Doublet Group distance statistics: 50498

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 5, 4, 2, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.020, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.020 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.016, 0.026, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.020, 0.030, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.030 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.023, 0.038, 0.052, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.038 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.033, 0.050, 0.068, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.050 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.026, 0.045, 0.064, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.045 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.028, 0.047, 0.066, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.047 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.028, 0.049, 0.069, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.049 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.040, 0.070, 0.100, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.070 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.055, 0.095, 0.135, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.095 std_dev=0.040
C2'	B	0, 0.183, 0.325, 0.466, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.325 std_dev=0.141
C1'	B	0, 0.180, 0.345, 0.510, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.345 std_dev=0.165
C4'	B	0, 0.301, 0.522, 0.742, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.522 std_dev=0.221
O4'	B	0, 0.148, 0.374, 0.599, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.374 std_dev=0.225
C3'	B	0, 0.217, 0.463, 0.709, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.463 std_dev=0.246
N9	B	0, 0.406, 0.656, 0.906, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.656 std_dev=0.250
O2'	B	0, 0.234, 0.489, 0.744, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.489 std_dev=0.255
O2'	A	0, 0.426, 0.704, 0.982, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.704 std_dev=0.278
O4'	A	0, 0.400, 0.691, 0.981, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.691 std_dev=0.290
C2'	A	0, 0.425, 0.716, 1.007, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.716 std_dev=0.291
O3'	B	0, 0.408, 0.704, 1.001, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.704 std_dev=0.296
C5'	B	0, 0.457, 0.779, 1.100, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.779 std_dev=0.322
C4	B	0, 0.553, 0.898, 1.242, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.898 std_dev=0.344
O5'	B	0, 0.512, 0.873, 1.233, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.873 std_dev=0.361
C8	B	0, 0.570, 0.943, 1.315, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.943 std_dev=0.372
N3	B	0, 0.590, 0.983, 1.376, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.983 std_dev=0.393
OP2	A	0, 0.535, 0.956, 1.377, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.956 std_dev=0.421
C5	B	0, 0.723, 1.196, 1.670, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.196 std_dev=0.473
C4'	A	0, 0.664, 1.139, 1.614, 1.463 max_d=1.463 avg_d=1.139 std_dev=0.475
P	A	0, 0.699, 1.181, 1.663, 1.635 max_d=1.635 avg_d=1.181 std_dev=0.482
C3'	A	0, 0.688, 1.172, 1.655, 1.492 max_d=1.492 avg_d=1.172 std_dev=0.484
N7	B	0, 0.746, 1.242, 1.738, 1.860 max_d=1.860 avg_d=1.242 std_dev=0.496
P	B	0, 0.657, 1.168, 1.679, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.168 std_dev=0.511
C2	B	0, 0.764, 1.293, 1.822, 1.904 max_d=1.904 avg_d=1.293 std_dev=0.529
O5'	A	0, 0.842, 1.416, 1.989, 1.771 max_d=1.771 avg_d=1.416 std_dev=0.573
OP1	A	0, 0.845, 1.422, 2.000, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.422 std_dev=0.578
C6	B	0, 0.893, 1.500, 2.108, 2.017 max_d=2.017 avg_d=1.500 std_dev=0.608
