Doublet Group distance statistics: 50481

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.000, 0.031, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.086 std_dev=0.086
C1'	B	0, 0.000, 0.361, 0.723, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.361 std_dev=0.361
N9	B	0, 0.000, 0.457, 0.914, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.457 std_dev=0.457
C2'	B	0, 0.000, 0.522, 1.043, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.522 std_dev=0.522
O4'	A	0, 0.000, 0.546, 1.092, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.546 std_dev=0.546
O4'	B	0, 0.000, 0.556, 1.112, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.556 std_dev=0.556
O2'	A	0, 0.000, 0.622, 1.243, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.622 std_dev=0.622
C2'	A	0, 0.000, 0.703, 1.405, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.703 std_dev=0.703
C8	B	0, 0.000, 0.764, 1.527, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.764 std_dev=0.764
O2'	B	0, 0.000, 0.864, 1.729, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.864 std_dev=0.864
C4	B	0, 0.000, 0.955, 1.910, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.955 std_dev=0.955
N3	B	0, 0.000, 1.175, 2.351, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.175 std_dev=1.175
N7	B	0, 0.000, 1.231, 2.462, 2.462 max_d=2.462 avg_d=1.231 std_dev=1.231
C4'	B	0, 0.000, 1.287, 2.574, 2.574 max_d=2.574 avg_d=1.287 std_dev=1.287
C4'	A	0, 0.000, 1.316, 2.631, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.316 std_dev=1.316
C5	B	0, 0.000, 1.328, 2.656, 2.656 max_d=2.656 avg_d=1.328 std_dev=1.328
O5'	B	0, 0.000, 1.367, 2.733, 2.733 max_d=2.733 avg_d=1.367 std_dev=1.367
C3'	A	0, 0.000, 1.444, 2.888, 2.888 max_d=2.888 avg_d=1.444 std_dev=1.444
C5'	B	0, 0.000, 1.498, 2.996, 2.996 max_d=2.996 avg_d=1.498 std_dev=1.498
C3'	B	0, 0.000, 1.598, 3.195, 3.195 max_d=3.195 avg_d=1.598 std_dev=1.598
OP2	A	0, 0.000, 1.659, 3.319, 3.319 max_d=3.319 avg_d=1.659 std_dev=1.659
C2	B	0, 0.000, 1.671, 3.341, 3.341 max_d=3.341 avg_d=1.671 std_dev=1.671
O5'	A	0, 0.000, 1.687, 3.375, 3.375 max_d=3.375 avg_d=1.687 std_dev=1.687
P	A	0, 0.000, 1.793, 3.586, 3.586 max_d=3.586 avg_d=1.793 std_dev=1.793
O3'	A	0, 0.000, 1.795, 3.590, 3.590 max_d=3.590 avg_d=1.795 std_dev=1.795
C5'	A	0, 0.000, 1.816, 3.631, 3.631 max_d=3.631 avg_d=1.816 std_dev=1.816
C6	B	0, 0.000, 1.850, 3.700, 3.700 max_d=3.700 avg_d=1.850 std_dev=1.850
P	B	0, 0.000, 1.975, 3.950, 3.950 max_d=3.950 avg_d=1.975 std_dev=1.975
N1	B	0, 0.000, 1.984, 3.968, 3.968 max_d=3.968 avg_d=1.984 std_dev=1.984
N6	B	0, 0.000, 2.276, 4.551, 4.551 max_d=4.551 avg_d=2.276 std_dev=2.276
OP1	A	0, 0.000, 2.391, 4.782, 4.782 max_d=4.782 avg_d=2.391 std_dev=2.391
OP2	B	0, 0.000, 2.403, 4.806, 4.806 max_d=4.806 avg_d=2.403 std_dev=2.403
O3'	B	0, 0.000, 2.520, 5.039, 5.039 max_d=5.039 avg_d=2.520 std_dev=2.520
OP1	B	0, 0.000, 2.754, 5.509, 5.509 max_d=5.509 avg_d=2.754 std_dev=2.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.26	0.21	0.96	0.40
C2	0.03	0.00	0.30	0.68	0.01	0.56	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.39	1.02	0.23	0.66	0.44	1.08	0.67
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.12	0.02	0.02	0.02	0.09	0.20	0.21	0.30	0.02	0.12	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.08	0.50	0.03
C3'	0.01	0.68	0.00	0.00	0.34	0.01	0.22	0.03	0.35	0.16	0.55	0.63	0.27	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.26	0.27	0.06	0.36
C4	0.00	0.01	0.12	0.34	0.00	0.26	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.25	0.57	0.10	0.41	0.19	1.04	0.48
