Doublet Group distance statistics: 50496

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 5, 4, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.011, 0.036, 0.060, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.036 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.002, 0.028, 0.054, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.028 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.005, 0.035, 0.064, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.035 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.028, 0.076, 0.125, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.076 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.027, 0.080, 0.133, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.080 std_dev=0.053
C4'	A	0, 0.049, 0.117, 0.185, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.117 std_dev=0.068
C3'	A	0, 0.055, 0.131, 0.206, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.131 std_dev=0.076
C5'	A	0, 0.068, 0.163, 0.258, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.163 std_dev=0.095
O2'	A	0, 0.025, 0.136, 0.247, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.136 std_dev=0.111
O3'	A	0, 0.066, 0.199, 0.333, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.199 std_dev=0.134
O5'	A	0, 0.004, 0.214, 0.424, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.214 std_dev=0.210
O2'	B	0, 0.112, 0.403, 0.693, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.403 std_dev=0.291
C2'	B	0, 0.098, 0.390, 0.681, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.390 std_dev=0.292
C3'	B	0, 0.094, 0.410, 0.725, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.410 std_dev=0.315
O3'	B	0, 0.086, 0.421, 0.756, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.421 std_dev=0.335
C1'	B	0, 0.077, 0.424, 0.771, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.424 std_dev=0.347
P	A	0, -0.076, 0.305, 0.686, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.305 std_dev=0.381
O4'	B	0, 0.076, 0.461, 0.845, 1.821 max_d=1.821 avg_d=0.461 std_dev=0.384
C4'	B	0, 0.047, 0.435, 0.823, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.435 std_dev=0.388
OP2	A	0, -0.019, 0.420, 0.859, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.420 std_dev=0.439
OP1	A	0, -0.104, 0.342, 0.787, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.342 std_dev=0.445
N9	B	0, -0.026, 0.535, 1.095, 2.603 max_d=2.603 avg_d=0.535 std_dev=0.561
C5'	B	0, -0.103, 0.481, 1.065, 2.836 max_d=2.836 avg_d=0.481 std_dev=0.584
O5'	B	0, -0.126, 0.544, 1.215, 3.232 max_d=3.232 avg_d=0.544 std_dev=0.671
C4	B	0, -0.129, 0.569, 1.267, 3.302 max_d=3.302 avg_d=0.569 std_dev=0.698
N3	B	0, -0.177, 0.524, 1.226, 3.330 max_d=3.330 avg_d=0.524 std_dev=0.702
C8	B	0, -0.060, 0.665, 1.390, 3.472 max_d=3.472 avg_d=0.665 std_dev=0.725
P	B	0, -0.239, 0.648, 1.534, 4.342 max_d=4.342 avg_d=0.648 std_dev=0.886
C5	B	0, -0.183, 0.716, 1.614, 4.302 max_d=4.302 avg_d=0.716 std_dev=0.898
N7	B	0, -0.146, 0.769, 1.683, 4.403 max_d=4.403 avg_d=0.769 std_dev=0.914
C2	B	0, -0.288, 0.634, 1.557, 4.408 max_d=4.408 avg_d=0.634 std_dev=0.923
OP1	B	0, -0.251, 0.678, 1.607, 4.581 max_d=4.581 avg_d=0.678 std_dev=0.929
OP2	B	0, -0.277, 0.700, 1.677, 4.779 max_d=4.779 avg_d=0.700 std_dev=0.977
N2	B	0, -0.372, 0.656, 1.684, 4.929 max_d=4.929 avg_d=0.656 std_dev=1.028
