Doublet Group distance statistics: 50494

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 4, 7, 2, 1, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.001, 0.014, 0.028, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.009, 0.027, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.017
O2'	B	0, 0.161, 0.375, 0.588, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.375 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.152, 0.393, 0.634, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.393 std_dev=0.241
C3'	B	0, -0.067, 0.410, 0.887, 2.458 max_d=2.458 avg_d=0.410 std_dev=0.477
O4'	A	0, -0.304, 0.198, 0.700, 2.489 max_d=2.489 avg_d=0.198 std_dev=0.502
C4'	A	0, -0.270, 0.256, 0.781, 2.633 max_d=2.633 avg_d=0.256 std_dev=0.525
C1'	B	0, -0.090, 0.460, 1.010, 2.795 max_d=2.795 avg_d=0.460 std_dev=0.550
C2'	A	0, -0.318, 0.233, 0.783, 2.740 max_d=2.740 avg_d=0.233 std_dev=0.551
C3'	A	0, -0.335, 0.295, 0.925, 3.149 max_d=3.149 avg_d=0.295 std_dev=0.630
N9	B	0, -0.133, 0.521, 1.176, 3.288 max_d=3.288 avg_d=0.521 std_dev=0.654
O3'	B	0, -0.255, 0.424, 1.103, 3.452 max_d=3.452 avg_d=0.424 std_dev=0.679
O3'	A	0, -0.288, 0.398, 1.084, 3.481 max_d=3.481 avg_d=0.398 std_dev=0.686
C4	B	0, -0.178, 0.577, 1.331, 3.753 max_d=3.753 avg_d=0.577 std_dev=0.755
C8	B	0, -0.203, 0.562, 1.327, 3.855 max_d=3.855 avg_d=0.562 std_dev=0.765
C4'	B	0, -0.333, 0.454, 1.241, 4.002 max_d=4.002 avg_d=0.454 std_dev=0.787
O4'	B	0, -0.315, 0.492, 1.299, 4.099 max_d=4.099 avg_d=0.492 std_dev=0.807
N3	B	0, -0.223, 0.605, 1.434, 4.126 max_d=4.126 avg_d=0.605 std_dev=0.829
N7	B	0, -0.227, 0.614, 1.455, 4.199 max_d=4.199 avg_d=0.614 std_dev=0.841
O2'	A	0, -0.449, 0.399, 1.248, 4.264 max_d=4.264 avg_d=0.399 std_dev=0.848
C5	B	0, -0.236, 0.624, 1.483, 4.255 max_d=4.255 avg_d=0.624 std_dev=0.859
O5'	B	0, -0.445, 0.549, 1.543, 5.035 max_d=5.035 avg_d=0.549 std_dev=0.994
C6	B	0, -0.340, 0.697, 1.734, 5.111 max_d=5.111 avg_d=0.697 std_dev=1.037
C2	B	0, -0.366, 0.687, 1.741, 5.231 max_d=5.231 avg_d=0.687 std_dev=1.054
C5'	B	0, -0.637, 0.491, 1.620, 5.625 max_d=5.625 avg_d=0.491 std_dev=1.128
C5'	A	0, -0.674, 0.458, 1.590, 5.601 max_d=5.601 avg_d=0.458 std_dev=1.132
O6	B	0, -0.381, 0.757, 1.894, 5.596 max_d=5.596 avg_d=0.757 std_dev=1.137
N1	B	0, -0.415, 0.728, 1.871, 5.650 max_d=5.650 avg_d=0.728 std_dev=1.143
OP2	B	0, -0.644, 0.589, 1.822, 6.158 max_d=6.158 avg_d=0.589 std_dev=1.233
N2	B	0, -0.489, 0.751, 1.991, 6.167 max_d=6.167 avg_d=0.751 std_dev=1.240
P	B	0, -0.773, 0.600, 1.974, 6.846 max_d=6.846 avg_d=0.600 std_dev=1.374
O5'	A	0, -0.935, 0.506, 1.947, 7.082 max_d=7.082 avg_d=0.506 std_dev=1.441
OP1	B	0, -0.988, 0.650, 2.288, 8.123 max_d=8.123 avg_d=0.650 std_dev=1.638
P	A	0, -1.378, 0.709, 2.796, 10.238 max_d=10.238 avg_d=0.709 std_dev=2.087
OP2	A	0, -1.557, 0.787, 3.131, 11.497 max_d=11.497 avg_d=0.787 std_dev=2.344
OP1	A	0, -1.552, 0.802, 3.155, 11.542 max_d=11.542 avg_d=0.802 std_dev=2.354

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.04	0.09	0.07	0.04
C2	0.03	0.00	0.15	0.13	0.00	0.17	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.29	0.20	0.48	0.21	0.27
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.07	0.10	0.04	0.14	0.15	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.17	0.27	0.11	0.19
C3'	0.03	0.13	0.00	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.21	0.18	0.18	0.10	0.23	0.22	0.12	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.04
