Doublet Group distance statistics: 50497

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 3, 3, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.006, 0.027, 0.047, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.010, 0.035, 0.061, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.010, 0.042, 0.073, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.042 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.010, 0.043, 0.075, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.043 std_dev=0.032
C1'	B	0, 0.110, 0.215, 0.320, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.215 std_dev=0.105
C3'	B	0, 0.121, 0.242, 0.363, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.242 std_dev=0.121
C2'	B	0, 0.099, 0.222, 0.345, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.222 std_dev=0.123
O4'	B	0, 0.102, 0.285, 0.467, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.285 std_dev=0.183
O3'	B	0, 0.150, 0.362, 0.573, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.362 std_dev=0.211
C4'	B	0, 0.106, 0.339, 0.572, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.339 std_dev=0.233
O2'	B	0, 0.061, 0.322, 0.583, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.322 std_dev=0.261
N9	B	0, 0.100, 0.363, 0.627, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.363 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.103, 0.411, 0.719, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.411 std_dev=0.308
C5'	B	0, 0.083, 0.523, 0.964, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.523 std_dev=0.440
O5'	B	0, 0.087, 0.573, 1.060, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.573 std_dev=0.487
N7	B	0, 0.051, 0.576, 1.101, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.576 std_dev=0.525
C4	B	0, 0.017, 0.568, 1.119, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.568 std_dev=0.551
N3	B	0, -0.024, 0.675, 1.374, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.675 std_dev=0.699
P	B	0, 0.071, 0.770, 1.469, 2.238 max_d=2.238 avg_d=0.770 std_dev=0.699
C5	B	0, -0.025, 0.688, 1.402, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.688 std_dev=0.714
OP2	B	0, 0.123, 0.837, 1.551, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.837 std_dev=0.714
OP1	B	0, 0.094, 0.828, 1.562, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.828 std_dev=0.734
O4'	A	0, -0.259, 0.687, 1.633, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.687 std_dev=0.946
C2'	A	0, -0.258, 0.724, 1.707, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.724 std_dev=0.983
C2	B	0, -0.125, 0.914, 1.952, 2.678 max_d=2.678 avg_d=0.914 std_dev=1.038
C6	B	0, -0.131, 0.940, 2.010, 2.804 max_d=2.804 avg_d=0.940 std_dev=1.070
O3'	A	0, -0.276, 0.832, 1.940, 2.641 max_d=2.641 avg_d=0.832 std_dev=1.108
C3'	A	0, -0.322, 0.875, 2.072, 2.790 max_d=2.790 avg_d=0.875 std_dev=1.197
N1	B	0, -0.178, 1.032, 2.241, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.032 std_dev=1.209
N2	B	0, -0.171, 1.075, 2.321, 3.197 max_d=3.197 avg_d=1.075 std_dev=1.246
O6	B	0, -0.168, 1.102, 2.372, 3.366 max_d=3.366 avg_d=1.102 std_dev=1.270
C4'	A	0, -0.395, 0.945, 2.286, 3.109 max_d=3.109 avg_d=0.945 std_dev=1.341
O2'	A	0, -0.360, 1.104, 2.568, 3.477 max_d=3.477 avg_d=1.104 std_dev=1.464
C5'	A	0, -0.648, 1.594, 3.836, 5.157 max_d=5.157 avg_d=1.594 std_dev=2.242
O5'	A	0, -0.597, 1.714, 4.024, 5.318 max_d=5.318 avg_d=1.714 std_dev=2.311
P	A	0, -0.904, 2.185, 5.275, 7.020 max_d=7.020 avg_d=2.185 std_dev=3.090
OP2	A	0, -1.007, 2.517, 6.040, 8.041 max_d=8.041 avg_d=2.517 std_dev=3.524
OP1	A	0, -1.216, 2.866, 6.948, 9.188 max_d=9.188 avg_d=2.866 std_dev=4.082

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.33	0.01	0.07	0.16	0.13	0.05
C2	0.04	0.00	0.48	0.22	0.01	0.40	0.01	0.58	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.52	0.13	0.58	0.28	0.82	0.32	0.29
