Doublet Group distance statistics: 50511

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.014, 0.030, 0.047, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.017, 0.039, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.039 std_dev=0.022
O2'	B	0, 0.251, 0.486, 0.721, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.486 std_dev=0.235
C2'	B	0, 0.308, 0.626, 0.944, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.626 std_dev=0.318
O4'	A	0, -0.020, 0.391, 0.802, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.391 std_dev=0.411
C2'	A	0, -0.031, 0.406, 0.842, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.406 std_dev=0.437
C4'	A	0, 0.013, 0.586, 1.158, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.586 std_dev=0.572
C3'	A	0, -0.061, 0.683, 1.427, 2.584 max_d=2.584 avg_d=0.683 std_dev=0.744
O2'	A	0, -0.215, 0.538, 1.291, 2.590 max_d=2.590 avg_d=0.538 std_dev=0.753
O3'	A	0, -0.096, 0.983, 2.062, 3.757 max_d=3.757 avg_d=0.983 std_dev=1.079
O5'	A	0, 0.109, 1.229, 2.349, 3.844 max_d=3.844 avg_d=1.229 std_dev=1.120
C3'	B	0, 0.304, 1.478, 2.651, 2.903 max_d=2.903 avg_d=1.478 std_dev=1.174
C5'	A	0, -0.059, 1.127, 2.313, 4.106 max_d=4.106 avg_d=1.127 std_dev=1.186
C1'	B	0, 0.614, 2.161, 3.707, 3.715 max_d=3.715 avg_d=2.161 std_dev=1.547
OP1	A	0, 0.434, 2.099, 3.763, 5.534 max_d=5.534 avg_d=2.099 std_dev=1.665
P	A	0, 0.309, 2.126, 3.943, 6.158 max_d=6.158 avg_d=2.126 std_dev=1.817
O3'	B	0, 0.459, 2.399, 4.339, 4.639 max_d=4.639 avg_d=2.399 std_dev=1.940
N9	B	0, 0.743, 2.825, 4.906, 4.818 max_d=4.818 avg_d=2.825 std_dev=2.081
C4'	B	0, 0.532, 2.713, 4.894, 5.183 max_d=5.183 avg_d=2.713 std_dev=2.181
O4'	B	0, 0.714, 2.978, 5.242, 5.364 max_d=5.364 avg_d=2.978 std_dev=2.264
OP2	A	0, 0.384, 2.754, 5.124, 8.007 max_d=8.007 avg_d=2.754 std_dev=2.370
C8	B	0, 0.876, 3.302, 5.728, 5.603 max_d=5.603 avg_d=3.302 std_dev=2.426
C4	B	0, 0.839, 3.571, 6.302, 6.185 max_d=6.185 avg_d=3.571 std_dev=2.732
N7	B	0, 1.034, 3.961, 6.888, 6.607 max_d=6.607 avg_d=3.961 std_dev=2.927
N3	B	0, 0.785, 3.871, 6.957, 6.975 max_d=6.975 avg_d=3.871 std_dev=3.086
O5'	B	0, 0.176, 3.387, 6.598, 7.094 max_d=7.094 avg_d=3.387 std_dev=3.211
C5	B	0, 1.026, 4.274, 7.521, 7.267 max_d=7.267 avg_d=4.274 std_dev=3.247
C5'	B	0, 0.563, 3.850, 7.136, 7.555 max_d=7.555 avg_d=3.850 std_dev=3.286
OP2	B	0, 0.454, 4.154, 7.855, 8.393 max_d=8.393 avg_d=4.154 std_dev=3.701
C2	B	0, 0.935, 5.083, 9.230, 9.258 max_d=9.258 avg_d=5.083 std_dev=4.148
C6	B	0, 1.204, 5.422, 9.640, 9.366 max_d=9.366 avg_d=5.422 std_dev=4.218
P	B	0, 0.079, 4.445, 8.812, 9.443 max_d=9.443 avg_d=4.445 std_dev=4.366
N1	B	0, 1.145, 5.801, 10.456, 10.343 max_d=10.343 avg_d=5.801 std_dev=4.655
O6	B	0, 1.393, 6.184, 10.975, 10.579 max_d=10.579 avg_d=6.184 std_dev=4.791
N2	B	0, 0.897, 5.777, 10.658, 10.837 max_d=10.837 avg_d=5.777 std_dev=4.881
OP1	B	0, 0.080, 5.293, 10.507, 11.217 max_d=11.217 avg_d=5.293 std_dev=5.213

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.11	0.09	0.21	0.08
C2	0.03	0.00	0.26	0.16	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.54	0.28	0.07	0.19	0.12	0.40	0.13
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.12	0.01	0.04	0.14	0.09	0.14	0.19	0.27	0.05	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.20	0.13	0.07
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.16	0.41	0.09	0.17	0.23	0.38	0.18	0.01	0.00	0.01	0.27	0.43	0.21	0.25
C4	0.02	0.00	0.12	0.09	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.32	0.11	0.04	0.24	0.12	0.48	0.19
