Doublet Group distance statistics: 50492

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 9, 3, 3, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.039, 0.050, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.050 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.022, 0.036, 0.049, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.041, 0.055, 0.070, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.055 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.029, 0.043, 0.058, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.043 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.032, 0.049, 0.067, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.049 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.030, 0.049, 0.069, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.049 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.049, 0.072, 0.095, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.072 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.026, 0.052, 0.078, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.052 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.043, 0.087, 0.131, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.087 std_dev=0.044
N6	A	0, 0.121, 0.170, 0.219, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.170 std_dev=0.049
C8	A	0, 0.042, 0.093, 0.143, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.093 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.075, 0.176, 0.277, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.176 std_dev=0.101
C2'	A	0, 0.140, 0.262, 0.384, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.262 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.081, 0.221, 0.361, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.221 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.251, 0.439, 0.628, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.439 std_dev=0.188
C3'	A	0, 0.202, 0.397, 0.592, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.397 std_dev=0.195
O2'	B	0, 0.242, 0.448, 0.654, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.448 std_dev=0.206
C2'	B	0, 0.193, 0.403, 0.613, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.403 std_dev=0.210
C1'	B	0, 0.210, 0.480, 0.750, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.480 std_dev=0.270
C5'	A	0, 0.212, 0.486, 0.759, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.486 std_dev=0.273
C3'	B	0, 0.242, 0.518, 0.794, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.518 std_dev=0.276
O4'	B	0, 0.258, 0.570, 0.881, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.570 std_dev=0.311
C4'	B	0, 0.270, 0.582, 0.895, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.582 std_dev=0.312
O3'	B	0, 0.438, 0.760, 1.083, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.760 std_dev=0.323
O3'	A	0, 0.348, 0.696, 1.044, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.696 std_dev=0.348
C5'	B	0, 0.327, 0.752, 1.176, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.752 std_dev=0.425
N9	B	0, 0.334, 0.760, 1.186, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.760 std_dev=0.426
OP1	A	0, 0.553, 1.068, 1.582, 2.825 max_d=2.825 avg_d=1.068 std_dev=0.514
O5'	B	0, 0.224, 0.746, 1.268, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.746 std_dev=0.522
C8	B	0, 0.424, 0.982, 1.541, 2.291 max_d=2.291 avg_d=0.982 std_dev=0.559
C4	B	0, 0.416, 0.981, 1.545, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.981 std_dev=0.564
N3	B	0, 0.378, 0.964, 1.550, 2.464 max_d=2.464 avg_d=0.964 std_dev=0.586
O5'	A	0, 0.533, 1.193, 1.853, 3.204 max_d=3.204 avg_d=1.193 std_dev=0.660
P	B	0, 0.223, 0.903, 1.583, 2.357 max_d=2.357 avg_d=0.903 std_dev=0.680
P	A	0, 0.716, 1.406, 2.095, 3.349 max_d=3.349 avg_d=1.406 std_dev=0.689
N7	B	0, 0.536, 1.273, 2.009, 3.045 max_d=3.045 avg_d=1.273 std_dev=0.737
C5	B	0, 0.550, 1.290, 2.029, 3.105 max_d=3.105 avg_d=1.290 std_dev=0.739
