Doublet Group distance statistics: 50459

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.017, 0.035, 0.052, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.035 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.017, 0.041, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.041 std_dev=0.024
O4'	A	0, -0.015, 0.101, 0.217, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.101 std_dev=0.116
C8	B	0, 0.094, 0.226, 0.358, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.226 std_dev=0.132
N9	B	0, 0.082, 0.229, 0.375, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.229 std_dev=0.146
C2'	A	0, -0.011, 0.144, 0.300, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.144 std_dev=0.156
C1'	B	0, 0.114, 0.272, 0.429, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.272 std_dev=0.157
C2'	B	0, 0.121, 0.281, 0.441, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.281 std_dev=0.160
O4'	B	0, 0.135, 0.296, 0.456, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.296 std_dev=0.161
N7	B	0, 0.064, 0.233, 0.403, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.233 std_dev=0.169
O2'	B	0, 0.133, 0.302, 0.472, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.302 std_dev=0.169
C4	B	0, 0.091, 0.272, 0.453, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.272 std_dev=0.181
C5	B	0, 0.088, 0.276, 0.464, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.276 std_dev=0.188
O5'	B	0, 0.122, 0.314, 0.505, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.314 std_dev=0.191
C4'	A	0, 0.030, 0.234, 0.437, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.234 std_dev=0.204
C3'	B	0, 0.150, 0.355, 0.559, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.355 std_dev=0.205
C4'	B	0, 0.152, 0.358, 0.565, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.358 std_dev=0.206
OP2	B	0, 0.134, 0.347, 0.560, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.347 std_dev=0.213
C5'	B	0, 0.161, 0.378, 0.595, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.378 std_dev=0.217
P	B	0, 0.127, 0.347, 0.567, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.347 std_dev=0.220
N3	B	0, 0.130, 0.349, 0.569, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.349 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.129, 0.364, 0.599, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.364 std_dev=0.235
OP1	B	0, 0.155, 0.392, 0.630, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.392 std_dev=0.237
C2	B	0, 0.178, 0.428, 0.678, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.428 std_dev=0.250
O3'	B	0, 0.205, 0.455, 0.705, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.455 std_dev=0.250
N6	B	0, 0.128, 0.389, 0.650, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.389 std_dev=0.261
C3'	A	0, -0.016, 0.247, 0.511, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.247 std_dev=0.264
N1	B	0, 0.179, 0.442, 0.706, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.442 std_dev=0.264
O2'	A	0, -0.027, 0.240, 0.506, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.240 std_dev=0.267
C5'	A	0, 0.003, 0.296, 0.590, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.296 std_dev=0.293
O3'	A	0, 0.029, 0.387, 0.745, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.387 std_dev=0.358
O5'	A	0, -0.104, 0.318, 0.740, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.318 std_dev=0.422
P	A	0, -0.151, 0.544, 1.240, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.544 std_dev=0.695
OP1	A	0, -0.074, 0.639, 1.352, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.639 std_dev=0.713
OP2	A	0, -0.209, 0.662, 1.533, 2.576 max_d=2.576 avg_d=0.662 std_dev=0.871

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.25	0.00	0.18	0.35	0.34	0.28
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.31	0.09	0.28	0.37	0.50	0.36
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.14	0.04	0.06	0.05	0.06	0.04	0.05	0.02	0.00	0.10	0.01	0.26	0.47	0.42	0.40
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.11	0.02	0.06	0.05	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.24	0.14	0.11
C4	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.26	0.05	0.31	0.44	0.54	0.42
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.07	0.07	0.05	0.07	0.03	0.09	0.07	0.00	0.01	0.15	0.07	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.23	0.04	0.38	0.52	0.66	0.51
C5'	0.07	0.12	0.14	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.18	0.22	0.16	0.09	0.20	0.23	0.15	0.07	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.25	0.06	0.37	0.51	0.66	0.50
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.18	0.03	0.39	0.58	0.68	0.57
N1	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.29	0.08	0.34	0.45	0.59	0.44
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.31	0.08	0.25	0.34	0.45	0.32
