Doublet Group distance statistics: 50483

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.000, 0.061, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.061 std_dev=0.061
C3'	A	0, 0.000, 0.084, 0.168, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.084 std_dev=0.084
C4'	A	0, 0.000, 0.092, 0.183, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.092 std_dev=0.092
O3'	A	0, 0.000, 0.139, 0.279, 0.279 max_d=0.279 avg_d=0.139 std_dev=0.139
C5'	A	0, 0.000, 0.151, 0.301, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.151 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.000, 0.170, 0.339, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.170 std_dev=0.170
C3'	B	0, 0.000, 0.259, 0.518, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.259 std_dev=0.259
O2'	B	0, 0.000, 0.312, 0.624, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.312 std_dev=0.312
C2'	B	0, 0.000, 0.558, 1.115, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.558 std_dev=0.558
C4'	B	0, 0.000, 1.037, 2.074, 2.074 max_d=2.074 avg_d=1.037 std_dev=1.037
OP2	A	0, 0.000, 1.069, 2.139, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.069 std_dev=1.069
O3'	B	0, 0.000, 1.132, 2.265, 2.265 max_d=2.265 avg_d=1.132 std_dev=1.132
C1'	B	0, 0.000, 1.250, 2.501, 2.501 max_d=2.501 avg_d=1.250 std_dev=1.250
O5'	A	0, 0.000, 1.305, 2.611, 2.611 max_d=2.611 avg_d=1.305 std_dev=1.305
O4'	B	0, 0.000, 1.407, 2.813, 2.813 max_d=2.813 avg_d=1.407 std_dev=1.407
O5'	B	0, 0.000, 1.578, 3.157, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.578 std_dev=1.578
C5'	B	0, 0.000, 1.702, 3.404, 3.404 max_d=3.404 avg_d=1.702 std_dev=1.702
C8	B	0, 0.000, 1.824, 3.649, 3.649 max_d=3.649 avg_d=1.824 std_dev=1.824
P	A	0, 0.000, 1.854, 3.707, 3.707 max_d=3.707 avg_d=1.854 std_dev=1.854
N9	B	0, 0.000, 1.863, 3.726, 3.726 max_d=3.726 avg_d=1.863 std_dev=1.863
OP2	B	0, 0.000, 2.176, 4.351, 4.351 max_d=4.351 avg_d=2.176 std_dev=2.176
N7	B	0, 0.000, 2.538, 5.075, 5.075 max_d=5.075 avg_d=2.538 std_dev=2.538
P	B	0, 0.000, 2.687, 5.373, 5.373 max_d=5.373 avg_d=2.687 std_dev=2.687
C4	B	0, 0.000, 2.798, 5.596, 5.596 max_d=5.596 avg_d=2.798 std_dev=2.798
OP1	A	0, 0.000, 2.974, 5.948, 5.948 max_d=5.948 avg_d=2.974 std_dev=2.974
C5	B	0, 0.000, 3.198, 6.397, 6.397 max_d=6.397 avg_d=3.198 std_dev=3.198
N3	B	0, 0.000, 3.309, 6.618, 6.618 max_d=6.618 avg_d=3.309 std_dev=3.309
OP1	B	0, 0.000, 3.951, 7.903, 7.903 max_d=7.903 avg_d=3.951 std_dev=3.951
C6	B	0, 0.000, 4.225, 8.450, 8.450 max_d=8.450 avg_d=4.225 std_dev=4.225
C2	B	0, 0.000, 4.314, 8.629, 8.629 max_d=8.629 avg_d=4.314 std_dev=4.314
N6	B	0, 0.000, 4.688, 9.376, 9.376 max_d=9.376 avg_d=4.688 std_dev=4.688
N1	B	0, 0.000, 4.793, 9.587, 9.587 max_d=9.587 avg_d=4.793 std_dev=4.793

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.36	0.34	0.29
C2	0.03	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.03	0.03	0.46	0.97	0.49	0.63
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.14	0.26	0.22
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.28	0.03	0.20	0.19
C4	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.50	0.99	0.51	0.66
C4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.23	0.16	0.01
C5	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.63	1.34	0.59	0.86
