Doublet Group distance statistics: 50466

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, -0.004, 0.017, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.021
C1'	A	0, -0.003, 0.019, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.023
C6	A	0, -0.007, 0.021, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.028
C4	A	0, -0.007, 0.022, 0.050, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.022 std_dev=0.028
N3	A	0, -0.006, 0.024, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.024 std_dev=0.030
C2	A	0, -0.007, 0.027, 0.061, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.034
O2'	A	0, 0.017, 0.058, 0.100, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.058 std_dev=0.041
C5	A	0, -0.012, 0.032, 0.075, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.032 std_dev=0.044
N6	A	0, -0.010, 0.034, 0.078, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.034 std_dev=0.044
N9	A	0, -0.012, 0.034, 0.080, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.034 std_dev=0.046
N7	A	0, -0.014, 0.041, 0.096, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.041 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.014, 0.074, 0.134, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.074 std_dev=0.060
C8	A	0, -0.016, 0.048, 0.112, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.048 std_dev=0.064
O4'	A	0, -0.017, 0.137, 0.291, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.137 std_dev=0.154
C3'	A	0, 0.006, 0.161, 0.316, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.161 std_dev=0.155
C4'	A	0, -0.021, 0.194, 0.409, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.194 std_dev=0.215
O3'	A	0, 0.008, 0.237, 0.467, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.237 std_dev=0.230
C2'	B	0, 0.085, 0.329, 0.574, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.329 std_dev=0.244
O5'	A	0, -0.015, 0.297, 0.609, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.297 std_dev=0.312
C5'	A	0, -0.025, 0.308, 0.640, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.308 std_dev=0.333
P	A	0, -0.015, 0.414, 0.843, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.414 std_dev=0.429
O2'	B	0, 0.032, 0.540, 1.049, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.540 std_dev=0.509
C3'	B	0, 0.025, 0.585, 1.145, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.585 std_dev=0.560
C1'	B	0, -0.101, 0.795, 1.691, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.795 std_dev=0.896
OP2	B	0, -0.094, 0.981, 2.055, 2.477 max_d=2.477 avg_d=0.981 std_dev=1.075
O3'	B	0, -0.101, 0.993, 2.088, 2.519 max_d=2.519 avg_d=0.993 std_dev=1.095
C4'	B	0, -0.188, 1.038, 2.263, 2.759 max_d=2.759 avg_d=1.038 std_dev=1.226
N9	B	0, -0.188, 1.080, 2.347, 2.859 max_d=2.859 avg_d=1.080 std_dev=1.268
O5'	B	0, -0.170, 1.143, 2.457, 2.983 max_d=2.983 avg_d=1.143 std_dev=1.314
OP1	A	0, -0.258, 1.070, 2.397, 2.941 max_d=2.941 avg_d=1.070 std_dev=1.328
O4'	B	0, -0.238, 1.098, 2.433, 2.978 max_d=2.978 avg_d=1.098 std_dev=1.335
P	B	0, -0.189, 1.203, 2.595, 3.154 max_d=3.154 avg_d=1.203 std_dev=1.392
C8	B	0, -0.214, 1.260, 2.735, 3.329 max_d=3.329 avg_d=1.260 std_dev=1.474
OP2	A	0, -0.332, 1.217, 2.767, 3.404 max_d=3.404 avg_d=1.217 std_dev=1.550
OP1	B	0, -0.253, 1.327, 2.907, 3.548 max_d=3.548 avg_d=1.327 std_dev=1.580
C5'	B	0, -0.305, 1.348, 3.000, 3.675 max_d=3.675 avg_d=1.348 std_dev=1.653
C4	B	0, -0.317, 1.388, 3.093, 3.789 max_d=3.789 avg_d=1.388 std_dev=1.705
N3	B	0, -0.373, 1.427, 3.227, 3.966 max_d=3.966 avg_d=1.427 std_dev=1.800
N7	B	0, -0.323, 1.617, 3.558, 4.346 max_d=4.346 avg_d=1.617 std_dev=1.940
C5	B	0, -0.405, 1.737, 3.879, 4.755 max_d=4.755 avg_d=1.737 std_dev=2.142