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.05	0.17	0.05	0.09	0.08	0.15	0.06	0.21	0.03	0.00	0.01	0.18	0.14	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.21	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.11	0.00	0.35	0.18	0.71	0.31
C5'	0.06	0.25	0.14	0.01	0.14	0.00	0.12	0.00	0.15	0.20	0.21	0.23	0.16	0.18	0.07	0.07	0.14	0.01	0.01	0.29	0.26	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.16	0.01	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.36	0.10	0.02	0.33	0.19	0.72	0.30
C8	0.01	0.01	0.14	0.41	0.00	0.17	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.27	0.06	0.44	0.21	0.77	0.40
N1	0.02	0.00	0.19	0.09	0.00	0.05	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.47	0.16	0.05	0.26	0.15	0.56	0.21
N3	0.03	0.00	0.27	0.17	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.52	0.31	0.08	0.15	0.09	0.33	0.10
N6	0.01	0.01	0.05	0.23	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.32	0.17	0.01	0.39	0.23	0.86	0.39
N7	0.01	0.00	0.09	0.38	0.01	0.15	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.28	0.04	0.46	0.24	0.92	0.46
N9	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.03	0.00	0.26	0.13	0.47	0.21
O2'	0.02	0.54	0.00	0.01	0.32	0.21	0.26	0.07	0.36	0.05	0.47	0.52	0.32	0.11	0.12	0.00	0.06	0.17	0.22	0.34	0.14	0.16
O3'	0.19	0.28	0.02	0.00	0.11	0.03	0.11	0.14	0.10	0.27	0.16	0.31	0.17	0.28	0.03	0.06	0.00	0.17	0.29	0.59	0.35	0.36
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.17	0.17	0.00	0.05	0.05	0.18	0.10
O5'	0.11	0.19	0.11	0.27	0.24	0.01	0.35	0.01	0.33	0.44	0.26	0.15	0.39	0.46	0.26	0.22	0.29	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.12	0.20	0.43	0.12	0.18	0.18	0.29	0.19	0.21	0.15	0.09	0.23	0.24	0.13	0.34	0.59	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.40	0.13	0.21	0.48	0.14	0.71	0.26	0.72	0.77	0.56	0.33	0.86	0.92	0.47	0.14	0.35	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.13	0.07	0.25	0.19	0.02	0.31	0.01	0.30	0.40	0.21	0.10	0.39	0.46	0.21	0.16	0.36	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	2.67	0.16	0.77	1.31	1.50	1.32	2.07	1.99	0.17	2.61	3.43	1.99	0.62	0.46	0.19	1.02	1.02	1.68	2.03	2.59	1.59	2.08
C2	0.45	1.43	0.19	0.45	0.66	1.14	0.61	1.36	0.93	0.39	1.29	1.84	1.13	0.33	0.32	0.11	0.38	1.08	1.10	0.90	1.38	0.96	1.27
C2'	0.67	2.72	0.47	0.99	1.28	1.83	1.27	2.50	1.97	0.55	2.66	3.54	1.99	0.61	0.60	0.52	1.11	1.46	2.11	2.01	3.14	2.05	2.60
C3'	0.68	2.61	0.45	0.94	1.22	1.76	1.22	2.42	1.90	0.63	2.57	3.41	1.89	0.65	0.63	0.47	1.04	1.45	2.08	1.96	3.13	2.07	2.60
C4	0.34	1.89	0.18	0.55	0.84	1.26	0.81	1.64	1.27	0.30	1.76	2.48	1.41	0.33	0.28	0.13	0.58	1.07	1.34	1.26	1.86	1.23	1.62
C4'	0.34	2.88	0.27	0.76	1.46	1.48	1.50	2.11	2.23	0.37	2.88	3.66	2.13	0.79	0.62	0.27	1.02	1.01	1.75	2.31	2.83	1.71	2.23
C5	0.43	1.50	0.21	0.36	0.65	1.03	0.65	1.33	1.00	0.47	1.40	2.02	1.10	0.42	0.35	0.12	0.25	1.03	1.11	1.00	1.47	1.05	1.36
C5'	0.52	2.85	0.44	0.71	1.54	1.34	1.61	1.92	2.28	0.65	2.87	3.56	2.14	1.00	0.81	0.37	0.90	0.96	1.59	2.38	2.61	1.56	2.05
C6	0.53	1.19	0.23	0.20	0.61	0.80	0.65	0.99	0.86	0.62	1.12	1.57	0.88	0.59	0.50	0.15	0.10	0.99	0.85	0.88	1.01	0.80	1.03
C8	0.33	1.93	0.19	0.52	0.84	1.22	0.83	1.65	1.33	0.32	1.84	2.57	1.40	0.35	0.28	0.13	0.54	1.04	1.37	1.35	1.98	1.32	1.71
N1	0.56	1.09	0.23	0.21	0.60	0.81	0.61	0.96	0.78	0.60	1.01	1.41	0.85	0.56	0.50	0.14	0.09	1.00	0.81	0.78	0.92	0.74	0.96
N3	0.33	1.97	0.17	0.64	0.92	1.37	0.88	1.73	1.34	0.23	1.82	2.54	1.53	0.35	0.30	0.16	0.72	1.10	1.39	1.32	1.89	1.23	1.63
