Doublet Group distance statistics: 50495

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 4, 7, 5, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.018, 0.032, 0.046, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.015, 0.030, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.021, 0.039, 0.056, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.039 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.027, 0.048, 0.069, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.048 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.030, 0.053, 0.076, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.053 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.100, 0.230, 0.360, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.230 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.175, 0.309, 0.443, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.309 std_dev=0.134
O4'	B	0, 0.213, 0.386, 0.560, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.386 std_dev=0.173
C2'	B	0, 0.154, 0.345, 0.536, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.345 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.289, 0.495, 0.702, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.495 std_dev=0.206
O2'	A	0, 0.313, 0.548, 0.783, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.548 std_dev=0.235
C3'	A	0, 0.258, 0.499, 0.739, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.499 std_dev=0.240
O2'	B	0, 0.415, 0.690, 0.964, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.690 std_dev=0.275
C4'	A	0, 0.490, 0.774, 1.059, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.774 std_dev=0.284
O3'	A	0, 0.232, 0.568, 0.904, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.568 std_dev=0.336
C4'	B	0, 0.675, 1.033, 1.390, 1.468 max_d=1.468 avg_d=1.033 std_dev=0.357
C3'	B	0, 0.713, 1.104, 1.494, 1.587 max_d=1.587 avg_d=1.104 std_dev=0.391
N9	B	0, 0.870, 1.347, 1.824, 1.784 max_d=1.784 avg_d=1.347 std_dev=0.477
C5'	B	0, 0.971, 1.488, 2.005, 1.962 max_d=1.962 avg_d=1.488 std_dev=0.517
O5'	B	0, 1.023, 1.561, 2.099, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.561 std_dev=0.538
C5'	A	0, 1.154, 1.746, 2.338, 2.405 max_d=2.405 avg_d=1.746 std_dev=0.592
O3'	B	0, 1.106, 1.713, 2.321, 2.350 max_d=2.350 avg_d=1.713 std_dev=0.607
C4	B	0, 1.307, 2.008, 2.709, 2.627 max_d=2.627 avg_d=2.008 std_dev=0.701
P	B	0, 1.264, 2.002, 2.740, 2.674 max_d=2.674 avg_d=2.002 std_dev=0.738
N3	B	0, 1.483, 2.247, 3.011, 2.979 max_d=2.979 avg_d=2.247 std_dev=0.764
C8	B	0, 1.216, 1.997, 2.778, 2.605 max_d=2.605 avg_d=1.997 std_dev=0.781
OP1	A	0, 1.702, 2.578, 3.455, 3.294 max_d=3.294 avg_d=2.578 std_dev=0.876
O5'	A	0, 1.823, 2.723, 3.623, 3.350 max_d=3.350 avg_d=2.723 std_dev=0.900
OP2	B	0, 1.528, 2.484, 3.440, 3.408 max_d=3.408 avg_d=2.484 std_dev=0.956
C5	B	0, 1.745, 2.751, 3.758, 3.513 max_d=3.513 avg_d=2.751 std_dev=1.007
OP1	B	0, 1.745, 2.761, 3.776, 3.596 max_d=3.596 avg_d=2.761 std_dev=1.016
C2	B	0, 2.012, 3.064, 4.117, 4.006 max_d=4.006 avg_d=3.064 std_dev=1.053
N7	B	0, 1.702, 2.780, 3.857, 3.546 max_d=3.546 avg_d=2.780 std_dev=1.077
N2	B	0, 2.379, 3.610, 4.842, 4.710 max_d=4.710 avg_d=3.610 std_dev=1.231
P	A	0, 2.463, 3.696, 4.928, 4.641 max_d=4.641 avg_d=3.696 std_dev=1.232
N1	B	0, 2.332, 3.594, 4.856, 4.629 max_d=4.629 avg_d=3.594 std_dev=1.262
C6	B	0, 2.272, 3.560, 4.847, 4.531 max_d=4.531 avg_d=3.560 std_dev=1.287
O6	B	0, 2.728, 4.315, 5.901, 5.426 max_d=5.426 avg_d=4.315 std_dev=1.587
OP2	A	0, 3.301, 4.981, 6.660, 6.708 max_d=6.708 avg_d=4.981 std_dev=1.679

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.15	0.31	0.14
C2	0.03	0.00	0.13	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.14	0.08	0.25	0.24	0.47	0.32