C5'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.05	0.02	0.01	0.05	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.30	0.12	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.02	0.64	1.41	0.61	0.90
C8	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.63	1.23	0.57	0.83
N1	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.10	0.01	0.02	0.57	1.23	0.57	0.78
N3	0.03	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.03	0.03	0.40	0.80	0.45	0.53
N6	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.02	0.71	1.63	0.67	1.02
N7	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02	0.69	1.51	0.63	0.97
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.47	0.85	0.48	0.60
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.01	0.10	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.15	0.20	0.03
O3'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.16	0.41	0.07	0.00
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.17	0.29	0.15
O5'	0.22	0.46	0.25	0.28	0.50	0.00	0.63	0.00	0.64	0.63	0.57	0.40	0.71	0.69	0.47	0.07	0.16	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.36	0.97	0.14	0.03	0.99	0.23	1.34	0.30	1.41	1.23	1.23	0.80	1.63	1.51	0.85	0.15	0.41	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.49	0.26	0.20	0.51	0.16	0.59	0.12	0.61	0.57	0.57	0.45	0.67	0.63	0.48	0.20	0.07	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.29	0.63	0.22	0.19	0.66	0.01	0.86	0.01	0.90	0.83	0.78	0.53	1.02	0.97	0.60	0.03	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.48	0.36	0.07	0.01	0.47	0.28	0.49	0.27	0.46	0.53	0.40	0.40	0.49	0.53	0.50	0.04	0.33	0.59	0.25	0.18	0.04	0.26
C2	0.80	1.10	0.22	0.13	1.05	0.08	1.07	0.11	1.14	0.89	1.14	1.05	1.16	0.98	0.93	0.01	0.65	0.78	0.04	0.48	0.33	0.18
C2'	0.48	0.11	0.03	0.02	0.33	0.45	0.36	0.52	0.28	0.52	0.16	0.19	0.31	0.47	0.45	0.07	0.32	0.71	0.45	0.60	0.25	0.56
C3'	0.48	0.12	0.02	0.02	0.34	0.45	0.37	0.54	0.29	0.53	0.16	0.20	0.32	0.48	0.46	0.06	0.32	0.72	0.47	0.65	0.26	0.60
C4	0.68	0.96	0.16	0.09	0.90	0.14	0.93	0.03	0.99	0.77	1.00	0.91	1.02	0.86	0.80	0.01	0.55	0.69	0.06	0.30	0.23	0.04
C4'	0.44	0.14	0.05	0.04	0.33	0.38	0.36	0.43	0.28	0.48	0.17	0.21	0.31	0.45	0.43	0.03	0.23	0.62	0.39	0.48	0.19	0.47
C5	0.76	1.31	0.21	0.11	1.14	0.08	1.19	0.10	1.32	0.91	1.37	1.20	1.36	1.06	0.95	0.02	0.61	0.70	0.04	0.59	0.39	0.21
C5'	0.45	0.26	0.05	0.01	0.41	0.34	0.44	0.38	0.39	0.52	0.29	0.31	0.42	0.50	0.47	0.03	0.28	0.61	0.34	0.37	0.12	0.41
C6	0.84	1.58	0.26	0.13	1.35	0.01	1.41	0.23	1.58	1.03	1.65	1.43	1.63	1.23	1.09	0.05	0.66	0.72	0.14	0.85	0.54	0.38
C8	0.64	1.00	0.15	0.08	0.90	0.15	0.94	0.05	1.02	0.76	1.04	0.93	1.06	0.86	0.78	0.00	0.50	0.64	0.07	0.31	0.25	0.03
N1	0.86	1.49	0.26	0.15	1.32	0.01	1.37	0.27	1.51	1.04	1.55	1.37	1.55	1.22	1.09	0.04	0.68	0.75	0.16	0.83	0.52	0.39
N3	0.67	0.79	0.15	0.10	0.80	0.17	0.82	0.06	0.84	0.72	0.82	0.77	0.87	0.78	0.74	0.02	0.56	0.71	0.08	0.19	0.17	0.01
N6	0.88	1.88	0.31	0.12	1.54	0.03	1.63	0.31	1.87	1.14	1.98	1.65	1.94	1.41	1.20	0.08	0.66	0.71	0.21	1.08	0.66	0.52
N7	0.73	1.30	0.20	0.10	1.11	0.09	1.17	0.07	1.30	0.88	1.36	1.18	1.35	1.04	0.92	0.02	0.57	0.67	0.02	0.56	0.38	0.18
N9	0.60	0.76	0.12	0.07	0.75	0.19	0.78	0.12	0.81	0.68	0.80	0.74	0.85	0.74	0.69	0.02	0.47	0.64	0.13	0.13	0.14	0.07
O2'	0.40	0.21	0.03	0.14	0.12	0.56	0.15	0.67	0.00	0.42	0.17	0.08	0.04	0.32	0.32	0.02	0.09	0.69	0.59	0.90	0.46	0.75