C4'	0.00	0.56	0.02	0.01	0.26	0.00	0.13	0.01	0.24	0.21	0.44	0.53	0.16	0.10	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.07	0.23	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.22	0.00	0.13	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.23	0.52	0.01	0.29	0.01	1.02	0.39
C5'	0.05	0.42	0.02	0.03	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.41	0.25	0.41	0.12	0.35	0.09	0.03	0.05	0.00	0.01	0.06	0.23	0.02
C6	0.01	0.00	0.09	0.35	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.29	0.72	0.06	0.39	0.06	1.04	0.45
C8	0.01	0.01	0.20	0.16	0.01	0.21	0.01	0.41	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.06	0.17	0.02	0.23	0.95	0.19
N1	0.01	0.00	0.21	0.55	0.01	0.44	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.37	0.93	0.16	0.56	0.28	1.08	0.59
N3	0.02	0.00	0.30	0.63	0.00	0.53	0.01	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.90	0.24	0.62	0.44	1.06	0.64
N6	0.03	0.01	0.02	0.27	0.02	0.16	0.03	0.12	0.00	0.06	0.02	0.01	0.00	0.07	0.04	0.26	0.68	0.01	0.29	0.09	0.99	0.36
N7	0.01	0.01	0.12	0.03	0.01	0.10	0.01	0.35	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.12	0.26	0.11	0.08	0.24	0.97	0.22
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.20	0.02	0.24	0.06	1.00	0.37
O2'	0.01	0.39	0.01	0.00	0.25	0.01	0.23	0.03	0.29	0.03	0.37	0.35	0.26	0.12	0.10	0.00	0.02	0.01	0.09	0.16	0.37	0.15
O3'	0.07	1.02	0.01	0.01	0.57	0.03	0.52	0.05	0.72	0.06	0.93	0.90	0.68	0.26	0.20	0.02	0.00	0.02	0.35	0.34	0.34	0.49
O4'	0.01	0.23	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.06	0.17	0.16	0.24	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.31	0.19	0.87	0.43
O5'	0.26	0.66	0.03	0.26	0.41	0.03	0.29	0.01	0.39	0.02	0.56	0.62	0.29	0.08	0.24	0.09	0.35	0.31	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.44	0.08	0.27	0.19	0.07	0.01	0.06	0.06	0.23	0.28	0.44	0.09	0.24	0.06	0.16	0.34	0.19	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.96	1.08	0.50	0.06	1.04	0.23	1.02	0.23	1.04	0.95	1.08	1.06	0.99	0.97	1.00	0.37	0.34	0.87	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.40	0.67	0.03	0.36	0.48	0.04	0.39	0.02	0.45	0.19	0.59	0.64	0.36	0.22	0.37	0.15	0.49	0.43	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.48	0.12	0.14	0.38	0.07	0.49	0.22	0.60	0.31	0.59	0.38	0.68	0.45	0.25	0.25	0.06	0.11	0.80	1.45	1.50	1.30
C2	0.06	0.64	0.01	0.17	0.52	0.27	0.65	0.15	0.76	0.36	0.76	0.51	0.81	0.55	0.30	0.09	0.52	0.12	0.27	0.64	1.27	0.77
C2'	0.57	0.58	0.59	0.73	0.61	0.67	0.66	0.87	0.67	0.64	0.63	0.56	0.70	0.69	0.58	0.69	0.61	0.59	1.37	2.13	1.90	1.84
C3'	1.10	1.01	1.10	1.23	1.04	1.20	1.01	1.32	0.99	1.01	0.99	1.03	0.94	0.99	1.03	1.28	1.16	1.13	1.89	2.36	2.09	2.18
C4	0.08	0.58	0.04	0.03	0.46	0.12	0.64	0.05	0.78	0.39	0.75	0.43	0.89	0.59	0.28	0.11	0.36	0.04	0.54	1.12	1.55	1.11
C4'	0.93	1.01	0.90	0.92	0.96	0.91	0.95	0.98	0.98	0.87	1.01	0.99	0.95	0.89	0.90	1.13	0.81	0.93	1.64	1.97	1.89	1.89
C5	0.02	0.65	0.01	0.10	0.50	0.20	0.75	0.01	0.95	0.45	0.89	0.44	1.11	0.71	0.29	0.02	0.51	0.11	0.45	1.09	1.56	1.06
C5'	0.90	0.85	0.91	0.97	0.86	0.96	0.85	1.09	0.85	0.83	0.85	0.86	0.83	0.83	0.84	1.15	0.87	0.93	1.78	2.21	1.94	2.01
C6	0.01	0.76	0.02	0.18	0.58	0.28	0.86	0.07	1.09	0.49	1.04	0.51	1.23	0.77	0.32	0.04	0.65	0.17	0.29	0.87	1.45	0.90
C8	0.06	0.54	0.04	0.01	0.43	0.08	0.65	0.14	0.82	0.41	0.75	0.37	0.99	0.63	0.26	0.08	0.33	0.03	0.64	1.39	1.63	1.25
N1	0.01	0.78	0.04	0.23	0.61	0.34	0.81	0.16	0.99	0.45	0.97	0.56	1.06	0.70	0.32	0.02	0.68	0.20	0.19	0.65	1.29	0.74
N3	0.10	0.56	0.04	0.06	0.45	0.14	0.56	0.02	0.67	0.32	0.66	0.44	0.73	0.49	0.26	0.16	0.33	0.02	0.48	0.90	1.41	0.99
