Doublet Group distance statistics: 50476

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N9	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C8	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O4'	A	0, 0.000, 0.064, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.064 std_dev=0.064
C2'	A	0, 0.000, 0.114, 0.229, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.114 std_dev=0.114
O4'	B	0, 0.000, 0.176, 0.352, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.176 std_dev=0.176
C4'	B	0, 0.000, 0.205, 0.410, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.205 std_dev=0.205
C5'	B	0, 0.000, 0.221, 0.441, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.221 std_dev=0.221
C4'	A	0, 0.000, 0.243, 0.486, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.243 std_dev=0.243
O2'	A	0, 0.000, 0.277, 0.554, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.277 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.000, 0.304, 0.607, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C1'	B	0, 0.000, 0.306, 0.612, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.306 std_dev=0.306
C5'	A	0, 0.000, 0.379, 0.758, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.379 std_dev=0.379
O5'	A	0, 0.000, 0.424, 0.849, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.424 std_dev=0.424
C2'	B	0, 0.000, 0.439, 0.877, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.439 std_dev=0.439
N9	B	0, 0.000, 0.443, 0.886, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.443 std_dev=0.443
O2'	B	0, 0.000, 0.448, 0.897, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.448 std_dev=0.448
O5'	B	0, 0.000, 0.464, 0.927, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.464 std_dev=0.464
O3'	A	0, 0.000, 0.498, 0.996, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.498 std_dev=0.498
C3'	B	0, 0.000, 0.513, 1.025, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.513 std_dev=0.513
P	B	0, 0.000, 0.546, 1.092, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.546 std_dev=0.546
OP1	B	0, 0.000, 0.548, 1.097, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.548 std_dev=0.548
C4	B	0, 0.000, 0.553, 1.107, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.553 std_dev=0.553
OP1	A	0, 0.000, 0.556, 1.112, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.556 std_dev=0.556
C8	B	0, 0.000, 0.607, 1.214, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.607 std_dev=0.607
C5	B	0, 0.000, 0.639, 1.278, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.639 std_dev=0.639
N3	B	0, 0.000, 0.699, 1.398, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.699 std_dev=0.699
N7	B	0, 0.000, 0.699, 1.399, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.699 std_dev=0.699
OP2	B	0, 0.000, 0.706, 1.411, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.706 std_dev=0.706
O3'	B	0, 0.000, 0.729, 1.458, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.729 std_dev=0.729
C6	B	0, 0.000, 0.764, 1.528, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.764 std_dev=0.764
P	A	0, 0.000, 0.851, 1.702, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.851 std_dev=0.851
N6	B	0, 0.000, 0.860, 1.719, 1.719 max_d=1.719 avg_d=0.860 std_dev=0.860
C2	B	0, 0.000, 0.872, 1.744, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.872 std_dev=0.872
N1	B	0, 0.000, 0.881, 1.761, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.881 std_dev=0.881
OP2	A	0, 0.000, 1.638, 3.276, 3.276 max_d=3.276 avg_d=1.638 std_dev=1.638

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.17	0.09
C2	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.04	0.03	0.11	0.16	0.46	0.30
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.33	0.50	0.26
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.13	0.17	0.10	0.05	0.15	0.18	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.43	0.64	0.35
C4	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.02	0.11	0.13	0.35	0.25
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.14	0.08	0.04	0.12	0.14	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.32	0.20	0.11
C5	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.14	0.02	0.18	0.08	0.33	0.29
C5'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.16	0.18	0.13	0.07	0.19	0.20	0.10	0.03	0.02	0.01	0.00	0.24	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.13	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.02	0.18	0.08	0.40	0.33
C8	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.14	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.18	0.01	0.18	0.06	0.11	0.18
N1	0.02	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.15	0.12	0.46	0.33
N3	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.02	0.08	0.17	0.42	0.26
N6	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.17	0.02	0.22	0.05	0.37	0.34
N7	0.01	0.00	0.05	0.18	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.02	0.22	0.03	0.19	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.09	0.12	0.23	0.18
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.08	0.10	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.42	0.46	0.25
O3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.14	0.02	0.14	0.18	0.09	0.02	0.17	0.20	0.09	0.03	0.00	0.01	0.03	0.66	0.82	0.48