N1	B	0, -0.329, 0.762, 1.853, 5.230 max_d=5.230 avg_d=0.762 std_dev=1.091
C6	B	0, -0.279, 0.817, 1.913, 5.265 max_d=5.265 avg_d=0.817 std_dev=1.096
O6	B	0, -0.331, 0.965, 2.261, 6.242 max_d=6.242 avg_d=0.965 std_dev=1.296

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.10	0.06
C2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.03	0.06	0.07	0.12	0.07
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.07	0.06	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.07	0.04
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.09	0.09
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.07	0.08	0.13	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.09	0.10	0.14	0.09
C5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.03	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.02	0.08	0.09	0.14	0.09
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.10	0.10	0.14	0.09
N1	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.08	0.02	0.07	0.08	0.13	0.08
N3	0.03	0.00	0.06	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.03	0.05	0.07	0.12	0.07
N6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.09	0.03	0.09	0.10	0.15	0.10
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.11	0.11	0.16	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.12	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.02	0.09	0.09	0.07	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.10	0.06	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.07	0.08	0.06	0.09	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.23	0.14	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.07	0.14	0.10
O5'	0.05	0.06	0.04	0.07	0.07	0.01	0.09	0.01	0.08	0.10	0.07	0.05	0.09	0.11	0.07	0.02	0.09	0.08	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.06	0.07	0.11	0.16	0.08	0.06	0.10	0.04	0.09	0.10	0.08	0.07	0.10	0.11	0.07	0.10	0.23	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.12	0.07	0.09	0.13	0.05	0.14	0.03	0.14	0.14	0.13	0.12	0.15	0.16	0.12	0.06	0.14	0.14	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.07	0.04	0.09	0.08	0.01	0.09	0.01	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.11	0.07	0.03	0.14	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.27	0.09	0.09	0.18	0.11	0.19	0.13	0.23	0.12	0.27	0.31	0.22	0.15	0.13	0.10	0.11	0.08	0.15	0.24	0.19	0.17	0.18
C2	0.11	0.12	0.08	0.06	0.14	0.08	0.16	0.13	0.15	0.18	0.12	0.13	0.12	0.19	0.14	0.13	0.08	0.15	0.18	0.17	0.20	0.25	0.23
C2'	0.12	0.41	0.11	0.10	0.28	0.12	0.29	0.14	0.37	0.17	0.42	0.46	0.34	0.23	0.19	0.11	0.16	0.07	0.13	0.38	0.19	0.14	0.16
C3'	0.12	0.47	0.11	0.12	0.30	0.16	0.31	0.20	0.40	0.16	0.48	0.55	0.38	0.23	0.19	0.11	0.19	0.09	0.17	0.42	0.26	0.17	0.21
C4	0.06	0.13	0.06	0.06	0.07	0.11	0.08	0.17	0.07	0.12	0.10	0.18	0.11	0.12	0.07	0.11	0.07	0.13	0.20	0.08	0.26	0.27	0.27
C4'	0.11	0.39	0.10	0.10	0.25	0.12	0.27	0.15	0.35	0.16	0.40	0.45	0.31	0.22	0.17	0.10	0.15	0.08	0.15	0.37	0.21	0.16	0.18
C5	0.10	0.11	0.08	0.08	0.10	0.15	0.13	0.24	0.10	0.21	0.07	0.18	0.10	0.20	0.13	0.16	0.06	0.19	0.29	0.13	0.36	0.38	0.39
C5'	0.11	0.40	0.11	0.09	0.25	0.13	0.26	0.17	0.34	0.14	0.41	0.48	0.32	0.20	0.17	0.10	0.14	0.09	0.17	0.36	0.25	0.19	0.22
C6	0.16	0.12	0.13	0.11	0.18	0.18	0.23	0.28	0.21	0.30	0.14	0.15	0.13	0.30	0.21	0.21	0.08	0.25	0.35	0.24	0.41	0.46	0.45
C8	0.06	0.20	0.07	0.07	0.08	0.14	0.08	0.22	0.10	0.13	0.16	0.28	0.16	0.12	0.07	0.12	0.08	0.15	0.25	0.10	0.34	0.33	0.34
