Doublet Group distance statistics: 50519

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.001, 0.027, 0.052, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.027 std_dev=0.026
O2'	A	0, 0.176, 0.390, 0.604, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.390 std_dev=0.214
O4'	A	0, 0.226, 0.464, 0.702, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.464 std_dev=0.238
C2'	A	0, 0.207, 0.448, 0.689, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.448 std_dev=0.241
C2'	B	0, 0.168, 0.477, 0.785, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.477 std_dev=0.308
O2'	B	0, 0.192, 0.565, 0.938, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.565 std_dev=0.373
C4'	A	0, 0.347, 0.741, 1.134, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.741 std_dev=0.394
C3'	A	0, 0.360, 0.764, 1.168, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.764 std_dev=0.404
OP2	A	0, 0.519, 1.098, 1.677, 1.976 max_d=1.976 avg_d=1.098 std_dev=0.579
O3'	A	0, 0.537, 1.138, 1.739, 1.671 max_d=1.671 avg_d=1.138 std_dev=0.601
C5'	A	0, 0.573, 1.192, 1.811, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.192 std_dev=0.619
P	A	0, 0.573, 1.203, 1.832, 2.101 max_d=2.101 avg_d=1.203 std_dev=0.630
O5'	A	0, 0.538, 1.171, 1.804, 1.935 max_d=1.935 avg_d=1.171 std_dev=0.633
OP1	A	0, 0.686, 1.423, 2.160, 2.470 max_d=2.470 avg_d=1.423 std_dev=0.737
C3'	B	0, 0.436, 1.659, 2.882, 2.933 max_d=2.933 avg_d=1.659 std_dev=1.223
C1'	B	0, 0.715, 2.087, 3.459, 3.590 max_d=3.590 avg_d=2.087 std_dev=1.372
N9	B	0, 1.038, 2.957, 4.877, 4.999 max_d=4.999 avg_d=2.957 std_dev=1.919
C8	B	0, 1.607, 3.719, 5.832, 5.885 max_d=5.885 avg_d=3.719 std_dev=2.112
O4'	B	0, 0.725, 2.848, 4.971, 5.120 max_d=5.120 avg_d=2.848 std_dev=2.123
O3'	B	0, 0.324, 2.454, 4.583, 4.672 max_d=4.672 avg_d=2.454 std_dev=2.129
C4'	B	0, 0.495, 2.654, 4.813, 4.925 max_d=4.925 avg_d=2.654 std_dev=2.159
N7	B	0, 1.803, 4.337, 6.872, 6.924 max_d=6.924 avg_d=4.337 std_dev=2.534
C4	B	0, 0.871, 3.600, 6.330, 6.441 max_d=6.441 avg_d=3.600 std_dev=2.729
C5	B	0, 1.328, 4.323, 7.317, 7.422 max_d=7.422 avg_d=4.323 std_dev=2.995
O5'	B	0, 1.005, 4.329, 7.654, 7.840 max_d=7.840 avg_d=4.329 std_dev=3.324
N3	B	0, 0.630, 4.004, 7.378, 7.447 max_d=7.447 avg_d=4.004 std_dev=3.374
C5'	B	0, 0.576, 4.070, 7.564, 7.696 max_d=7.696 avg_d=4.070 std_dev=3.494
C6	B	0, 1.251, 5.253, 9.256, 9.354 max_d=9.354 avg_d=5.253 std_dev=4.002
OP2	B	0, 1.650, 5.761, 9.871, 10.025 max_d=10.025 avg_d=5.761 std_dev=4.111
O6	B	0, 1.621, 5.975, 10.329, 10.425 max_d=10.425 avg_d=5.975 std_dev=4.354
C2	B	0, 0.706, 5.138, 9.571, 9.626 max_d=9.626 avg_d=5.138 std_dev=4.432
P	B	0, 1.280, 5.730, 10.180, 10.346 max_d=10.346 avg_d=5.730 std_dev=4.450
N1	B	0, 0.767, 5.558, 10.348, 10.427 max_d=10.427 avg_d=5.558 std_dev=4.790
N2	B	0, 1.067, 6.239, 11.412, 11.418 max_d=11.418 avg_d=6.239 std_dev=5.173
OP1	B	0, 1.086, 6.310, 11.533, 11.654 max_d=11.654 avg_d=6.310 std_dev=5.224

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.09	0.08
C2	0.03	0.00	0.13	0.17	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.02	0.08	0.10	0.21	0.16
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.05	0.11	0.13	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.20	0.10	0.07
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.13	0.09	0.16	0.15	0.12	0.10	0.07	0.01	0.01	0.00	0.08	0.25	0.13	0.11
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.02	0.06	0.08	0.19	0.16