C2	B	0, 0.522, 1.290, 2.059, 3.231 max_d=3.231 avg_d=1.290 std_dev=0.769
OP1	B	0, 0.297, 1.080, 1.863, 2.821 max_d=2.821 avg_d=1.080 std_dev=0.783
N2	B	0, 0.558, 1.398, 2.238, 3.530 max_d=3.530 avg_d=1.398 std_dev=0.840
N1	B	0, 0.668, 1.589, 2.510, 3.872 max_d=3.872 avg_d=1.589 std_dev=0.921
OP2	B	0, 0.058, 0.991, 1.925, 3.200 max_d=3.200 avg_d=0.991 std_dev=0.934
C6	B	0, 0.671, 1.606, 2.541, 3.900 max_d=3.900 avg_d=1.606 std_dev=0.935
OP2	A	0, 1.001, 1.948, 2.895, 3.665 max_d=3.665 avg_d=1.948 std_dev=0.947
O6	B	0, 0.825, 1.950, 3.075, 4.675 max_d=4.675 avg_d=1.950 std_dev=1.125

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.10	0.36	0.13
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.30	0.23	0.30	0.27
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.01	0.07	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.03	0.01	0.02	0.01	0.15	0.12	0.25	0.11
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.13	0.10	0.10	0.12	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.19	0.20	0.17	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.33	0.24	0.28	0.28
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.33	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.44	0.33	0.34	0.39
C5'	0.03	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.15	0.09	0.05	0.15	0.16	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.12	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.44	0.36	0.37	0.42
C8	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.15	0.04	0.46	0.31	0.28	0.37
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.38	0.31	0.34	0.35
N3	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.04	0.25	0.19	0.29	0.22
N6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.17	0.04	0.50	0.43	0.44	0.49
N7	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.17	0.04	0.50	0.38	0.38	0.46
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.32	0.21	0.27	0.24
O2'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.08	0.10	0.06	0.07	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.10	0.35	0.14
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.14	0.15	0.14	0.12	0.17	0.17	0.06	0.04	0.00	0.02	0.14	0.25	0.19	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.11	0.47	0.16
O5'	0.14	0.30	0.15	0.19	0.33	0.02	0.44	0.01	0.44	0.46	0.38	0.25	0.50	0.50	0.32	0.05	0.14	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.23	0.12	0.20	0.24	0.08	0.33	0.12	0.36	0.31	0.31	0.19	0.43	0.38	0.21	0.10	0.25	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.30	0.25	0.17	0.28	0.33	0.34	0.22	0.37	0.28	0.34	0.29	0.44	0.38	0.27	0.35	0.19	0.47	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.27	0.11	0.12	0.28	0.09	0.39	0.02	0.42	0.37	0.35	0.22	0.49	0.46	0.24	0.14	0.11	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.79	0.19	0.16	0.60	0.17	0.67	0.19	0.78	0.45	0.83	0.84	0.67	0.57	0.45	0.22	0.27	0.18	0.15	0.82	0.29	0.22	0.15
C2	0.18	0.39	0.16	0.14	0.33	0.17	0.36	0.16	0.40	0.27	0.41	0.41	0.35	0.33	0.26	0.24	0.22	0.12	0.14	0.42	0.24	0.16	0.13
C2'	0.37	0.90	0.27	0.22	0.70	0.21	0.74	0.23	0.86	0.52	0.93	0.97	0.78	0.63	0.53	0.25	0.31	0.27	0.20	0.88	0.32	0.24	0.19
C3'	0.39	0.93	0.30	0.25	0.70	0.24	0.74	0.26	0.87	0.51	0.96	1.03	0.80	0.62	0.54	0.28	0.34	0.29	0.22	0.90	0.37	0.24	0.22
C4	0.21	0.57	0.16	0.14	0.45	0.16	0.49	0.18	0.56	0.33	0.59	0.61	0.50	0.42	0.33	0.23	0.25	0.13	0.15	0.58	0.33	0.15	0.14
C4'	0.33	0.90	0.24	0.20	0.67	0.20	0.73	0.22	0.87	0.49	0.95	0.98	0.75	0.62	0.49	0.23	0.30	0.23	0.17	0.92	0.33	0.22	0.17
C5	0.17	0.49	0.14	0.16	0.37	0.18	0.40	0.22	0.47	0.27	0.51	0.53	0.42	0.35	0.26	0.23	0.28	0.10	0.21	0.50	0.42	0.14	0.20
C5'	0.33	0.89	0.25	0.19	0.66	0.18	0.71	0.20	0.85	0.47	0.93	0.98	0.74	0.60	0.48	0.24	0.29	0.22	0.15	0.90	0.33	0.21	0.15
C6	0.15	0.37	0.15	0.18	0.28	0.20	0.31	0.23	0.37	0.22	0.38	0.40	0.32	0.29	0.20	0.24	0.28	0.11	0.25	0.39	0.45	0.17	0.24
