Doublet Group distance statistics: 50468

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.006, 0.022, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.003, 0.035, 0.066, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.035 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.004, 0.045, 0.086, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.045 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.005, 0.051, 0.098, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.051 std_dev=0.046
N7	A	0, -0.009, 0.042, 0.093, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.042 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.025, 0.087, 0.148, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.087 std_dev=0.061
O2'	A	0, 0.019, 0.145, 0.271, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.145 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.037, 0.168, 0.298, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.168 std_dev=0.130
C3'	A	0, 0.030, 0.188, 0.346, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.188 std_dev=0.158
N7	B	0, 0.045, 0.248, 0.451, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.248 std_dev=0.203
C5'	A	0, 0.086, 0.313, 0.541, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.313 std_dev=0.228
C8	B	0, 0.102, 0.356, 0.609, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.356 std_dev=0.254
O3'	A	0, 0.011, 0.273, 0.535, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.273 std_dev=0.262
C5	B	0, 0.076, 0.345, 0.614, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.345 std_dev=0.269
N9	B	0, 0.103, 0.431, 0.759, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.431 std_dev=0.328
C3'	B	0, 0.129, 0.463, 0.797, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.463 std_dev=0.334
C4	B	0, 0.061, 0.421, 0.782, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.421 std_dev=0.361
C2'	B	0, 0.136, 0.502, 0.867, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.502 std_dev=0.366
O3'	B	0, 0.161, 0.552, 0.942, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.552 std_dev=0.391
C4'	B	0, 0.139, 0.542, 0.945, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.542 std_dev=0.403
C1'	B	0, 0.110, 0.520, 0.931, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.520 std_dev=0.411
OP2	B	0, 0.120, 0.535, 0.950, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.535 std_dev=0.415
C6	B	0, 0.029, 0.465, 0.900, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.465 std_dev=0.435
O2'	B	0, 0.175, 0.617, 1.059, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.617 std_dev=0.442
O4'	B	0, 0.095, 0.543, 0.992, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.543 std_dev=0.448
P	B	0, 0.187, 0.640, 1.092, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.640 std_dev=0.453
C5'	B	0, 0.160, 0.638, 1.116, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.638 std_dev=0.478
O5'	B	0, 0.121, 0.599, 1.078, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.599 std_dev=0.478
N6	B	0, 0.042, 0.529, 1.015, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.529 std_dev=0.487
N3	B	0, -0.020, 0.531, 1.081, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.531 std_dev=0.550
N1	B	0, -0.026, 0.584, 1.195, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.584 std_dev=0.610
C2	B	0, -0.060, 0.589, 1.238, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.589 std_dev=0.649
OP1	B	0, 0.145, 1.002, 1.860, 2.095 max_d=2.095 avg_d=1.002 std_dev=0.857
P	A	0, 0.409, 1.573, 2.737, 2.780 max_d=2.780 avg_d=1.573 std_dev=1.164
O5'	A	0, 0.404, 1.574, 2.743, 2.802 max_d=2.802 avg_d=1.574 std_dev=1.170
OP1	A	0, 0.477, 1.929, 3.381, 3.503 max_d=3.503 avg_d=1.929 std_dev=1.452
OP2	A	0, 0.648, 2.372, 4.096, 4.045 max_d=4.045 avg_d=2.372 std_dev=1.724

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.17	0.22	0.15
