Doublet Group distance statistics: 50513

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 4, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.022, 0.040, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.003, 0.024, 0.045, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.001, 0.025, 0.050, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.025 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.034 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.031, 0.085, 0.139, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.085 std_dev=0.054
O2'	A	0, 0.027, 0.091, 0.156, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.091 std_dev=0.064
O4'	A	0, 0.012, 0.093, 0.174, 0.272 max_d=0.272 avg_d=0.093 std_dev=0.081
C3'	A	0, 0.033, 0.158, 0.284, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.158 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.022, 0.167, 0.312, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.167 std_dev=0.145
O3'	A	0, 0.071, 0.231, 0.390, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.231 std_dev=0.160
C5'	A	0, 0.033, 0.274, 0.516, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.274 std_dev=0.242
O2'	B	0, 0.156, 0.411, 0.666, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.411 std_dev=0.255
C2'	B	0, 0.146, 0.403, 0.661, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.403 std_dev=0.257
C3'	B	0, 0.076, 0.386, 0.697, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.386 std_dev=0.310
C4'	B	0, 0.045, 0.358, 0.671, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.358 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.098, 0.489, 0.880, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.489 std_dev=0.391
O3'	B	0, 0.006, 0.513, 1.020, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.513 std_dev=0.507
C5'	B	0, -0.027, 0.505, 1.037, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.505 std_dev=0.532
O4'	B	0, -0.047, 0.500, 1.047, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.500 std_dev=0.547
O5'	A	0, -0.160, 0.387, 0.935, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.387 std_dev=0.548
P	A	0, -0.089, 0.461, 1.011, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.461 std_dev=0.550
OP2	A	0, -0.089, 0.479, 1.047, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.479 std_dev=0.568
N9	B	0, -0.028, 0.568, 1.163, 2.014 max_d=2.014 avg_d=0.568 std_dev=0.595
OP1	A	0, -0.059, 0.541, 1.140, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.541 std_dev=0.600
O5'	B	0, -0.065, 0.666, 1.396, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.666 std_dev=0.731
C8	B	0, -0.099, 0.642, 1.384, 2.495 max_d=2.495 avg_d=0.642 std_dev=0.741
C4	B	0, -0.196, 0.639, 1.474, 2.766 max_d=2.766 avg_d=0.639 std_dev=0.835
N3	B	0, -0.280, 0.667, 1.613, 3.105 max_d=3.105 avg_d=0.667 std_dev=0.946
N7	B	0, -0.271, 0.727, 1.724, 3.289 max_d=3.289 avg_d=0.727 std_dev=0.998
C5	B	0, -0.325, 0.722, 1.769, 3.423 max_d=3.423 avg_d=0.722 std_dev=1.047
C2	B	0, -0.476, 0.769, 2.014, 4.012 max_d=4.012 avg_d=0.769 std_dev=1.245
C6	B	0, -0.526, 0.818, 2.162, 4.322 max_d=4.322 avg_d=0.818 std_dev=1.344
N1	B	0, -0.575, 0.834, 2.243, 4.514 max_d=4.514 avg_d=0.834 std_dev=1.409
N2	B	0, -0.608, 0.851, 2.310, 4.664 max_d=4.664 avg_d=0.851 std_dev=1.459
P	B	0, -0.417, 1.138, 2.693, 4.273 max_d=4.273 avg_d=1.138 std_dev=1.555
O6	B	0, -0.672, 0.908, 2.487, 5.045 max_d=5.045 avg_d=0.908 std_dev=1.580
OP2	B	0, -0.684, 1.421, 3.527, 5.748 max_d=5.748 avg_d=1.421 std_dev=2.105
OP1	B	0, -0.736, 1.802, 4.340, 6.487 max_d=6.487 avg_d=1.802 std_dev=2.538

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.08	0.11
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.37	0.36	0.29	0.31
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.28	0.10	0.16