C8	0.22	0.65	0.15	0.15	0.48	0.17	0.52	0.21	0.62	0.34	0.67	0.70	0.55	0.44	0.34	0.22	0.29	0.12	0.18	0.65	0.41	0.14	0.18
N1	0.15	0.32	0.15	0.17	0.26	0.19	0.29	0.20	0.33	0.22	0.34	0.34	0.28	0.28	0.20	0.24	0.25	0.12	0.22	0.35	0.36	0.15	0.19
N3	0.23	0.54	0.17	0.14	0.45	0.16	0.49	0.16	0.54	0.36	0.57	0.56	0.49	0.44	0.35	0.23	0.23	0.16	0.13	0.56	0.24	0.19	0.13
N6	0.14	0.31	0.16	0.21	0.23	0.22	0.27	0.28	0.32	0.22	0.32	0.34	0.27	0.28	0.18	0.24	0.31	0.13	0.33	0.35	0.56	0.24	0.33
N7	0.18	0.55	0.14	0.16	0.40	0.18	0.44	0.23	0.52	0.28	0.56	0.60	0.46	0.37	0.28	0.23	0.30	0.10	0.22	0.55	0.47	0.14	0.22
N9	0.24	0.68	0.16	0.14	0.52	0.16	0.57	0.19	0.66	0.38	0.71	0.73	0.58	0.48	0.38	0.22	0.26	0.14	0.15	0.69	0.34	0.16	0.14
O2'	0.39	1.01	0.27	0.22	0.78	0.21	0.84	0.22	0.98	0.59	1.05	1.07	0.86	0.73	0.59	0.23	0.29	0.28	0.21	1.02	0.26	0.29	0.20
O3'	0.45	1.04	0.37	0.31	0.78	0.30	0.81	0.32	0.96	0.56	1.06	1.16	0.89	0.68	0.60	0.34	0.40	0.35	0.28	0.99	0.41	0.28	0.27
O4'	0.27	0.81	0.19	0.16	0.61	0.17	0.68	0.19	0.81	0.44	0.87	0.87	0.67	0.58	0.44	0.21	0.27	0.17	0.14	0.86	0.30	0.22	0.15
O5'	0.37	0.89	0.32	0.28	0.65	0.29	0.68	0.31	0.81	0.44	0.91	0.99	0.75	0.55	0.48	0.35	0.39	0.27	0.27	0.84	0.45	0.30	0.31
OP1	0.38	0.91	0.31	0.26	0.67	0.26	0.72	0.27	0.87	0.48	0.96	1.01	0.77	0.61	0.50	0.33	0.38	0.27	0.22	0.92	0.41	0.27	0.24
OP2	0.50	0.99	0.43	0.35	0.77	0.33	0.81	0.32	0.94	0.59	1.02	1.08	0.87	0.70	0.61	0.44	0.41	0.39	0.28	0.98	0.43	0.30	0.28
P	0.41	0.92	0.35	0.30	0.69	0.30	0.73	0.30	0.87	0.50	0.95	1.01	0.78	0.61	0.53	0.37	0.39	0.31	0.25	0.91	0.41	0.29	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.03	0.06	0.10	0.06
C2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.07	0.04	0.10	0.02	0.11	0.19	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.08	0.13	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.06	0.08	0.06	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.10	0.09	0.10	0.14	0.08
C4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.10	0.02	0.10	0.16	0.13
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.04	0.05	0.03	0.09	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.14	0.02	0.14	0.19	0.18
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.09	0.06	0.05	0.14	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.14	0.06	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.09	0.03	0.15	0.01	0.16	0.22	0.20
C8	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.04	0.14	0.03	0.12	0.12	0.15
N1	0.03	0.01	0.05	0.06	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.07	0.03	0.13	0.02	0.14	0.22	0.18
N2	0.05	0.00	0.08	0.08	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.15	0.10	0.05	0.10	0.03	0.11	0.20	0.14
N3	0.04	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.07	0.04	0.09	0.02	0.09	0.16	0.12
N7	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.13	0.04	0.17	0.03	0.16	0.18	0.20
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.03	0.08	0.12	0.10
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.03	0.10	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.11	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.09	0.02	0.09	0.12	0.07	0.10	0.07	0.13	0.05	0.06	0.00	0.02	0.14	0.11	0.15	0.19	0.13
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.04	0.08	0.11	0.08
O5'	0.06	0.10	0.05	0.10	0.10	0.02	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.10	0.09	0.17	0.09	0.04	0.14	0.09	0.00	0.18	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.03	0.09	0.02	0.08	0.02	0.14	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.11	0.04	0.18	0.00	0.19	0.25	0.23
OP1	0.06	0.11	0.08	0.10	0.10	0.05	0.14	0.06	0.16	0.12	0.14	0.11	0.09	0.16	0.08	0.07	0.15	0.08	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.19	0.13	0.14	0.16	0.06	0.19	0.05	0.22	0.12	0.22	0.20	0.16	0.18	0.12	0.11	0.19	0.11	0.02	0.25	0.02	0.00	0.02
P	0.06	0.15	0.06	0.08	0.13	0.02	0.18	0.01	0.20	0.15	0.18	0.14	0.12	0.20	0.10	0.04	0.13	0.08	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00