C2	B	0, -0.551, 1.900, 4.351, 5.361 max_d=5.361 avg_d=1.900 std_dev=2.451
C6	B	0, -0.565, 2.190, 4.944, 6.075 max_d=6.075 avg_d=2.190 std_dev=2.754
N1	B	0, -0.648, 2.285, 5.218, 6.425 max_d=6.425 avg_d=2.285 std_dev=2.933
N6	B	0, -0.645, 2.554, 5.753, 7.065 max_d=7.065 avg_d=2.554 std_dev=3.199

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.27	0.21	0.01
C2	0.04	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.04	0.05	0.03	0.10	0.38	0.77	0.13
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.03	0.01	0.08	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.10	0.07	0.06	0.02	0.12	0.09	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.08	0.00
C4	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.40	0.67	0.09
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.03	0.02	0.10	0.11	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.19	0.01
C5	0.01	0.05	0.05	0.07	0.02	0.06	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.04	0.13	0.43	0.90	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.12	0.10	0.07	0.01	0.15	0.14	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.36	0.00
C6	0.01	0.05	0.06	0.10	0.02	0.07	0.02	0.12	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02	0.12	0.04	0.17	0.41	1.03	0.20
C8	0.05	0.04	0.06	0.07	0.02	0.09	0.01	0.10	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.09	0.10	0.10	0.43	0.70	0.09
N1	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.02	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.08	0.00	0.13	0.40	0.94	0.17
N3	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.38	0.60	0.08
N6	0.03	0.07	0.08	0.12	0.04	0.10	0.02	0.15	0.01	0.03	0.05	0.06	0.00	0.03	0.04	0.04	0.15	0.07	0.20	0.41	1.18	0.24
N7	0.04	0.05	0.07	0.09	0.03	0.11	0.01	0.14	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.04	0.12	0.09	0.16	0.43	0.97	0.17
N9	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.39	0.49	0.04
O2'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.08	0.02
O3'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.10	0.02	0.12	0.09	0.08	0.03	0.15	0.12	0.04	0.03	0.00	0.01	0.02	0.40	0.28	0.02
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.10	0.00	0.04	0.07	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.28	0.09	0.02
O5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.17	0.10	0.13	0.06	0.20	0.16	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.27	0.38	0.02	0.16	0.40	0.03	0.43	0.12	0.41	0.43	0.40	0.38	0.41	0.43	0.39	0.01	0.40	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.77	0.09	0.08	0.67	0.19	0.90	0.36	1.03	0.70	0.94	0.60	1.18	0.97	0.49	0.08	0.28	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.15	0.00	0.20	0.09	0.17	0.08	0.24	0.17	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.88	1.23	0.11	0.17	1.24	0.31	1.41	0.40	1.46	1.32	1.40	1.13	1.56	1.47	1.16	0.20	0.92	1.05	0.60	0.04	0.66	0.61
C2	0.86	0.97	0.07	0.22	1.03	0.31	1.11	0.36	1.10	1.09	1.06	0.94	1.12	1.15	1.02	0.24	1.00	1.09	0.47	0.14	0.37	0.38
C2'	0.78	1.31	0.03	0.28	1.26	0.09	1.47	0.13	1.57	1.31	1.50	1.16	1.70	1.52	1.13	0.30	1.03	0.87	0.42	0.28	0.59	0.43
C3'	0.72	1.37	0.01	0.34	1.27	0.01	1.50	0.01	1.64	1.27	1.58	1.18	1.79	1.52	1.10	0.36	1.06	0.76	0.32	0.35	0.54	0.35
C4	0.83	1.17	0.04	0.26	1.16	0.20	1.29	0.25	1.34	1.18	1.30	1.08	1.39	1.31	1.08	0.28	1.01	0.97	0.43	0.20	0.43	0.39
C4'	0.80	1.29	0.06	0.21	1.25	0.20	1.45	0.28	1.55	1.30	1.49	1.15	1.68	1.50	1.12	0.26	0.94	0.92	0.52	0.06	0.68	0.57
C5	0.75	1.22	0.01	0.31	1.15	0.07	1.26	0.09	1.34	1.09	1.34	1.11	1.40	1.24	1.02	0.33	1.01	0.82	0.28	0.29	0.31	0.24
C5'	0.73	1.29	0.01	0.28	1.21	0.11	1.43	0.18	1.55	1.24	1.50	1.13	1.69	1.46	1.07	0.34	0.98	0.82	0.43	0.12	0.61	0.48