C4	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.14	0.10	0.12	0.21	0.11
C4'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.02	0.22	0.09	0.18	0.07	0.19	0.06	0.15	0.02	0.00	0.01	0.10	0.11	0.01
C5	0.01	0.01	0.07	0.20	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.04	0.04	0.34	0.18	0.58	0.41
C5'	0.01	0.29	0.07	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.07	0.43	0.13	0.30	0.17	0.39	0.14	0.07	0.09	0.01	0.01	0.17	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.21	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.10	0.25	0.09	0.49	0.31
C8	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.22	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.12	0.19	0.63	0.50	0.88	0.73
N1	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.21	0.04	0.26	0.13	0.05
N3	0.03	0.00	0.15	0.10	0.00	0.18	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.07	0.30	0.23	0.46	0.24	0.28
N6	0.01	0.01	0.09	0.23	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.05	0.39	0.24	0.73	0.50
N7	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.19	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.07	0.12	0.63	0.52	0.99	0.77
N9	0.00	0.01	0.03	0.12	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.02	0.25	0.12	0.37	0.28
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.02	0.15	0.13	0.07	0.08	0.30	0.06	0.18	0.14	0.28	0.12	0.00	0.03	0.11	0.13	0.26	0.10	0.17
O3'	0.18	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.08	0.12	0.11	0.07	0.09	0.07	0.09	0.03	0.00	0.08	0.07	0.24	0.09	0.09
O4'	0.00	0.29	0.02	0.01	0.14	0.00	0.04	0.01	0.10	0.19	0.21	0.30	0.05	0.12	0.02	0.11	0.08	0.00	0.05	0.05	0.07	0.06
O5'	0.04	0.20	0.17	0.04	0.10	0.01	0.34	0.01	0.25	0.63	0.04	0.23	0.39	0.63	0.25	0.13	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.48	0.27	0.06	0.12	0.10	0.18	0.17	0.09	0.50	0.26	0.46	0.24	0.52	0.12	0.26	0.24	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.21	0.11	0.03	0.21	0.11	0.58	0.20	0.49	0.88	0.13	0.24	0.73	0.99	0.37	0.10	0.09	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.27	0.19	0.04	0.11	0.01	0.41	0.01	0.31	0.73	0.05	0.28	0.50	0.77	0.28	0.17	0.09	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.55	0.09	0.23	0.37	0.32	0.36	0.52	0.45	0.19	0.53	0.63	0.47	0.26	0.25	0.12	0.41	0.08	0.38	0.44	0.64	0.36	0.50
C2	0.44	0.74	0.11	0.29	0.64	0.23	0.64	0.46	0.70	0.48	0.74	0.76	0.69	0.55	0.53	0.12	0.63	0.30	0.32	0.70	0.72	0.28	0.44
C2'	0.12	0.61	0.06	0.33	0.38	0.41	0.39	0.58	0.50	0.17	0.60	0.72	0.50	0.26	0.23	0.07	0.55	0.12	0.41	0.51	0.68	0.35	0.51
C3'	0.31	0.75	0.23	0.10	0.53	0.18	0.52	0.37	0.62	0.32	0.73	0.86	0.66	0.40	0.39	0.25	0.28	0.12	0.23	0.63	0.50	0.19	0.34
C4	0.33	0.72	0.11	0.27	0.56	0.29	0.56	0.53	0.65	0.36	0.72	0.78	0.65	0.45	0.43	0.14	0.54	0.15	0.39	0.65	0.76	0.37	0.53
C4'	0.58	0.87	0.57	0.32	0.73	0.20	0.71	0.06	0.77	0.56	0.85	0.94	0.82	0.61	0.62	0.62	0.20	0.40	0.13	0.76	0.15	0.12	0.06
C5	0.37	0.79	0.11	0.29	0.62	0.28	0.64	0.55	0.73	0.42	0.80	0.85	0.71	0.52	0.48	0.13	0.59	0.19	0.42	0.74	0.89	0.43	0.60
C5'	0.99	1.32	1.04	0.76	1.15	0.58	1.12	0.34	1.19	0.94	1.28	1.40	1.27	1.00	1.03	1.11	0.66	0.75	0.48	1.18	0.22	0.47	0.32
C6	0.41	0.83	0.10	0.31	0.68	0.25	0.71	0.52	0.80	0.50	0.85	0.87	0.74	0.60	0.54	0.12	0.64	0.26	0.41	0.82	0.95	0.42	0.60
C8	0.28	0.73	0.10	0.27	0.53	0.31	0.54	0.57	0.64	0.32	0.73	0.81	0.63	0.41	0.38	0.14	0.51	0.11	0.44	0.65	0.84	0.45	0.61
N1	0.45	0.80	0.11	0.31	0.69	0.22	0.72	0.47	0.79	0.54	0.83	0.82	0.73	0.63	0.57	0.12	0.65	0.33	0.36	0.80	0.87	0.35	0.52
