Doublet Group distance statistics: 50500

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 1, 0, 2, 4, 3, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.031, 0.047, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.016, 0.036, 0.055, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.036 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.017, 0.041, 0.064, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.041 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.022, 0.050, 0.079, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.050 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.025, 0.059, 0.094, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.059 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.099, 0.232, 0.366, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.232 std_dev=0.133
O2'	A	0, 0.119, 0.258, 0.396, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.258 std_dev=0.139
O4'	A	0, 0.068, 0.228, 0.388, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.228 std_dev=0.160
O4'	B	0, 0.276, 0.488, 0.700, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.488 std_dev=0.212
C5'	B	0, 0.341, 0.576, 0.812, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.576 std_dev=0.235
C4'	B	0, 0.227, 0.472, 0.718, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.472 std_dev=0.246
C3'	A	0, 0.103, 0.358, 0.614, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.358 std_dev=0.256
C4'	A	0, 0.060, 0.322, 0.584, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.322 std_dev=0.262
O2'	B	0, 0.277, 0.572, 0.866, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.572 std_dev=0.295
C1'	B	0, 0.315, 0.611, 0.907, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.611 std_dev=0.296
C2'	B	0, 0.275, 0.574, 0.874, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.574 std_dev=0.300
O5'	B	0, 0.401, 0.711, 1.021, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.711 std_dev=0.310
P	B	0, 0.463, 0.797, 1.130, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.797 std_dev=0.334
OP1	B	0, 0.535, 0.906, 1.277, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.906 std_dev=0.371
O3'	A	0, 0.110, 0.482, 0.853, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.482 std_dev=0.371
C5'	A	0, 0.200, 0.593, 0.987, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.593 std_dev=0.393
O5'	A	0, 0.365, 0.787, 1.210, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.787 std_dev=0.422
OP2	B	0, 0.609, 1.064, 1.520, 1.631 max_d=1.631 avg_d=1.064 std_dev=0.455
C3'	B	0, 0.198, 0.685, 1.172, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.685 std_dev=0.487
N9	B	0, 0.442, 0.970, 1.498, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.970 std_dev=0.528
P	A	0, 0.490, 1.020, 1.551, 1.641 max_d=1.641 avg_d=1.020 std_dev=0.530
OP1	A	0, 0.533, 1.073, 1.613, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.073 std_dev=0.540
OP2	A	0, 0.459, 1.083, 1.707, 1.905 max_d=1.905 avg_d=1.083 std_dev=0.624
C8	B	0, 0.500, 1.129, 1.759, 1.872 max_d=1.872 avg_d=1.129 std_dev=0.629
O3'	B	0, 0.340, 1.087, 1.835, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.087 std_dev=0.747
C4	B	0, 0.527, 1.303, 2.079, 2.297 max_d=2.297 avg_d=1.303 std_dev=0.776
N3	B	0, 0.527, 1.371, 2.216, 2.475 max_d=2.475 avg_d=1.371 std_dev=0.844
N7	B	0, 0.608, 1.506, 2.405, 2.566 max_d=2.566 avg_d=1.506 std_dev=0.898
C5	B	0, 0.618, 1.604, 2.590, 2.790 max_d=2.790 avg_d=1.604 std_dev=0.986
C2	B	0, 0.614, 1.734, 2.853, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.734 std_dev=1.120
N2	B	0, 0.642, 1.896, 3.150, 3.488 max_d=3.488 avg_d=1.896 std_dev=1.254