O3'	0.44	0.12	0.00	0.06	0.19	0.55	0.22	0.71	0.08	0.48	0.09	0.00	0.11	0.39	0.38	0.07	0.25	0.75	0.62	0.98	0.44	0.83
O4'	0.44	0.32	0.07	0.00	0.43	0.26	0.46	0.26	0.43	0.49	0.35	0.36	0.45	0.50	0.46	0.03	0.27	0.54	0.24	0.17	0.04	0.26
O5'	0.28	0.31	0.07	0.21	0.33	0.01	0.33	0.06	0.33	0.30	0.32	0.32	0.35	0.32	0.31	0.11	0.49	0.32	0.07	0.14	0.38	0.07
OP1	0.05	0.03	0.31	0.45	0.02	0.30	0.02	0.40	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.32	0.65	0.05	0.41	0.52	0.77	0.43
OP2	0.07	0.18	0.26	0.37	0.18	0.18	0.20	0.22	0.23	0.15	0.21	0.16	0.26	0.19	0.14	0.33	0.62	0.11	0.22	0.39	0.51	0.25
P	0.16	0.24	0.15	0.29	0.23	0.11	0.24	0.19	0.26	0.18	0.25	0.24	0.28	0.21	0.20	0.18	0.54	0.17	0.20	0.31	0.53	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.23	0.06	0.13
C2	0.07	0.00	0.22	0.19	0.00	0.08	0.04	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.22	0.24	0.01	0.06	0.24	0.20	0.13
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.11	0.01	0.06	0.00	0.10	0.07	0.18	0.21	0.06	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.12	0.14	0.05
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.07	0.15	0.18	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.29	0.12	0.14
C4	0.03	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.02	0.05	0.24	0.18	0.14
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.09	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.04	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.00	0.20	0.28	0.10
C5'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.02	0.05	0.13	0.11	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.10	0.11	0.01
C6	0.02	0.03	0.10	0.08	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.12	0.05	0.02	0.17	0.33	0.07
C8	0.04	0.03	0.07	0.07	0.01	0.07	0.01	0.09	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.08	0.04	0.00	0.22	0.22	0.13
N1	0.05	0.01	0.18	0.15	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.18	0.20	0.03	0.02	0.20	0.28	0.10
N3	0.07	0.01	0.21	0.18	0.00	0.09	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.20	0.21	0.01	0.09	0.27	0.13	0.17
N6	0.01	0.04	0.06	0.04	0.01	0.05	0.02	0.13	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.07	0.08	0.07	0.11	0.43	0.01
N7	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.07	0.01	0.11	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.18	0.32	0.08
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.26	0.13	0.16
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.08	0.03	0.05	0.04	0.09	0.07	0.18	0.20	0.06	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.10	0.06	0.04
O3'	0.03	0.24	0.03	0.01	0.11	0.01	0.07	0.02	0.12	0.08	0.20	0.21	0.07	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.10	0.58	0.10	0.26
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.39	0.04	0.21
O5'	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.09	0.07	0.04	0.05	0.01	0.10	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.23	0.24	0.12	0.29	0.24	0.05	0.20	0.10	0.17	0.22	0.20	0.27	0.11	0.18	0.26	0.10	0.58	0.39	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.20	0.14	0.12	0.18	0.02	0.28	0.11	0.33	0.22	0.28	0.13	0.43	0.32	0.13	0.06	0.10	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.05	0.14	0.14	0.02	0.10	0.01	0.07	0.13	0.10	0.17	0.01	0.08	0.16	0.04	0.26	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00