OP2	B	0, 0.781, 1.389, 1.997, 2.063 max_d=2.063 avg_d=1.389 std_dev=0.608
OP1	B	0, 0.817, 1.428, 2.039, 2.066 max_d=2.066 avg_d=1.428 std_dev=0.611
N1	B	0, 0.897, 1.513, 2.129, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.513 std_dev=0.616
N2	B	0, 0.881, 1.521, 2.161, 2.301 max_d=2.301 avg_d=1.521 std_dev=0.640
O3'	A	0, 1.035, 1.756, 2.477, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.756 std_dev=0.721
C5'	A	0, 1.011, 1.732, 2.453, 2.213 max_d=2.213 avg_d=1.732 std_dev=0.721
O6	B	0, 1.032, 1.756, 2.481, 2.409 max_d=2.409 avg_d=1.756 std_dev=0.724

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.16	0.16
C2	0.02	0.00	0.19	0.25	0.01	0.11	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.32	0.03	0.16	0.19	0.27	0.21
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.01	0.10	0.06	0.15	0.19	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.06
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.15	0.00	0.11	0.01	0.16	0.09	0.22	0.23	0.13	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.10	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.17	0.02	0.12	0.17	0.24	0.19
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.11	0.09	0.10	0.07	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.13	0.16	0.24	0.17
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.17	0.10	0.09	0.13	0.16	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.16	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.20	0.04	0.15	0.18	0.26	0.19
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.14	0.11	0.17	0.12
N1	0.01	0.00	0.15	0.22	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.29	0.04	0.16	0.19	0.27	0.20
N3	0.02	0.00	0.19	0.23	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.28	0.02	0.15	0.19	0.25	0.21
N6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.18	0.05	0.16	0.18	0.26	0.18
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.04	0.15	0.13	0.20	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.09	0.14	0.19	0.17
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.04	0.09	0.04	0.12	0.14	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.04	0.07	0.08
O3'	0.02	0.32	0.02	0.01	0.17	0.02	0.13	0.03	0.20	0.09	0.29	0.28	0.18	0.05	0.04	0.04	0.00	0.02	0.06	0.18	0.10	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.06	0.18	0.21	0.21
O5'	0.04	0.16	0.03	0.04	0.12	0.01	0.13	0.01	0.15	0.14	0.16	0.15	0.16	0.15	0.09	0.02	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.19	0.02	0.09	0.17	0.03	0.16	0.04	0.18	0.11	0.19	0.19	0.18	0.13	0.14	0.04	0.18	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.27	0.07	0.06	0.24	0.06	0.24	0.01	0.26	0.17	0.27	0.25	0.26	0.20	0.19	0.07	0.10	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.21	0.06	0.04	0.19	0.06	0.17	0.01	0.19	0.12	0.20	0.21	0.18	0.13	0.17	0.08	0.09	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.41	0.12	0.06	0.35	0.08	0.41	0.10	0.46	0.33	0.45	0.40	0.34	0.39	0.29	0.13	0.12	0.10	0.07	0.50	0.06	0.14	0.07
C2	0.13	0.19	0.11	0.07	0.19	0.08	0.22	0.10	0.23	0.22	0.21	0.19	0.18	0.24	0.18	0.19	0.12	0.07	0.06	0.25	0.08	0.09	0.06
C2'	0.24	0.37	0.19	0.24	0.32	0.30	0.35	0.32	0.39	0.29	0.40	0.38	0.32	0.33	0.28	0.21	0.31	0.28	0.25	0.41	0.27	0.25	0.24
C3'	0.32	0.36	0.33	0.40	0.32	0.44	0.35	0.47	0.38	0.31	0.39	0.38	0.32	0.33	0.32	0.36	0.50	0.39	0.36	0.40	0.42	0.33	0.35
C4	0.17	0.30	0.12	0.06	0.28	0.07	0.31	0.10	0.34	0.27	0.33	0.29	0.27	0.31	0.24	0.18	0.12	0.09	0.06	0.36	0.08	0.09	0.06
C4'	0.20	0.39	0.19	0.24	0.31	0.27	0.38	0.29	0.44	0.28	0.44	0.40	0.31	0.35	0.26	0.26	0.36	0.22	0.17	0.49	0.21	0.14	0.14
C5	0.15	0.26	0.12	0.07	0.24	0.09	0.27	0.12	0.29	0.23	0.28	0.27	0.24	0.27	0.21	0.19	0.14	0.08	0.07	0.32	0.12	0.07	0.07
C5'	0.21	0.38	0.21	0.27	0.32	0.29	0.39	0.30	0.46	0.30	0.45	0.39	0.31	0.37	0.27	0.29	0.41	0.23	0.17	0.51	0.22	0.14	0.14
C6	0.13	0.20	0.11	0.08	0.18	0.10	0.21	0.13	0.23	0.19	0.21	0.21	0.18	0.22	0.17	0.20	0.15	0.07	0.09	0.25	0.14	0.09	0.10