C6	B	0, 0.711, 1.991, 3.270, 3.507 max_d=3.507 avg_d=1.991 std_dev=1.280
N1	B	0, 0.695, 2.012, 3.329, 3.611 max_d=3.611 avg_d=2.012 std_dev=1.317
O6	B	0, 0.804, 2.316, 3.827, 4.081 max_d=4.081 avg_d=2.316 std_dev=1.512

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.07	0.10	0.10	0.16	0.11
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.01	0.09	0.05	0.10	0.09	0.10	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.08	0.10	0.16	0.08
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.14	0.09	0.14	0.09	0.16	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.14	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.09	0.10	0.15	0.10
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.02	0.06	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03
C5	0.00	0.01	0.07	0.12	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.02	0.09	0.12	0.17	0.13
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.06	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.19	0.03	0.09	0.12	0.17	0.14
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.05	0.09	0.11	0.15	0.12
N1	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.05	0.10	0.12	0.17	0.13
N3	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.07	0.10	0.09	0.15	0.10
N6	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.21	0.03	0.10	0.14	0.18	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.15	0.03	0.09	0.12	0.17	0.14
N9	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.09	0.09	0.13	0.09
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.04	0.05	0.10	0.04
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.11	0.02	0.16	0.03	0.19	0.11	0.17	0.10	0.21	0.15	0.07	0.04	0.00	0.01	0.06	0.12	0.13	0.08
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.05	0.06	0.07
O5'	0.08	0.10	0.08	0.06	0.09	0.01	0.09	0.01	0.09	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09	0.04	0.06	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.10	0.10	0.12	0.10	0.04	0.12	0.03	0.12	0.11	0.12	0.09	0.14	0.12	0.09	0.05	0.12	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.16	0.16	0.14	0.15	0.03	0.17	0.01	0.17	0.15	0.17	0.15	0.18	0.17	0.13	0.10	0.13	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.08	0.08	0.10	0.03	0.13	0.02	0.14	0.12	0.13	0.10	0.16	0.14	0.09	0.04	0.08	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	1.21	0.12	0.17	0.86	0.23	0.90	0.26	1.09	0.51	1.23	1.36	1.02	0.70	0.56	0.24	0.44	0.10	0.11	1.12	0.33	0.08	0.15
C2	0.33	0.71	0.18	0.09	0.59	0.13	0.57	0.19	0.62	0.38	0.69	0.75	0.66	0.45	0.46	0.17	0.21	0.18	0.10	0.61	0.26	0.08	0.13
C2'	0.28	1.25	0.13	0.27	0.85	0.30	0.88	0.33	1.09	0.47	1.26	1.44	1.04	0.67	0.54	0.27	0.56	0.10	0.21	1.12	0.41	0.15	0.24
C3'	0.28	1.28	0.17	0.33	0.84	0.35	0.89	0.40	1.12	0.46	1.29	1.50	1.05	0.66	0.53	0.30	0.65	0.13	0.27	1.16	0.50	0.21	0.31
C4	0.32	0.95	0.13	0.13	0.71	0.19	0.70	0.24	0.82	0.41	0.93	1.05	0.84	0.53	0.49	0.16	0.37	0.14	0.12	0.82	0.35	0.08	0.17
C4'	0.27	1.31	0.12	0.23	0.89	0.27	0.96	0.30	1.20	0.52	1.36	1.50	1.06	0.74	0.56	0.28	0.54	0.08	0.15	1.26	0.38	0.08	0.18
C5	0.30	0.84	0.11	0.15	0.61	0.18	0.58	0.25	0.69	0.33	0.80	0.95	0.75	0.42	0.43	0.15	0.40	0.15	0.16	0.68	0.42	0.14	0.23
C5'	0.30	1.30	0.11	0.21	0.89	0.24	0.96	0.27	1.20	0.52	1.35	1.50	1.06	0.74	0.57	0.23	0.53	0.11	0.13	1.26	0.39	0.09	0.17
C6	0.29	0.67	0.13	0.13	0.50	0.15	0.46	0.23	0.53	0.27	0.63	0.76	0.62	0.33	0.36	0.15	0.34	0.19	0.17	0.50	0.42	0.17	0.24
C8	0.31	1.04	0.10	0.19	0.73	0.21	0.72	0.28	0.88	0.39	1.02	1.19	0.90	0.53	0.48	0.17	0.48	0.12	0.16	0.89	0.44	0.13	0.23
N1	0.31	0.59	0.17	0.10	0.47	0.12	0.43	0.20	0.48	0.28	0.55	0.65	0.56	0.32	0.36	0.17	0.24	0.21	0.14	0.45	0.33	0.12	0.19
