Doublet Group distance statistics: 50503

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.013 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N9	A	0, -0.003, 0.016, 0.035, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.016 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.023 std_dev=0.024
P	B	0, 0.064, 0.297, 0.531, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.297 std_dev=0.233
O5'	B	0, 0.075, 0.309, 0.543, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.309 std_dev=0.234
C5'	B	0, 0.068, 0.319, 0.570, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.319 std_dev=0.251
C3'	B	0, 0.124, 0.395, 0.666, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.395 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.161, 0.436, 0.711, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.436 std_dev=0.275
C4'	B	0, 0.085, 0.378, 0.672, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.378 std_dev=0.294
OP1	B	0, 0.076, 0.374, 0.673, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.374 std_dev=0.299
C1'	B	0, 0.105, 0.430, 0.755, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.430 std_dev=0.325
O4'	B	0, 0.023, 0.389, 0.755, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.389 std_dev=0.366
N9	B	0, 0.078, 0.463, 0.849, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.463 std_dev=0.385
O2'	B	0, 0.133, 0.577, 1.021, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.577 std_dev=0.444
OP2	B	0, -0.036, 0.421, 0.878, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.421 std_dev=0.457
C4	B	0, 0.093, 0.557, 1.021, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.557 std_dev=0.464
O3'	B	0, 0.066, 0.544, 1.023, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.544 std_dev=0.479
N3	B	0, 0.112, 0.600, 1.089, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.600 std_dev=0.488
C8	B	0, -0.032, 0.517, 1.067, 2.301 max_d=2.301 avg_d=0.517 std_dev=0.549
C2	B	0, 0.075, 0.706, 1.337, 2.342 max_d=2.342 avg_d=0.706 std_dev=0.631
O4'	A	0, -0.400, 0.249, 0.899, 2.584 max_d=2.584 avg_d=0.249 std_dev=0.649
C5	B	0, 0.006, 0.656, 1.307, 2.483 max_d=2.483 avg_d=0.656 std_dev=0.650
C2'	A	0, -0.405, 0.250, 0.905, 2.604 max_d=2.604 avg_d=0.250 std_dev=0.655
N7	B	0, -0.085, 0.644, 1.373, 2.955 max_d=2.955 avg_d=0.644 std_dev=0.729
N2	B	0, 0.049, 0.787, 1.525, 2.797 max_d=2.797 avg_d=0.787 std_dev=0.738
O2'	A	0, -0.445, 0.301, 1.047, 2.981 max_d=2.981 avg_d=0.301 std_dev=0.746
N1	B	0, 0.021, 0.783, 1.544, 2.744 max_d=2.744 avg_d=0.783 std_dev=0.762
C6	B	0, -0.029, 0.785, 1.600, 2.823 max_d=2.823 avg_d=0.785 std_dev=0.814
C4'	A	0, -0.550, 0.367, 1.284, 3.666 max_d=3.666 avg_d=0.367 std_dev=0.917
C3'	A	0, -0.631, 0.390, 1.412, 4.065 max_d=4.065 avg_d=0.390 std_dev=1.021
O6	B	0, -0.126, 0.911, 1.947, 3.623 max_d=3.623 avg_d=0.911 std_dev=1.036
O3'	A	0, -0.840, 0.545, 1.930, 5.524 max_d=5.524 avg_d=0.545 std_dev=1.385
C5'	A	0, -0.978, 0.641, 2.260, 6.466 max_d=6.466 avg_d=0.641 std_dev=1.619
O5'	A	0, -0.941, 0.765, 2.471, 6.854 max_d=6.854 avg_d=0.765 std_dev=1.706
P	A	0, -1.287, 1.008, 3.302, 9.207 max_d=9.207 avg_d=1.008 std_dev=2.294
OP2	A	0, -1.419, 1.112, 3.643, 10.178 max_d=10.178 avg_d=1.112 std_dev=2.531
OP1	A	0, -1.431, 1.182, 3.795, 10.495 max_d=10.495 avg_d=1.182 std_dev=2.613

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.07	0.20	0.10
C2	0.01	0.00	0.15	0.52	0.01	0.46	0.01	0.70	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.52	0.26	0.42	0.59	0.58	0.59
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.09	0.11	0.16	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.14	0.32	0.19
C3'	0.00	0.52	0.00	0.00	0.22	0.00	0.07	0.01	0.18	0.29	0.37	0.51	0.10	0.20	0.04	0.01	0.00	0.01	0.19	0.24	0.35	0.23