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.09	0.11	0.08
O5'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.11	0.02	0.18	0.00	0.18	0.18	0.15	0.08	0.22	0.22	0.09	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.16	0.33	0.43	0.13	0.32	0.08	0.24	0.08	0.06	0.12	0.17	0.05	0.03	0.12	0.42	0.66	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.46	0.50	0.64	0.35	0.20	0.33	0.03	0.40	0.11	0.46	0.42	0.37	0.19	0.23	0.46	0.82	0.11	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.30	0.26	0.35	0.25	0.11	0.29	0.01	0.33	0.18	0.33	0.26	0.34	0.26	0.18	0.25	0.48	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.49	0.14	0.14	0.26	0.05	0.22	0.01	0.31	0.02	0.43	0.42	0.27	0.08	0.12	0.18	0.25	0.00	0.03	0.11	0.04	0.04
C2	0.00	0.20	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.05	0.08	0.12	0.16	0.17	0.05	0.08	0.02	0.01	0.11	0.06	0.10	0.14	0.03	0.09
C2'	0.20	0.58	0.24	0.23	0.38	0.12	0.35	0.06	0.43	0.16	0.53	0.52	0.40	0.23	0.25	0.27	0.34	0.08	0.07	0.03	0.14	0.05
C3'	0.20	0.66	0.28	0.25	0.42	0.09	0.38	0.01	0.48	0.17	0.61	0.58	0.46	0.24	0.26	0.32	0.38	0.05	0.03	0.10	0.09	0.01
C4	0.06	0.35	0.10	0.10	0.17	0.04	0.11	0.03	0.19	0.06	0.29	0.31	0.15	0.01	0.05	0.13	0.22	0.02	0.08	0.15	0.03	0.09
C4'	0.17	0.65	0.24	0.21	0.38	0.08	0.34	0.00	0.46	0.12	0.60	0.55	0.43	0.19	0.22	0.28	0.34	0.03	0.00	0.11	0.06	0.03
C5	0.05	0.31	0.09	0.10	0.14	0.04	0.07	0.05	0.14	0.10	0.25	0.27	0.10	0.06	0.02	0.12	0.22	0.04	0.11	0.20	0.09	0.14
C5'	0.16	0.65	0.25	0.22	0.37	0.07	0.32	0.03	0.44	0.08	0.60	0.55	0.41	0.15	0.20	0.31	0.37	0.01	0.04	0.17	0.00	0.09
C6	0.01	0.23	0.05	0.06	0.08	0.02	0.01	0.07	0.07	0.15	0.17	0.20	0.03	0.12	0.02	0.07	0.17	0.06	0.15	0.23	0.13	0.17
C8	0.08	0.41	0.14	0.14	0.20	0.05	0.14	0.03	0.23	0.05	0.35	0.36	0.18	0.00	0.07	0.18	0.28	0.02	0.08	0.17	0.05	0.11
N1	0.02	0.17	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.03	0.17	0.12	0.14	0.00	0.13	0.05	0.01	0.11	0.07	0.15	0.21	0.12	0.16
N3	0.05	0.30	0.07	0.07	0.16	0.03	0.11	0.02	0.17	0.05	0.26	0.27	0.14	0.00	0.05	0.08	0.17	0.02	0.06	0.11	0.01	0.05
N6	0.01	0.21	0.05	0.05	0.05	0.01	0.02	0.08	0.04	0.18	0.15	0.18	0.01	0.15	0.04	0.06	0.17	0.06	0.17	0.27	0.19	0.22
N7	0.06	0.36	0.12	0.12	0.16	0.05	0.09	0.04	0.17	0.09	0.30	0.31	0.13	0.05	0.04	0.15	0.26	0.03	0.11	0.20	0.10	0.14
N9	0.08	0.42	0.13	0.13	0.22	0.05	0.16	0.02	0.25	0.03	0.37	0.37	0.21	0.02	0.09	0.17	0.26	0.01	0.06	0.14	0.01	0.08
O2'	0.29	0.72	0.30	0.29	0.52	0.19	0.50	0.15	0.59	0.32	0.68	0.65	0.57	0.39	0.38	0.29	0.35	0.18	0.19	0.10	0.30	0.19
O3'	0.29	0.80	0.37	0.33	0.55	0.14	0.53	0.06	0.64	0.31	0.76	0.70	0.62	0.39	0.38	0.39	0.43	0.12	0.11	0.03	0.19	0.07
O4'	0.09	0.51	0.16	0.15	0.26	0.06	0.22	0.01	0.32	0.01	0.46	0.43	0.28	0.07	0.12	0.21	0.29	0.01	0.04	0.12	0.02	0.05
O5'	0.14	0.59	0.24	0.22	0.32	0.06	0.25	0.06	0.37	0.02	0.53	0.50	0.32	0.08	0.16	0.31	0.39	0.02	0.08	0.22	0.07	0.15
OP1	0.11	0.24	0.05	0.03	0.04	0.15	0.00	0.21	0.09	0.17	0.21	0.17	0.07	0.12	0.09	0.03	0.13	0.21	0.22	0.34	0.19	0.25
OP2	0.53	0.04	0.57	0.60	0.26	0.69	0.27	0.77	0.12	0.53	0.02	0.10	0.12	0.43	0.44	0.58	0.53	0.65	0.75	0.92	0.67	0.77
P	0.19	0.34	0.16	0.19	0.04	0.32	0.01	0.43	0.14	0.25	0.30	0.22	0.12	0.16	0.14	0.13	0.06	0.34	0.43	0.59	0.39	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02
C2	0.01	0.00	0.11	0.18	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.02	0.09	0.11	0.01	0.06
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.01	0.07	0.02	0.10	0.11	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.18	0.07	0.19	0.16	0.18	0.11	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.03
C4	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.02	0.07	0.08	0.01	0.04
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.08	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01
C5	0.00	0.00	0.05	0.15	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.02	0.09	0.08	0.00	0.06
C5'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.06	0.04	0.07	0.03	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.07	0.18	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.02	0.10	0.10	0.02	0.07
C8	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.06	0.03	0.06	0.02
N1	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.02	0.10	0.12	0.03	0.07
N3	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.02	0.08	0.10	0.00	0.04
N6	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.23	0.02	0.11	0.10	0.04	0.08
N7	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.01	0.08	0.05	0.02	0.05
N9	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.05	0.05	0.02
O2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.12	0.00	0.05
O3'	0.00	0.21	0.01	0.00	0.15	0.00	0.18	0.03	0.22	0.09	0.23	0.17	0.23	0.14	0.09	0.06	0.00	0.00	0.06	0.15	0.13	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.04
O5'	0.00	0.09	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.06	0.10	0.08	0.11	0.08	0.05	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.11	0.04	0.06	0.08	0.06	0.08	0.07	0.10	0.03	0.12	0.10	0.10	0.05	0.05	0.12	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.00	0.13	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.04	0.08	0.05	0.02	0.05	0.10	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00