C2	0.02	0.00	0.03	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.03	0.43	0.31	0.65	0.39
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.22	0.15
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.05	0.15	0.13	0.15	0.12	0.14	0.15	0.10	0.01	0.00	0.02	0.21	0.22	0.22	0.14
C4	0.02	0.00	0.03	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.13	0.02	0.42	0.29	0.60	0.37
C4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.10	0.09	0.08	0.09	0.11	0.07	0.07	0.03	0.01	0.02	0.10	0.16	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.02	0.50	0.36	0.75	0.47
C5'	0.04	0.16	0.05	0.05	0.16	0.01	0.19	0.00	0.19	0.18	0.18	0.15	0.20	0.21	0.13	0.08	0.06	0.02	0.01	0.21	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.15	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.02	0.53	0.40	0.81	0.50
C8	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.14	0.02	0.46	0.30	0.61	0.40
N1	0.02	0.00	0.03	0.15	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.50	0.37	0.76	0.47
N3	0.03	0.00	0.04	0.12	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.37	0.26	0.55	0.33
N6	0.01	0.00	0.03	0.14	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.17	0.01	0.57	0.46	0.91	0.56
N7	0.01	0.00	0.03	0.15	0.01	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.02	0.52	0.37	0.77	0.49
N9	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.36	0.24	0.47	0.31
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.08	0.04	0.01	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.04	0.20	0.04
O3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.13	0.03	0.16	0.06	0.16	0.14	0.16	0.12	0.17	0.17	0.09	0.01	0.00	0.03	0.13	0.22	0.29	0.10
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03	0.00	0.08	0.14	0.06	0.09
O5'	0.16	0.43	0.18	0.21	0.42	0.02	0.50	0.01	0.53	0.46	0.50	0.37	0.57	0.52	0.36	0.07	0.13	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.17	0.31	0.16	0.22	0.29	0.10	0.36	0.21	0.40	0.30	0.37	0.26	0.46	0.37	0.24	0.04	0.22	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.65	0.22	0.22	0.60	0.16	0.75	0.27	0.81	0.61	0.76	0.55	0.91	0.77	0.47	0.20	0.29	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.39	0.15	0.14	0.37	0.03	0.47	0.01	0.50	0.40	0.47	0.33	0.56	0.49	0.31	0.04	0.10	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.08	0.12	0.06	0.05	0.07	0.04	0.27	0.15	0.15	0.15	0.05	0.26	0.01	0.15	0.12	0.02	0.12	0.49	0.18	0.26	0.20
C2	0.32	0.28	0.25	0.15	0.27	0.10	0.16	0.15	0.13	0.16	0.20	0.34	0.08	0.07	0.30	0.25	0.09	0.26	0.51	0.17	0.24	0.15
C2'	0.11	0.08	0.09	0.07	0.03	0.14	0.02	0.34	0.12	0.16	0.13	0.01	0.20	0.07	0.12	0.10	0.06	0.09	0.44	0.14	0.18	0.13
C3'	0.15	0.11	0.13	0.10	0.06	0.13	0.06	0.30	0.15	0.19	0.17	0.04	0.24	0.11	0.15	0.16	0.08	0.13	0.47	0.15	0.16	0.14
C4	0.25	0.15	0.19	0.10	0.18	0.06	0.08	0.18	0.07	0.17	0.09	0.21	0.13	0.04	0.24	0.20	0.05	0.19	0.53	0.20	0.26	0.18
C4'	0.13	0.15	0.11	0.07	0.05	0.11	0.08	0.30	0.19	0.16	0.21	0.06	0.30	0.08	0.13	0.13	0.05	0.11	0.45	0.15	0.17	0.16
C5	0.28	0.20	0.22	0.13	0.22	0.08	0.11	0.11	0.08	0.17	0.12	0.26	0.12	0.05	0.27	0.24	0.07	0.23	0.54	0.24	0.28	0.18
C5'	0.20	0.14	0.17	0.11	0.09	0.11	0.09	0.23	0.18	0.21	0.21	0.07	0.30	0.12	0.18	0.21	0.09	0.18	0.52	0.18	0.21	0.19
C6	0.32	0.27	0.26	0.16	0.26	0.13	0.14	0.11	0.11	0.17	0.18	0.33	0.09	0.06	0.29	0.28	0.10	0.27	0.53	0.21	0.29	0.18
C8	0.22	0.08	0.17	0.09	0.13	0.05	0.04	0.17	0.08	0.16	0.06	0.15	0.19	0.04	0.21	0.18	0.04	0.17	0.52	0.28	0.29	0.21
N1	0.34	0.32	0.28	0.18	0.29	0.15	0.17	0.14	0.15	0.16	0.23	0.37	0.08	0.07	0.31	0.29	0.12	0.29	0.51	0.17	0.27	0.16
N3	0.25	0.19	0.19	0.10	0.21	0.06	0.11	0.23	0.08	0.17	0.12	0.24	0.09	0.05	0.25	0.19	0.06	0.19	0.51	0.16	0.23	0.15
N6	0.33	0.30	0.28	0.19	0.27	0.16	0.15	0.16	0.12	0.16	0.20	0.35	0.09	0.06	0.30	0.31	0.13	0.28	0.53	0.22	0.31	0.19