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.07	0.11	0.13	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.31	0.46	0.18
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.11	0.10	0.11	0.11	0.12	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.15	0.42	0.47	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.09	0.05	0.28	0.24	0.46	0.34
C4'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.09	0.11	0.07	0.05	0.11	0.11	0.05	0.04	0.02	0.00	0.03	0.22	0.25	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04	0.37	0.33	0.53	0.46
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.14	0.01	0.21	0.00	0.22	0.24	0.17	0.10	0.26	0.26	0.14	0.05	0.08	0.03	0.01	0.14	0.21	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.11	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.12	0.06	0.38	0.36	0.55	0.48
C8	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.11	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.11	0.06	0.41	0.32	0.50	0.46
N1	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.13	0.07	0.32	0.30	0.52	0.41
N3	0.03	0.01	0.13	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.07	0.22	0.20	0.43	0.27
N6	0.04	0.01	0.08	0.12	0.02	0.11	0.02	0.26	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.10	0.13	0.06	0.42	0.42	0.60	0.55
N7	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.10	0.04	0.44	0.39	0.56	0.54
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.28	0.22	0.42	0.31
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.08	0.04	0.07	0.05	0.10	0.06	0.13	0.14	0.10	0.06	0.03	0.00	0.04	0.05	0.08	0.37	0.43	0.16
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.08	0.12	0.11	0.13	0.13	0.13	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.14	0.64	0.49	0.27
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.03	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.19	0.18	0.08
O5'	0.13	0.25	0.14	0.15	0.28	0.03	0.37	0.01	0.38	0.41	0.32	0.22	0.42	0.44	0.28	0.08	0.14	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.24	0.31	0.42	0.24	0.22	0.33	0.14	0.36	0.32	0.30	0.20	0.42	0.39	0.22	0.37	0.64	0.19	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.31	0.47	0.46	0.47	0.46	0.25	0.53	0.21	0.55	0.50	0.52	0.43	0.60	0.56	0.42	0.43	0.49	0.18	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.14	0.32	0.18	0.21	0.34	0.07	0.46	0.02	0.48	0.46	0.41	0.27	0.55	0.54	0.31	0.16	0.27	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.13	0.26	0.09	0.23	0.13	0.37	0.12	0.20	0.08	0.17	0.12	0.21	0.11	0.15	0.34	0.11	0.37	0.15	0.59	0.34	0.41
C2	0.20	0.35	0.15	0.21	0.30	0.26	0.29	0.32	0.32	0.21	0.35	0.37	0.33	0.24	0.24	0.17	0.28	0.15	0.24	0.32	0.33	0.12	0.19
C2'	0.17	0.17	0.21	0.33	0.23	0.29	0.31	0.42	0.30	0.34	0.23	0.13	0.16	0.38	0.24	0.16	0.38	0.20	0.44	0.36	0.61	0.41	0.48
C3'	0.12	0.14	0.15	0.28	0.19	0.23	0.30	0.36	0.30	0.33	0.22	0.11	0.12	0.38	0.20	0.13	0.33	0.15	0.40	0.37	0.61	0.43	0.47
C4	0.15	0.29	0.13	0.24	0.21	0.26	0.18	0.38	0.21	0.12	0.26	0.34	0.27	0.12	0.16	0.16	0.34	0.13	0.31	0.19	0.48	0.19	0.30
C4'	0.15	0.12	0.17	0.23	0.11	0.18	0.18	0.28	0.17	0.24	0.10	0.18	0.14	0.28	0.13	0.25	0.30	0.13	0.31	0.25	0.58	0.39	0.41
C5	0.18	0.42	0.14	0.25	0.30	0.28	0.28	0.38	0.34	0.16	0.40	0.48	0.38	0.20	0.22	0.17	0.37	0.14	0.30	0.33	0.48	0.17	0.28
C5'	0.17	0.17	0.19	0.22	0.10	0.18	0.13	0.25	0.12	0.19	0.09	0.26	0.19	0.23	0.11	0.30	0.30	0.13	0.27	0.20	0.53	0.36	0.36
C6	0.22	0.53	0.17	0.24	0.40	0.28	0.40	0.36	0.47	0.25	0.53	0.58	0.46	0.31	0.29	0.20	0.36	0.15	0.27	0.48	0.42	0.12	0.23
C8	0.15	0.32	0.13	0.27	0.20	0.27	0.16	0.40	0.20	0.11	0.27	0.39	0.29	0.11	0.14	0.16	0.39	0.13	0.35	0.17	0.58	0.26	0.36
