0.16	0.34	0.44	0.12	0.13	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00