Doublet Group distance statistics: 50480

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
C8	A	0, 0.000, 0.060, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N9	A	0, 0.000, 0.077, 0.155, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.077 std_dev=0.077
N1	A	0, 0.000, 0.084, 0.169, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.084 std_dev=0.084
N3	A	0, 0.000, 0.101, 0.202, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.101 std_dev=0.101
C2	A	0, 0.000, 0.114, 0.229, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.114 std_dev=0.114
C1'	A	0, 0.000, 0.130, 0.261, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.130 std_dev=0.130
C2'	B	0, 0.000, 0.424, 0.848, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.424 std_dev=0.424
O4'	A	0, 0.000, 0.443, 0.885, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.443 std_dev=0.443
O2'	B	0, 0.000, 0.508, 1.017, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.508 std_dev=0.508
C4'	A	0, 0.000, 0.778, 1.556, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.778 std_dev=0.778
C2'	A	0, 0.000, 0.778, 1.556, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.778 std_dev=0.778
C3'	A	0, 0.000, 0.861, 1.721, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.861 std_dev=0.861
C3'	B	0, 0.000, 0.879, 1.758, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.879 std_dev=0.879
O5'	A	0, 0.000, 0.902, 1.804, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.902 std_dev=0.902
P	A	0, 0.000, 0.972, 1.945, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.972 std_dev=0.972
O3'	A	0, 0.000, 1.054, 2.108, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.054 std_dev=1.054
C5'	A	0, 0.000, 1.069, 2.138, 2.138 max_d=2.138 avg_d=1.069 std_dev=1.069
O2'	A	0, 0.000, 1.185, 2.370, 2.370 max_d=2.370 avg_d=1.185 std_dev=1.185
O3'	B	0, 0.000, 1.212, 2.423, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.212 std_dev=1.212
C1'	B	0, 0.000, 1.256, 2.512, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.256 std_dev=1.256
OP1	A	0, 0.000, 1.525, 3.050, 3.050 max_d=3.050 avg_d=1.525 std_dev=1.525
C4'	B	0, 0.000, 1.759, 3.519, 3.519 max_d=3.519 avg_d=1.759 std_dev=1.759
O4'	B	0, 0.000, 1.844, 3.688, 3.688 max_d=3.688 avg_d=1.844 std_dev=1.844
N9	B	0, 0.000, 1.948, 3.896, 3.896 max_d=3.896 avg_d=1.948 std_dev=1.948
OP2	A	0, 0.000, 2.228, 4.456, 4.456 max_d=4.456 avg_d=2.228 std_dev=2.228
C4	B	0, 0.000, 2.436, 4.872, 4.872 max_d=4.872 avg_d=2.436 std_dev=2.436
C5'	B	0, 0.000, 2.555, 5.109, 5.109 max_d=5.109 avg_d=2.555 std_dev=2.555
N3	B	0, 0.000, 2.635, 5.270, 5.270 max_d=5.270 avg_d=2.635 std_dev=2.635
C8	B	0, 0.000, 2.637, 5.274, 5.274 max_d=5.274 avg_d=2.637 std_dev=2.637
O5'	B	0, 0.000, 2.821, 5.642, 5.642 max_d=5.642 avg_d=2.821 std_dev=2.821
C5	B	0, 0.000, 3.112, 6.223, 6.223 max_d=6.223 avg_d=3.112 std_dev=3.112
N7	B	0, 0.000, 3.190, 6.381, 6.381 max_d=6.381 avg_d=3.190 std_dev=3.190
C2	B	0, 0.000, 3.558, 7.115, 7.115 max_d=7.115 avg_d=3.558 std_dev=3.558
P	B	0, 0.000, 3.859, 7.718, 7.718 max_d=7.718 avg_d=3.859 std_dev=3.859
C6	B	0, 0.000, 3.861, 7.721, 7.721 max_d=7.721 avg_d=3.861 std_dev=3.861
N1	B	0, 0.000, 4.098, 8.197, 8.197 max_d=8.197 avg_d=4.098 std_dev=4.098
OP2	B	0, 0.000, 4.240, 8.480, 8.480 max_d=8.480 avg_d=4.240 std_dev=4.240
OP1	B	0, 0.000, 4.318, 8.637, 8.637 max_d=8.637 avg_d=4.318 std_dev=4.318
N6	B	0, 0.000, 4.530, 9.060, 9.060 max_d=9.060 avg_d=4.530 std_dev=4.530

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.17	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.04	0.08	0.02	0.15	0.16	0.07	0.00	0.01	0.03	0.23	0.00	0.10	0.31	0.01	0.08
C2	0.17	0.00	0.39	0.23	0.05	0.01	0.01	0.10	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.07	0.45	0.05	0.10	0.08	0.57	0.02	0.08