C6	0.72	1.17	0.02	0.31	1.08	0.03	1.16	0.04	1.23	0.98	1.26	1.07	1.26	1.12	0.95	0.33	0.96	0.75	0.20	0.31	0.21	0.16
C8	0.76	1.31	0.01	0.31	1.21	0.08	1.38	0.11	1.48	1.18	1.46	1.16	1.57	1.37	1.07	0.33	1.03	0.84	0.33	0.27	0.41	0.32
N1	0.78	1.03	0.03	0.27	1.02	0.14	1.08	0.15	1.10	0.98	1.10	0.98	1.11	1.06	0.95	0.30	0.94	0.88	0.28	0.24	0.24	0.22
N3	0.86	1.03	0.07	0.22	1.09	0.32	1.20	0.40	1.21	1.18	1.15	0.98	1.25	1.26	1.06	0.24	1.01	1.09	0.54	0.11	0.48	0.48
N6	0.59	1.17	0.06	0.34	1.01	0.09	1.09	0.10	1.19	0.84	1.25	1.05	1.22	1.00	0.83	0.37	0.90	0.55	0.07	0.38	0.11	0.05
N7	0.72	1.30	0.03	0.33	1.18	0.02	1.32	0.03	1.44	1.10	1.45	1.16	1.51	1.29	1.02	0.35	1.02	0.76	0.24	0.32	0.31	0.23
N9	0.81	1.22	0.03	0.27	1.19	0.18	1.35	0.24	1.42	1.22	1.38	1.11	1.50	1.37	1.09	0.29	1.02	0.94	0.44	0.19	0.48	0.42
O2'	0.84	1.24	0.11	0.17	1.24	0.25	1.44	0.32	1.51	1.35	1.43	1.12	1.63	1.53	1.15	0.19	0.90	0.98	0.59	0.11	0.73	0.61
O3'	0.67	1.38	0.03	0.36	1.26	0.07	1.52	0.08	1.68	1.27	1.62	1.18	1.85	1.54	1.07	0.38	1.06	0.68	0.26	0.41	0.55	0.31
O4'	0.86	1.21	0.10	0.15	1.21	0.33	1.39	0.44	1.45	1.29	1.38	1.11	1.55	1.45	1.13	0.20	0.88	1.03	0.62	0.06	0.70	0.65
O5'	0.63	1.30	0.10	0.39	1.17	0.05	1.39	0.02	1.54	1.15	1.51	1.11	1.69	1.39	0.99	0.45	1.09	0.68	0.26	0.30	0.46	0.31
OP1	0.98	1.66	0.34	0.03	1.47	0.33	1.62	0.29	1.78	1.34	1.82	1.48	1.88	1.56	1.28	0.08	0.58	0.98	0.48	0.07	0.58	0.47
OP2	0.21	0.50	0.90	1.10	0.39	0.80	0.67	0.67	0.83	0.43	0.76	0.29	1.03	0.71	0.21	1.31	1.75	0.15	0.35	0.69	0.03	0.17
P	0.56	1.28	0.16	0.44	1.12	0.12	1.35	0.08	1.51	1.07	1.49	1.07	1.66	1.33	0.93	0.50	1.11	0.59	0.19	0.33	0.40	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.10	0.10	0.05
C2	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.07	0.04	0.00	0.10	0.19	0.23	0.13
C2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.14	0.09
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.18	0.13	0.10
C4	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.09	0.15	0.18	0.10
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.08	0.06	0.03
C5	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.10	0.15	0.18	0.11
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.06	0.05	0.04	0.11	0.06	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00
C6	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.03	0.12	0.17	0.21	0.13
C8	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.09	0.09	0.10	0.06
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00	0.09	0.18	0.22	0.13
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.09	0.17	0.21	0.11
N6	0.04	0.04	0.01	0.04	0.04	0.07	0.04	0.11	0.01	0.05	0.02	0.04	0.00	0.05	0.05	0.03	0.04	0.07	0.15	0.20	0.24	0.17
N7	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.09	0.11	0.13	0.08
N9	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.13	0.07
O2'	0.01	0.07	0.00	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.01	0.08	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.20	0.15	0.11
O3'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.24	0.15	0.13
O4'	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00	0.07	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.01
O5'	0.05	0.10	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.12	0.09	0.09	0.09	0.15	0.09	0.08	0.05	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.10	0.19	0.17	0.18	0.15	0.08	0.15	0.02	0.17	0.09	0.18	0.17	0.20	0.11	0.12	0.20	0.24	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.23	0.14	0.13	0.18	0.06	0.18	0.01	0.21	0.10	0.22	0.21	0.24	0.13	0.13	0.15	0.15	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.13	0.09	0.10	0.10	0.03	0.11	0.00	0.13	0.06	0.13	0.11	0.17	0.08	0.07	0.11	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00