N7	0.27	0.15	0.21	0.12	0.19	0.07	0.08	0.11	0.06	0.18	0.08	0.23	0.14	0.05	0.25	0.23	0.06	0.22	0.54	0.29	0.30	0.21
N9	0.19	0.07	0.15	0.08	0.11	0.05	0.03	0.21	0.09	0.15	0.08	0.12	0.20	0.03	0.19	0.16	0.03	0.15	0.53	0.22	0.28	0.20
O2'	0.08	0.23	0.08	0.14	0.13	0.27	0.17	0.51	0.25	0.06	0.26	0.17	0.30	0.10	0.06	0.08	0.15	0.13	0.24	0.03	0.00	0.13
O3'	0.13	0.19	0.12	0.11	0.10	0.18	0.11	0.36	0.19	0.18	0.22	0.12	0.24	0.14	0.13	0.14	0.10	0.13	0.39	0.13	0.06	0.08
O4'	0.14	0.10	0.11	0.05	0.03	0.07	0.04	0.26	0.17	0.15	0.18	0.02	0.29	0.04	0.14	0.13	0.01	0.12	0.48	0.22	0.25	0.21
O5'	0.28	0.24	0.24	0.18	0.14	0.17	0.11	0.21	0.27	0.20	0.31	0.18	0.41	0.05	0.22	0.29	0.17	0.28	0.59	0.30	0.22	0.29
OP1	0.20	0.23	0.16	0.15	0.14	0.21	0.14	0.41	0.27	0.09	0.29	0.18	0.40	0.08	0.15	0.20	0.19	0.19	0.33	0.51	0.10	0.35
OP2	0.51	0.13	0.47	0.41	0.30	0.40	0.19	0.33	0.06	0.40	0.05	0.28	0.19	0.25	0.43	0.54	0.40	0.51	0.82	0.59	0.42	0.55
P	0.27	0.17	0.23	0.19	0.13	0.21	0.09	0.30	0.22	0.17	0.24	0.15	0.36	0.05	0.21	0.28	0.19	0.27	0.54	0.46	0.20	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.07	0.09	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.26	0.63	0.04	0.21
C2	0.08	0.00	0.17	0.10	0.01	0.05	0.02	0.18	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.26	0.18	0.04	0.17	0.54	0.23	0.03
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.04	0.06	0.02	0.10	0.06	0.15	0.17	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.69	0.09	0.17
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.13	0.06	0.11	0.03	0.11	0.04	0.01	0.01	0.02	0.13	0.69	0.12	0.16
C4	0.05	0.01	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.06	0.00	0.22	0.51	0.13	0.08
C4'	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.13	0.01	0.11	0.22	0.03	0.07	0.16	0.23	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.52	0.09	0.12
C5	0.02	0.02	0.06	0.03	0.01	0.13	0.00	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.03	0.04	0.19	0.33	0.21	0.08
C5'	0.05	0.18	0.02	0.03	0.23	0.01	0.38	0.00	0.38	0.42	0.29	0.11	0.47	0.49	0.21	0.07	0.05	0.01	0.01	0.38	0.18	0.02
C6	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.11	0.00	0.38	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.05	0.03	0.16	0.29	0.29	0.12
C8	0.04	0.02	0.06	0.13	0.01	0.22	0.01	0.42	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.09	0.26	0.32	0.06	0.11
N1	0.07	0.00	0.15	0.06	0.01	0.03	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.13	0.01	0.15	0.42	0.29	0.06
N3	0.09	0.00	0.17	0.11	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.24	0.17	0.05	0.21	0.61	0.14	0.11
N6	0.03	0.01	0.08	0.03	0.02	0.16	0.00	0.47	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.14	0.03	0.06	0.15	0.16	0.35	0.22
N7	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.23	0.00	0.49	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.11	0.09	0.20	0.18	0.18	0.15
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.27	0.52	0.03	0.14
O2'	0.00	0.26	0.00	0.01	0.13	0.08	0.09	0.07	0.16	0.05	0.23	0.24	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.67	0.09	0.17
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.05	0.05	0.14	0.13	0.17	0.03	0.11	0.04	0.01	0.00	0.01	0.36	0.65	0.19	0.14
O4'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.06	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.37	0.61	0.14	0.28
O5'	0.26	0.17	0.05	0.13	0.22	0.01	0.19	0.01	0.16	0.26	0.15	0.21	0.15	0.20	0.27	0.02	0.36	0.37	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.63	0.54	0.69	0.69	0.51	0.52	0.33	0.38	0.29	0.32	0.42	0.61	0.16	0.18	0.52	0.67	0.65	0.61	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.23	0.09	0.12	0.13	0.09	0.21	0.18	0.29	0.06	0.29	0.14	0.35	0.18	0.03	0.09	0.19	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.03	0.17	0.16	0.08	0.12	0.08	0.02	0.12	0.11	0.06	0.11	0.22	0.15	0.14	0.17	0.14	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00