C2'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.21	0.02	0.14	0.16	0.21	0.10	0.33	0.37	0.17	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.32	0.53	0.17	0.36
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.18	0.00	0.23	0.00	0.24	0.21	0.25	0.19	0.26	0.23	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04
C4	0.08	0.05	0.21	0.18	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.12	0.06	0.09	0.06	0.56	0.13	0.05
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.13	0.01	0.01	0.03	0.09	0.05	0.17	0.03	0.01	0.00	0.17	0.19	0.00
C5	0.05	0.01	0.14	0.23	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.69	0.29	0.03
C5'	0.04	0.10	0.16	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.11	0.09	0.09	0.05	0.05	0.02	0.01	0.11	0.02	0.01	0.32	0.33	0.01
C6	0.08	0.02	0.21	0.24	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.09	0.03	0.07	0.05	0.75	0.24	0.05
C8	0.02	0.04	0.10	0.21	0.01	0.13	0.01	0.11	0.02	0.00	0.05	0.02	0.02	0.00	0.00	0.35	0.07	0.07	0.09	0.55	0.47	0.08
N1	0.15	0.00	0.33	0.25	0.05	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.03	0.07	0.31	0.01	0.08	0.07	0.68	0.11	0.07
N3	0.16	0.01	0.37	0.19	0.01	0.01	0.02	0.09	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.44	0.09	0.10	0.07	0.48	0.00	0.07
N6	0.07	0.03	0.17	0.26	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.00	0.08	0.06	0.03	0.82	0.34	0.04
N7	0.00	0.02	0.02	0.23	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.28	0.09	0.02	0.05	0.70	0.49	0.05
N9	0.01	0.07	0.03	0.15	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.00	0.07	0.05	0.04	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.01	0.45	0.21	0.00
O2'	0.03	0.45	0.00	0.01	0.12	0.17	0.03	0.01	0.09	0.35	0.31	0.44	0.00	0.28	0.11	0.00	0.03	0.13	0.28	0.54	0.18	0.37
O3'	0.23	0.05	0.00	0.00	0.06	0.03	0.03	0.11	0.03	0.07	0.01	0.09	0.08	0.09	0.07	0.03	0.00	0.17	0.12	0.31	0.14	0.12
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.08	0.10	0.06	0.02	0.00	0.13	0.17	0.00	0.01	0.02	0.10	0.05
O5'	0.10	0.08	0.32	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.07	0.07	0.03	0.05	0.01	0.28	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.31	0.57	0.53	0.04	0.56	0.17	0.69	0.32	0.75	0.55	0.68	0.48	0.82	0.70	0.45	0.54	0.31	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.02	0.17	0.02	0.13	0.19	0.29	0.33	0.24	0.47	0.11	0.00	0.34	0.49	0.21	0.18	0.14	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.08	0.36	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.07	0.07	0.04	0.05	0.00	0.37	0.12	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.54	0.57	0.04	0.12	0.37	0.54	0.71	0.75	0.39	1.25	0.21	0.33	0.58	1.23	0.75	0.23	0.17	0.83	1.01	1.50	1.71	1.37
C2	0.31	0.28	0.04	0.10	0.45	0.02	0.52	0.06	0.48	0.54	0.37	0.29	0.51	0.57	0.47	0.25	0.32	0.25	0.15	0.39	0.49	0.29
C2'	0.33	0.66	0.33	0.19	0.22	0.30	0.63	0.55	0.35	1.12	0.28	0.46	0.60	1.17	0.57	0.52	0.54	0.65	0.79	1.35	1.58	1.22
C3'	0.66	0.73	0.00	0.22	0.36	0.78	0.75	1.10	0.34	1.47	0.39	0.40	0.58	1.44	0.85	0.20	0.12	1.09	1.41	1.98	2.30	1.89
C4	0.52	0.16	0.02	0.04	0.63	0.28	0.85	0.38	0.73	1.03	0.42	0.21	0.83	1.07	0.77	0.23	0.26	0.58	0.57	0.91	1.10	0.81
C4'	0.75	0.99	0.19	0.44	0.21	0.98	0.49	1.27	0.01	1.37	0.73	0.55	0.15	1.20	0.80	0.07	0.18	1.22	1.61	2.07	2.43	2.02
C5	0.43	0.50	0.01	0.07	0.73	0.08	0.96	0.16	0.95	0.95	0.74	0.45	1.06	1.08	0.73	0.29	0.39	0.39	0.36	0.64	0.90	0.58
C5'	0.75	0.96	0.24	0.47	0.21	1.00	0.46	1.27	0.03	1.32	0.73	0.52	0.11	1.15	0.78	0.15	0.24	1.21	1.64	2.05	2.46	2.03
C6	0.29	0.72	0.06	0.19	0.71	0.15	0.87	0.12	0.94	0.71	0.88	0.60	1.02	0.86	0.59	0.34	0.50	0.15	0.05	0.25	0.50	0.21
C8	0.55	0.19	0.03	0.06	0.72	0.33	1.05	0.48	0.94	1.23	0.54	0.23	1.13	1.34	0.86	0.24	0.28	0.65	0.73	1.13	1.41	1.04