N3	0.33	0.92	0.16	0.10	0.72	0.16	0.72	0.21	0.82	0.45	0.90	0.98	0.83	0.57	0.52	0.17	0.28	0.14	0.10	0.82	0.27	0.08	0.13
N6	0.28	0.59	0.13	0.15	0.42	0.14	0.37	0.24	0.42	0.23	0.53	0.68	0.54	0.26	0.31	0.17	0.35	0.20	0.21	0.39	0.49	0.25	0.30
N7	0.30	0.91	0.10	0.19	0.64	0.19	0.62	0.28	0.74	0.33	0.88	1.05	0.80	0.44	0.43	0.15	0.46	0.14	0.19	0.74	0.47	0.17	0.26
N9	0.31	1.08	0.12	0.16	0.78	0.21	0.79	0.26	0.94	0.44	1.07	1.21	0.93	0.60	0.52	0.19	0.43	0.12	0.13	0.95	0.37	0.08	0.18
O2'	0.27	1.36	0.09	0.20	0.92	0.26	0.99	0.27	1.22	0.55	1.39	1.56	1.11	0.77	0.58	0.29	0.49	0.08	0.12	1.27	0.30	0.07	0.15
O3'	0.26	1.33	0.22	0.42	0.85	0.43	0.91	0.47	1.16	0.45	1.35	1.57	1.06	0.67	0.51	0.36	0.75	0.16	0.34	1.22	0.57	0.27	0.38
O4'	0.30	1.26	0.13	0.16	0.89	0.22	0.96	0.25	1.17	0.54	1.31	1.42	1.04	0.76	0.58	0.25	0.44	0.13	0.11	1.23	0.32	0.12	0.15
O5'	0.36	1.28	0.13	0.16	0.88	0.18	0.91	0.24	1.13	0.51	1.29	1.47	1.07	0.69	0.59	0.13	0.46	0.17	0.14	1.16	0.40	0.10	0.19
OP1	0.37	1.31	0.15	0.15	0.89	0.17	0.92	0.24	1.15	0.51	1.33	1.52	1.08	0.70	0.59	0.14	0.46	0.18	0.14	1.20	0.42	0.12	0.20
OP2	0.42	1.21	0.23	0.15	0.84	0.16	0.82	0.24	1.00	0.45	1.18	1.42	1.04	0.60	0.58	0.18	0.37	0.25	0.18	1.01	0.45	0.17	0.25
P	0.37	1.24	0.15	0.14	0.85	0.16	0.87	0.23	1.08	0.48	1.24	1.43	1.04	0.66	0.57	0.11	0.42	0.19	0.15	1.11	0.41	0.13	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.07	0.17	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.02	0.22	0.01	0.24	0.41	0.30
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.14	0.11	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.05	0.10	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.10	0.07	0.14	0.10	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.21	0.01	0.23	0.37	0.28
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.25	0.01	0.31	0.45	0.36
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.10	0.00	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.09	0.08	0.16	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.16	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.26	0.00	0.34	0.49	0.39
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.23	0.02	0.27	0.35	0.32
N1	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.25	0.01	0.30	0.47	0.35
N2	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.18	0.03	0.21	0.02	0.22	0.40	0.28
N3	0.02	0.01	0.11	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02	0.20	0.01	0.20	0.35	0.26
N7	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.26	0.02	0.34	0.46	0.38
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.19	0.01	0.19	0.29	0.24
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.10	0.15	0.11	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.08	0.10	0.06	0.04
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.12	0.09	0.18	0.12	0.12	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.09	0.17	0.15	0.12
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.03	0.05	0.10	0.08
O5'	0.10	0.22	0.06	0.04	0.21	0.01	0.25	0.01	0.26	0.23	0.25	0.21	0.20	0.26	0.19	0.04	0.08	0.06	0.00	0.27	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.03	0.27	0.00	0.39	0.53	0.42
OP1	0.07	0.24	0.05	0.07	0.23	0.04	0.31	0.03	0.34	0.27	0.30	0.22	0.20	0.34	0.19	0.10	0.17	0.05	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.41	0.10	0.06	0.37	0.03	0.45	0.01	0.49	0.35	0.47	0.40	0.35	0.46	0.29	0.06	0.15	0.10	0.02	0.53	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.30	0.06	0.04	0.28	0.01	0.36	0.01	0.39	0.32	0.35	0.28	0.26	0.38	0.24	0.04	0.12	0.08	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00