Doublet Group distance statistics: 50475

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.001, 0.017, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N1	A	0, -0.002, 0.017, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.003, 0.023, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.008, 0.029, 0.051, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N7	A	0, -0.002, 0.026, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.026 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.001, 0.031, 0.062, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.021, 0.081, 0.141, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.081 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.008, 0.075, 0.143, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.075 std_dev=0.067
C3'	A	0, 0.019, 0.129, 0.239, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.129 std_dev=0.110
O3'	A	0, 0.048, 0.166, 0.284, 0.264 max_d=0.264 avg_d=0.166 std_dev=0.118
O2'	A	0, 0.037, 0.166, 0.295, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.166 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.030, 0.164, 0.298, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.164 std_dev=0.134
P	A	0, 0.033, 0.236, 0.440, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.236 std_dev=0.203
C5'	A	0, 0.063, 0.270, 0.478, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.270 std_dev=0.208
O5'	A	0, 0.070, 0.283, 0.496, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.283 std_dev=0.213
OP2	A	0, 0.067, 0.300, 0.534, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.300 std_dev=0.233
OP1	A	0, 0.001, 0.324, 0.647, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.324 std_dev=0.323
O4'	B	0, 0.109, 0.439, 0.768, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.439 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.074, 0.450, 0.826, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.450 std_dev=0.376
C4'	B	0, 0.111, 0.497, 0.883, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.497 std_dev=0.386
C1'	B	0, 0.103, 0.518, 0.932, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.518 std_dev=0.414
C2'	B	0, 0.093, 0.552, 1.010, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.552 std_dev=0.458
C5'	B	0, 0.115, 0.600, 1.086, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.600 std_dev=0.485
C3'	B	0, 0.055, 0.745, 1.434, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.745 std_dev=0.689
O5'	B	0, 0.122, 0.884, 1.645, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.884 std_dev=0.762
N9	B	0, 0.047, 0.858, 1.669, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.858 std_dev=0.811
C8	B	0, 0.052, 0.952, 1.851, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.952 std_dev=0.900
P	B	0, 0.083, 0.984, 1.885, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.984 std_dev=0.901
OP1	B	0, 0.134, 1.075, 2.017, 2.293 max_d=2.293 avg_d=1.075 std_dev=0.942
O3'	B	0, -0.032, 0.953, 1.937, 2.309 max_d=2.309 avg_d=0.953 std_dev=0.985
OP2	B	0, 0.077, 1.228, 2.379, 2.767 max_d=2.767 avg_d=1.228 std_dev=1.151
C4	B	0, -0.045, 1.164, 2.373, 2.830 max_d=2.830 avg_d=1.164 std_dev=1.209
N3	B	0, -0.075, 1.219, 2.514, 3.011 max_d=3.011 avg_d=1.219 std_dev=1.294
N7	B	0, -0.041, 1.286, 2.612, 3.112 max_d=3.112 avg_d=1.286 std_dev=1.327
C5	B	0, -0.095, 1.430, 2.954, 3.542 max_d=3.542 avg_d=1.430 std_dev=1.524
C2	B	0, -0.150, 1.582, 3.314, 3.992 max_d=3.992 avg_d=1.582 std_dev=1.732