N3	0.36	0.68	0.12	0.26	0.56	0.26	0.55	0.48	0.61	0.38	0.68	0.72	0.63	0.45	0.44	0.14	0.54	0.19	0.33	0.61	0.66	0.29	0.44
N6	0.42	0.87	0.10	0.33	0.71	0.25	0.75	0.52	0.86	0.53	0.91	0.91	0.77	0.64	0.56	0.12	0.66	0.28	0.44	0.88	1.04	0.48	0.65
N7	0.33	0.79	0.10	0.29	0.60	0.30	0.61	0.57	0.72	0.39	0.81	0.87	0.69	0.49	0.45	0.13	0.56	0.15	0.45	0.74	0.92	0.48	0.64
N9	0.27	0.68	0.11	0.25	0.49	0.31	0.49	0.54	0.58	0.29	0.67	0.75	0.59	0.37	0.36	0.14	0.48	0.09	0.40	0.58	0.75	0.39	0.55
O2'	0.23	0.27	0.38	0.63	0.08	0.68	0.11	0.79	0.21	0.14	0.29	0.37	0.16	0.07	0.12	0.44	0.83	0.40	0.62	0.24	0.83	0.53	0.69
O3'	0.17	0.51	0.08	0.21	0.35	0.25	0.35	0.39	0.43	0.20	0.50	0.59	0.43	0.26	0.24	0.08	0.40	0.08	0.28	0.44	0.51	0.24	0.37
O4'	0.60	0.86	0.56	0.29	0.73	0.18	0.71	0.08	0.77	0.57	0.83	0.92	0.82	0.62	0.64	0.61	0.16	0.41	0.10	0.76	0.20	0.09	0.09
O5'	1.11	1.66	1.15	0.79	1.39	0.57	1.35	0.28	1.47	1.07	1.61	1.79	1.56	1.17	1.19	1.21	0.63	0.80	0.46	1.45	0.12	0.47	0.27
OP1	1.65	2.49	1.70	1.31	2.10	1.02	2.08	0.74	2.27	1.69	2.44	2.67	2.32	1.85	1.82	1.65	1.11	1.28	0.99	2.27	0.60	1.07	0.81
OP2	1.58	2.16	1.73	1.36	1.87	1.05	1.82	0.71	1.95	1.51	2.10	2.30	2.07	1.61	1.66	1.82	1.26	1.23	0.89	1.92	0.48	0.87	0.66
P	1.43	2.10	1.52	1.15	1.77	0.85	1.73	0.55	1.88	1.39	2.05	2.26	1.98	1.52	1.53	1.57	1.01	1.07	0.75	1.86	0.37	0.77	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.20	0.01	0.24	0.29	0.23
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.09	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.05	0.09	0.10	0.07
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.12	0.06	0.13	0.13	0.11	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.09	0.09	0.07
C4	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.19	0.01	0.21	0.24	0.21
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.04	0.04	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.22	0.01	0.25	0.29	0.26
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.11	0.00	0.15	0.00	0.15	0.14	0.13	0.09	0.09	0.16	0.10	0.03	0.02	0.02	0.01	0.16	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.23	0.00	0.28	0.33	0.28
C8	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.18	0.02	0.18	0.17	0.19
N1	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.23	0.00	0.27	0.33	0.27
N2	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.03	0.19	0.01	0.24	0.29	0.22
N3	0.02	0.00	0.08	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.18	0.01	0.20	0.24	0.19
N7	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.22	0.02	0.24	0.26	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.15	0.01	0.15	0.16	0.15
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.07	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.08	0.06
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.13	0.06	0.14	0.15	0.12	0.09	0.06	0.03	0.00	0.01	0.05	0.14	0.10	0.10	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04
O5'	0.07	0.20	0.06	0.05	0.19	0.01	0.22	0.01	0.23	0.18	0.23	0.19	0.18	0.22	0.15	0.05	0.05	0.04	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.14	0.03	0.24	0.00	0.30	0.36	0.31
OP1	0.08	0.24	0.09	0.09	0.21	0.06	0.25	0.05	0.28	0.18	0.27	0.24	0.20	0.24	0.15	0.09	0.10	0.05	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.29	0.10	0.09	0.24	0.02	0.29	0.01	0.33	0.17	0.33	0.29	0.24	0.26	0.16	0.08	0.10	0.06	0.01	0.36	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.23	0.07	0.07	0.21	0.02	0.26	0.01	0.28	0.19	0.27	0.22	0.19	0.26	0.15	0.06	0.07	0.04	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00