C2'	0.00	0.48	0.00	0.00	0.26	0.02	0.14	0.17	0.23	0.22	0.38	0.47	0.17	0.10	0.03	0.00	0.02	0.03	0.41	0.34	0.51	0.46
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.27	0.00	0.36	0.02	0.36	0.36	0.30	0.18	0.40	0.40	0.25	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	0.31	0.12
C4	0.02	0.01	0.26	0.27	0.00	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.30	0.08	0.34	0.57	0.08
C4'	0.01	0.40	0.02	0.00	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.39	0.26	0.39	0.03	0.30	0.10	0.32	0.03	0.00	0.01	0.05	0.15	0.01
C5	0.01	0.01	0.14	0.36	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.06	0.13	0.29	0.11	1.01	0.36
C5'	0.04	0.58	0.17	0.02	0.20	0.01	0.06	0.00	0.14	0.51	0.40	0.55	0.07	0.41	0.10	0.15	0.19	0.02	0.01	0.05	0.18	0.01
C6	0.02	0.00	0.23	0.36	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.25	0.19	0.27	0.98	0.24
C8	0.01	0.01	0.22	0.36	0.00	0.39	0.00	0.51	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.66	0.08	0.31	0.67	0.54	1.22	0.77
N1	0.03	0.00	0.38	0.30	0.01	0.26	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.05	0.44	0.11	0.62	0.64	0.08
N3	0.04	0.01	0.47	0.18	0.00	0.39	0.00	0.55	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.53	0.17	0.58	0.29	0.74	0.21	0.29
N6	0.02	0.01	0.17	0.40	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.17	0.11	0.16	0.33	0.12	1.26	0.43
N7	0.01	0.01	0.10	0.40	0.00	0.30	0.00	0.41	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.55	0.13	0.16	0.63	0.46	1.42	0.77
N9	0.00	0.01	0.03	0.25	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.09	0.01	0.22	0.10	0.62	0.27
O2'	0.02	0.52	0.00	0.02	0.12	0.32	0.18	0.15	0.06	0.66	0.29	0.53	0.17	0.55	0.21	0.00	0.05	0.22	0.28	0.14	0.60	0.37
O3'	0.33	0.13	0.02	0.01	0.08	0.03	0.06	0.19	0.06	0.08	0.05	0.17	0.11	0.13	0.09	0.05	0.00	0.20	0.16	0.43	0.17	0.17
O4'	0.01	0.58	0.03	0.02	0.30	0.00	0.13	0.02	0.25	0.31	0.44	0.58	0.16	0.16	0.01	0.22	0.20	0.00	0.09	0.14	0.22	0.14
O5'	0.07	0.28	0.41	0.07	0.08	0.01	0.29	0.01	0.19	0.67	0.11	0.29	0.33	0.63	0.22	0.28	0.16	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.82	0.34	0.06	0.34	0.05	0.11	0.05	0.27	0.54	0.62	0.74	0.12	0.46	0.10	0.14	0.43	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.32	0.51	0.31	0.57	0.15	1.01	0.18	0.98	1.22	0.64	0.21	1.26	1.42	0.62	0.60	0.17	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.29	0.46	0.12	0.08	0.01	0.36	0.01	0.24	0.77	0.08	0.29	0.43	0.77	0.27	0.37	0.17	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.26	0.10	0.07	0.17	0.15	0.17	0.19	0.21	0.10	0.25	0.31	0.22	0.13	0.11	0.08	0.14	0.08	0.10	0.21	0.18	0.08	0.12
C2	0.10	0.30	0.10	0.08	0.24	0.10	0.27	0.15	0.31	0.17	0.32	0.30	0.26	0.23	0.17	0.24	0.11	0.14	0.15	0.33	0.13	0.20	0.18
C2'	0.49	0.27	0.66	0.67	0.39	0.56	0.40	0.54	0.35	0.47	0.29	0.19	0.33	0.44	0.46	0.66	0.69	0.49	0.59	0.35	0.60	0.61	0.59
C3'	0.27	0.42	0.22	0.18	0.39	0.16	0.40	0.15	0.43	0.34	0.43	0.42	0.40	0.38	0.34	0.19	0.15	0.20	0.18	0.43	0.15	0.21	0.17
C4	0.07	0.16	0.10	0.07	0.12	0.14	0.13	0.19	0.16	0.09	0.17	0.18	0.14	0.11	0.09	0.18	0.08	0.13	0.14	0.17	0.17	0.16	0.17
C4'	0.95	0.81	0.92	0.90	0.96	0.89	0.97	0.88	0.91	1.01	0.83	0.65	0.89	1.01	0.99	0.88	0.84	0.90	0.91	0.91	0.89	0.94	0.91
C5	0.08	0.28	0.10	0.07	0.19	0.12	0.21	0.18	0.26	0.11	0.29	0.31	0.23	0.17	0.12	0.19	0.08	0.13	0.15	0.28	0.17	0.18	0.19
C5'	1.41	1.71	1.31	1.22	1.70	1.17	1.73	1.16	1.76	1.61	1.73	1.61	1.70	1.70	1.59	1.12	1.06	1.27	1.28	1.76	1.19	1.39	1.28
C6	0.09	0.39	0.10	0.08	0.27	0.10	0.31	0.16	0.38	0.16	0.42	0.43	0.32	0.24	0.17	0.22	0.09	0.13	0.16	0.41	0.16	0.22	0.20
C8	0.06	0.11	0.09	0.07	0.08	0.15	0.08	0.21	0.09	0.06	0.11	0.14	0.10	0.07	0.06	0.13	0.10	0.11	0.14	0.10	0.20	0.14	0.17
N1	0.10	0.41	0.10	0.08	0.30	0.10	0.34	0.15	0.41	0.19	0.44	0.43	0.34	0.28	0.20	0.24	0.11	0.14	0.16	0.44	0.14	0.23	0.20