N6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.23	0.06	0.39	0.54	0.71	0.54
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.19	0.01	0.42	0.60	0.74	0.60
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.23	0.01	0.30	0.46	0.52	0.43
O2'	0.03	0.11	0.00	0.02	0.05	0.09	0.07	0.07	0.04	0.17	0.07	0.11	0.06	0.14	0.08	0.00	0.16	0.03	0.23	0.52	0.53	0.43
O3'	0.25	0.31	0.10	0.01	0.26	0.07	0.23	0.14	0.25	0.18	0.29	0.31	0.23	0.19	0.23	0.16	0.00	0.21	0.24	0.26	0.23	0.25
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.03	0.08	0.08	0.06	0.01	0.01	0.03	0.21	0.00	0.08	0.19	0.14	0.11
O5'	0.18	0.28	0.26	0.04	0.31	0.01	0.38	0.01	0.37	0.39	0.34	0.25	0.39	0.42	0.30	0.23	0.24	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.35	0.37	0.47	0.24	0.44	0.15	0.52	0.07	0.51	0.58	0.45	0.34	0.54	0.60	0.46	0.52	0.26	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.50	0.42	0.14	0.54	0.07	0.66	0.02	0.66	0.68	0.59	0.45	0.71	0.74	0.52	0.53	0.23	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.36	0.40	0.11	0.42	0.06	0.51	0.02	0.50	0.57	0.44	0.32	0.54	0.60	0.43	0.43	0.25	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.15	0.06	0.09	0.14	0.12	0.19	0.17	0.22	0.16	0.20	0.12	0.24	0.21	0.12	0.06	0.08	0.09	0.16	0.25	0.25	0.24
C2	0.06	0.08	0.10	0.13	0.06	0.14	0.10	0.20	0.11	0.07	0.10	0.06	0.12	0.11	0.04	0.09	0.10	0.10	0.21	0.21	0.23	0.22
C2'	0.22	0.24	0.22	0.22	0.24	0.22	0.26	0.23	0.28	0.25	0.27	0.22	0.29	0.28	0.23	0.21	0.22	0.19	0.22	0.25	0.25	0.25
C3'	0.12	0.19	0.11	0.06	0.18	0.05	0.23	0.06	0.26	0.20	0.24	0.16	0.29	0.25	0.16	0.13	0.07	0.09	0.06	0.19	0.15	0.15
C4	0.02	0.11	0.04	0.08	0.09	0.11	0.14	0.17	0.16	0.08	0.15	0.07	0.19	0.15	0.05	0.05	0.06	0.07	0.18	0.22	0.25	0.24
C4'	0.09	0.13	0.09	0.06	0.14	0.06	0.18	0.09	0.19	0.18	0.17	0.11	0.21	0.21	0.13	0.10	0.06	0.06	0.07	0.14	0.10	0.11
C5	0.03	0.10	0.06	0.09	0.07	0.11	0.11	0.17	0.15	0.03	0.14	0.07	0.17	0.09	0.03	0.06	0.05	0.08	0.18	0.21	0.24	0.23
C5'	0.04	0.04	0.03	0.06	0.03	0.08	0.05	0.13	0.05	0.06	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.13	0.11	0.12
C6	0.07	0.06	0.10	0.12	0.03	0.14	0.05	0.19	0.09	0.05	0.09	0.03	0.10	0.05	0.03	0.09	0.08	0.11	0.20	0.20	0.23	0.22
C8	0.03	0.15	0.03	0.07	0.11	0.10	0.16	0.17	0.21	0.08	0.20	0.11	0.24	0.15	0.07	0.06	0.04	0.06	0.18	0.24	0.26	0.24
N1	0.08	0.06	0.12	0.14	0.05	0.16	0.08	0.20	0.09	0.07	0.09	0.04	0.10	0.08	0.05	0.10	0.11	0.13	0.21	0.20	0.23	0.22
N3	0.03	0.09	0.06	0.11	0.08	0.12	0.13	0.18	0.14	0.10	0.13	0.06	0.16	0.15	0.06	0.05	0.08	0.08	0.19	0.22	0.24	0.24
N6	0.10	0.05	0.12	0.13	0.05	0.16	0.05	0.20	0.05	0.09	0.06	0.05	0.07	0.09	0.07	0.11	0.09	0.14	0.20	0.20	0.23	0.22
N7	0.03	0.14	0.04	0.08	0.09	0.10	0.13	0.17	0.18	0.04	0.18	0.09	0.21	0.10	0.05	0.07	0.04	0.08	0.18	0.22	0.26	0.24
N9	0.04	0.13	0.03	0.07	0.11	0.10	0.17	0.17	0.20	0.11	0.18	0.10	0.23	0.18	0.08	0.05	0.05	0.07	0.17	0.24	0.26	0.24
O2'	0.31	0.29	0.34	0.36	0.29	0.35	0.29	0.36	0.30	0.30	0.31	0.28	0.31	0.29	0.30	0.31	0.36	0.30	0.36	0.39	0.38	0.38
O3'	0.29	0.16	0.30	0.37	0.18	0.40	0.11	0.46	0.10	0.16	0.11	0.20	0.13	0.10	0.22	0.27	0.37	0.37	0.45	0.58	0.53	0.54
O4'	0.04	0.09	0.04	0.09	0.08	0.11	0.14	0.18	0.17	0.11	0.14	0.06	0.20	0.17	0.06	0.05	0.08	0.08	0.17	0.27	0.25	0.25
O5'	0.22	0.23	0.18	0.21	0.21	0.25	0.18	0.28	0.18	0.16	0.20	0.24	0.17	0.15	0.20	0.18	0.20	0.27	0.25	0.25	0.24	0.26
OP1	0.33	0.38	0.30	0.29	0.36	0.31	0.35	0.32	0.36	0.33	0.37	0.37	0.37	0.34	0.34	0.30	0.29	0.35	0.30	0.27	0.28	0.28
OP2	0.53	0.59	0.49	0.48	0.57	0.49	0.56	0.47	0.58	0.53	0.58	0.58	0.58	0.55	0.54	0.51	0.47	0.54	0.46	0.40	0.41	0.42
P	0.33	0.39	0.29	0.29	0.36	0.31	0.35	0.31	0.37	0.32	0.38	0.38	0.38	0.33	0.34	0.31	0.28	0.35	0.29	0.26	0.26	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.05	0.07	0.05	0.08	0.07
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.03
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.04	0.02
C4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.06
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05
C8	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.03	0.04	0.06	0.02
N1	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.04	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05
N3	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.07	0.05	0.08	0.07
N6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05
N7	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.07	0.04
O2'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.06	0.09	0.05	0.09	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.04
O3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.05	0.10	0.07
O5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.08	0.06	0.04	0.07	0.03	0.06	0.01	0.05	0.06	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.06	0.03	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00