C4	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.20	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.20	0.14	0.14	0.22	0.13	0.16
C4'	0.01	0.46	0.01	0.00	0.20	0.00	0.07	0.00	0.18	0.26	0.35	0.45	0.11	0.17	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.07	0.28	0.23	0.31	0.25
C5'	0.01	0.70	0.01	0.01	0.28	0.00	0.11	0.00	0.26	0.40	0.53	0.64	0.16	0.28	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.18	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.18	0.00	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.17	0.12	0.21	0.29	0.20	0.22
C8	0.01	0.01	0.09	0.29	0.01	0.26	0.00	0.40	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.27	0.14	0.69	0.53	0.81	0.69
N1	0.01	0.00	0.11	0.37	0.01	0.35	0.01	0.53	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.38	0.20	0.28	0.47	0.38	0.42
N3	0.01	0.00	0.16	0.51	0.00	0.45	0.01	0.64	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.49	0.26	0.37	0.50	0.47	0.50
N6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.09	0.29	0.30	0.30	0.28
N7	0.00	0.02	0.07	0.20	0.01	0.17	0.01	0.28	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.20	0.07	0.61	0.49	0.75	0.63
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.28	0.17	0.34	0.24
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.07	0.24	0.10
O3'	0.01	0.52	0.02	0.00	0.20	0.01	0.06	0.02	0.17	0.27	0.38	0.49	0.09	0.20	0.03	0.03	0.00	0.01	0.15	0.28	0.38	0.25
O4'	0.01	0.26	0.01	0.01	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.14	0.20	0.26	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.09	0.06	0.07
O5'	0.13	0.42	0.16	0.19	0.14	0.01	0.28	0.01	0.21	0.69	0.28	0.37	0.29	0.61	0.28	0.07	0.15	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.59	0.14	0.24	0.22	0.07	0.23	0.18	0.29	0.53	0.47	0.50	0.30	0.49	0.17	0.07	0.28	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.58	0.32	0.35	0.13	0.08	0.31	0.06	0.20	0.81	0.38	0.47	0.30	0.75	0.34	0.24	0.38	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.59	0.19	0.23	0.16	0.02	0.25	0.02	0.22	0.69	0.42	0.50	0.28	0.63	0.24	0.10	0.25	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.19	0.12	0.12	0.23	0.16	0.37	0.09	0.39	0.39	0.29	0.16	0.15	0.48	0.22	0.23	0.22	0.09	0.18	0.48	0.16	0.42	0.18
C2	0.19	0.19	0.20	0.20	0.31	0.22	0.48	0.14	0.46	0.57	0.33	0.10	0.15	0.62	0.34	0.37	0.34	0.19	0.26	0.55	0.13	0.41	0.21
C2'	0.29	0.26	0.31	0.36	0.32	0.30	0.41	0.39	0.40	0.47	0.33	0.21	0.24	0.50	0.36	0.24	0.34	0.28	0.51	0.46	0.26	0.58	0.48
C3'	0.88	0.88	0.90	0.94	0.96	0.83	1.05	0.91	1.03	1.13	0.95	0.81	0.87	1.15	1.00	0.77	0.87	0.84	1.16	1.06	0.75	1.25	1.10
C4	0.16	0.16	0.17	0.17	0.27	0.20	0.43	0.12	0.43	0.51	0.29	0.08	0.13	0.58	0.30	0.32	0.31	0.15	0.25	0.52	0.13	0.44	0.21
C4'	0.72	0.92	0.65	0.63	0.97	0.50	1.13	0.54	1.16	1.13	1.05	0.84	0.85	1.24	0.94	0.48	0.47	0.64	0.89	1.26	0.43	1.22	0.89
C5	0.18	0.18	0.20	0.20	0.30	0.21	0.47	0.14	0.47	0.54	0.33	0.10	0.14	0.62	0.32	0.36	0.36	0.18	0.25	0.58	0.14	0.43	0.21
C5'	1.13	1.49	1.05	0.97	1.52	0.79	1.75	0.79	1.81	1.69	1.67	1.40	1.39	1.88	1.45	0.80	0.75	1.00	1.23	1.94	0.67	1.68	1.20
C6	0.20	0.24	0.22	0.22	0.34	0.23	0.52	0.15	0.53	0.58	0.39	0.17	0.18	0.67	0.36	0.40	0.40	0.20	0.26	0.64	0.14	0.43	0.21
C8	0.15	0.16	0.16	0.17	0.26	0.18	0.43	0.11	0.43	0.49	0.30	0.09	0.13	0.57	0.28	0.30	0.31	0.14	0.23	0.54	0.15	0.44	0.20
N1	0.20	0.25	0.22	0.23	0.35	0.23	0.53	0.16	0.54	0.59	0.40	0.18	0.19	0.67	0.37	0.41	0.39	0.21	0.26	0.64	0.14	0.41	0.21
N3	0.15	0.16	0.17	0.17	0.27	0.21	0.42	0.12	0.41	0.52	0.28	0.09	0.13	0.57	0.30	0.31	0.29	0.15	0.26	0.49	0.11	0.43	0.22
N6	0.21	0.29	0.24	0.25	0.37	0.24	0.56	0.17	0.59	0.59	0.45	0.23	0.21	0.69	0.37	0.42	0.43	0.22	0.26	0.70	0.15	0.42	0.21