C6	B	0, -0.181, 1.801, 3.783, 4.562 max_d=4.562 avg_d=1.801 std_dev=1.982
N1	B	0, -0.207, 1.869, 3.946, 4.765 max_d=4.765 avg_d=1.869 std_dev=2.076
N6	B	0, -0.211, 2.107, 4.424, 5.335 max_d=5.335 avg_d=2.107 std_dev=2.318

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.08	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.05	0.08	0.08
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.10	0.04
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.04	0.08	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.11	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.09	0.07	0.09	0.10
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03
C5	0.00	0.02	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.10	0.07	0.09	0.12
C5'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.02	0.06	0.07	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.09	0.03	0.04
C6	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.09	0.06	0.08	0.12
C8	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.11	0.09	0.07	0.11
N1	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.08	0.05	0.09	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.07	0.06	0.09	0.08
N6	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.09	0.05	0.08	0.13
N7	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.11	0.08	0.08	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.08	0.08	0.08
O2'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.01	0.06	0.04	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.07	0.01
O3'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.07	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.09	0.03
O5'	0.07	0.07	0.03	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.11	0.08	0.07	0.09	0.11	0.09	0.01	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.08	0.05	0.04	0.03	0.07	0.07	0.07	0.09	0.06	0.09	0.05	0.06	0.05	0.08	0.08	0.06	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.08	0.10	0.11	0.09	0.02	0.09	0.03	0.08	0.07	0.09	0.09	0.08	0.08	0.08	0.07	0.14	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.04	0.04	0.10	0.03	0.12	0.04	0.12	0.11	0.10	0.08	0.13	0.13	0.08	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.25	0.28	0.56	0.13	0.36	0.11	0.42	0.16	0.03	0.23	0.21	0.14	0.03	0.05	0.24	0.91	0.04	0.40	0.34	0.36	0.33
C2	0.23	0.62	0.03	0.18	0.49	0.15	0.50	0.14	0.57	0.30	0.63	0.56	0.57	0.39	0.36	0.18	0.42	0.15	0.08	0.11	0.07	0.07
C2'	0.08	0.17	0.29	0.56	0.08	0.38	0.06	0.46	0.08	0.12	0.14	0.14	0.07	0.10	0.07	0.22	0.85	0.10	0.44	0.37	0.39	0.38
C3'	0.08	0.25	0.28	0.56	0.12	0.38	0.10	0.47	0.15	0.12	0.22	0.20	0.13	0.09	0.08	0.22	0.86	0.11	0.45	0.40	0.39	0.39
C4	0.14	0.56	0.17	0.38	0.40	0.26	0.40	0.26	0.49	0.21	0.57	0.48	0.50	0.30	0.26	0.26	0.70	0.09	0.17	0.10	0.12	0.10
C4'	0.05	0.21	0.30	0.61	0.08	0.40	0.05	0.50	0.09	0.11	0.17	0.17	0.07	0.09	0.05	0.22	0.95	0.09	0.51	0.49	0.47	0.46
C5	0.21	0.81	0.10	0.30	0.58	0.21	0.61	0.20	0.75	0.34	0.84	0.68	0.76	0.48	0.39	0.26	0.63	0.14	0.08	0.06	0.05	0.04
C5'	0.06	0.34	0.28	0.59	0.17	0.38	0.14	0.48	0.21	0.07	0.31	0.28	0.19	0.06	0.08	0.21	0.95	0.08	0.48	0.47	0.43	0.43
C6	0.29	1.00	0.01	0.17	0.75	0.14	0.79	0.11	0.95	0.47	1.04	0.86	0.97	0.64	0.52	0.22	0.46	0.19	0.11	0.14	0.14	0.14
C8	0.14	0.64	0.20	0.44	0.43	0.28	0.45	0.29	0.56	0.22	0.65	0.53	0.58	0.33	0.27	0.28	0.80	0.09	0.20	0.14	0.13	0.12
N1	0.31	0.93	0.04	0.10	0.73	0.10	0.76	0.09	0.88	0.47	0.96	0.82	0.89	0.61	0.52	0.18	0.35	0.21	0.14	0.17	0.15	0.16
N3	0.12	0.43	0.16	0.36	0.31	0.26	0.30	0.25	0.37	0.15	0.42	0.38	0.36	0.22	0.20	0.23	0.63	0.07	0.18	0.11	0.16	0.12