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.03	0.09	0.13	0.24	0.19
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.09	0.08	0.05	0.09	0.10	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.18	0.03	0.10	0.15	0.25	0.19
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.07	0.11	0.20	0.17
N1	0.02	0.00	0.11	0.16	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.02	0.09	0.13	0.24	0.18
N3	0.02	0.00	0.13	0.15	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.02	0.06	0.08	0.18	0.15
N6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.18	0.04	0.10	0.17	0.26	0.19
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.10	0.17	0.25	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.03	0.06	0.16	0.14
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.11	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.17	0.08	0.05
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.14	0.02	0.15	0.01	0.18	0.11	0.21	0.18	0.18	0.13	0.08	0.03	0.00	0.01	0.10	0.32	0.16	0.15
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.05	0.10	0.10
O5'	0.03	0.08	0.05	0.08	0.06	0.01	0.09	0.00	0.10	0.07	0.09	0.06	0.10	0.10	0.03	0.04	0.10	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.10	0.20	0.25	0.08	0.11	0.13	0.07	0.15	0.11	0.13	0.08	0.17	0.17	0.06	0.17	0.32	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.21	0.10	0.13	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.20	0.24	0.18	0.26	0.25	0.16	0.08	0.16	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.16	0.07	0.11	0.16	0.02	0.19	0.01	0.19	0.17	0.18	0.15	0.19	0.20	0.14	0.05	0.15	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.41	1.26	0.20	0.26	0.89	0.40	0.91	0.60	1.10	0.53	1.26	1.42	1.07	0.70	0.61	0.12	0.53	0.15	0.37	1.13	0.79	0.21	0.37
C2	0.43	0.23	0.18	0.42	0.24	0.74	0.30	0.89	0.22	0.52	0.19	0.38	0.19	0.45	0.39	0.10	0.28	0.74	0.86	0.25	0.85	0.96	1.02
C2'	0.18	1.30	0.21	0.30	0.71	0.68	0.64	1.03	0.91	0.14	1.21	1.62	1.07	0.29	0.32	0.30	0.42	0.43	0.79	0.88	1.25	0.65	0.89
C3'	0.16	1.28	0.23	0.29	0.66	0.66	0.59	1.04	0.87	0.11	1.19	1.63	1.03	0.24	0.28	0.34	0.37	0.45	0.82	0.85	1.30	0.70	0.94
C4	0.38	0.36	0.17	0.19	0.42	0.30	0.47	0.35	0.46	0.49	0.41	0.32	0.36	0.51	0.43	0.08	0.13	0.42	0.45	0.49	0.38	0.65	0.59
C4'	0.34	1.54	0.20	0.32	0.96	0.61	0.96	0.96	1.26	0.41	1.53	1.84	1.26	0.64	0.56	0.19	0.58	0.23	0.68	1.28	1.26	0.48	0.78
C5	0.33	0.28	0.16	0.36	0.21	0.59	0.26	0.78	0.22	0.45	0.23	0.43	0.22	0.39	0.32	0.08	0.28	0.56	0.79	0.24	0.89	0.99	1.02
C5'	0.34	1.41	0.19	0.27	0.89	0.50	0.92	0.81	1.19	0.44	1.41	1.67	1.15	0.64	0.55	0.18	0.51	0.19	0.56	1.23	1.08	0.36	0.63
C6	0.30	0.71	0.15	0.57	0.26	0.96	0.21	1.28	0.35	0.43	0.60	1.00	0.54	0.31	0.24	0.09	0.56	0.76	1.19	0.32	1.45	1.34	1.48
C8	0.33	0.41	0.17	0.17	0.42	0.22	0.47	0.25	0.49	0.45	0.46	0.40	0.38	0.49	0.40	0.09	0.14	0.32	0.36	0.52	0.32	0.59	0.50
N1	0.33	0.74	0.15	0.63	0.25	1.09	0.20	1.41	0.34	0.46	0.60	1.04	0.57	0.32	0.25	0.12	0.60	0.87	1.27	0.30	1.48	1.35	1.52
N3	0.44	0.47	0.18	0.17	0.51	0.26	0.55	0.29	0.55	0.54	0.52	0.43	0.46	0.56	0.50	0.07	0.17	0.45	0.39	0.57	0.27	0.57	0.50
N6	0.26	1.12	0.14	0.70	0.45	1.16	0.36	1.62	0.63	0.40	0.98	1.52	0.86	0.24	0.20	0.10	0.77	0.84	1.47	0.59	1.94	1.64	1.85
N7	0.31	0.23	0.16	0.30	0.23	0.48	0.29	0.63	0.25	0.43	0.22	0.33	0.20	0.40	0.32	0.08	0.23	0.47	0.68	0.27	0.78	0.92	0.91
N9	0.37	0.69	0.18	0.14	0.58	0.15	0.62	0.17	0.69	0.49	0.72	0.72	0.61	0.57	0.48	0.09	0.26	0.27	0.22	0.72	0.26	0.41	0.29
O2'	0.16	1.78	0.17	0.52	0.94	1.03	0.85	1.52	1.23	0.13	1.65	2.22	1.44	0.36	0.38	0.28	0.71	0.62	1.21	1.20	1.85	1.05	1.40