N1	0.19	0.62	0.10	0.24	0.56	0.23	0.64	0.22	0.71	0.48	0.70	0.53	0.75	0.60	0.43	0.36	0.50	0.03	0.09	0.09	0.27	0.03
N3	0.52	0.04	0.04	0.08	0.47	0.33	0.61	0.41	0.44	0.86	0.16	0.06	0.50	0.82	0.67	0.15	0.17	0.59	0.54	0.86	0.95	0.74
N6	0.22	0.92	0.08	0.27	0.76	0.29	0.92	0.30	1.08	0.66	1.08	0.73	1.17	0.86	0.56	0.36	0.59	0.02	0.11	0.02	0.34	0.02
N7	0.47	0.48	0.00	0.04	0.78	0.15	1.07	0.25	1.06	1.10	0.79	0.43	1.23	1.25	0.80	0.29	0.38	0.47	0.49	0.81	1.11	0.75
N9	0.57	0.05	0.03	0.11	0.61	0.42	0.92	0.58	0.73	1.22	0.28	0.06	0.89	1.27	0.84	0.21	0.20	0.73	0.82	1.23	1.46	1.12
O2'	0.08	0.74	0.55	0.43	0.06	0.03	0.50	0.28	0.28	0.88	0.34	0.58	0.59	1.01	0.35	0.71	0.77	0.38	0.43	1.11	1.17	0.88
O3'	1.05	0.48	0.37	0.62	0.70	1.23	1.09	1.60	0.60	1.91	0.18	0.08	0.82	1.86	1.23	0.16	0.26	1.54	1.88	2.54	2.79	2.41
O4'	0.75	0.84	0.24	0.45	0.27	0.91	0.53	1.13	0.08	1.31	0.56	0.45	0.22	1.15	0.81	0.12	0.22	1.14	1.44	1.84	2.14	1.77
O5'	0.71	0.62	0.19	0.36	0.37	0.81	0.67	1.05	0.30	1.34	0.34	0.30	0.48	1.26	0.83	0.04	0.08	1.06	1.42	1.81	2.24	1.80
OP1	0.89	0.34	0.48	0.59	0.56	0.97	0.80	1.14	0.44	1.39	0.13	0.02	0.57	1.31	0.97	0.40	0.37	1.16	1.46	1.85	2.20	1.79
OP2	0.71	0.58	0.19	0.36	0.37	0.84	0.66	1.09	0.29	1.32	0.31	0.29	0.47	1.24	0.82	0.04	0.08	1.08	1.53	1.79	2.39	1.89
P	0.64	0.62	0.16	0.32	0.33	0.74	0.63	0.97	0.27	1.26	0.34	0.32	0.46	1.20	0.76	0.02	0.06	0.97	1.37	1.73	2.21	1.74

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.40	0.21	0.13
C2	0.04	0.00	0.15	0.22	0.02	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.27	0.04	0.15	0.73	0.01	0.12
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.10	0.17	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.17	0.11	0.08
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.06	0.21	0.16	0.21	0.02	0.15	0.04	0.02	0.01	0.01	0.33	0.01	0.32	0.22
C4	0.01	0.02	0.07	0.09	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.17	0.66	0.03	0.10
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.06	0.08	0.02	0.07	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.72	0.04	0.06
C5'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.06	0.13	0.11	0.11	0.05	0.08	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.02	0.24	0.78	0.08	0.07
C8	0.00	0.02	0.11	0.21	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.23	0.01	0.28	0.55	0.05	0.02
N1	0.04	0.00	0.10	0.16	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.08	0.19	0.04	0.20	0.78	0.07	0.09
N3	0.04	0.00	0.17	0.21	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.25	0.04	0.12	0.66	0.04	0.12
N6	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.26	0.82	0.12	0.07
N7	0.00	0.01	0.08	0.15	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.01	0.31	0.66	0.05	0.01
N9	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.16	0.55	0.10	0.09
O2'	0.00	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.11	0.02	0.04	0.00	0.00	0.03	0.03	0.11	0.04	0.01	0.06
O3'	0.02	0.27	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.06	0.23	0.19	0.25	0.01	0.18	0.06	0.03	0.00	0.01	0.36	0.27	0.49	0.36
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.16	0.41	0.39	0.24
O5'	0.03	0.15	0.20	0.33	0.17	0.01	0.24	0.01	0.24	0.28	0.20	0.12	0.26	0.31	0.16	0.11	0.36	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.40	0.73	0.17	0.01	0.66	0.11	0.72	0.06	0.78	0.55	0.78	0.66	0.82	0.66	0.55	0.04	0.27	0.41	0.00	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.01	0.11	0.32	0.03	0.07	0.04	0.00	0.08	0.05	0.07	0.04	0.12	0.05	0.10	0.01	0.49	0.39	0.00	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.12	0.08	0.22	0.10	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.09	0.12	0.07	0.01	0.09	0.06	0.36	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00