N1	0.18	0.16	0.13	0.10	0.21	0.14	0.26	0.22	0.24	0.31	0.19	0.16	0.16	0.31	0.23	0.21	0.08	0.25	0.30	0.27	0.31	0.39	0.38
N3	0.06	0.10	0.07	0.07	0.07	0.10	0.08	0.13	0.08	0.10	0.08	0.13	0.09	0.10	0.07	0.09	0.10	0.10	0.16	0.09	0.18	0.20	0.19
N6	0.20	0.15	0.17	0.16	0.23	0.23	0.30	0.37	0.27	0.38	0.19	0.16	0.16	0.39	0.26	0.26	0.13	0.30	0.44	0.32	0.53	0.58	0.57
N7	0.09	0.14	0.08	0.08	0.08	0.16	0.10	0.27	0.08	0.20	0.09	0.23	0.12	0.19	0.11	0.16	0.07	0.19	0.31	0.10	0.41	0.41	0.42
N9	0.06	0.20	0.07	0.07	0.11	0.11	0.10	0.17	0.13	0.09	0.18	0.26	0.17	0.10	0.07	0.10	0.08	0.11	0.19	0.13	0.25	0.25	0.26
O2'	0.17	0.45	0.13	0.11	0.35	0.10	0.39	0.09	0.47	0.28	0.49	0.48	0.37	0.35	0.27	0.14	0.16	0.10	0.12	0.50	0.11	0.15	0.11
O3'	0.14	0.58	0.12	0.13	0.38	0.17	0.41	0.20	0.53	0.23	0.60	0.67	0.46	0.32	0.25	0.13	0.23	0.08	0.15	0.56	0.24	0.14	0.19
O4'	0.10	0.28	0.09	0.09	0.18	0.10	0.20	0.13	0.25	0.13	0.28	0.33	0.23	0.16	0.13	0.09	0.11	0.09	0.15	0.26	0.20	0.18	0.19
O5'	0.11	0.38	0.13	0.10	0.22	0.15	0.20	0.22	0.28	0.11	0.36	0.48	0.31	0.14	0.14	0.15	0.12	0.13	0.23	0.28	0.33	0.29	0.31
OP1	0.17	0.50	0.20	0.15	0.30	0.16	0.28	0.23	0.36	0.15	0.47	0.62	0.41	0.19	0.20	0.23	0.16	0.14	0.24	0.36	0.35	0.30	0.33
OP2	0.13	0.35	0.16	0.15	0.17	0.23	0.15	0.34	0.20	0.19	0.30	0.47	0.28	0.17	0.14	0.21	0.17	0.22	0.37	0.19	0.50	0.47	0.49
P	0.11	0.36	0.14	0.11	0.19	0.17	0.16	0.26	0.23	0.12	0.32	0.47	0.29	0.13	0.12	0.18	0.13	0.16	0.28	0.22	0.39	0.36	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.05
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.03	0.08	0.01	0.09	0.13	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.08	0.02	0.10	0.12	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.11	0.02	0.14	0.16	0.14
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.09	0.07	0.05	0.05	0.10	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.12	0.01	0.16	0.18	0.15
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.11	0.03	0.12	0.13	0.12
N1	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.10	0.01	0.13	0.16	0.13
N2	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.10	0.04	0.07	0.02	0.08	0.12	0.10
N3	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.06	0.03	0.07	0.01	0.08	0.11	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.12	0.03	0.16	0.17	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.08	0.10	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.08	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.06	0.06	0.03
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.06	0.10	0.06	0.07	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.08	0.11	0.10	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.03	0.05	0.08	0.05
O5'	0.04	0.08	0.03	0.03	0.08	0.01	0.11	0.01	0.12	0.11	0.10	0.07	0.07	0.12	0.08	0.03	0.06	0.05	0.00	0.14	0.01	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.08	0.03	0.14	0.00	0.20	0.22	0.19
OP1	0.04	0.09	0.05	0.07	0.10	0.03	0.14	0.03	0.16	0.12	0.13	0.08	0.08	0.16	0.08	0.06	0.11	0.05	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.13	0.07	0.07	0.12	0.04	0.16	0.02	0.18	0.13	0.16	0.12	0.11	0.17	0.10	0.06	0.10	0.08	0.03	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.03	0.04	0.10	0.01	0.14	0.02	0.15	0.12	0.13	0.10	0.09	0.15	0.09	0.03	0.08	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00