N6	0.01	0.86	0.00	0.19	0.62	0.30	0.95	0.07	1.26	0.54	1.22	0.53	1.45	0.86	0.34	0.08	0.72	0.18	0.25	0.85	1.43	0.87
N7	0.02	0.59	0.01	0.06	0.46	0.16	0.73	0.07	0.94	0.45	0.86	0.38	1.14	0.71	0.27	0.01	0.47	0.09	0.53	1.26	1.63	1.17
N9	0.10	0.53	0.07	0.04	0.42	0.04	0.58	0.15	0.72	0.37	0.68	0.39	0.84	0.55	0.26	0.15	0.24	0.02	0.67	1.35	1.59	1.25
O2'	0.59	0.59	0.61	0.81	0.63	0.71	0.69	0.90	0.70	0.69	0.65	0.58	0.72	0.73	0.61	0.66	0.70	0.60	1.23	2.02	1.89	1.72
O3'	1.46	1.39	1.42	1.51	1.40	1.49	1.31	1.49	1.29	1.28	1.34	1.43	1.20	1.24	1.37	1.62	1.47	1.48	2.03	2.08	2.10	2.19
O4'	0.45	0.75	0.39	0.35	0.64	0.31	0.70	0.42	0.79	0.53	0.81	0.66	0.84	0.63	0.51	0.58	0.15	0.40	1.09	1.56	1.64	1.49
O5'	0.98	1.12	0.93	0.92	1.01	0.92	0.96	0.94	1.01	0.84	1.09	1.09	0.97	0.85	0.91	1.22	0.84	0.96	1.62	1.88	1.76	1.78
OP1	0.84	0.80	0.86	0.92	0.78	0.92	0.74	1.04	0.75	0.72	0.78	0.81	0.71	0.71	0.75	1.13	0.85	0.87	1.71	2.16	1.81	1.90
OP2	1.16	1.49	1.07	1.07	1.31	1.05	1.31	1.07	1.43	1.10	1.51	1.40	1.42	1.18	1.17	1.31	0.98	1.12	1.69	2.06	1.93	1.91
P	0.90	1.05	0.86	0.88	0.93	0.87	0.88	0.92	0.94	0.76	1.03	1.01	0.90	0.78	0.84	1.13	0.80	0.89	1.56	1.92	1.71	1.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.27	0.11	0.31	0.02
C2	0.06	0.00	0.10	0.08	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.39	0.44	0.02	0.18	0.21	0.55	0.23
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.16	0.07	0.01	0.09	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.55	0.51	0.11	0.38
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.12	0.29	0.01	0.09	0.18	0.28	0.13	0.01	0.01	0.00	0.28	0.32	0.17	0.16
C4	0.03	0.02	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.30	0.20	0.01	0.25	0.11	0.44	0.11
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.08	0.17	0.02	0.06	0.13	0.18	0.06	0.16	0.00	0.00	0.01	0.09	0.38	0.06
C5	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.35	0.05	0.03	0.25	0.19	0.40	0.11
C5'	0.05	0.02	0.16	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.09	0.01	0.21	0.20	0.04	0.00	0.12	0.02	0.00	0.11	0.30	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.41	0.13	0.02	0.21	0.28	0.46	0.18
C8	0.01	0.02	0.01	0.29	0.01	0.17	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.21	0.19	0.03	0.38	0.01	0.17	0.12
N1	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.43	0.31	0.00	0.19	0.28	0.53	0.24
N3	0.06	0.01	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.32	0.44	0.03	0.20	0.13	0.51	0.18
N6	0.02	0.01	0.06	0.18	0.01	0.13	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.43	0.04	0.04	0.20	0.34	0.42	0.19
N7	0.00	0.02	0.03	0.28	0.01	0.18	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.16	0.04	0.31	0.13	0.23	0.02
N9	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.17	0.06	0.00	0.32	0.02	0.32	0.01
O2'	0.01	0.39	0.01	0.01	0.30	0.16	0.35	0.00	0.41	0.21	0.43	0.32	0.43	0.30	0.17	0.00	0.00	0.14	0.36	0.42	0.11	0.27
O3'	0.20	0.44	0.02	0.01	0.20	0.00	0.05	0.12	0.13	0.19	0.31	0.44	0.04	0.16	0.06	0.00	0.00	0.13	0.06	0.14	0.26	0.00
O4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.04	0.04	0.00	0.14	0.13	0.00	0.03	0.06	0.51	0.18
O5'	0.27	0.18	0.55	0.28	0.25	0.01	0.25	0.00	0.21	0.38	0.19	0.20	0.20	0.31	0.32	0.36	0.06	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.11	0.21	0.51	0.32	0.11	0.09	0.19	0.11	0.28	0.01	0.28	0.13	0.34	0.13	0.02	0.42	0.14	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.55	0.11	0.17	0.44	0.38	0.40	0.30	0.46	0.17	0.53	0.51	0.42	0.23	0.32	0.11	0.26	0.51	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.23	0.38	0.16	0.11	0.06	0.11	0.01	0.18	0.12	0.24	0.18	0.19	0.02	0.01	0.27	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00