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.09	0.08	0.10	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.25	0.35	0.10	0.20
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.40	0.37	0.26	0.32
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.05	0.04	0.08	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.14	0.23	0.02
C5	0.00	0.02	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.49	0.45	0.37	0.42
C5'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.06	0.13	0.10	0.06	0.05	0.04	0.00	0.01	0.19	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.02	0.50	0.47	0.41	0.44
C8	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.09	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.51	0.43	0.28	0.40
N1	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.45	0.43	0.38	0.39
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.33	0.31	0.23	0.26
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.12	0.03	0.52	0.50	0.47	0.48
N7	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.55	0.49	0.41	0.47
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.38	0.34	0.18	0.28
O2'	0.01	0.06	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.01	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.06	0.13	0.15	0.07
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.04	0.11	0.05	0.11	0.09	0.12	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.13	0.32	0.14	0.15
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.11	0.19	0.04
O5'	0.19	0.37	0.21	0.25	0.40	0.02	0.49	0.01	0.50	0.51	0.45	0.33	0.52	0.55	0.38	0.06	0.13	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.20	0.36	0.28	0.35	0.37	0.14	0.45	0.19	0.47	0.43	0.43	0.31	0.50	0.49	0.34	0.13	0.32	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.29	0.10	0.10	0.26	0.23	0.37	0.34	0.41	0.28	0.38	0.23	0.47	0.41	0.18	0.15	0.14	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.31	0.16	0.20	0.32	0.02	0.42	0.01	0.44	0.40	0.39	0.26	0.48	0.47	0.28	0.07	0.15	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	1.13	0.12	0.14	0.79	0.11	1.00	0.34	1.27	0.63	1.34	1.21	0.80	0.88	0.53	0.09	0.41	0.20	0.28	1.40	0.61	0.91	0.14
C2	0.03	0.53	0.07	0.22	0.49	0.27	0.72	0.50	0.85	0.49	0.76	0.39	0.36	0.69	0.32	0.04	0.42	0.11	0.50	0.93	0.50	1.31	0.57
C2'	0.23	1.05	0.15	0.14	0.73	0.08	0.90	0.25	1.15	0.56	1.23	1.15	0.76	0.78	0.49	0.15	0.37	0.21	0.24	1.26	0.82	0.81	0.21
C3'	0.21	0.99	0.15	0.15	0.68	0.09	0.88	0.24	1.14	0.54	1.20	1.07	0.70	0.77	0.46	0.15	0.38	0.18	0.23	1.28	0.82	0.85	0.22
C4	0.08	0.81	0.09	0.18	0.62	0.20	0.89	0.44	1.12	0.58	1.10	0.72	0.52	0.82	0.41	0.06	0.44	0.07	0.42	1.26	0.36	1.26	0.42
C4'	0.22	1.11	0.13	0.13	0.77	0.09	0.99	0.29	1.27	0.62	1.34	1.21	0.79	0.87	0.52	0.10	0.38	0.22	0.24	1.43	0.80	0.83	0.20
C5	0.05	0.52	0.10	0.21	0.47	0.26	0.81	0.49	1.04	0.55	0.91	0.33	0.28	0.81	0.32	0.05	0.45	0.13	0.50	1.25	0.58	1.49	0.64
C5'	0.18	1.02	0.11	0.14	0.72	0.08	0.96	0.29	1.25	0.61	1.29	1.08	0.70	0.87	0.49	0.09	0.41	0.17	0.24	1.45	0.73	0.90	0.18
C6	0.12	0.19	0.12	0.25	0.29	0.32	0.65	0.54	0.82	0.48	0.57	0.20	0.11	0.72	0.21	0.05	0.45	0.24	0.59	1.04	0.89	1.64	0.84
C8	0.09	0.78	0.10	0.18	0.61	0.19	0.92	0.43	1.20	0.61	1.15	0.69	0.48	0.88	0.42	0.08	0.46	0.08	0.41	1.42	0.37	1.32	0.43
N1	0.13	0.18	0.11	0.25	0.28	0.32	0.60	0.55	0.70	0.44	0.48	0.14	0.09	0.66	0.19	0.05	0.43	0.27	0.60	0.85	0.89	1.58	0.84
N3	0.10	0.84	0.08	0.18	0.65	0.19	0.85	0.42	1.04	0.55	1.04	0.78	0.60	0.76	0.43	0.06	0.42	0.07	0.39	1.12	0.32	1.12	0.34
N6	0.21	0.27	0.16	0.29	0.14	0.36	0.47	0.57	0.58	0.41	0.23	0.57	0.31	0.63	0.13	0.09	0.46	0.34	0.65	0.87	1.18	1.79	1.02
N7	0.05	0.53	0.10	0.21	0.49	0.24	0.83	0.48	1.09	0.57	0.96	0.36	0.30	0.84	0.34	0.06	0.46	0.12	0.49	1.35	0.54	1.50	0.61