N1	0.23	0.51	0.18	0.22	0.41	0.27	0.42	0.32	0.48	0.28	0.52	0.54	0.46	0.35	0.31	0.20	0.32	0.16	0.24	0.49	0.35	0.11	0.19
N3	0.15	0.24	0.13	0.22	0.18	0.25	0.16	0.35	0.17	0.12	0.21	0.27	0.23	0.12	0.15	0.15	0.29	0.14	0.28	0.15	0.39	0.15	0.25
N6	0.24	0.64	0.19	0.24	0.47	0.29	0.49	0.36	0.59	0.29	0.65	0.70	0.55	0.39	0.33	0.22	0.38	0.16	0.26	0.61	0.42	0.12	0.23
N7	0.17	0.42	0.14	0.27	0.28	0.28	0.26	0.40	0.32	0.14	0.40	0.49	0.37	0.17	0.20	0.17	0.40	0.13	0.33	0.30	0.54	0.21	0.33
N9	0.13	0.23	0.13	0.26	0.15	0.25	0.11	0.39	0.12	0.12	0.19	0.29	0.22	0.11	0.12	0.15	0.36	0.12	0.34	0.10	0.55	0.26	0.36
O2'	0.26	0.31	0.29	0.37	0.35	0.31	0.44	0.42	0.45	0.46	0.38	0.26	0.29	0.51	0.35	0.24	0.40	0.26	0.47	0.51	0.62	0.47	0.52
O3'	0.19	0.27	0.20	0.29	0.31	0.24	0.43	0.35	0.45	0.43	0.37	0.22	0.23	0.51	0.30	0.16	0.33	0.20	0.41	0.54	0.58	0.48	0.49
O4'	0.17	0.19	0.17	0.25	0.13	0.20	0.13	0.33	0.12	0.19	0.13	0.26	0.20	0.21	0.13	0.24	0.33	0.14	0.35	0.16	0.63	0.39	0.43
O5'	0.13	0.19	0.17	0.24	0.12	0.20	0.17	0.31	0.18	0.23	0.15	0.26	0.18	0.27	0.12	0.25	0.31	0.12	0.33	0.24	0.57	0.38	0.41
OP1	0.25	0.25	0.35	0.46	0.23	0.38	0.26	0.42	0.25	0.29	0.24	0.28	0.24	0.31	0.24	0.39	0.61	0.25	0.38	0.28	0.56	0.33	0.38
OP2	0.38	0.54	0.30	0.22	0.45	0.23	0.47	0.26	0.51	0.41	0.53	0.61	0.51	0.47	0.40	0.38	0.24	0.33	0.30	0.54	0.49	0.40	0.39
P	0.13	0.22	0.18	0.28	0.17	0.24	0.22	0.32	0.23	0.24	0.22	0.28	0.20	0.28	0.15	0.24	0.38	0.14	0.31	0.28	0.52	0.32	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.03	0.15	0.01	0.18	0.26	0.20
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.08	0.05	0.11	0.16	0.13	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.07	0.10	0.13	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.06	0.10	0.09	0.14	0.10	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.06	0.10	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.03	0.17	0.01	0.18	0.24	0.20
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.03	0.06	0.04	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.03	0.21	0.01	0.25	0.30	0.26
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.10	0.05	0.05	0.17	0.09	0.03	0.04	0.02	0.01	0.16	0.08	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.22	0.01	0.26	0.33	0.28
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.23	0.01	0.24	0.24	0.24
N1	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.13	0.04	0.19	0.01	0.22	0.30	0.25
N2	0.03	0.01	0.16	0.14	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.22	0.22	0.03	0.14	0.02	0.15	0.25	0.18
N3	0.02	0.01	0.13	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.03	0.14	0.01	0.15	0.22	0.17
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.25	0.01	0.28	0.32	0.30
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.16	0.01	0.17	0.19	0.17
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.04	0.07	0.03	0.11	0.04	0.15	0.22	0.16	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.05	0.10	0.09	0.11	0.06
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.04	0.08	0.11	0.13	0.22	0.14	0.09	0.04	0.04	0.00	0.02	0.10	0.07	0.13	0.11	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.04	0.09	0.09	0.07
O5'	0.09	0.15	0.08	0.07	0.17	0.01	0.21	0.01	0.22	0.23	0.19	0.14	0.14	0.25	0.16	0.05	0.10	0.07	0.00	0.24	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.04	0.24	0.00	0.30	0.37	0.32
OP1	0.10	0.18	0.10	0.10	0.18	0.08	0.25	0.08	0.26	0.24	0.22	0.15	0.15	0.28	0.17	0.09	0.13	0.09	0.02	0.30	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.26	0.13	0.10	0.24	0.03	0.30	0.02	0.33	0.24	0.30	0.25	0.22	0.32	0.19	0.11	0.11	0.09	0.02	0.37	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.20	0.09	0.07	0.20	0.02	0.26	0.02	0.28	0.24	0.25	0.18	0.17	0.30	0.17	0.06	0.09	0.07	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00