C8	0.18	0.35	0.13	0.06	0.31	0.08	0.35	0.11	0.39	0.29	0.38	0.35	0.30	0.34	0.26	0.17	0.13	0.09	0.06	0.42	0.10	0.09	0.06
N1	0.12	0.17	0.11	0.08	0.16	0.10	0.19	0.12	0.20	0.18	0.18	0.17	0.16	0.20	0.15	0.20	0.14	0.07	0.09	0.22	0.12	0.09	0.09
N3	0.16	0.27	0.12	0.07	0.26	0.08	0.30	0.09	0.31	0.27	0.30	0.26	0.25	0.30	0.24	0.18	0.11	0.08	0.07	0.33	0.07	0.11	0.06
N6	0.12	0.18	0.11	0.10	0.16	0.11	0.19	0.15	0.20	0.16	0.19	0.19	0.17	0.20	0.14	0.21	0.17	0.07	0.12	0.23	0.19	0.12	0.15
N7	0.16	0.30	0.12	0.06	0.26	0.08	0.30	0.12	0.33	0.25	0.32	0.31	0.26	0.29	0.23	0.19	0.14	0.08	0.07	0.36	0.13	0.07	0.07
N9	0.19	0.36	0.14	0.06	0.32	0.07	0.37	0.10	0.40	0.30	0.39	0.36	0.31	0.35	0.27	0.17	0.11	0.10	0.06	0.43	0.08	0.11	0.06
O2'	0.19	0.38	0.16	0.19	0.30	0.24	0.34	0.26	0.40	0.26	0.42	0.40	0.31	0.31	0.25	0.19	0.25	0.23	0.19	0.42	0.21	0.21	0.19
O3'	0.46	0.37	0.49	0.58	0.37	0.61	0.36	0.63	0.37	0.38	0.38	0.39	0.36	0.35	0.40	0.55	0.70	0.53	0.52	0.39	0.59	0.48	0.51
O4'	0.19	0.45	0.11	0.07	0.39	0.09	0.47	0.10	0.53	0.37	0.52	0.44	0.37	0.45	0.32	0.13	0.16	0.11	0.08	0.58	0.07	0.17	0.09
O5'	0.25	0.39	0.23	0.28	0.34	0.31	0.39	0.35	0.44	0.32	0.44	0.40	0.33	0.37	0.30	0.25	0.41	0.28	0.23	0.48	0.29	0.20	0.22
OP1	0.26	0.37	0.24	0.29	0.32	0.33	0.36	0.37	0.41	0.30	0.41	0.39	0.32	0.34	0.29	0.25	0.41	0.29	0.26	0.45	0.33	0.22	0.25
OP2	0.28	0.33	0.26	0.33	0.31	0.37	0.33	0.44	0.35	0.31	0.35	0.34	0.30	0.33	0.30	0.23	0.42	0.34	0.35	0.37	0.42	0.33	0.36
P	0.25	0.32	0.24	0.30	0.29	0.34	0.32	0.38	0.36	0.28	0.36	0.33	0.28	0.31	0.27	0.25	0.41	0.30	0.27	0.39	0.33	0.23	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.07	0.04
C2	0.04	0.00	0.12	0.13	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.16	0.03	0.07	0.02	0.08	0.12	0.08
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.03	0.10	0.13	0.11	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.06	0.10	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.11	0.06	0.12	0.14	0.11	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.07	0.09	0.06
C4	0.02	0.02	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.06	0.01	0.07	0.12	0.08
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.08	0.06	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.09	0.01	0.11	0.15	0.11
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.09	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.03	0.10	0.01	0.12	0.17	0.13
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.08	0.02	0.09	0.12	0.09
N1	0.04	0.01	0.10	0.12	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.16	0.03	0.09	0.02	0.10	0.15	0.11
N2	0.05	0.01	0.13	0.14	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.18	0.03	0.07	0.03	0.08	0.12	0.08
N3	0.04	0.01	0.11	0.11	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.06	0.02	0.06	0.11	0.07
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.10	0.02	0.13	0.16	0.13
N9	0.00	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.06	0.09	0.06
O2'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.07	0.02	0.09	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.08	0.04
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.10	0.03	0.11	0.03	0.14	0.07	0.16	0.18	0.14	0.09	0.05	0.03	0.00	0.02	0.07	0.15	0.07	0.10	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.03	0.06	0.08	0.06
O5'	0.03	0.07	0.04	0.06	0.06	0.01	0.09	0.01	0.10	0.08	0.09	0.07	0.06	0.10	0.05	0.04	0.07	0.07	0.00	0.12	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.07	0.15	0.03	0.12	0.00	0.15	0.19	0.15
OP1	0.04	0.08	0.06	0.07	0.07	0.03	0.11	0.04	0.12	0.09	0.10	0.08	0.06	0.13	0.06	0.05	0.07	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.12	0.10	0.09	0.12	0.03	0.15	0.01	0.17	0.12	0.15	0.12	0.11	0.16	0.09	0.08	0.10	0.08	0.02	0.19	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.05	0.06	0.08	0.01	0.11	0.01	0.13	0.09	0.11	0.08	0.07	0.13	0.06	0.04	0.06	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00