N9	0.13	0.94	0.10	0.16	0.69	0.16	0.95	0.40	1.22	0.61	1.24	0.93	0.63	0.87	0.46	0.08	0.44	0.11	0.36	1.38	0.38	1.16	0.30
O2'	0.31	1.19	0.19	0.09	0.83	0.12	0.97	0.28	1.20	0.60	1.32	1.34	0.92	0.81	0.57	0.15	0.27	0.33	0.20	1.29	1.07	0.63	0.33
O3'	0.23	0.99	0.17	0.16	0.67	0.11	0.84	0.20	1.09	0.51	1.17	1.10	0.71	0.72	0.45	0.16	0.34	0.21	0.24	1.22	1.02	0.73	0.34
O4'	0.22	1.15	0.12	0.14	0.81	0.12	1.05	0.35	1.34	0.67	1.41	1.24	0.81	0.93	0.55	0.08	0.42	0.23	0.28	1.50	0.64	0.90	0.14
O5'	0.17	0.82	0.22	0.34	0.59	0.33	0.83	0.52	1.11	0.53	1.11	0.83	0.54	0.77	0.39	0.19	0.52	0.22	0.54	1.32	0.36	1.21	0.27
OP1	0.16	0.76	0.21	0.34	0.54	0.35	0.78	0.52	1.05	0.49	1.04	0.76	0.49	0.73	0.36	0.17	0.50	0.22	0.58	1.27	0.33	1.24	0.29
OP2	0.17	0.51	0.20	0.36	0.39	0.36	0.66	0.47	0.92	0.41	0.85	0.44	0.28	0.65	0.25	0.19	0.58	0.23	0.55	1.18	0.21	1.34	0.38
P	0.13	0.72	0.18	0.32	0.52	0.31	0.79	0.49	1.06	0.49	1.03	0.70	0.45	0.74	0.34	0.15	0.51	0.18	0.53	1.29	0.31	1.25	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.09	0.02	0.54	0.29	0.17
C2	0.04	0.00	0.04	0.06	0.02	0.22	0.02	0.49	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.18	0.16	0.19	0.44	0.00	0.88	0.86	0.56
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.03	0.70	0.34	0.26
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.09	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.33	0.27	0.08
C4	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.15	0.01	0.38	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.14	0.11	0.10	0.37	0.01	0.89	0.75	0.52
C4'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.15	0.00	0.14	0.00	0.17	0.05	0.21	0.25	0.20	0.08	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.34	0.13	0.12
C5	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.14	0.09	0.04	0.42	0.01	1.10	0.94	0.65
C5'	0.08	0.49	0.04	0.01	0.38	0.00	0.38	0.00	0.45	0.19	0.50	0.51	0.43	0.28	0.24	0.03	0.01	0.01	0.00	0.44	0.22	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.17	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.08	0.48	0.01	1.11	1.07	0.71
C8	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.08	0.04	0.08	0.28	0.01	1.14	0.75	0.58
N1	0.03	0.01	0.03	0.06	0.01	0.21	0.01	0.50	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.14	0.49	0.01	0.99	1.02	0.66
N2	0.07	0.01	0.06	0.09	0.03	0.25	0.03	0.51	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.20	0.19	0.24	0.44	0.01	0.91	0.84	0.57
N3	0.04	0.01	0.04	0.05	0.01	0.20	0.02	0.43	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.16	0.15	0.20	0.37	0.00	0.79	0.69	0.47
N7	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.11	0.06	0.05	0.37	0.01	1.26	0.93	0.70
N9	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.26	0.01	0.86	0.59	0.43
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.14	0.01	0.14	0.03	0.17	0.08	0.19	0.20	0.16	0.11	0.08	0.00	0.04	0.03	0.10	0.17	0.74	0.36	0.27
O3'	0.07	0.16	0.01	0.01	0.11	0.02	0.09	0.01	0.11	0.04	0.14	0.19	0.15	0.06	0.07	0.04	0.00	0.05	0.03	0.10	0.23	0.31	0.09
O4'	0.00	0.19	0.02	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.08	0.14	0.24	0.20	0.05	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.05	0.41	0.20	0.10
O5'	0.09	0.44	0.11	0.05	0.37	0.01	0.42	0.00	0.48	0.28	0.49	0.44	0.37	0.37	0.26	0.10	0.03	0.02	0.00	0.50	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.16	0.01	0.44	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.10	0.05	0.50	0.00	1.22	1.18	0.78
OP1	0.54	0.88	0.70	0.33	0.89	0.34	1.10	0.22	1.11	1.14	0.99	0.91	0.79	1.26	0.86	0.74	0.23	0.41	0.02	1.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.86	0.34	0.27	0.75	0.13	0.94	0.25	1.07	0.75	1.02	0.84	0.69	0.93	0.59	0.36	0.31	0.20	0.01	1.18	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.56	0.26	0.08	0.52	0.12	0.65	0.01	0.71	0.58	0.66	0.57	0.47	0.70	0.43	0.27	0.09	0.10	0.01	0.78	0.01	0.01	0.00