N7	0.17	0.17	0.19	0.20	0.29	0.21	0.46	0.13	0.47	0.53	0.32	0.09	0.13	0.61	0.31	0.35	0.36	0.17	0.25	0.58	0.15	0.44	0.21
N9	0.14	0.17	0.15	0.15	0.25	0.18	0.41	0.10	0.41	0.47	0.29	0.11	0.13	0.55	0.26	0.28	0.27	0.12	0.23	0.51	0.14	0.44	0.20
O2'	0.13	0.32	0.07	0.07	0.26	0.06	0.33	0.07	0.39	0.23	0.37	0.32	0.26	0.32	0.18	0.08	0.11	0.11	0.12	0.45	0.09	0.16	0.10
O3'	1.02	0.96	1.14	1.24	1.04	1.08	1.08	1.18	1.05	1.15	1.00	0.92	0.97	1.15	1.08	1.03	1.25	0.98	1.39	1.06	1.17	1.46	1.44
O4'	0.33	0.56	0.20	0.13	0.61	0.08	0.80	0.09	0.84	0.78	0.72	0.48	0.49	0.92	0.57	0.11	0.10	0.26	0.42	0.96	0.04	0.76	0.42
O5'	0.84	1.30	0.74	0.67	1.33	0.48	1.63	0.51	1.73	1.52	1.55	1.18	1.16	1.78	1.22	0.45	0.43	0.70	0.99	1.93	0.54	1.56	1.03
OP1	1.01	1.68	0.86	0.72	1.65	0.52	2.02	0.51	2.21	1.78	2.01	1.57	1.48	2.13	1.47	0.54	0.43	0.82	1.01	2.49	0.49	1.60	1.02
OP2	1.33	1.97	1.29	1.20	1.95	0.89	2.32	0.85	2.49	2.08	2.28	1.85	1.78	2.44	1.78	0.98	0.97	1.09	1.35	2.75	0.89	1.95	1.33
P	1.13	1.73	1.02	0.91	1.73	0.68	2.09	0.67	2.24	1.89	2.03	1.60	1.55	2.23	1.57	0.70	0.64	0.93	1.17	2.49	0.66	1.74	1.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.10	0.08
C2	0.03	0.00	0.12	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.14	0.19	0.03	0.22	0.00	0.32	0.42	0.33
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.09	0.14	0.12	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.13	0.09	0.05
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.10	0.07	0.14	0.18	0.14	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.17	0.08	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.02	0.19	0.01	0.23	0.31	0.26
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.06	0.05	0.09	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.03	0.02
C5	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.24	0.01	0.29	0.39	0.34
C5'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.18	0.14	0.17	0.12	0.10	0.18	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.21	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.11	0.04	0.27	0.00	0.35	0.47	0.39
C8	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.05	0.19	0.02	0.18	0.21	0.23
N1	0.02	0.00	0.09	0.14	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.16	0.03	0.25	0.00	0.35	0.48	0.38
N2	0.04	0.00	0.14	0.18	0.01	0.06	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.18	0.23	0.04	0.21	0.01	0.33	0.43	0.32
N3	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.03	0.18	0.01	0.26	0.34	0.26
N7	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.09	0.00	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.05	0.24	0.02	0.27	0.34	0.33
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.14	0.01	0.14	0.19	0.18
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.03	0.12	0.18	0.13	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.14	0.08	0.05
O3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.10	0.01	0.08	0.03	0.11	0.07	0.16	0.23	0.16	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.08	0.10	0.26	0.13	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.04	0.04	0.06
O5'	0.06	0.22	0.03	0.04	0.19	0.01	0.24	0.01	0.27	0.19	0.25	0.21	0.18	0.24	0.14	0.02	0.08	0.04	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.05	0.30	0.00	0.39	0.52	0.44
OP1	0.07	0.32	0.13	0.17	0.23	0.06	0.29	0.04	0.35	0.18	0.35	0.33	0.26	0.27	0.14	0.14	0.26	0.04	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.42	0.09	0.08	0.31	0.03	0.39	0.01	0.47	0.21	0.48	0.43	0.34	0.34	0.19	0.08	0.13	0.04	0.01	0.52	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.33	0.05	0.08	0.26	0.02	0.34	0.01	0.39	0.23	0.38	0.32	0.26	0.33	0.18	0.05	0.15	0.06	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00