O3'	0.10	1.45	0.25	0.38	0.62	0.90	0.50	1.42	0.85	0.24	1.29	1.92	1.13	0.06	0.14	0.44	0.40	0.71	1.21	0.80	1.79	1.17	1.44
O4'	0.49	1.43	0.21	0.28	1.03	0.41	1.09	0.63	1.32	0.67	1.47	1.60	1.21	0.88	0.73	0.10	0.62	0.18	0.38	1.37	0.86	0.23	0.39
O5'	0.28	0.98	0.18	0.17	0.64	0.31	0.66	0.51	0.84	0.36	0.98	1.15	0.80	0.50	0.42	0.18	0.33	0.15	0.33	0.87	0.66	0.20	0.33
OP1	0.15	0.89	0.09	0.25	0.50	0.46	0.51	0.71	0.71	0.24	0.88	1.09	0.69	0.34	0.27	0.12	0.38	0.29	0.52	0.74	0.88	0.36	0.55
OP2	0.27	0.47	0.24	0.22	0.37	0.22	0.39	0.23	0.44	0.31	0.47	0.52	0.41	0.35	0.31	0.24	0.22	0.26	0.26	0.46	0.26	0.41	0.32
P	0.32	0.86	0.23	0.16	0.60	0.22	0.64	0.35	0.78	0.40	0.88	0.98	0.72	0.52	0.43	0.22	0.25	0.19	0.22	0.81	0.44	0.27	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.11	0.09
C2	0.04	0.00	0.17	0.15	0.02	0.07	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.20	0.21	0.04	0.04	0.01	0.08	0.12	0.08
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.08	0.13	0.20	0.17	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.06	0.21	0.12	0.09
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.16	0.10	0.20	0.15	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.27	0.22	0.18
C4	0.02	0.02	0.08	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.02	0.06	0.02	0.09	0.12	0.09
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.12	0.04	0.10	0.07	0.11	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.03	0.10	0.02	0.13	0.16	0.12
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.17	0.04	0.07	0.04	0.17	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.12	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.06	0.03	0.10	0.00	0.13	0.18	0.14
C8	0.03	0.02	0.08	0.16	0.00	0.12	0.00	0.17	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.05	0.15	0.02	0.16	0.17	0.14
N1	0.03	0.00	0.13	0.10	0.02	0.04	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.15	0.03	0.06	0.01	0.10	0.16	0.10
N2	0.06	0.01	0.20	0.20	0.02	0.10	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.25	0.28	0.06	0.04	0.02	0.07	0.12	0.07
N3	0.04	0.01	0.17	0.15	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.19	0.04	0.05	0.01	0.07	0.11	0.08
N7	0.02	0.02	0.04	0.13	0.01	0.11	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.05	0.16	0.02	0.17	0.18	0.16
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.10	0.13	0.10
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.09	0.03	0.06	0.04	0.10	0.05	0.16	0.25	0.19	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.09	0.22	0.10	0.07
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.07	0.02	0.04	0.04	0.06	0.18	0.15	0.28	0.19	0.14	0.06	0.03	0.00	0.02	0.20	0.05	0.41	0.34	0.28
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.11	0.04	0.09	0.19	0.17
O5'	0.05	0.04	0.07	0.13	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.15	0.06	0.04	0.05	0.16	0.08	0.07	0.20	0.11	0.00	0.13	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.02	0.06	0.02	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.05	0.04	0.13	0.00	0.15	0.20	0.17
OP1	0.07	0.08	0.21	0.27	0.09	0.11	0.13	0.06	0.13	0.16	0.10	0.07	0.07	0.17	0.10	0.22	0.41	0.09	0.02	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.12	0.12	0.22	0.12	0.02	0.16	0.01	0.18	0.17	0.16	0.12	0.11	0.18	0.13	0.10	0.34	0.19	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.08	0.09	0.18	0.09	0.01	0.12	0.01	0.14	0.14	0.10	0.07	0.08	0.16	0.10	0.07	0.28	0.17	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00