N6	0.34	1.23	0.06	0.10	0.90	0.10	0.98	0.08	1.18	0.59	1.30	1.03	1.23	0.79	0.62	0.20	0.40	0.23	0.18	0.20	0.23	0.22
N7	0.20	0.82	0.13	0.35	0.58	0.23	0.62	0.23	0.76	0.33	0.86	0.68	0.79	0.47	0.38	0.28	0.70	0.13	0.11	0.05	0.04	0.03
N9	0.10	0.47	0.22	0.47	0.31	0.31	0.31	0.33	0.39	0.13	0.47	0.40	0.39	0.21	0.18	0.27	0.82	0.06	0.26	0.19	0.20	0.18
O2'	0.10	0.04	0.31	0.60	0.12	0.40	0.18	0.52	0.16	0.24	0.09	0.04	0.21	0.25	0.16	0.15	0.86	0.13	0.57	0.52	0.54	0.52
O3'	0.09	0.17	0.28	0.55	0.08	0.38	0.08	0.48	0.08	0.17	0.14	0.14	0.09	0.15	0.10	0.18	0.82	0.13	0.49	0.46	0.44	0.44
O4'	0.04	0.27	0.27	0.57	0.14	0.35	0.11	0.43	0.16	0.03	0.24	0.23	0.14	0.02	0.05	0.21	0.93	0.03	0.44	0.40	0.40	0.38
O5'	0.15	0.56	0.19	0.48	0.36	0.30	0.35	0.37	0.45	0.15	0.56	0.47	0.45	0.23	0.22	0.18	0.86	0.10	0.32	0.31	0.26	0.26
OP1	0.16	0.63	0.19	0.49	0.40	0.30	0.39	0.38	0.51	0.16	0.63	0.52	0.51	0.25	0.24	0.18	0.86	0.10	0.33	0.34	0.26	0.27
OP2	0.21	0.78	0.17	0.41	0.54	0.22	0.59	0.22	0.73	0.33	0.82	0.64	0.77	0.46	0.37	0.27	0.83	0.18	0.14	0.08	0.06	0.05
P	0.18	0.68	0.18	0.47	0.45	0.27	0.46	0.33	0.59	0.22	0.70	0.57	0.60	0.32	0.29	0.20	0.87	0.12	0.27	0.26	0.19	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.24	0.12
C2	0.02	0.00	0.21	0.21	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.28	0.03	0.21	0.30	0.47	0.27
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.02	0.12	0.08	0.17	0.20	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.18	0.10
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.02	0.10	0.13	0.17	0.19	0.09	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.07	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.11	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.09	0.11	0.02	0.15	0.22	0.41	0.23
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02	0.13	0.26	0.43	0.24
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.11	0.11	0.10	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.12	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.17	0.32	0.48	0.28
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.15	0.01	0.05	0.14	0.33	0.17
N1	0.02	0.00	0.17	0.17	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.22	0.03	0.20	0.33	0.49	0.28
N3	0.02	0.00	0.20	0.19	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.24	0.02	0.19	0.24	0.42	0.24
N6	0.03	0.00	0.10	0.09	0.02	0.05	0.02	0.10	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.10	0.01	0.16	0.36	0.49	0.29
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.22	0.39	0.21
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.11	0.15	0.34	0.19
O2'	0.01	0.19	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.11	0.05	0.16	0.18	0.10	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.15	0.06
O3'	0.01	0.28	0.01	0.00	0.11	0.01	0.05	0.02	0.13	0.15	0.22	0.24	0.10	0.09	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.12	0.09	0.05
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.17	0.07
O5'	0.08	0.21	0.08	0.05	0.15	0.03	0.13	0.00	0.17	0.05	0.20	0.19	0.16	0.07	0.11	0.06	0.00	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.30	0.08	0.07	0.22	0.09	0.26	0.12	0.32	0.14	0.33	0.24	0.36	0.22	0.15	0.08	0.12	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.47	0.18	0.07	0.41	0.07	0.43	0.02	0.48	0.33	0.49	0.42	0.49	0.39	0.34	0.15	0.09	0.17	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.27	0.10	0.05	0.23	0.02	0.24	0.02	0.28	0.17	0.28	0.24	0.29	0.21	0.19	0.06	0.05	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00