N6	0.58	1.12	0.25	0.14	0.74	0.57	0.83	0.69	1.00	0.76	1.14	1.39	0.84	0.81	0.65	0.21	0.40	0.90	0.62	1.05	0.63	0.63	0.77
N7	0.40	1.58	0.21	0.37	0.67	1.05	0.68	1.38	1.07	0.46	1.50	2.14	1.13	0.42	0.33	0.12	0.27	1.02	1.16	1.09	1.60	1.13	1.45
N9	0.28	2.18	0.17	0.64	1.00	1.35	0.98	1.82	1.53	0.21	2.08	2.86	1.62	0.39	0.31	0.16	0.74	1.06	1.49	1.55	2.18	1.40	1.83
O2'	0.90	3.18	0.77	1.11	1.66	1.90	1.67	2.62	2.44	0.70	3.17	4.04	2.38	0.93	0.92	0.90	1.30	1.47	2.17	2.51	3.36	2.08	2.69
O3'	0.87	2.65	0.63	1.09	1.21	1.95	1.18	2.68	1.89	0.76	2.62	3.50	1.90	0.63	0.71	0.71	1.14	1.66	2.34	1.95	3.50	2.39	2.93
O4'	0.17	2.81	0.18	0.69	1.47	1.33	1.52	1.90	2.19	0.33	2.80	3.55	2.12	0.83	0.63	0.14	1.01	0.80	1.54	2.26	2.50	1.46	1.94
O5'	0.29	2.27	0.13	0.72	1.03	1.40	1.07	1.92	1.70	0.32	2.27	2.97	1.62	0.50	0.33	0.15	0.88	1.07	1.66	1.78	2.53	1.64	2.08
OP1	0.29	2.35	0.21	0.61	1.12	1.27	1.18	1.81	1.82	0.41	2.38	3.04	1.69	0.64	0.45	0.17	0.73	0.97	1.58	1.92	2.49	1.61	2.04
OP2	0.37	1.88	0.29	0.58	0.85	1.17	0.94	1.59	1.46	0.51	1.91	2.47	1.32	0.61	0.37	0.45	0.68	1.00	1.46	1.57	2.17	1.48	1.86
P	0.25	2.25	0.19	0.53	1.10	1.16	1.17	1.64	1.76	0.41	2.27	2.89	1.63	0.67	0.45	0.20	0.66	0.89	1.42	1.86	2.24	1.42	1.84

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.23	0.01	0.24	0.15	0.23
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.29	0.01	0.25	0.33	0.34
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.10	0.09	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.02	0.09	0.04	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.10	0.07	0.12	0.09	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.11	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.34	0.01	0.32	0.34	0.38
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.42	0.01	0.41	0.45	0.48
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.10	0.10	0.08	0.07	0.11	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.12	0.27	0.24	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.41	0.00	0.40	0.48	0.49
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.47	0.01	0.48	0.42	0.51
N1	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.35	0.01	0.32	0.42	0.42
N2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.03	0.24	0.01	0.19	0.30	0.29
N3	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02	0.27	0.01	0.23	0.28	0.30
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.49	0.01	0.50	0.52	0.56
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.36	0.01	0.34	0.30	0.37
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.09	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.11	0.07	0.06
O3'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.11	0.08	0.16	0.11	0.10	0.04	0.04	0.00	0.01	0.32	0.06	0.32	0.30	0.31
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.02	0.30	0.09	0.23
O5'	0.23	0.29	0.06	0.06	0.34	0.01	0.42	0.00	0.41	0.47	0.35	0.24	0.27	0.49	0.36	0.06	0.32	0.24	0.00	0.44	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.44	0.00	0.46	0.55	0.54
OP1	0.24	0.25	0.09	0.11	0.32	0.12	0.41	0.27	0.40	0.48	0.32	0.19	0.23	0.50	0.34	0.11	0.32	0.30	0.01	0.46	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.33	0.04	0.10	0.34	0.13	0.45	0.24	0.48	0.42	0.42	0.30	0.28	0.52	0.30	0.07	0.30	0.09	0.02	0.55	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.34	0.06	0.07	0.38	0.02	0.48	0.01	0.49	0.51	0.42	0.29	0.30	0.56	0.37	0.06	0.31	0.23	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00