N3	0.08	0.16	0.10	0.07	0.14	0.13	0.15	0.17	0.17	0.11	0.17	0.16	0.14	0.14	0.11	0.22	0.08	0.14	0.14	0.18	0.15	0.16	0.16
N6	0.09	0.46	0.10	0.08	0.31	0.10	0.35	0.16	0.45	0.17	0.49	0.51	0.36	0.27	0.19	0.22	0.10	0.13	0.16	0.49	0.17	0.24	0.21
N7	0.07	0.24	0.10	0.07	0.15	0.14	0.17	0.20	0.22	0.09	0.24	0.28	0.19	0.13	0.10	0.16	0.08	0.12	0.15	0.23	0.19	0.17	0.19
N9	0.06	0.07	0.10	0.07	0.06	0.15	0.05	0.20	0.06	0.05	0.06	0.09	0.06	0.06	0.05	0.13	0.10	0.11	0.13	0.06	0.19	0.13	0.16
O2'	1.17	1.27	1.41	1.33	1.30	1.03	1.33	0.98	1.34	1.26	1.30	1.18	1.28	1.31	1.26	1.27	1.28	1.01	1.15	1.36	1.08	1.27	1.14
O3'	0.52	0.35	0.49	0.48	0.47	0.49	0.48	0.49	0.43	0.55	0.37	0.26	0.41	0.53	0.52	0.51	0.46	0.49	0.50	0.43	0.49	0.50	0.49
O4'	0.89	0.50	0.84	0.88	0.74	0.95	0.72	0.96	0.62	0.85	0.52	0.31	0.63	0.80	0.84	0.86	0.86	0.92	0.92	0.61	0.94	0.89	0.92
O5'	1.12	1.78	1.00	0.89	1.55	0.82	1.61	0.80	1.74	1.35	1.80	1.85	1.64	1.50	1.35	0.80	0.74	0.95	0.93	1.76	0.81	1.06	0.93
OP1	1.94	3.16	1.67	1.54	2.72	1.46	2.90	1.48	3.17	2.45	3.28	3.33	2.81	2.73	2.37	1.28	1.23	1.73	1.74	3.26	1.54	2.00	1.76
OP2	0.94	2.13	0.94	0.80	1.64	0.55	1.77	0.50	2.06	1.31	2.22	2.36	1.79	1.57	1.29	0.69	0.69	0.66	0.73	2.15	0.59	0.95	0.71
P	1.28	2.29	1.14	1.03	1.90	0.91	2.02	0.90	2.24	1.64	2.35	2.45	2.02	1.86	1.61	0.88	0.84	1.08	1.09	2.31	0.95	1.28	1.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.17	0.22	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.27	0.05	0.20	0.01	0.26	0.29	0.23
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.05	0.14	0.19	0.15	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.07	0.06	0.04
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.02	0.19	0.05	0.22	0.24	0.19	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.04	0.18	0.08	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.09	0.15	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02	0.18	0.01	0.21	0.23	0.20
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.06	0.08	0.08	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.17	0.02	0.22	0.01	0.26	0.29	0.25
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.10	0.00	0.13	0.00	0.14	0.11	0.13	0.11	0.09	0.14	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.15	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.19	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.23	0.03	0.23	0.00	0.31	0.34	0.28
C8	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.03	0.17	0.02	0.17	0.17	0.18
N1	0.02	0.00	0.14	0.22	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.27	0.04	0.23	0.01	0.30	0.33	0.27
N2	0.03	0.00	0.19	0.24	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.30	0.05	0.20	0.01	0.26	0.29	0.23
N3	0.02	0.00	0.15	0.19	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.21	0.04	0.17	0.01	0.21	0.23	0.19
N7	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.21	0.02	0.25	0.27	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.08	0.12	0.08	0.03	0.02	0.00	0.06	0.04	0.03	0.05	0.09	0.05	0.04
O3'	0.02	0.27	0.02	0.01	0.16	0.02	0.17	0.03	0.23	0.06	0.27	0.30	0.21	0.11	0.07	0.06	0.00	0.02	0.05	0.24	0.09	0.06	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04
O5'	0.06	0.20	0.04	0.04	0.18	0.01	0.22	0.00	0.23	0.17	0.23	0.20	0.17	0.21	0.14	0.03	0.05	0.04	0.00	0.25	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.18	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.24	0.03	0.25	0.00	0.34	0.38	0.31
OP1	0.07	0.26	0.07	0.08	0.21	0.06	0.26	0.06	0.31	0.17	0.30	0.26	0.21	0.25	0.15	0.09	0.09	0.06	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.29	0.06	0.05	0.23	0.02	0.29	0.01	0.34	0.17	0.33	0.29	0.23	0.27	0.15	0.05	0.06	0.05	0.02	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.23	0.04	0.04	0.20	0.01	0.25	0.01	0.28	0.18	0.27	0.23	0.19	0.25	0.15	0.04	0.05	0.04	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00